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福建省艾滋病分子流行病学的初步调查
艾滋病病毒(HIV)基因的高度变异性,使其在传播过程中产生出许多具有基因序列特性的亚型(subtype),并在全球范围流行蔓延过程中形成一定的地区性分布特点.根据HIV-l基因组中变异性大、同时也被研究多的膜蛋白基因(env)核酸和氨基酸序列的同源性,目前已确定了由A~J和O至少11种HIV-1亚型.各亚型间基因核苷酸序列的差异较大,A~J亚型间的差异一般在22%~35%,而O亚型与A~J各亚型间的差异则高达50%以上[1~3].
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狂犬病病毒SRV9疫苗株糖蛋白核酸序列及抗原特性研究
狂犬病病毒SRV9株是经克隆获得的中等蚀斑口服弱毒疫苗候选株,具有安全和免疫原性较好等优点.本试验根据狂犬病病毒糖蛋白核苷酸5'末端和3'末端序列设计了一对引物,通过反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)分别扩增了SRV9及其母源株SAD B19糖蛋白的全长cDNA.测序结果表明,SRV9和SAD B19糖蛋白cDNA读框长1575bp,编码524氨基酸残基的多肽.通过和其母源株SAD B19核苷酸序列比较发现,SRV9的158、575、931位碱基分别出现了G→A、A→G和A→G的转换,相应地导致第53位、192位、311位氨基酸出现了Gly→Glu、His→Arg、Thr→Ala突变;和我国现行的犬用疫苗株ERA的核苷酸和氨基酸比较,有10个碱基不同,7个氨基酸发生改变.经Jameson-Wolf抗原表位优势图分析发现,SRV9在192位氨基酸的改变,导致该部位产生了一个新的潜在抗原位点.由于狂犬病病毒糖蛋白是诱导机体产生中和抗体唯一抗原,因此,上述氨基酸的改变可能与其特殊的蚀斑特性和其安全性提高有关.保持对毒株的氨基酸序列分析也是监测其特性的重要手段之一.