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脉冲场凝胶电泳分析(PFGE)文献资料
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应用PFGE分析广州稻叶型霍乱弧菌的同源性
目的 分析广州40株稻叶型霍乱弧菌的毒力基因和PFGE特征,探讨菌株的同源性和广州稻叶型霍乱弧菌流行的特点.方法 应用PCR方法 检测稻叶型菌株的4种毒力基因,采用限制性内切酶Not I对菌株进行PFGE分型,使用BioNumerics Version 4.0软件(复选Dice相关系数和UPGMA方法 )对菌株进行聚类和同源分析.结果 绝大多数水型稻叶霍乱疫情相关菌株为genotype A型菌,而绝大多数环境分离稻叶型霍乱弧菌为genotype B型和C型菌.40株霍乱菌株分布于18种pulsotype,水型霍乱疫情相关菌株的pulsotype极为相近(相似性系数98%以上),而环境分离的稻叶型霍乱弧菌呈现明显的pulsotype多样性.结论 是否携带ctxA基因是稻叶型霍乱弧菌人源分离株与环境分离株的主要区别之一,绝大多数环境分离的稻叶型霍乱弧菌与人源分离株的同源性较低,但仍需加强对不同来源菌株的同源性分析和溯源追踪.
关键词： 霍乱弧菌 毒力基因 脉冲场凝胶电泳分析(PFGE) 分子分型 同源性
