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肝癌的规律已被发现
刘连新博士(哈尔滨医科大学)采用国际上先进的微阵列技术(一种新兴的分子生物学技术),初步摸清了肝癌的发病、发展规律。其中部分基因规律为国际上首次发现。刘博士根据肝部588种基因的变化,掌握了一个较为系统的肝部基因变化谱。通过对P53等基因的观察可以预测出某人有无患肝癌的可能性;通过观察“血清播散因子”变化,可以预测出所患的肝癌是否容易转移;从E2F基因的变化,可以更准确推断出肝癌患者的存活年限。 该方法亦为肝癌的早期诊断提供了更为准确的分子标志。 (林广棣摘自 科技文摘)
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应用微阵列技术初步探讨间变性星形细胞瘤基因表达谱
间变性星形细胞瘤为星形细胞起源的恶性肿瘤(WHOⅢ级),占脑肿瘤的26.6%,既可以是原发,也可由低度恶性星形细胞瘤发展而来[1].我们拟应用微阵列技术对该肿瘤的差异表达进行初步探索.
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组织微阵列及其在肿瘤病理研究中的应用
2000年6月底公布人类基因组工作草图后,基因研究的重点已从结构转向功能,即后基因组时代.今年2月公布的整理后的基因草图序列[1],初步认定人类约有3万个左右的基因,大大少于原来约有10万个基因的估计.由于一个基因可以编码不同的蛋白,所以基因编码产物数量要多于基因数.对于数万个基因的功能研究,分析其复杂的表达方式以及基因间相互作用、相互调节的关系,其艰巨性和对阐明生命活动过程的重要意义将超过人类基因组计划.面对如此艰巨、复杂的工作,传统的基因功能研究方法已无法满足,由此出现了一系列的新技术、新方法,微阵列技术(microarray technology)便是这些革命性新技术之一.微阵列技术是在一小片固相载体上储存大量的生物信息,含有大量生物信息的固相基质称之为微阵列,又称生物芯片(biochip),根据储存生物信息的类型,可分为寡核苷酸微阵列(DNA芯片),cDNA微阵列(cDNA芯片),蛋白质微阵列(蛋白质芯片)和组织微阵列(tissue microarray,组织芯片).在此就组织微阵列研究进展和应用作一介绍.
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微阵列技术诊断神经系统细菌感染
微阵列技术以高通量、大规模、微型化和平行化的显著特点,已越来越多地应用于人类疾病诊断.我们在细菌的16S rRNA基因内设计了一套保守的通用引物,并对脑脊液常见病原菌各设计了2条特异性探针,建立了膜微阵列技术平行检测脑脊液病原菌DNA的方法,在对标准菌株进行检测鉴定的基础上,又对34株脑脊液临床分离株进行了鉴定,其结果可靠,而且仅用5?h即可鉴定出菌种,具有一定的现实意义.
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晚发性阿尔茨海默病全基因组关联研究进展
阿尔茨海默病(Alzheimer disease,AD)是常见的神经退行 性疾病.临床表现为进行性学习记忆功能障碍和其他认知功能 损害.临床上以晚发性阿尔茨海默病(late-onset AD,LOAD)为 主.研究认为,LOAD 的发生是由于遗传、环境和免疫等多种因 素导致,其中60% ~80%发病危险和基因异常相联系[1] .载脂 蛋白E4(apolipoprotein E4,ApoE4)是目前惟一确定和LOAD 发 生相关的易感基因,ApoE4 基因携带者的LOAD 发病率是非携 带者的2 ~4 倍[2] .但是ApoE4 并不能解释所有的LOAD 的发 生,一种复杂疾病的发生大都是多基因的低频变异逐渐累积而 成的.以往常规的筛选候选基因的研究方法很难发现这些大量 低频变异位点.随着微阵列技术的发展,全基因组关联研究 (genome-wide association studies, GWAS) 可以帮助解决这个 问题[3] .
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悬浮微阵列技术检测乳腺癌细胞八种癌基因的评价
研究发现乳腺癌患者死亡与早期肿瘤转移密切相关[1].早期转移系直径<2 mm的恶性肿瘤转移灶,包括单个肿瘤细胞和组织中的微小转移[2].由于取材限制,目前研究主要集中在前哨淋巴结、血液、骨髓等方面.而外周血循环肿瘤细胞具有原发肿瘤的特征,乳腺癌循环肿瘤细胞检测对乳腺癌的早期诊断,复发转移诊断,以及指导术后治疗等意义重大[3].本研究采用悬浮微阵列技术同时检测乳腺癌细胞多个基因表达水平,以便为乳腺癌早期转移的多基因联合检测的临床应用研究奠定基础.
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固定的人白细胞分化抗原45单克隆抗体在人白细胞捕获效率研究中的佳试验因素分析
固定化抗体与相应细胞表面抗原结合常用于造血干细胞分选,白血病免疫分型,及磁性微球在血液病中的应用等.但均不能满足高通量分析与研究的要求.我们已用蛋白质微阵列技术研究多克隆抗体检测RBC的价值[1],但鲜见固定单克隆抗体检测WBC的研究报道.人白细胞分化抗原(CD)45为WBC表面共同抗原,我们通过观察固定CD45单克隆抗体与WBC结合效果,找出佳试验条件,为WBC检测及分型的蛋白质微阵列芯片研制和应用奠定基础.
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免疫芯片研究的现状及未来
生物科学正迅速演变为一门信息科学,微型化分析系统正在对21世纪的生命科学形成强有力的冲击,其中有代表性的是生物芯片技术[1-4].综观生物芯片的发展,以微阵列技术为基础的检测用生物芯片的发展为迅速[5-7].如基因微阵列检测芯片和蛋白质微阵列检测芯片[8-10].基因芯片已广泛应用于生物基础研究及临床医学各领域.随着人类基因组计划测序工作的完成,即将进入后基因组时代,对更加复杂的蛋白质功能研究,迫切需要蛋白质芯片技术.
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微阵列技术及其在消化系疾病研究中的应用进展
微阵列技术是近年来兴起的一项前沿生物技术,他利用分子杂交的原理,将生物学中许多不连续的分析过程,移植到固相的递质芯片上,进行样品的多方位分析,首次提供了高通量或平行监测基因表达变化和功能的新方法.已广泛应用于基因表达分析、新基因发现及功能研究、基因组文库作图、基因突变及多肽性分析、疾病诊断、药物筛选、基因测序等领域.利用基因微阵列研究消化系统疾病将会有助于从整体水平上认识疾病发生中相应的分子事件,更深刻地了解消化系肿瘤与疾病的基因变化路径和机制.本文综述了微列阵技术原理及近年来在消化系疾病研究中的应用.
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脂肪组织分泌功能研究新进展
长期以来,脂肪组织一直被认为是仅供能量贮备的终末分化器官.然而,随着瘦素(leptin)、脂肪源性的肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、脂联素(adiponectin)和抵抗素(resistin)等的发现,脂肪组织的分泌功能及其在肥胖、胰岛素抵抗(IR)和2型糖尿病(T2DM)发病机制中的作用已倍受关注.鉴于上述多种脂肪细胞因子的相继发现,已有学者提出脂肪组织是一个内分泌器官[1].为全面了解脂肪组织的分泌功能,我们率先以cDNA微阵列技术建立了人腹腔内脏脂肪组织的基因表达谱.首次发现60种分泌蛋白和88种受体蛋白在内脏脂肪组织表达,并鉴定出脂肪组织内的8个新的自分泌或旁分泌系统[2].脂肪组织表达的众多分泌蛋白中,多数是通过自分泌或旁分泌的方式发挥作用.本文主要就部分脂肪细胞因子的研究热点及重要进展作一阐述.
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基因探针与表达序列标签微阵列技术在心血管疾病分子研究中的应用
DNA微阵列(DNA microarray)是近20年来发展起来的一项多学科交叉、应用杂交原理进行分子分析的生物检测技术.虽然历史较短,但在生命科学的诸多领域已显示出巨大的潜力和诱人的前景[1,2].
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DNA微阵列在乳腺癌研究中的进展
乳腺癌是危害女性生命健康的一大杀手,全世界每年约有120万女性患乳腺癌,50万人死于乳腺癌.我国属于乳腺癌低发地区,但近年来的发病率有明显增长趋势,在一些城市如北京、天津、上海已居女性恶性肿瘤发病的首位,随着基因研究的深入,许多同乳腺癌发生发展相关的基因被发现并逐渐应用于临床工作,但仍不能解释个体之间在乳腺癌进展过程及对治疗反应等方面存在的差异,无法从根本上解释肿瘤细胞以及正常细胞内复杂的细胞信号转导通路.微阵列技术因其具有大规模、高通量、平行处理等优点,目前被广泛应用于医学研究,特别是肿瘤研究领域,在乳腺癌方面的研究也初显成果,现综述如下.
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使用微阵列分析胎儿先天性心脏缺陷的产前基因诊断
本文发表在2011年10月的《Prenatal Diagnosis》杂志上.微阵列技术具有高分辨率、高通量和高准确性等优点,已成为一种重要的工具,用于产前、产后和植入前诊断染色体亚微结构异常.
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基因芯片技术更有利于揭秘死产的原因
本文标题为"Karyotype versus Microarray Testing for Genetic Abnormalities after Stillbirth",与前一篇论文一起发表于2012年12月第367卷的《新英格兰医学杂志》上.来自于得克萨斯大学医学分校的研究者使用基因芯片微阵列技术对死产婴儿的染色体进行分析研究,研究表明这种微阵列技术相比过去的核型分析技术更为有效.
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芯片技术及其在医学遗传染色体异常诊疗中的应用指南
1 简介随着比较基因组杂交芯片以及单核苷酸多样性微阵列分析等微阵列技术在临床上的应用,实验室对于患者在发育迟缓/智力障碍(DD/ID)、先天畸形以及异形的评价体系在近几年产生了很大的变化.患者基因组中无法用经典G显带方法检测的小缺失和小重复,现在都能用这些方法检测到.由于这些年全基因组拷贝数微阵列技术在临床应用的日渐广泛,我们在这里对相关指南进行更新.
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“高解析度微阵列技术在超声诊断的胎儿畸形中的应用”点评
论文核心内容及点评
该文章于2014年2月发表在《Australian andNew Zealand Journal of Obstetrics and Gynaecology》上。该研究中,澳洲的学者们用高解析度的微阵列技术对产前超声发现胎儿异常的病例进行检测,从而评估微阵列技术在产前诊断的应用价值。 -
线粒体DNA定量和缺失检测及其与肿瘤发生的关系
目的研究线粒体DNA(mtDNA)与肿瘤发生的关系,提供一种可以对mtDNA进行快速、准确的定量和缺失检测的方法.方法利用改进的PCR方法对2例正常人外周血白细胞及5例胃癌患者癌组织进行线粒体基因组的全序列(16 569 bp)扩增,同时标记荧光素;然后用聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染加以证实.设计出17对叠加引物扩增mtDNA探针,用芯片点样仪将其点到经过氨基化的玻片上,制成芯片,杂交.GeneTACTM激光扫描仪扫描芯片得出扫描图像,后用ScanAnalyzer得出阵列数据,对mtDNA拷贝量准确定量.结果扩增的17对探针经聚丙烯酰胺凝胶电泳银染显示,设计合理,特异性高.改进的PCR方法对线粒体全基因组的扩增效率高,银染后结果显示,杂带少,特异性强,产量丰富.芯片杂交后扫描图像清晰、背景低;阴性探针信号接近背景信号,两者间差异无显著性(P>0.05).实验结果与设计的实验完全符合,对同一血白细胞和胃癌组织样本的多次杂交后数据分析得出,同一样本同一阳性探针数据间差异无显著性(P>0.05),而两种样本间数据差异显著(P<0.01).杂交信号稳定,数据分布集中(均值两侧一倍标准差范围内),显示了非常好的可重复性.结论已知mtDNA的大片段或整个基因组的缺失,以及拷贝数量的改变与肿瘤发生有一定的关系,微阵列技术方法经反复实验证实具有非常好的可重复性,可以快速、准确、大通量地检测出肿瘤患者是否存在特定的mtDNA缺失及拷贝量的改变,有助于mtDNA与肿瘤关系的进一步研究.
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微阵列技术在肿瘤研究中的应用
微阵列技术 (microarray)又常称为微排列或微点阵,目前新兴的DNA芯片 (DNA chip)即是微阵列中主要的一种,微阵列与 DNA芯片二者的名词常混用.微阵列根据其在固相载体上排列的探针不同,可大致分为两类:一类是 cDNA或寡核苷酸微阵列 (cDNA microarray);另一类是组织微阵列(tissue microarray).肿瘤的发生、发展涉及多个基因的改变,由于技术上的不足和缺陷,在肿瘤的基因表达和基因间相互作用的研究上,不但费时费力,而且事倍功半,长期停留在零敲碎打的水平上.自1995年微阵列技术问世以来,人们立即将其应用于肿瘤研究,并取得了许多重要进展,为人类终揭示肿瘤的发生、发展规律带来了新的希望和可能.
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蛋白质和抗体微阵列技术进展
为了进行复杂样品的特征分析,人们必须重视对蛋白质组的特征研究.蛋白质和抗体微阵列技术作为二维凝胶电泳-质谱技术的补充,是筛选复杂蛋白质样品适宜的两项技术.然而,蛋白质和抗体微阵列技术还必须克服目前的局限性以获得成功.本文对这些新技术进行了介绍并强调了它们目前的发展前景和缺点.
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基因组学及相关组学技术对药物毒理学的影响
随着对基因组结构和功能认识的深入和有效的分析细胞整体基因、蛋白和代谢物表达状况等技术的发展,产生了毒理学新分支"毒理基因组学".本文就基因组学技术对这一传统学科发展的影响作一概述.