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肥胖者唾液微生物宏基因组学特点
目的:探讨肥胖者口腔唾液微生物的特点,比较肥胖者与正常体重者口腔唾液微生物组成、基因功能及代谢通路上的差异.方法:研究纳入无全身系统性疾病、无牙周炎及口腔黏膜病的肥胖者及性别、年龄相匹配的正常体重者,收集研究对象的非刺激性唾液.提取唾液样本DNA,用高通量测序方法进行宏基因组分析,结果经数据质控后进行物种分类及注释,差异物种线性判别分析(linear discriminant analysis, LDA),基因预测,基因集构建和功能注释分析.结果:过滤后每个样本得到可分类的、细菌的DNA序列平均条数为2 630 428.唾液微生物群落共包括11个菌门、19个菌纲、26个菌目、41个菌科、62个菌属和164菌种.肥胖组与正常体重组微生物群落的优势菌门相同,为变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和梭杆菌门,两组在纲、目、科、属、种等分类水平上均发现相对丰度差异具有统计学意义的物种.在纲水平上,Negativicutes纲和丹毒丝菌纲(Erysipelotrichia)丰度在肥胖组中的相对丰度高于正常体重组(P<0.05),黄杆菌纲(Flavobacteriia)和Bateroidetes纲在肥胖组中的相对丰度低于正常体重组(P<0.05).9个菌属在两组间丰度差异具有统计学意义;种水平上,16个菌种的丰度差异具有统计学意义,其中产黑色素普雷沃氏菌(Prevotella melaninogenica)、唾液普雷沃氏菌(Prevotella salivae)、Solobacterium moorei和极小阿托波氏菌(Atopobium parvulum)等在肥胖组中相对丰度高于正常体重组(P<0.05),而血链球菌(Strepto-coccus sanguinis)在正常体重组中相对丰度高于肥胖组(P<0.05).对基因预测结果进行分析,发现肥胖组样本基因数目较正常体重组多,差异有统计学意义(P<0.05),其中与营养和能量代谢、环境信息处理、人体疾病等通路相关的基因在肥胖组唾液样本中显著富集(P<0.01). 结论:肥胖者与正常体重者的口腔唾液微生物在物种组成、基因数目及代谢通路上均存在差异,值得今后扩大样本量进一步研究.
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儿童复发性腮腺炎患者与正常儿童腮腺液微生物群落多样性的差异
目的 通过检测儿童复发性腮腺炎患者与正常儿童腮腺液的微生物群落分布的变化情况,分析二者之间微生物群落多样性的差异.方法 通过使用Illumina Hiseq 2500 PE250高通量测序平台对34例儿童复发性腮腺炎患者和16例正常儿童腮腺液标本中微生物群落的16SrRNA进行多样性分析,并对两组样本数据进行统计比较.结果 与正常儿童腮腺液对比,儿童复发性腮腺炎患者腮腺液Alpha多样性指标中样品文库的覆盖率(goods_coverage)增高(P＜ 0.05),Chaol、菌群丰富度指数(abundance coverage estimator, ACE)、Shannon指数降低(P＜0.05 ) ,simpSOn指数差异无统计学意义.结论 儿童复发性腮腺炎患者腮腺液微生态环境中微生物群落的多样性与正常儿童腮腺液差异有统计学意义.
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应用PCR与温度梯度凝胶电泳分析龈上菌斑微生物群落
目的应用PCR与温度梯度凝胶电泳(PCR-TGGE)分子技术对成年健康口腔的龈上菌斑中微生物群落组成进行分析.方法8例成年个体包括4男4女,年龄19～29岁,分别采取每例个体上下颌牙周龈上菌斑样品,共18份(个体Subl间隔10天采集2次样品).提取菌斑DNA,PCR扩增16S rDNA V3可变区,产物经TGGE后进行相似系数分析.结果同一个体的上下颌微生物群落组成相似性系数为81%～95%,而不同个体的龈上菌斑微生物群落组成相似性系数,均在60%以下.结论不同个体具有其独特的牙周微生物群落,而且在一定时期内组成稳定.
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变性梯度凝胶电泳技术及其在口腔微生物检测中的应用
口腔微环境是细菌适宜的栖息地,大约有七百余种细菌,构成了一个复杂多样的微生态系统[1].其中某些微生物是导致龋病、牙髓病、牙周病等口腔常见感染性疾病的主要病原菌,准确快速检测口腔微生物群落的多样性和动态性,进而探明导致这些疾病发生发展并影响预后转归的微生物特性成为预防及治疗口腔疾病的重中之重.
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龋病相关微生物群落结构与功能的多组学研究进展
龋病作为一种感染性疾病,口腔微生物群落在其发生发展过程中的具体作用机制尚无定论.高通量测序技术及宏组学技术的应用为龋病病因研究和龋病的微生态防治提供了新的思路.本文从与龋病相关口腔微生物群落的基因组学、宏基因组学、宏转录组学、宏蛋白质组学及宏代谢组学等方面的研究进展进行综述.
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口腔微生物群落在口腔与全身疾病预警中的作用
口腔微生物群落是指定植于人体口腔的微生物集合,多以生物膜形式行使微生物生理学功能.当微生物群落与宿主间生态关系失衡时,可诱发多种口腔感染性疾病,包括龋病、牙髓根尖周病、牙周病、智齿冠周炎、颌骨骨髓炎等,严重危害口腔健康.更为重要的是,口腔微生物群落与口腔肿瘤、糖尿病、类风湿性关节炎、心血管疾病及早产等系统性疾病紧密相关,口腔微生物群落结构特征可作为口腔及全身健康预警的重要标记.随着"人类微生物组计划"及其他微生物宏基因组学相关项目的开展,人们对口腔微生物群落的认识不断深入,已获得了海量大数据信息.在"后微生物组计划"时代如何有效地将微生物群落大数据转化为具有实际运用价值的临床诊疗手段,进而为患者提供有效的个体化医疗服务将是推动口腔疾病乃至全身疾病"精准医疗"的重大前沿问题.本文拟从常见口腔及相关系统性疾病微生物群落研究进展入手,阐述口腔微生物群落信息在疾病发生、发展及预后预警中的作用,提出建立基于口腔微生物群落疾病预警系统的必要性,为实现口腔疾病及相关系统性疾病的个性化诊疗提供新的思路.
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口腔微生物与肿瘤关系的研究进展
口腔幽门螺杆菌与胃部肿瘤关系的研究，引发了对口腔微生物与肿瘤之间关系研究的热潮。本文从口腔幽门螺杆菌与胃部肿瘤的关系，口腔微生物群落与口腔鳞状细胞癌的关系，以及人类免疫缺陷病毒感染患者口腔微生物群落与肿瘤的特殊且密切的关系三个方面对口腔微生物群落与肿瘤之间的关系进行综述，对口腔微生物与肿瘤关系的进一步研究提供参考，以实现通过检测口腔微生物对肿瘤患者进行早期诊断，甚至辅助治疗的目的。
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木糖醇口香糖咀嚼时间对口腔微生物群落的影响
目的：研究咀嚼木糖醇口香糖时间长短对口腔常见细菌的影响。方法：纳入60名年龄在18～22岁口腔健康志愿者，随机分为3组（n＝20）。 A组于午餐后咀嚼木糖醇口香糖45 min；B组于午餐后咀嚼等剂量同品牌木糖醇口香糖15 min；C组（对照组）午餐后不咀嚼口香糖。于咀嚼口香糖3周后收集唾液，接种于BHI、MSB、Rogosa培养基平板，计数总菌落与主要条件致龋菌的数量，评估咀嚼口香糖时间长短对口腔微生物群落的影响。结果：咀嚼木糖醇口香糖组口腔微生物水平低于对照组（P＜0．05）），但咀嚼口香糖时间长短对口腔微生物水平的影响无统计学差异。结论：咀嚼口香糖15 min即可达到良好口腔清洁效果，延长咀嚼时间并不能显著增强其对龋病相关微生物的清除作用。
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口腔微生物群落在口腔与全身疾病预警中的作用
目的：探究分析口腔微生物群落在口腔与全身疾病预警中的作用。方法：调查分析2013年12月--2014年12月在我院就诊的400例患者，分析其病历资料，总结相关规律。结果：口腔微生物群落与牙周病、龋齿、口腔癌、早产、牙髓根尖周病、心脑血管疾病的发生减具有相关联系。结论：口腔微生物群落和口腔与全身疾病具有密切联系，其预警作用可在临床中作为重要参考。
