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精准医疗:分子流行病学的机遇与挑战
自2003年人类基因组计划完成,到2015年1月美国总统奥巴马宣布启动精准医疗计划,人类初步完成基因组到生物学、生物学到健康、健康到社会的三级跳.作为新型交叉领域,精准医疗的产生和发展离不开生命科学、基础医学、临床医学、流行病学、统计学、社会学和信息学等多学科的共同支撑和促进.分子流行病学作为流行病学与分子生物学的交叉学科,被认为是促进精准医疗的核心力量.本文将基于精准医疗和分子流行病学各自的特点和研究进展,着重探讨分子流行病学对精准医疗的贡献和意义,并展望精准医疗未来可能的机遇与挑战.
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流行病学展望:医学大数据与精准医疗
近年来随着高通量技术的发展、电子病历系统的普及和大数据开发工具的进步,医学大数据的研究价值开始受到重视.而精准医疗计划的提出,则为医学大数据的应用开拓了前景.流行病学作为工具学科,未来的研究重点将以系统流行病学为设计原则,深度挖掘现有的大数据资源,促进转化研究和知识整合,深入揭示对暴露-疾病这一过程中分子机制,加快实现科学研究向人群健康促进的终极目标转化.
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数据挖掘常用算法及其在医学大数据研究中的应用
医院信息化的发展及云计算、大数据、物联网、人工智能等在医疗领域的应用,为医学数据的获取、存储及处理提供了极大便利.数据挖掘也随着计算机技术得到了广泛应用,从而提高了数据利用效率,拓展了知识发现的广度与深度.目前,医院已积累了大量医疗相关数据.医学大数据与数据挖掘的结合,能够帮助人们从存储的大体量、高复杂的医学数据中提取有价值信息,加速医学成果转化,为医疗行业开拓一个新的时代.介绍了医学数据挖掘中常用算法及其在医学大数据中的研究成果,以期为今后医学大数据的挖掘利用提供参考.
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超算中心及其在医学信息计算分析中的应用
在医疗卫生数据迅猛增长的背景下，首先介绍了国内超算中心的基本情况和建设现状；然后结合临床脑电信号（EEG）研究工作的实际情况，从超算中心的使用流程，计算分析的程序设计和优化，任务交付和结果获取，以及计算结果和速度的分析对比，详细阐述了基于超算中心的医学信息分析研究的步骤与方法。研究对于应用超算中心来支持医学大数据分析，同时对推广超级计算在医学领域的应用有重要意义。
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NIH生物医学数据共享仓储分析
目的:对美国国立卫生研究院(NIH)的共享仓储进行分析,为生物医学科学数据领域相关研究和我国医学科学数据共享仓储建设提供参考和借鉴.方法:对UniProt、Protein Data Bank、GenBank等10个典型的数据共享仓储进行对比分析,总结其在数据获取方式、数据管理及共享模式、服务方式等方面的经验.结果:各仓储根据自身特性,设计了符合自身特点的数据管理链条及流程规范.结论:我国可借鉴美国国立卫生研究院生物医学数据共享仓储的建设经验,设计数据服务工具、开展半人工半自动模式的数据审核,收集尽可能详尽的元数据,并制定符合自身仓储特点的引用规范等.
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基于CiteSpace的医学大数据国际发展研究现状分析
目的:使用CiteSpace探讨医学大数据研究热点与研究前沿.方法:以WoS核心核集收录的医学大数据领域相关文献作为数据来源,利用文献计量方法结合信息分析可视化工具CiteSpace对其进行分析.结果:自2012年以来,相关研究成果数量迅速攀升;big data、system、care、medicine、personalized medicine等节点较大;quality、children和mapreduce等Burst值较高.结论:当前医学大数据领域对医学大数据技术、精准医疗、医学健康大数据管理、医学大数据隐私及发展研究较多,mapreduce、ontology、hadoop等是研究前沿与发展趋势.
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医学大数据应用信息系统策划与设计
医学大数据是国家重要的战略性基础数据资源,将应用于精准临床诊疗、决策支持、疾病监测预警与管理、公众健康服务等领域.当前,国内对医学大数据技术的应用成熟度还有待提高,如何将传统的医学数据平稳过渡到大数据体系中,通过数据挖掘等手段对其进行专业的分析来实现数据的"增值",是当下亟待解决的重要问题.本文通过构建区域级医学大数据应用技术工程实验室,对医学大数据应用信息系统总体架构、数据中心架构等核心功能进行初步策划与设计.
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医疗大数据在肿瘤早期筛查标志物中的研究现状和前景
肿瘤的早期筛查有望提高患者生存率,对肿瘤治疗具有重要意义.信息技术为分析临床记录、医学影像、基因信息等不同形式的数据提供先进的数据平台,也为肿瘤早期筛查的研究工作提供了契机.文章阐述了医疗大数据的概念及对医疗行业的意义、医学大数据在肿瘤早期筛查标志物方面的研究(包括肺癌、结直肠癌、乳腺癌等),肿瘤早期筛查的研究现状,展望了大数据应用于肿瘤早期筛查的前景,旨在为大数据技术在肿瘤早期筛查中的应用提供新思路.
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关键一课将学生领入大数据时代—ACCESS案例教学方法研究
目的 文章基于医学院校数据库课程教育对学生学习兴趣培养的视角,分析案例教学在医科大学数据库教学改革中第一堂课内容安排的重要性.方法 调查问卷设计10个问题,围绕专业兴趣、大数据和生物信息3个方面,第一堂课授课安排采用回答调查问卷、生物信息表达谱分析案例教学、再次回答调查问卷三个步骤.然后对两次的调查问卷进行分析.结果 调查问卷分析结果表明,案例教学使得学生在对大数据、数据库和数据挖掘的了解有明显提高.结论 通过教学前后调查问卷的对比,表明通过大数据分析案例教学可以有效培养学生对数据库课程学习的兴趣与动力.
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医学大数据辨析
医学大数据的收集、 整理、 存储、 分析和应用管理已经成为医学决策中的重要支柱之一,但目前仍存在盲目追求医学大数据、 忽视医学大数据建设、 轻视医学抽样调查、 忽视伦理审查等问题,结合医学管理实践,进一步厘清医学大数据有关误区并提出相应的建议.
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基于数据的临床决策对无行为能力患者治疗选择的潜在意义
无行为能力患者医疗决策的选择是临床实践的难点。阐述了传统的无行为能力患者的代理决策在法律、伦理方面的不足，并提出在大数据时代，基于数据的临床决策对无行为能力患者临床优化选择的潜在价值。
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医学大数据研究进展及应用前景
医学大数据具有数据量庞大、结构复杂、分析难度大等特点,包括临床数据、多种组学数据、环境暴露、日常生活习惯、地理位置信息、社交媒体及其他多种与个体健康和疾病状态相关的数据维度.医学大数据的重要应用方向包括群体层面的疾病预防及诊疗体系的评价、特定疾病的机制阐释,逐步完善精准医学知识体系、构建具有自主学习能力的临床决策支持系统等.
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国外医学大数据研究进展及其启示
介绍大数据的概念、相关建设内容,分析国外医学大数据研究进展情况,包括美国、英国、澳大利亚等,从医疗卫生信息化基础建设、医学大数据平台建设和大数据组织体系与机制建设3个方面对我国医学大数据建设提出建议.
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基于文献的国内外医学大数据研究
以CNKI和Web of Science索引库SCI/SSCI为数据源,从社会网络视角对国内外医学大数据文献从年度分布、期刊分布、研究方向等方面进行分析,绘制高频关键词、高产作者、高产机构共现网络图谱.结果表明国内外医学大数据研究有多学科协同发展趋势,但研究内容未形成要点,作者群体、机构群体还未产生密切的合作与联系.
