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半夏种质资源的随机扩增多态性DNA技术分析
目的 分析半夏种质资源在分子水平上的遗传多样性.方法 应用随机扩增多态性DNA技术(RAPD)对21份半夏种质资源进行检测.结果 29个引物共得到162条扩增DNA片段,其中123条(75.9%)的片段具多态性,揭示了半夏居群间较丰富的遗传多样性.利用UPGMA法进行聚类分析表明,所有材料可划分为3类,根据RAPD遗传相似系数划分的类群同地理分布有一定关系.结论 半夏种质资源在分子水平上确实存在较大遗传差异.RAPD标记可作为构建半夏DNA指纹图谱的有效工具.
关键词： 半夏 随机扩增多态性DNA技术 遗传多样性 DNA指纹图谱 -
RAPD技术在中药鉴定中的研究进展
随着分子生物学和基因工程技术的日趋成熟,通过基因工程分析手段,从遗传物质的DNA分子水平检测生物遗传多样性并进行分类与鉴定成为一个新的便捷、准确的鉴定方法.
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明党参遗传多样性的SRAP分子标记
目的:研究明党参的遗传多样性,为明党参种质资源利用提供理论依据.方法:以10个不同居群的明党参为材料,通过SRAP分析,计算各样品间的遗传相似系数,在此基础上采用UPGMA方法进行聚类,构建树状图.结果:从160个引物组合中筛选得到17个多态性引物组合,共检测到363个基因位点,其中多态性位点有314个,平均每个引物组合产生18.47个多态性位点,多态性位点百分率为86.50%,显示了较高的多态性比率;各居群遗传相似系数在0.495 9～0.818 2;根据聚类结果可将10个不同居群的明党参分为两大类.结论:明党参不同居群间具有高度的遗传多样性;不同居群的亲缘关系与其地理分布有一定的相关性.
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药用菊花遗传多样性的RAPD分析
目的:分析不同药用菊花栽培类型的遗传差异.方法:采用2%CTAB法进行药用菊花的DNA提取,并用RAPD技术对22个类型药用菊花种质资源的DNA进行检测,采用NTSYS软件对扩增结果进行统计和聚类.结果:筛选得到的26个引物共得到了233条扩增DNA片断,其中89.7%的扩增条带表现出多态性,每个引物平均可扩增得到8.04条多态性片断.聚类分析结果表明利用RAPD技术可将全部供试材料区分开.结论:药用菊花种质资源在分子水平上确实存在较大差异;药用菊花栽培类型间的差异与环境因素有关,但更大程度上由其遗传因素决定.
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不同种源高良姜遗传多样性的AFLP分析
目的:研究不同种源高良姜的遗传多样性,探求各种质间的亲缘关系,为合理利用高良姜种质资源及优良品种选育奠定理论基础.方法:采用扩增片段长度多态性(AFLP)技术,对8个种源地的高良姜进行遗传多态性分析,将扩增出的条带作为原始矩阵,用NTSYSpc-2.11F软件计算并分析高良姜种质间的相似度,构建遗传系统进化树.结果:通过筛选得到8对AFLP引物组合,共扩增出1120个DNA条带,多态性条带为1044个,多态性位点平均为92.57%;通过构建系统进化树,将8个种源地的高良姜种质分为3类.结论:高良姜种质间存在较高多态性,遗传多样性丰富.
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药用植物白术栽培群体的遗传多样性研究
目的:研究药材白术Atractylodes macrocephala 国内主要种质资源的遗传多样性,对白术种质遗传分化进行分析,为白术品种选育提供建议.方法:应用ISSR分子标记技术对来自浙江磐安3个和浙江、贵州、福建、湖北的4个白术栽培群体以及来自安徽的1个苍术栽培群体进行遗传多样性分析.结果:用12个ISSR引物对白术86个个体和5个苍术个体的DNA进行PCR扩增,共得到63条清晰的条带,其中55条为多态性条带,总多态性位点(PPL)为87.30%.7个白术栽培群体的多态位点(PPL)在58.73%～71.43%,平均为64.85%.其中,磐安县栽培群体光明表现出高的遗传变异(PPL=71.43%;HE=0.283 5,H0=0.426 7).根据POPGEN软件计算得到的群体之间的遗传距离进行聚类分析,结果显示浙江的各栽培群体有较近的遗传关系,与其他群体已存在遗传分化.AMOVA分析表明,自术种质遗传分化主要存在于栽培群体内个体间(90.52%).结论:我国栽培白术的种质遗传多样性较高,有利于培育高品质的药材.
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药用石斛遗传多样性的SRAP标记研究
目的:利用SRAP分子标记技术进行药用石斛的遗传多样性研究.方法:采用在本实验中优化的SBAP反应体系,应用NTSYS软件对9种供试石斛的SRAP-PCR结果进行分析.结果:从中筛选得到40对多态性引物组合,共产生1 782条多态性条带,平均每个引物组合产生44.55条多态性条带,显示了较高的多态性比率.聚类分析40对引物组合的扩增结果,供试材料分为2大类,Jaccard's遗传相似系数在0.330 2～0.789 2.结论:SRAP技术可有效地应用于药用石斛的遗传多样性及亲缘关系的研究.
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半夏种质资源遗传多样性的SRAP分析
目的:利用SRAP标记技术对全国不同产地和表型的半夏居群进行了遗传多样性分析.方法:从80对引物中筛选出14对合适的引物进行半夏不同居群的SRAP分析,用SPSS 16.0软件分析,建立Jaccard相关系数矩阵,构建遗传树系图.结果:14对SRAP引物共扩增出171条带,多态位点百分率为15.8%,35个半夏居群中表型先于产地聚类在一起.结论:SRAP标记适合于半夏的DNA遗传多样性分析;在半夏种质资源划分上产地较表型更为重要.
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迁地保护黄檗群体的遗传多样性评价
目的:评价迁地保护黄檗群体的遗传多样性水平.方法:利用8对荧光引物,对10个迁地保护黄檗群体共计67株个体进行AFLP分析.结果:共扩增1 574条谱带,其中多态带1 354条;黄檗物种水平的遗传多样性高于迁地保护群体水平,多态位点百分率PPL分别是86.02,41.55,有效等位基因数Ne分别为1.427 5,1.237 6,Nei基因多样性指数H分别是0.231 2,0.140 0,Shannon信息指数I分别是0.397 3,0.211 3.结论:初步评价了黄檗迁地保护效果.
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银杏不同变异类型的RAPD指纹研究
目的:分析银杏变异类型的遗传分化及其遗传多样性水平.方法:用随机扩增多态性DNA(RAPD)标记方法对28个银杏变异类型进行遗传多样性检测和遗传分析.结果:供试银杏样品之间遗传多样性水平较低,遗传关系较近.结论:开发银杏种质资源时,首要任务是扩大银杏的自然变异率,并在此基础上,通过无性繁殖的方式,选育药用银杏新品种.
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半夏不同居群3种化学成分的动态比较研究
目的：通过对不同半夏居群3种化学成分的比较研究，以期为半夏遗传多样性的研究提供依据。方法：以3种化学成分为检测指标，对栽培在同一生境下的6个半夏居群进行了动态比较分析。结果与结论：半夏各居群间β-谷甾醇、缬氨酸及精氨酸含量存在着很大的差异，不同采收期其含量也存在有较大的差异，但从3种成分的平均含量来看，各居群均以秋收者为高。
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药用金荞麦遗传多样性的RAPD分析
目的:对野生金荞麦进行遗传多样性研究.方法:通过RAPD技术对7个野生金荞麦居群共87个个体进行遗传多样性分析.结果:用12个随机引物共扩增出85条清晰条带,其中75条具多态性,平均多态性位点比率为88.24%,Nei's基因多样性指数H=0.310 3,Shannon多样性指数I=0.563 2,遗传分化指数G_(st)=0.192 4.结论:金荞麦种内具有较高的遗传多样性,遗传变异主要存在于居群内部,遗传多样性与地理关系表现出明显的相关性.RAPD可以作为研究遗传多样性及遗传分化的有效标记.
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野生地黄种内遗传多样性的RAPD,ISSR分析
目的:分析野生地黄群落之间的遗传差异类型,比较RAPD和ISSR分子标记在分析地黄野生种质遗传多样性中的应用.方法:应用RAPD和ISSR分子标记技术,对55份地黄材料进行了遗传差异分析.结果:平均每条RAPD引物扩增出16.00条带,平均每条ISSR引物扩增出19.08条带,多态性位点百分率分别为89.58%和94.32%;聚类分析表明,55份地黄分成7大类群.结论:野生地黄具有丰富的遗传多样性;不同地理居群的相似性为0.63～0.98;ISSR标记比RAPD标记能检测到地黄种内更高的遗传差异性.
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地黄不同品种遗传关系的RAPD分析
目的:揭示地黄不同品种的亲缘关系和遗传特点.方法:采用RAPD技术和群体遗传学的分析方法,对地黄16个栽培品种、2个野生居群共54个个体进行了亲缘关系、遗传多样性和遗传结构分析.结果:邻接法构建的多数一致树将54个地黄样品划分为3个明显的类群;Popgene和AMOVA分析均显示地黄品种间的遗传分化大于品种内;类群II所包含的各品种未表现出明显的遗传分化.结论:长期的无性繁殖为地黄积累了一定的遗传分化,野生地黄与栽培品之间遗传距离较大,但在主要栽培品种中遗传分化不明显,显示遗传背景较为单一.野生地黄作为地黄的育种资源应给予充分重视和研究.
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半夏种内不同居群花粉粒形态比较研究
目的:研究半夏不同居群的花粉粒形态特征,以便为进一步研究半夏的遗传多样性提供孢粉学资料.方法:借助扫描电镜对栽培在同一生境下的18个半夏居群的花粉形态、大小及表面纹饰等特征进行观测比较.结果与讨论:半夏各居群的花粉粒大小存在较大的差异:17个有珠芽半夏居群花粉粒的平均值为17.42 μm×14.86μm,其中花粉粒大的姜堰居群为20.43 μm×18.16μm,而小的沛县居群仅有15.23 μm×12.82 μm,灵谷寺无珠芽半夏居群的花粉粒大小明显小于所有有珠芽半夏居群,仅有13.23 μm×11.98 μm;各半夏居群花粉粒表面均具刺状突起,但刺的长短、疏密及刺端和刺基变化因居群不同而有所不同;半夏花粉粒可能为有孔盖萌发孔类型.
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半夏种内不同居群生长节律的研究
目的：通过对在同一栽培条件中的不同半夏居群的生长节律观测比较，以期为半夏遗传多样性的研究提供依据。方法：采用田间试验的方法对16个半夏居群生长节律进行了连续两年的平行比较观测。结果与结论：半夏各居群在出苗、展叶、抽薹及倒苗期等生长节律方面存在着差异：大部分半夏居群在本试验栽培条件下具明显的3次出苗和3次倒苗现象，并且在年生长期内表现出春秋两个生长高峰期;从抽薹开花时间看，大部分居群在5月有1个抽薹开花高峰期，但具体起始和延续时间各居群间存在着较大的差异。其中以引自于江苏句容的半夏居群抽薹早，且具“先花后叶”特性。
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孑遗植物杜仲的遗传多样性RAPD分析和保护策略研究
目的:进行杜仲群体遗传多样性的研究.方法:采用随机扩增多态DNA(RAPD)方法对杜仲的16个群体、260个个体进行遗传多样性分析.结果:用10个随机引物共扩出110条清晰条带,其中多态性条带为106条,总的多态位点百分率为96.36,平均多态位点百分率为38.92.Nei's基因多样性指数H=0.246 1,Shannon's多态性信息指数I=0.386 8.基因分化系数Gst=0.424 4.结论:杜仲种内具有丰富的遗传多样性,而不同群体内部的遗传多样性低.遗传分化分析表明杜仲群体间已发生了高度的遗传分化,因此,生物多样性保护时应尽可能保护更多的种群.
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雷公藤属3种植物遗传关系与遗传多样性的RAPD分析
目的:阐明雷公藤属植物的遗传关系和遗传多样性.方法:用RAPD分子标记方法研究来自雷公藤属植物3个种4个类型24个居群的110个样本.结果和讨论:从100个随机引物中筛选出10个引物,得到128条带,其中多样性条带123个,占96%.通过聚类分析可以看出,东北雷公藤明显与其他种有显著的遗传差异;中间类型和雷公藤的关系较与昆明山海棠的关系更密切,但中间类型和雷公藤之间也有明显的遗传分化,且中间类型呈现较雷公藤复杂的遗传多样性,不同的中间类型居群与雷公藤的关系远近不同.大量的中间类型的存在,连接了昆明山海棠与雷公藤这2个种,从分类上建议将2个种合并.将除去东北雷公藤的其他居群作为一个整体分析,居群间分化明显,遗传多样性主要存在于居群间,因此应当收集不同来源的种质以保存尽可能多的遗传多样性.
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参薯种质遗传多样性的ISSR分析
目的:研究参薯亲缘关系和遗传多样性.方法:收集20个样品并对其原植物进行鉴定,样品进行ISSR分析,NTSYS-pc计算遗传相似系数,UPGMA方法聚类.结果:20个样品被鉴定为参薯、褐苞薯蓣、山薯.参薯与褐苞薯蓣、山薯存在明细的遗传差异,且其种内差异十分显著,遗传相似性系数为0.672 9～0.990 7.UPGMA聚类显示参薯种内16个样品可划分为4组,对照样品原植物表型特征,可见断面颜色及块茎支根数是评价参薯种质亲缘关系的重要依据.结论:参薯种内遗传多样性水平高,研究为山药区分提供了分子生物学依据,也为参薯新品种选育奠定了基础.
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夏枯草种质资源遗传多样性的AFLP分析
目的:通过对8份夏枯草种质资源的AFLP分析,探求各种质间的遗传多样性.方法:采用扩增片段长度多态性(AFLP)标记,在DNA水平上进行遗传多样性研究,筛选了32对选择性扩增引物,将扩增出的条带作为原始矩阵,用NTSYS-PC软件计算并分析了夏枯草种质间的相似度,构建了遗传系统进化树.结果:①SDS法提取的夏枯草基因组DNA质量较佳,能够满足AFLP分析的要求;②从32对选择性扩增引物中,筛选出10对多态性较强、带型较好、分辨率较高的组合;③构建了夏枯草AFLP指纹图谱,将8个夏枯草种质全部区分开来;④通过构建进化树,把8个种质分成3类.结论:夏枯草种质资源有丰富的遗传多样性,某些形态特征差异和基因型存在相关性.
