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数目可变串联重复序列技术文献资料
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13个VNTR位点用于113株结核分支杆菌的基因分型研究
目的 应用数目可变串联重复序列(VNTR)分子分型技术,对北京地区113株肺结核临床分离菌株进行分型研究,探讨北京地区菌株DNA多态性和基因型特征.方法 采用PCR和琼脂糖凝胶电泳技术对结核分支杆菌13个VNTR位点进行检测,并应用Gel-Pro analyzer 3.1软件和BioNumerics 3.0软件进行结果分析.结果 113株结核分支杆菌可分为4个基因型(分别为Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ和V型),其中Ⅰ型占92.0%(104/113),其他3型所占比例很小,分别为Ⅱ型占4.4%(5/113),Ⅳ和V型均为1.8%(2/113),而标准菌株H37Rv在分型中为独立的一个基因型,即Ⅲ型.结论 北京地区的结核分支杆菌存在基因多态性,其主要流行型为Ⅰ型.
关键词： 结核分支杆菌 基因分型 聚类分析 数目可变串联重复序列技术 -
15个VNTR位点用于87株丽水市结核分枝杆菌分离株的基因分型研究
目的:选取2008年-2010年间丽水市结核分枝杆菌临床分离株,通过多位点可变数目串联重复序列分型,了解丽水市结核分枝杆菌流行菌株基因分型情况.方法:对临床分离株进行常规培养,收集菌体,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应(PCR)分别对15个VNTR位点进行检测分析,基因聚类分析采用BioN-umerics软件.结果:经聚类分析,87株结核分枝杆菌分为4个基因群(Ⅰ群、Ⅱ群、Ⅲ群、Ⅳ群)69个基因型.其中Ⅳ群占74.7％,含49个基因型,Ⅰ群占9.2％,含8个基因型,Ⅱ群占8％,含7个基因型,Ⅲ群占5.75％.含5个基因型.结论:丽水市的结核分枝杆菌存在基因多态性,其主要流行型为Ⅳ型.
关键词： 结核分枝杆菌 基因分型 聚类分析 数目可变串联重复序列技术
