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福建省2011-2014年手足口病相关病原柯萨奇病毒A组10型的分子流行病学研究
目的 了解2011-2014年福建省手足口病相关病原其他肠道病毒中优势血清型柯萨奇病毒A组10型(CoxA10)的分子流行病学特征.方法 对2011-2014年福建省确诊为其他肠道病毒感染的1 525例手足口病病例咽拭子和肛拭子标本进行病毒培养和鉴定分型,扩增、测序并分析其中优势血清型Cox A10的完整VP1区基因片段.结果 共分型鉴定出407例其他肠道病毒病例,包括CoxA 10病例103例(占25.3％).Cox A10病例在2011-2014年福建省手足口病病原谱的年度构成比分别为11.0％、6.0％、18.4％和9.2％.与手足口病总体疫情相比,Cox A10病例在地区、性别、年龄组的分布上没有特异性,致重症率较高.VP1区基因序列分析显示,Cox A10福建分离株与原型株的核苷酸序列同源性较低(76.0％～77.1％),氨基酸序列同源性为91.9％ ～93.6％.进化分析显示,CoxA10福建分离株与原型株及国外地区分离株的亲缘关系远,与国内地区分离株的亲缘关系近.Cox A10福建分离株分布在进化树上的多个分支.结论 CoxA10为2011-2014年福建省手足口病的主要病原之一.Cox A10福建分离株与国内相应分离株同进化共循环.
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6718例手足口病病例流行病学特征分析
目的 了解6 718例手足口病病例流行病学特征,为手足口病例防控提供依据. 方法 收集医院诊断的手足口病病例资料进行统计学描述和分析;采集咽拭子标本,采用荧光RT-PCR检测肠道病毒;筛选病例对照进行Logistic单因素分析和多因素回归分析. 结果 6 718例手足口病例中,＜3岁儿童发病2 782例;2012、201 3和2014年各年度病例数分别为2 366、2 395和1 957例,＜3岁儿童发病1 070、988和724例,分别占各年度报告病例数的45.22％、41.22％和36.99％.2012-2014年散居儿童发病3 554例,各年度发病人数分别为1 236、1 105和1 213例;男性3 892例,女性2 826例,男女比为1.38∶1,男性多于女性.2012-2014年HFMD的发病高峰集中在13～30周(4～7月份),共3 330例,占49.57％.2012-2014年手足口病毒检测阳性3 780例,检出率为56.27％,其中EV71阳性率为25.23％(1 695例),CVA16阳性率为14.2％(955例),其他肠道病毒阳性率为16.79％(1 128例).Logistic回归分析显示年龄、优质社区、勤洗手、家庭条件较好、家庭1个儿童为感染肠道病毒的保护因素,男性、幼托儿童、家庭或学习环境阴暗潮湿、近一周有病例接触史、有重大疾病史为感染手足口病的危险因素. 结论 手足口病好发于家庭或生活环境较差、有病例接触史的托幼男童,应加强对该人群的健康教育和防护工作,以减少手足口病的发生.
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2010-2012年青岛地区手足口病病原谱及柯萨奇 A10型的分子流行病学研究
目的：阐明2010-2012年青岛地区手足口病（ HFMD）病原谱及相关柯萨奇病毒A10（ CVA10）型基因特征。方法用荧光RT-PCR法对HFMD患者咽拭子标本进行总肠道病毒（ EV）、柯萨奇病毒A16（CVA16）型和肠道病毒71（EV71）型检测，然后用半巢式反转录PCR进行肠道病毒VP1基因部分序列扩增，再结合序列分析鉴定血清型；对CVA10阳性分离株进行VP1基因全长序列扩增及基因序列测定，用MEGA5．0软件进行系统发育分析及分子特征分析。结果2010-2012年间，共检测1919个手足口病门诊轻症病例和1336个住院重症病例；门诊轻症病例中，2010年和2012年以CVA16为主，各占轻症病例总阳性数的53％和73％，而2011年以EV71为主，占轻症病例总阳性数的78％；住院重症病例中，EV71为2010年和2011年主要病原，各占重症病例总阳性数的70％和86％；其他型别（非CVA16、非EV71）肠道病毒在2012年住院重症病例中成为主要病原，占重症病例总阳性数的44％；2010-2012年分别检出其他型别肠道病毒19株、16株和22株，其中CVA10检出率高；23株CVA10的VP1全长基因序列进化分析表明这23株CVA10病毒全部属于C基因型，它们VP1基因氨基酸序列同源性为97．3％～100．0％，与其他地区同期参考株相比无显著差异。结论2010-2012年间，CVA16和EV71是引起青岛地区手足口病流行的主要病原，同时伴有多种其他型别肠道病毒流行，其中C基因型CVA10分离率较高，它们相互间同源性较高，与其他地区同期参考株相似。
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2014～2015年龙岩市手足口病流行病学及病原学特征分析
目的 对龙岩市2014～2015年HFMD流行病学和病原学特征进行分析,为防控提供依据.方法 运用描述流行病学方法对龙岩市2014～2015年HFMD资料进行分析.采用实时荧光RT-PCR法对龙岩市HFMD监测标本进行肠道病毒核酸检测.结果2014～2015年共报告HFMD病例17 436例,5岁以下病例占94.24％,男性(61.95％)多于女性(38.05％).男性年均发病率为404.27/10万,女性为266.82/10万,男女发病率差异有统计学意义(P＜0.01).发病呈双高峰分布,分别在3～5月(发病6 497例,占总病例数的37.26％)和9～11月(发病数为6 091例,占总病例数的34.93％).1 220例HFMD标本病毒核酸检测,结果 EV核酸阳性952例(78.03％),其中CoxA6占29.18％,EV71占20.66％.CoxA16占18.85％,CoxA10占4.43％,Echo30占0.08％,未分型占4.84％.结论 龙岩市HFMD发病以5岁以下儿童为主,跟往年相比2014～2015年HFMD病原学发生明显的变化,以CoxA6为主.加强病原学监测,做好5岁以下散居儿童HFMD防控,是当前防控工作的重点.
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柯萨奇病毒A10荧光定量PCR检测方法的建立
目的 建立一种检测柯萨奇病毒A10的荧光定量PCR方法.方法 从GenBank上下载柯萨奇病毒A10 VP1基因序列并进行同源性分析,选取相对保守的区域设计引物和探针,建立和优化柯萨奇病毒A10荧光定量PCR检测反应体系,并对质粒标准品和临床样本进行检测,评估其特异性和灵敏度.结果 优化的引物探针浓度分别为0.5μmol/L和0.2 μmol/L,退火/延伸温度为58℃.建立的柯萨奇病毒A10荧光定量PCR检测方法具有良好的特异性,仅质粒标准品和柯萨奇病毒A10阳性临床样本能获得S形扩增曲线,其他临床样本未见任何扩增,而且灵敏度高.probit回归分析估测其检测下限为3.82拷贝/μl(95％置信区间).结论 建立的荧光定量PCR方法能准确检测出柯萨奇病毒A10,可用于临床样本柯萨奇病毒A10的检测.
