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基因微阵列技术和炎症性关节炎
基因微阵列(microarray)检测技术伴随着对人类基因组及其编码的蛋白的相关结构和功能的深入研究,从初基因的cDNA微阵列,到蛋白微阵列技术等正在迅速发展和广泛应用.我们知道,大多数生物学过程是一个涉及疾病相关基因的识别、量化和蛋白质分子相互作用的复杂网络[1,2],关于基因功能分类的研究也已经存在,如在组织相容性抗原(MHC)和免疫球蛋白系列已较系统和深入.
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近交系小鼠C57BL/6和C57BL/10的转录组差异研究
目的:对近交系小鼠C57BL/6和C57BL/10进行转录组测序,对比其转录组差异,发现免疫反应相关差异基因,为药物体内活性评价动物选择提供参考.方法:采用Illumina Hiseq 2000测序平台进行测序,通过短序列分析获取转录本,通过基因功能分类(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库进行测序结果分析.结果:获得38 553 614个C57BL/6小鼠的原始序列和37 721 318个C57BL/10小鼠的原始序列.获得118 002个转录本,注释了46 193个差异基因.38 106个转录本注释到2 196个GO分类中,GO分类主要分为3类:细胞成分,分子功能和生物过程.1 600个转录本注释到254个KEGG通路中.另外,发现了4 651个单核苷酸(SNP)位点.结论:通过二代测序方法发现近交系小鼠C57BL/6和C57BL/10转录组存在显著差异基因.在KEGG通路分析中筛选了一系列与小鼠免疫应答相关的差异基因,为建立小鼠免疫评价模型积累了数据,对药物实验动物体内活性检测分析具有参考意义,为生物制品评价用实验动物的标准化提供技术支撑.