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上海地区H9N2亚型禽流感病毒的遗传演化分析
为阐明上海地区 H9N2亚型禽流感病毒分离株的遗传变异、分子特征和重组模式，选取2002和2006～2014年分离自活禽市场、家禽养殖场和生猪屠宰场的14株 H9N2亚型禽流感病毒进行分析。这14株病毒分别来源于鸡、鸭、鸽、野鸡咽喉和泄殖腔样品及猪肺脏样品，用 H9亚型荧光反转录‐聚合酶链反应（RT‐PCR）试剂盒检测后，阳性样品经无特定病原体（SPF）级鸡胚尿囊腔接种并分离病毒，用血凝抑制（HI）实验进一步确定其血凝素（HA）亚型。RT‐PCR分别扩增这14株病毒全基因并进行序列测定，分析8个基因片段的遗传发生关系，发现这些分离株主要由 F／98亚系、Y280亚系、G1亚系及未知亚系重组而成。根据8个基因片段的组合情况，这14株病毒可分成5个基因型。2002、2006～2008年分离的5株H9N2亚型禽流感病毒代表了4个不同基因型，2009～2014年分离的9株H9N2亚型禽流感病毒属第5种基因型，推测可能与疫苗免疫选择压力有关。因此，在以后工作中加强H9N2亚型禽流感分子流行病学监测是非常必要的。
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2007-2008年上海市H9N2亚型禽流感病毒的遗传演化
目的:对分离自上海活禽批发市场的11株H9N2亚型AIV（2007年5株、2008年6株）进行了PB2,PB1,HA,NP和NA的测序,以阐明2007年至2008年上海地区H9N2亚型禽流感病毒分离株的遗传变异及分子特征.方法:采集鸡气管和泄殖腔样品,将H9亚型荧光RT-PCR试剂盒检测的阳性样品处理后,经鸡胚尿囊腔接种分离病毒,HI进一步确定HA亚型,通过RT-PCR方法分别扩增了这11个毒株的PB2,PB1,HA,NP和NA并进行了序列测定.结果:对HA基因进行遗传发生关系分析,这11株分离株均属于Ck/ Bei/ 1/94系.这11个毒株的5个片段的组成有两种方式.结论:上海活禽批发市场的11株H9N2亚型AIV毒株中已包含了H5的片段,所以在今后的工作中加强H9N2亚型禽流感流行病学监测是非常必要的.
