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2017年安徽省宿州市人感染H7N9禽流感病毒基因组特征分析
目的 分析2017年安徽省宿州市人感染H7N9禽流感病毒的基因组分子进化特征.方法 收集宿州市4例H7N9病例的咽拭子样本,分离培养后进行扩增和测序,构建血凝素HA基因进化树并进行重要氨基酸位点的变异分析.结果 4株毒株的HA与A/He nan/15337/2017(H7N9)的相似度高(99％);神经氨酸酶NA与A/Changsha/44/2017(H7N9)的相似度高(99％～100％);其他内部基因与2013-2017年浙江省、湖南省、江西省和广东省等地区分离到的H9N2相似度较高(94％～100％).分子进化树显示均为长三角分支.HA蛋白受体结合位点未发生G186V、Q226L突变;NA蛋白上未发现耐神经氨酸酶的位点突变;PB2蛋白发生E627V突变;M1蛋白出现N30D、T215A突变;NS1蛋白出现P42S突变、盘状同源区域模块缺失;M2蛋白出现S31N突变.结论 4株人感染H7N9禽流感病毒均处于长三角分支,M2蛋白S31N突变提示对M2离子通道抑制剂出现耐药,应及时关注其遗传变异演变方向,为H7N9禽流感的有效防治提供科学依据.
关键词： 禽流感 基因组 序列同源性 人感染H7N9禽流感病毒 氨基酸位点 -
河南省首例人感染H7N9禽流感病例的流行病学调查
[目的]通过对1例人感染H7 N9禽流感病毒患者的调查分析，为人感染H7 N9禽流感的科学防控提供依据。[方法]采用流行病学调查方法，调查病例的发病经过、可能的感染来源、传播途径及暴露因素等，医学观察患者的密切接触者，同时对患者进行临床诊治、实验室检测。[结果]确诊1例人感染H7 N9禽流感病毒，经救治后痊愈出院。患者有明确的活禽接触史，咽拭子检测H7 N9禽流感病毒核酸阳性。患者的密切接触者中均未发现异常临床表现。通过扩大监测流感病例160例和职业人群858例，均未发现H7N9禽流感病毒核酸阳性。当地活禽交易市场鸡咽拭子标本检出2份H7 N9禽流感病毒核酸阳性，阳性鸡来源于外省。[结论]活禽暴露是人感染H7 N9禽流感病毒的关键风险因素，暂无证据人传人，未发现人群隐性感染和轻症病例。仍需开展扩大监测和流行病学调查，以完善对感染谱的认识。
关键词： 人感染H7N9禽流感病毒 流行病学 防控 -
广州市人感染H7N9禽流感病毒高致病性变异株监测与基因进化分析
目的 通过对广州市人感染H7N9禽流感病毒高致病性变异株基因变异和进化特点进行分析,掌握本地区H7N9病毒病原学特点,为疾病防控提供参考.方法 选取2017年广州市人感染H7N9禽流感病毒阳性标本10份,提取核酸扩增HA、NA、M基因进行测序,通过生物信息学软件分析病毒重要蛋白突变情况和遗传进化特点.结果 广州地区H7N9禽流感病毒基因同源性差异较大,大部分毒株基因与广东毒株同源性高,部分毒株基因与河南、内蒙古等地毒株同源性高.监测到5株病毒为H7N9禽流感病毒高致病性变异株,部分病毒出现了HA蛋白Q226L的突变,提示对人呼吸道上皮细胞SAα-2,6Gal受体结合能力增加.HA蛋白和NA蛋白上糖基化位点均有一定的增加和缺失突变.HA、NA和M1蛋白上毒力相关位点均突变增强.M2蛋白均呈现耐药突变,同时监测到2株高致病性突变株出现对神经氨酸酶抑制剂的耐药突变.遗传进化结果显示,HA基因和NA基因在华南和华东分支均有分布,M1基因进化特点相对复杂,分别与华南地区H9N2、H7N9病毒,及北方地区的H7N9病毒重组.结论 2017年广州地区发现2株对达菲耐药的人感染H7N9禽流感病毒高致病性交异株.H7N9禽流感病毒在广州地区不断发生进化重组,具有遗传多样性和复杂性,提示高致病性耐药株有向华南以外地区传播的风险.
关键词： 人感染H7N9禽流感病毒 高致病性突变株 耐药 基因变异 遗传进化 -
2014-2016年广东省肇庆市人感染H7N9禽流感病毒基因组特征分析
目的 了解广东省肇庆市2014-2016年人感染H7N9禽流感病毒基因进化特征.方法 对肇庆市17例H7N9患者咽拭核酸直接进行8节段基因序列扩增与测定,用BioEdit5.0、MEGA6.0进行同源性和重要氨基酸位点分析,采用Neighbor-Joining法构建进化树,参比序列从GenBank下载.结果 7份H7N9病例标本获得8节段全基因序列,HA与A/chicken/Dongguan/695/2014 (H7N9)相似度高,NA与A/ chicken/Dongguan/1075/2014 (H7N9)相似度高;内部基因与2013-2014年广东东莞、深圳禽源H7N9及H9N2相似度较高.HA和NA基因与广东省东莞、广州、深圳等地市的H7N9序列同处于珠三角进化分支,与安徽、浙江、江苏等长三角分支的序列相似性低.HA蛋白受体结合位点发生G186V、Q226L变异,裂解位点序列均为PEIPKGR↓ GLF,含有2个碱性氨基酸;M2蛋白上发现耐药位点S31N,PB2蛋白上发现E627K突变,NA蛋白上未发现耐神经氨酸酶的位点变异.结论 肇庆市人感染H7N9病毒株可能来源于2013 2014年广东省珠三角地区禽源H7N9和H9N2,G186V、Q226L和E627K位点变异增强了对人的易感性.
关键词： 人感染H7N9禽流感病毒 血凝素基因 神经氨酸酶基因 序列分析 -
广东省2015年人感染H7N9禽流感病毒基因特征分析
目的 分析2015年广东省人感染H7N9禽流感病毒基因特征.方法 对2015年1-12月送检广东省疾病预防控制中心的4份人感染H7N9禽流感病毒株进行病毒分离纯化并进行Ion Torrent高通量测序获得H7N9禽流感病毒全基因组8个基因片段.使用生物信息学软件将RNA序列与GenBank得到序列进行多重比对,并对病毒关键位点的分子变异情况进行分析,使用MEGA 7.0软件中大似然法绘制遗传进化树进行基因进化分析.结果 A/Guangdong/SZ17/2015(H7N9)、A/Guangdong/JM51/2015(H7N9)、A/Guangdong/ZH57/2015(H7N9)这3株人感染H7 N9禽流感病毒的HA和NA基因与2014年广东省汕头、东莞等地的H7N9禽流感病毒进化距离近,A/Guangdong/SW20/2015 (H7N9)病毒的HA、NA基因与2014-2015年浙江温州、江苏淮安等地的H7N9禽流感病毒进化距离近.ZH57病毒除NP基因与深圳H9N2亚型病毒高度同源(99.4％)以外,其余7个基因片段均与2013-2014年广东省内1H7N9亚型禽流感毒株高度同源;其余3株病毒除HA和NA基因外,其余6个基因片段均与江西、安徽、江苏等地H9N2亚型病毒高度同源.分析相关致病位点得知,4株毒株中均出现可导致宿主特异性改变、病毒传播力、致病力、毒力及复制能力增强的位点突变,其中,4株病毒的HA蛋白受体结合区均发生G186V和Q226L这2个关键氨基酸位点的变异,对人呼吸道上皮细胞SAα-2,6Gal受体的结合能力增加,提示广东省H7N9禽流感病毒更容易感染人类.4株病毒的NA蛋白茎杆区69 ～73位氨基酸均出现缺失,这是禽流感病毒由野生水禽适应陆生家禽(鸡、鹌鹑等)的结果.4株病毒的M2蛋白均发生S31N突变,该突变会使流感病毒对M2离子通道抑制剂(金刚烷胺类药物)产生耐药性.所有毒株均保留了病毒对神经氨酸酶抑制剂的敏感性.结论 2015年广东省人感染H7N9病毒株具有遗传多样性及复杂性、致病力增强、对M2离子通道抑制剂的耐药性位点突变等趋势,存在对人和家禽宿主体内增殖及重配的可能性.
关键词： 广东省 2015年 人感染H7N9禽流感病毒 基因特征 -
福州市人感染H7N9流感病毒基因特性分析
目的 了解福州市人感染H7N9流感病毒基因特性及进化分布.方法 对2013-2016年福州市流感监测网络实验室从监测哨点医院采集的不明原因肺炎病例中人感染H7N9流感病毒核酸检测阳性的标本进行病毒分离,选取部分H7N9禽流感病毒株进行基因组基因序列测定,使用DNAman.exe分析软件进行基因序列比对,并对病毒关键位点的氨基酸变异情况进行分析,绘制遗传进化树进行进化分布分析.结果 血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因进化树分析结果显示福州市人感染H7N9禽流感病毒株与以上海、浙江为代表的长三角分支相近.7株毒株中均出现可导致宿主特异性改变、病毒传播力、致病力、毒力及复制能力增强的相关致病位点突变.病毒的HA蛋白受体结合区均发生G186V和Q226L这2个关键氨基酸位点的变异,HA蛋白裂解位点序列均为PEIPKGR↓GLF,含有2个碱性氨基酸.7株病毒的NA蛋白茎杆区69～73位氨基酸均出现缺失.病毒的M2蛋白均发生S31N突变.结论 福州市人感染H7N9病毒株具有遗传多样性及复杂性,呈现致病力增强、对金刚烷胺类药物耐药等特点,在监测工作中应加强病原学的监测和遗传变异特性的研究.
关键词： 人感染H7N9禽流感病毒 基因特征 序列分析
