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丝甘蛋白聚糖在乳腺癌对多柔比星耐药过程中的重要性研究
目的 研究丝甘蛋白聚糖(serglycin)的表达高低是否会影响乳腺癌细胞系对多柔比星的敏感性.方法 用瞬时干扰的方法敲低丝甘蛋白聚糖在MDA-MB-231中的表达水平,且用qRT-PCR,免疫荧光的方法验证敲低效率;用MTS法测定多柔比星在阴性对照(NC)组和Si-丝甘蛋白聚糖(Si-SG)组中的IC50值,以及测定在0.018μmol·L-1多柔比星的作用下两组的增殖曲线;用克隆形成的方法观察在不同药物压力下两组克隆形成数的差异.结果 瞬时干扰的效率达到70％以上;MTS方法检测Si-SG组的IC50值以及药物压力下的增殖曲线均显著低于NC组;且在不同药物压力下的克隆形成能力也显著低于NC组.结论 在MDA-MB-231中瞬时干扰丝甘蛋白聚糖能够显著增强MDA-MB-231对多柔比星的敏感性.
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Serglycin及其与肿瘤相关性的研究进展
蛋白聚糖是一类非常复杂的大分子糖复合物.主要由糖胺聚糖(GAG)共价连接于核心蛋白所组成.丝甘蛋白聚糖(Serglycin)属于小分子蛋白聚糖家族,由SRGN基因编码的核心蛋白和丝甘氨酸重复序列和各种GAG链修组成.其主要生理功能涉及肽水解酶、炎症趋化因子类或者其他的细胞因子的储存和释放.近年来发现Serglycin和一些人类肿瘤相关,本文就serglycin和肿瘤关系的研究进展综述如下.
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基于生物信息学分析丝甘蛋白聚糖对卵巢癌耐药性的影响及作用机制
目的:研究丝甘蛋白聚糖(SRGN)对卵巢癌耐药性的影响及作用机制.方法:采用基因表达谱交互分析工具(GEPIA)提取卵巢癌相关数据集并分析SRGN mRNA在人类正常卵巢组织与卵巢癌组织的表达差异;基于基因表达数据库(GEO)获取SRGN mRNA在顺铂敏感性与顺铂耐药性卵巢癌细胞株(A2780)中的表达差异;采用STRING在线数据库筛选SRGN的互作蛋白(置信度为0.900,联结数为10),然后通过生物学信息注释数据库(DAVID)进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)代谢通路分析,预测SRGN调节卵巢癌耐药性的潜在通路;采用医学本体信息检索平台COREMINE挖掘SRGN、卵巢癌、耐药性三者显著关联的生物过程.结果:SRGN mRNA在卵巢癌组织中的表达显著高于正常卵巢组织(P<0.05),在顺铂耐药性卵巢癌细胞株中表达显著高于顺铂敏感性卵巢癌细胞株(P<0.001).筛选出10个与SRGN互作的蛋白,包括白蛋白、转化生长因子β1、血小板因子4、血纤维蛋白溶酶原、血管内皮生长因子A等;SRGN参与调节卵巢癌耐药性的KEGG代谢通路有缺氧诱导因子1α信号通路、细胞因子-细胞因子受体通路、凝血与补体级联反应信号通路等,生物过程有基因表达、细胞生长、凋亡过程、细胞死亡.结论:SRGN介导卵巢癌耐药可能与缺氧诱导因子1α信号通路、细胞因子-细胞因子受体通路等有关.
