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几种常见吸虫的分子系统发生学研究
目的研究日本血吸虫、卫氏并殖吸虫、华支睾吸虫、布氏姜片吸虫和肝片形吸虫分子系统发生学的关系.方法利用PCR技术特异性扩增日本血吸虫、卫氏并殖吸虫和华支睾吸虫核糖体小亚基(18SrDNA)的V4区基因并测序.根据Genebank,检索布氏姜片吸虫和肝片形吸虫的相关序列,并与上述3种吸虫的V4区基因序列进行排列比较,计算它们的遗传距离并构建系统发生树.结果日本血吸虫与其他吸虫的遗传距离远>其他吸虫之间的遗传距离,在分子系统发生树中,日本血吸虫单独形成一个支系,其他吸虫形成另外一个支系.结论日本血吸虫与其他吸虫的亲缘关系较远,它们可能来自不同的祖先.
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不同地域株华支睾吸虫基因差异的研究
目的 探讨湖北、广东、辽宁和韩国4地华支睾吸虫的基因差异,为华支睾吸虫种下分型提供依据.方法 取湖北、广东两地的华支睾吸虫,提取基因组DNA,PCR特异性扩增18S rDNA V4区并测序;登陆GenBank,检索中国辽宁(AF217100)和韩国(AF408144)的华支睾吸虫18S rDNA的登录序列,应用系统发生学分析法对所有序列进行排列比较,分析4地华支睾吸虫的基因差异,并构建系统发生树,分析其亲缘关系.结果 获得的湖北和广东两地华支睾吸虫18S rDNA V4区的碱基数分别为392 bp和440 bp.通过对18S rDNA V4区基因序列的比较与进化树的构建,证实4个地域株华支睾吸虫的18S rDNA V4区具有较高的同源性(98%～100%),彼此间遗传距离较小(0～0.013);在系统发生树中,湖北株和广东株华支睾吸虫形成一个支系,韩国株和辽宁株华支睾吸虫形成另外一个支系.结论 以18S rDNA V4区为分子标记的DNA序列分析表明,湖北、广东、辽宁和韩国4地华支睾吸虫存在基因差异,但亲缘关系较近,即起源于共同的祖先.
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日本结核分枝杆菌北京家族株的系统发生学与基因学特征
为评价目前在日本流行的结核分枝杆菌的基因结构特征,对从全日本结核病患者中分离到的237株北京家族株进行了系统发生学的研究.与之前来自于其他国家的报道不同,古老亚型菌株是日本的主要流行株.成簇分析建立在JATA-VNTR(日本防痨协会随机重复序列的可变数目)的基础上,这种方法可以描述日本结核分枝杆菌菌株的独特的VNTR方法,结果揭示了现代亚型菌株间没有地域来源的区别,具有高度的相似性.JATA-VNTR方法可能对在经常分离出古老亚型菌株的菌群中进行系统发生学研究是有价值的.
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森林脑炎病毒分子生物学研究进展
森林脑炎病毒(Tick-brone encephalitis virus,TBEV)属于黄病毒科黄病毒属蜱传脑炎血清亚组成员.TBEV根据系统发生学分为欧洲亚型、远东亚型、西伯利亚亚型三个亚型,前者主要经蓖籽硬蜱传播,后两者主要经全沟硬蜱传播.TBEV流行于欧洲、前苏联、日本、中国,在我国东北的长白山、大小兴安岭及云南、新疆均有森林脑炎自然疫源地存在的报道[1,2].近几年TBEV在分子生物学方面研究进展很快,现就这方面进展作一综述.
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湖北地区22例宫颈癌组织中HPV16型LCR基因变异特点分析
目的:研究人乳头瘤病毒(HPV) 16型LCR基因在湖北地区部分宫颈癌组织中的变异特点,通过系统发生学分析探讨宫颈癌患者感染的HPV16型变异株的流行型别及特征.方法:从22例宫颈癌手术切除标本中提取组织DNA,用HPV16 LCR特异性引物进行PCR扩增,对扩增的LCR产物片段进行测序,用Paup 4.0软件使用邻接法对HPV16变异株进行系统发生学分析.结果:在22例宫颈癌组织中LCR基因存在着12个位点的基因变异.高频率突变位点有5个.其中第7 521位核苷酸由G变异为A,变异频率为100％;第7 730位核苷酸由A变异为C,变异频率为86.4％,第7 842位核苷酸由G变异为A,变异频率为77.3％,第7 714位由T变异为G,变异频率为31.8％;第7 930位核苷酸由C变异为T,变异频率为31.8％.HPV 16 LCR中的5个高频位点,均位于可与多个转录因子结合的区域.对LCR基因进行的系统发生学分析表明,湖北地区流行的HPV16病毒株主要为亚洲型(As)变异体(77.2％),其次为欧洲型(E)(22.8％),没有发现非洲-1型(Af-1),非洲-2型(Af-2)和亚洲美洲型(AA) HPV16变异体.结论:湖北地区宫颈癌组织中LCR存在着一定程度的基因变异,其中一些高频位点与国内、外报道的结果有明显差异,可能是湖北地区LCR的突变热点.
