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染色体基因芯片分析技术在不明原因智力落后诊断中的应用——附500例基因芯片结果分析
近年来,染色体基因芯片分析技术(Chromosomal Microarray Analysis,CMA)随着技术的革新和通量的增加,逐步从科研领域走向临床诊断.2010年美国医学遗传医学学会发布了关于CMA在出生后缺陷中的临床应用指南[1],提出CMA可代替染色体核型分析检测,作为不明原因的发育迟缓(智力损害)、多发畸形、非明显综合征及临床怀疑染色体病患儿的首选检测手段.随着该指南的颁布,欧洲、日本、新加坡、韩国也相继发布了指南,推荐CMA作为首选检测代替染色体核型分析技术[2-4].2011年,加拿大妇产科医师协会又发布了产前诊断的基因芯片应用指南[5].随着各国指南的发布,目前染色体基因芯片分析技术已广泛被临床实验室所认可,成为相关适应证在产前和产后领域的首选诊断检测技术.
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出生缺陷患儿345例细胞遗传学分析
目的 分析出生缺陷患儿的染色体核型分布特点和临床表现.方法 选取我院就诊的345例出生缺陷患儿,行外周血染色体核型分析,部分标本进行了SNP-array基因芯片分析,以明确诊断.结果 345例患儿中临床表现居前三位分别是特殊面容、尿道下裂、智力低下.345患儿中共检出116例染色体异常核型,检出率33.6％.其中常染色体异常105例,占90.5％(105/116);性染色体异常9例,占7.8％(9/116).常染色体异常中21-三体综合征85例,占总异常的73.3％(85/116).结论 21-三体综合征在本组病例中发病率高,应对有染色体异常儿生育史的父母再生育提供指导.
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原发性智力障碍/发育迟缓患儿临床及遗传学分析
目的 对30例原发性智力障碍/发育迟缓(ID/DD)患儿进行临床及遗传学分析,明确病因诊断.方法 收集病例,按照规范化ID/DD病因学诊断流程,对30例患儿依次行生化、代谢、神经影像学检查、染色体核型分析、多重连接依赖的探针扩增技术(MLPA)、目标基因靶向捕获-高通量测序、染色体基因芯片分析(CMA)等检查,对检出的变异进行致病性分析.结果 30例(100％)患儿均表现智力、运动、发育落后,12例(40.0％,12/30例)伴先天畸形,8例(26.7％,8/30例)伴精神行为异常;29例(96.7％,29/30例)存在遗传变异,8例(26.7％,8/30例)变异为致病性突变,其中4种基因的5种变异为未报道的新突变:NFIXc.613C＞T(p.Q205X),DHCR7 c.1376G＞ A(p.W459X)与c.901C＞ A(p.H301 N),UPF3B c.1034G＞ A(p.R345H),DLG3c.128G ＞T(p.G43V),确诊22q13.3微缺失综合征、Angelman综合征、Sotos综合征2型、Smith-Lemli-Opitz综合征、1 1q24.1q24.2微重复综合征、15q21.3q22.2微缺失综合征各1例及X连锁ID 2例.染色体核型、MLPA、目标基因靶向捕获-高通量测序、CMA的诊断阳性率分别为4.5％(1/22例)、6.7％(2/30例)、13.3％(4/30例)、28.6％(2/7例).结论 明确了8例ID/DD患儿的病因诊断,扩大了NFIX、DHCR7、UPF3B、DLG3基因突变谱.在国内首次报道1例NFIX突变导致Sotos综合征2型.
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产前诊断唇腭裂308例回顾性研究
目的:探讨胎儿唇腭裂与染色体异常的关系,为该疾病的临床咨询及预后评估提供依据.方法:回顾性分析我院2008年1月至2016年12月所有超声诊断为唇裂/腭裂/唇腭裂的308例孕妇的产前诊断情况,比较不同类型唇腭裂的超声表型特征及染色体异常的发生率.结果:①超声诊断结果显示,在308例唇腭裂胎儿中非综合征型唇腭裂258例(83.77％),综合征型唇腭裂50例(16.23％),其中单纯唇裂40例(12.99％),唇裂合并腭裂266例(86.36％),单纯腭裂2例(0.65％).②同意进行产前诊断137例(44.48％),染色体异常共22例(16.06％),其中23例综合征型唇腭裂中发现染色体异常共12例(52.17％),分别为13-三体8例(66.67％),18-三体2例(16.67％),三倍体2例(16.67％);而在114例非综合征型唇腭裂中发现染色体异常10例(8.77％),分别为18-三体1例,21-三体1例,标记染色体1例,发现基因微缺失微重复等遗传综合征4例(B超检查均无任何软指标及除唇腭裂外的其他结构异常),臂间倒位等染色体多态性3例.染色体基因芯片分析(CMA)检测的染色体异常检出率为16.16％ (16/99),染色体核型分析异常检出率为15.79％ (6/38).③随访到204例患者,186例患者选择引产,18例患者出生后进行手术干预治疗.结论:唇腭裂胎儿染色体异常发生率较高,建议对所有类型唇腭裂均进行产前诊断;CMA检测可以发现除非整倍体外的拷贝数变异,建议对唇腭裂胎儿优选基因芯片进行产前诊断.
