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TaqMan-MGB荧光探针法检测北京地区幽门螺杆菌gyrA基因第87位密码子和第91位密码子耐药突变
目的 采用TaqMan-MGB荧光探针法检测北京地区幽门螺杆菌喹诺酮类耐药位点gyrA基因第87位密码子和第91位密码子突变情况,比较与药敏试验和一代测序法的一致性.方法 收集北京大学第一医院消化内科门诊尿素酶试验阳性的患者252例,所有患者均使用MGB荧光探针法和一代测序法对喹诺酮类耐药位点gyrA基因第87位密码子和第91位密码子进行检测.其中158例患者同时进行药敏试验检测,同时分析耐药位点突变发生率与耐药表型的关系.结果 158例传统培养联合药敏法检测的标本中成功培养出85例,占53.8%,其中耐药型菌株40例,敏感型菌株42例.而MGB荧光探针法成功检出155例,占98.1%,其中野生型93例,突变型62例.在药敏试验检测出的85例阳性标本中,两种方法检出的符合率为94.1%.252例标本中,一代测序法成功检测出234例,占92.9%,其中野生型160例,突变型74例.在74例突变型标本中,含gyrA基因第87位密码子突变的标本占60.8%,含gyrA基因第91位密码子突变的标本占39.2%.MGB荧光探针法成功检测出250例,占99.2%,其中野生型161例,突变型89例.在89例突变组标本中,含gyrA基因第87位密码子突变的标本占64.0%,含gyrA基因第91位密码子突变的标本占36.0%.一代测序法和MGB荧光探针法在区分是否含有突变上的符合率为95.3%.结论 TaqMan-MGB荧光探针法可快速、敏感地检测患者胃黏膜标本中幽门螺杆菌喹诺酮类耐药位点gyrA基因第87位密码子和第91位密码子的突变情况,与药敏试验和一代测序法有较高的符合性.
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用TaqMan-MGB荧光探针法检测北京地区幽门螺杆菌A2142G/A2143G耐药突变
目的 用TaqMan-MGB荧光探针法检测北京地区幽门螺杆菌克拉霉素耐药位点A2142G、A2143G突变情况.方法 收集北京大学人民医院消化科门诊尿素酶试验及病理活检均阳性的患者233例,所有患者均应用MGB荧光探针法和一代测序法对耐药位点A2142G/A2143G进行检测,其中79例患者同时进行传统培养联合药敏法检测.分析耐药位点突变发生率与患者年龄、性别和消化性溃疡的关系.结果 79例传统培养联合药敏法检测的标本中成功培养出42例,占53％(42/79),其中耐药型菌株22例,敏感型菌株20例,而MGB荧光探针法成功检出77例,占97％(77/79),其中野生型28例,突变型49例.在传统培养+药敏法培养出的42例阳性标本中,两种方法检出的符合率为86％(36/42).233例标本中,一代测序法成功检测出214例,占92％(214/233),其中野生型138例,突变型76例.在76例突变型标本中,含A2142G突变(包括A2142G和A2142G+野生)的标本占5％(4/76),含A2143G突变(包括A2143G和A2143G+野生)的标本占95％(72/76).MGB荧光探针法成功检测出231例,占99％(231/233),其中野生型141例,突变型90例.在90例突变型标本中,含A2142G突变的标本占14％ (13/90),含A2143G突变的标本占86％(77/90).一代测序法和MGB荧光探针法在区分是否含有突变上的符合率为95％ (203/214).根据MGB荧光探针法检测结果将患者分为突变组与野生组,2组在年龄和性别上差异无统计学意义(t年龄=-0.685,P=0.4 93;x2性别=0.065,P=0.890),而在消化性溃疡发生率上差异存在统计学意义(x2=6.653,P=0.044).结论 TaqMan MGB荧光探针法可应用于临床快速、敏感地检测患者胃黏膜标本中幽门螺杆菌克拉霉素A2142G、A2143G耐药位点突变情况.
