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金黄色葡萄球菌中可移动遗传元件与耐药传播机制研究进展
金黄色葡萄球菌可移动遗传元件介导的耐药传播机制复杂,给耐药性防控带来重大挑战.本文结合国内外新文献,综述了金黄色葡萄球菌抗生素耐药传播相关的可移动遗传元件及其传播机制研究进展.金黄色葡萄球菌编码耐药基因的可移动遗传元件种类繁多,不同的可移动遗传元件编码耐药基因不尽相同,其传播机制也具有特异性,人和动物来源的金黄色葡萄球菌可移动遗传元件存在显著差异,金黄色葡萄球菌可移动遗传元件可在人和动物间交互传递,因此又存在一定的趋向性.可通过研究金黄色葡萄球菌耐药基因随可移动遗传元件扩散的传播机制,解析可移动遗传元件转移过程重要的生物学信息,有效防控金黄色葡萄球菌耐药性在动物、人类和环境中的传播.
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多重耐药福氏志贺菌相关耐药基因的指标聚类分析
目的 探讨福氏志贺菌的耐药性及其获得性耐药相关基因和可移动遗传元件的携带状况,并分析两者的相关性.方法 选取并复苏2010至2014年上海市各区县疾病预防与控制中心上送的139株福氏志贺菌,采用K-B法测定菌株对13种抗生素的敏感性,同时用PCR检测17种β-内酰胺类药物耐药基因、季铵盐消毒剂与磺胺耐药重叠基因、甲氧苄啶-磺胺甲68970唑耐药基因、氨基糖苷类修饰酶耐药基因及7种可移动遗传标记,用指标聚类分析法分析获得性耐药基因和可移动元件遗传标记存在状况的相关性.结果 139株福氏志贺菌共检测到ISEcp1、intI1和trbC 3种可移动遗传元件的遗传标记;CTX-M、OXA和TEM 3种β-内酰胺类药物耐药相关基因;ant(3")-I和aac(6′)-Ib2种氨基糖苷类修饰酶基因;1种季铵盐消毒剂与磺胺耐药重叠基因qacEΔ1-sull和1种甲氧苄啶-磺胺甲68970唑相关基因dfrA1.指标聚类分析显示,OXA、ant(3")-I和drfA1这3个基因高度相关,并同时被Ⅰ类整合子intI1介导;TEM、qacEΔl-sull和aac(6′)-Ib这3个基因高度相关,并同时被另一个移动元件即接合性质粒trbC介导.结论 多种可移动遗传元件介导的获得性耐药基因水平转移可能在很大程度上导致了志贺菌耐药株的不断蔓延.
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大肠埃希菌耐药相关基因和可移动遗传元件指标与样本聚类分析
目的 调查多重耐药大肠埃希菌耐药相关基因与可移动遗传元件的相互关系,以及菌株间的亲缘性关系.方法 收集浙江省磐安县人民医院2009年6月-2010年6月临床分离的多重耐药大肠埃希菌共20株,采用聚合酶链反应(PCR)分析β-内酰胺类与氨基糖苷类耐药相关基因以及可移动遗传元件,并对检测结果作指标与样本聚类分析.结果 20株多重耐药大肠埃希菌共检出4种β-内酰胺类耐药相关基因,4种氨基糖苷类耐药相关基因,以及5种可移动遗传元件的遗传标记.指标聚类分析显示,耐药基因TEM、CTX-M-1、aadA5与可移动遗传元件traA、IS26、ISEcpl相关联,耐药基因OXA-1、aac(6′)-Ⅰb、ant(3″)-Ⅰ、rmtB与可移动遗传元件trbC、IS903相关联.样本聚类分析显示,本院20株耐药大肠埃希菌可分为两个群,并且两群菌株演化明显.结论 多重耐药大肠埃希菌耐药相关基因与可移动遗传元件有关,对菌株进行样本聚类分析可获得菌株亲缘性关系,对控制医院感染意义重大.
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肺炎克雷伯菌临床分离株β-内酰胺类耐药特征分析
目的 调查一组耐药肺炎克雷伯菌的β-内酰胺类药物耐药的遗传学背景和可移动遗传元件的存在情况,以及二者可能存在的关系.方法 收集2008年8月-2010年5月浙江省杭州市和湖州市6家医院共47株肺炎克雷伯菌,先采用改良Hodge试验检测产碳青霉烯酶表型确证试验,再采用聚合酶链反应(PCR)的方法检测A～D四类40种β-内酰胺酶基因与膜孔蛋白编码基因(ompK35、omp K36)和12种可移动遗传元件标记基因,后对检测结果作指标聚类分析.结果 本组耐药肺炎克雷伯菌共检出改良Hodge试验阳性株35株,5种β-内酰胺酶基因,并发现KPC-2变异型( KPC-2-1ike,GenBank登录号:HQ258934),以及9种可移动遗传元件标记基因.耐药肺炎克雷伯菌的ompK35、ompK36膜孔蛋白编码基因经测序并与肺炎克雷伯菌敏感株比对均存在突变.指标聚类分析显示,KPC-2以及变异型与 ISKpn6高度相关联,TEM-1与ISEcpl、IS26、intI1、trbC、IS903相关联,CMY-2、OXA-30、DHA-1与tnpU、tnp513、trbC相关联.结论 携带5种β-内酰胺酶基因和ompK35、ompK36膜孔蛋白编码基因存在突变是本组肺炎克雷伯菌对β-内酰胺类药物耐药的主要原因.
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多重耐药大肠埃希菌获得性耐药基因检测及指标聚类分析
目的 调查多重耐药大肠埃希菌尿液分离株中获得性耐药相关基因和可移动遗传元件遗传标记的存在状况,并分析二者的相关性.方法 收集宁波市第一医院2008年10月-2009年3月患者尿液样本中分离的大肠埃希菌共28株,采用聚合酶链反应(PCR)法分析47种β-内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类获得性耐药基因,2种获得性抗菌制剂外排泵基因和13种整合子、转座子、插入序列、接合性质粒遗传标记,并用指标聚类分析(SPSS法)分析获得性耐药相关基因和可移动遗传元件遗传标记的相关性.结果 28株大肠埃希菌共检出7种β-内酰胺类获得件耐药基因、8种氨基糖苷类获得性耐药基因、1种获得性抗菌制剂外排泵基因、1种整合子遗传标记、3种转座子和插入序列遗传标记,以及2种接合性质粒遗传标记,其余46种基因均未检测到.SPSS法将上述阳性检出基因分成A、B两大簇.结论 本组菌株携带获得性耐药相关基因可导致对相关抗菌药物耐药,可移动遗传元件的水平转移使细菌的耐药性在同种菌株及不同种菌株间得以快速传播.SPSS分析提示获得性耐药相关基因和可移动遗传元件密切相关.
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泛耐药鲍曼不动杆菌获得性耐药基因和可移动遗传元件检测与指标聚类分析
目的 调查泛耐药鲍曼不动杆菌获得性耐药基因和可移动遗传元件携带情况,并探讨二者之间的相关性.方法 收集临床样本中分离的20株泛耐药鲍曼不动杆菌,采用PCR法检测53种水平转移获得性耐药基因(与β-内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类耐药相关)以及12种可移动遗传元件(接合性质粒、转座子、插入序列、整合子等),并对检测结果进行指标聚类分析.结果 本组菌株检出3种β-内酰胺酶类药物耐药基因TEM-1、ADC-30和OXA-23,4种氨基糖苷类修饰酶基因aac(3)-Ⅰ、aac(6′)-Ⅰb、ant(3″)-Ⅰ和aph(3′)-Ⅰ,以及5种可移动遗传元件intⅠ1、tnpU、tnp513、IS26和ISAba1.指标聚类分析显示、TEM-1、ADC-30等2种β-内酰胺酶基因,aac (6′)-Ⅰb、ant(3″)-Ⅰ等2种氨基糖苷类修饰酶基因,abeB和qacE Δ1外排泵基因与intⅠ1、tnpU、tnp513、IS26、ISAba1等可移动遗传元件高度相关.结论 临床分离的PDR-ABA可携带多种获得性耐药基因和可移动遗传元件,且二者之间高度相关.
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福氏志贺菌β-内酰胺类药物耐药元件检测及聚类分析
志贺菌属为革兰阴性短杆菌,是人畜共患病原菌,可导致人与动物的肠道炎症性疾病(细菌性痢疾). 根据志贺菌抗原结构的不同,可分为四群48个血清型. 来自全国性细菌性痢疾监测分析报告(全国20个监测点)显示:我国福氏志贺菌( B群)分离率占67.26％,宋内志贺菌( D群)占32.74％.无痢疾志贺菌(A群)和鲍氏志贺菌(C群)检出[1].隋吉林等[1]报道全国志贺菌株对氨苄西林耐药率达95 .92％. 近年来,国内尽管有志贺菌的β-内酰胺酶基因型检测报道,但所检测的β-内酰胺酶基因型型别较少且鲜见涉及常见的β-内酰胺酶基因载体——整合子和插入序列等可移动遗传元件标记基因[ 2-6 ].
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老年患者多重耐药大肠埃希菌分离株可移动遗传元件检测
多重耐药大肠埃希菌(multidrug-resistant Escherichia coli,MDR-ECO)在医院感染病原菌中占重要地位.先前,我们已报道了MDR-ECO老年患者分离株β-内酰胺类、磺胺类、氯霉素等耐药基因检测状况[1-4],国内有关MDR-ECO耐药基因的载体—可移动遗传元件的研究鲜见报道[5-6].为了解MDR-ECO可移动遗传元件的存在情况,我们对分离自老年患者20株MDR-ECO的2种接合性质粒遗传标记(traA和trbC),6种转座子标记(tnpA/Tn3、tnpA/Tn21、tnpU、tnp513、ISEcp1和IS26)和3种整合子标记(int I 1、int I 2和int I 3),共11种可移动遗传元件进行了检测.
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耐药肺炎克雷伯菌获得性耐药基因的指标与样本聚类分析
肺炎克雷伯菌是临床常见分离到的细菌之一，其对临床常用药物（β-内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类）的耐药性连年居高不下［1-2］，继出现多耐药（ MDR）菌株后，又出现了泛耐药（PDR）菌株及极度耐药（XDR）肺炎克雷伯菌［3-7］。由可移动遗传元件介导的细菌获得性耐药基因是细菌耐药性急速传播的主要原因［8］。2012年，我们分离到20株耐药肺炎克雷伯菌，为了解菌株的常用药物获得性耐药基因与可移动遗传元件存在状况，我们检测了39种β-内酰胺类、21种氨基糖苷类、4种喹诺酮类获得性耐药基因与12种可移动遗传元件标记基因，并对检测结果作指标聚类分析，以探讨获得性耐药基因与可移动遗传元件可能存在的关系。此外，我们还对检测结果进行了样本聚类分析，以探讨本组菌株之间的亲缘关系，现报道如下。
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耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药元件分析研究
目的 探讨一组耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌获得性耐药基因及可移动遗传元件遗传标记的携带情况及关联性.方法 收集2013年1-12月宁波市第二医院住院患者中分离到的20株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌,用gyrA与parC测序确认菌种,再采用聚合酶链反应(PCR)及序列分析的方法分析β-内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类共56种获得性耐药相关基因和12种可移动遗传元件遗传标记,后对检测结果作指标聚类分析.结果 20株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌每株均检出获得性耐药基因与可移动遗传元件标记,20株菌共检出6种β-内酰胺类获得性耐药基因、4种氨基糖苷类获得性耐药基因、1种16S rRNA甲基化酶基因、8种可移动遗传元件遗传标记,指标聚类分析提示bla KPC与ISKpn6相强关联,bla OXA-1与tnp513相强关联,17株bla KPC-2阳性菌bla KPC-ISKpn6连锁检测均为阳性.结论 肺炎克雷伯菌中携带的耐药基因和耐药表表型相对应,携带blaKPC-2和bla IMP-4是该组菌耐碳青霉烯类的重要原因.
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耐β-内酰胺类肺炎克雷伯菌常见耐药元件与菌株亲缘性研究
目的 调查耐β-内酰胺类肺炎克雷伯菌(DRKP)常见耐药元件的携带情况和菌株间的亲缘性.方法 收集2014年1-12月医院住院患者痰液中分离到的30株DRKP,采用PCR分析17种β内酰胺类、6种氨基糖苷类获得性耐药基因以及4种可移动遗传元件遗传标记,并对检测结果作样本聚类分析.结果 30株DRKP对β-内酰胺类(头孢唑林、头孢他啶、头孢呋辛、头孢噻肟等)、氨基糖苷类(庆大霉素、阿米卡星等)药物及环丙沙星均耐药,耐药率均为100.0％,对亚胺培南与美罗培南均敏感,耐药率均为0;每株DRKP均检出β-内酰胺类和氨基糖苷类药物获得性耐药基因及MGEs标记;样本聚类分析提示,30株DRKP有5组呈克隆传播,存在医院感染.结论 β-内酰胺酶blaTEM、blaD HA基因,氨基糖苷类修饰酶aac(3)-Ⅱ、aph3'-Ⅰ基因,MGEs标记intⅠ1、IS903在DRKP中流行,是导致该组菌对多种抗菌药物耐药的重要原因,基于获得性耐药基因与可移动遗传元件标记检测结果的样本聚类分析是监控医院感染实用手段.
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阴沟肠杆菌分离株五类抗菌药物耐药基因元件分析
目的 调查一组20株阴沟肠杆菌中五类抗菌药物耐药基因元件的携带状况,及菌株间的亲缘关系.方法收集2014年1－12月医院患者痰标本中分离的20株阴沟肠杆菌,12种抗菌药物敏感性试验为K-B法.采用聚合酶链反应(PCR)及序列分析的方法分析20种β-内酰胺类耐药基因、17种氨基糖苷类耐药基因、5种喹诺酮类耐药基因、2种氯霉素耐药基因、4种磺胺类耐药基因、7种可移动遗传元件遗传标记.阳性耐药基因测序后直接作BLAST比对.耐药基因检测结果作样本聚类分析(UPGMA法).结果 20株阴沟肠杆菌对β-内酰胺类药物除亚胺培南、美罗培南外均为耐药,对氨基糖苷类与磺胺类药物亦均为耐药. 20株菌共检出4种β-内酰胺酶类耐药基因、6种氨基糖苷类耐药基因、3种喹诺酮类耐药基因、1种氯霉素耐药基因、4种磺胺类耐药基因、4种可移动遗传元件遗传标记,且阳性率较高.样本聚类分析显示:除13号菌株外的其余19株显聚集性.其中4～7号菌株,6～11号菌株,14～16号菌株均为克隆传播.本组菌检出的3个克隆可能为医院感染.结论 本组20株阴沟肠杆菌携带的β-内酰胺类耐药基因、氨基糖苷类耐药基因、喹诺酮类耐药基因、氯霉素耐药基因、磺胺类耐药基因和可移动遗传元件遗传标记是对β-内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类、氯霉素、磺胺类产生耐药的重要原因.
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泛耐药铜绿假单胞菌湖北襄阳分离株获得性耐药元件研究
目的 调查一组泛耐药的铜绿假单胞菌获得性耐药元件基因的携带情况及菌株间的亲缘关系.方法 收集2015年1-12月医院住院患者痰液标本分离到的20株泛耐药的铜绿假单胞菌,采用K-B法测定9种抗菌药物的敏感性,采用聚合酶链反应(PCR)及序列分析的方法分析35种β-内酰胺类获得性耐药基因与膜孔蛋白oprD2基因、21种氨基糖苷类获得性耐药基因和9种可移动遗传元件遗传标记.阳性耐药基因测序后直接作BLAST比对,对57种获得性耐药元件基因与膜孔蛋白oprD2基因检测结果作样本聚类分析(UPGMA法).结果 20株铜绿假单胞菌为泛耐药菌.20株菌有19株分别检出1~3种β-内酰胺酶基因,仅1株未检出β-内酰胺酶基因且膜孔蛋白oprD2基因缺失.20株菌均检出氨基糖苷类药物获得性耐药基因和可移动遗传元件遗传标记基因.样本聚类分析提示20株菌有聚集性且可分成A、B群.其中A群中有4个克隆播散,B群中有2个克隆播散.结论 20株泛耐药铜绿假单胞菌同时携带了β-内酰胺类药物获得性耐药基因、氨基糖苷类药物获得性耐药基因和可移动遗传元件遗传标记,是对β-内酰胺类和氨基糖苷类产生耐药的重要原因.本组菌检出的6个克隆高度疑似医院感染,同一克隆菌株携带相同基因.
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泛耐药肺炎克雷伯菌耐药基因检测及聚类分析
目的：调查三家医院31株泛耐药肺炎克雷伯菌（PDR‐KPN）获得性耐药相关基因和可移动遗传元件遗传标记的存在状况，并分析其亲缘关系。方法收集三家医院2013年1月－12月分离31株PDR‐K PN ；采用聚合酶链反应（PCR）法检测β‐内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类获得性耐药基因以及可移动遗传元件标记基因。对全部耐药基因检测结果作样本聚类分析。结果31株PDR‐KPN每株均检出β‐内酰胺类、氨基糖苷类药物获得性耐药基因，喹诺酮类药物作用靶位 gyrA基因突变阳性率100％；31株blaK PC与ISK pn6均阳性，blaK PC‐ISK‐p n6连锁检测阳性率100．0％。样本聚类分析显示A、B、C三家医院的菌株分为三个簇群。B医院与C医院的菌株有较近的亲缘关系。结论本组菌株携带获得性耐药相关基因导致对相关抗菌药物耐药。指标聚类分析提示菌株之间存在克隆传播。
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耐药大肠埃希菌可移动耐药元件研究
目的：调查耐药大肠埃希菌中可移动耐药元件（可移动遗传元件遗传标记与耐药基因）的携带情况，为临床治疗提供参考依据。方法收集医院2015年1—12月住院患者痰液标本中分离的耐药大肠埃希菌共32株，采用聚合酶链反应（PCR）及序列分析的方法分析3种可移动遗传元件与16种β-内酰胺类耐药基因并对结果进行了样本聚类分析，以了解菌株的亲缘关系。结果32株耐药大肠埃希菌共检出1种可移动遗传元件遗传标记intⅠ1共27株（84．4％）；β-内酰胺类耐药基因总检出率为100．0％，共检出4种阳性基因：blaTEM、blaSHV、blaCTX-M-群、blaOXA-1群；氨基糖苷类耐药基因总检出率为93．8％，共检出5种阳性基因：aac（3）-Ⅱ、aac （6′）-Ⅰb、ant（3″）-Ⅰ、ant（2″）-Ⅰ、ap h（3′）-Ⅰ。结论耐药大肠埃希菌检出的可移动耐药元件是导致对β-内酰胺类、氨基糖苷类、磺胺甲噁唑／甲氧苄啶耐药的重要原因，并且耐药表型和基因型一一对应；本组菌中三个不同的克隆有医院感染的可能。
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产ESBLs大肠埃希菌功能基因的样本聚类分析研究
目的：调查一组产ESBLs大肠埃希菌株间的亲缘性关系。方法收集医院2013年住院患者标本，从中分离到产ESBLs大肠埃希菌共20株，了解其样本聚类分析的聚集性，为消毒隔离提供依据；采用聚合酶链反应（PCR）分析获得性耐药基因并对检测结果作样本聚类分析（UPGMA法）。结果20株大肠埃希菌中，获得性耐药基因共检出6种β‐内酰胺类耐药相关基因、4种氨基糖苷类耐药相关基因、1种消毒剂与磺胺耐药重叠基因、7种可移动遗传元件的遗传标记，2种毒力基因均有检出；β‐内酰胺酶基因、氨基糖苷类修饰酶基因、消毒剂与磺胺耐药重叠基因、可移动遗传元件遗传标记和毒力基因的总阳性率分别为100．0％、95．0％、80．0％、100．0％和40．0％；样本聚类分析显示，本组20株菌可分A与B两大群，A群又可分A1与A2两小群；A1群13个成员每个菌株均携带blaCTX‐M‐9cluster基因，A2群5个成员或携带blaCTX‐M‐1cluster基因，或不携带blaCTX‐M基因；B群两个成员均携带blaDHA基因。结论本组20株产ESBLs大肠埃希菌的样本聚类分析显示出聚集性，对感染者仍有加强消毒隔离必要性。
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基于耐药相关基因耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌亲缘关系分析
目的 了解耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药相关基因与可移动遗传元件存在状况和菌株之间的亲缘关系.方法 收集2014年1-12月浙江省磐安县人民医院住院患者标本中分离20株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌,用gyrA测序后BLASTn比对确认菌种,再采用聚合酶链反应(PCR)法分析40种β-内酰胺酶获得性耐药基因、两种膜孔蛋白基因、12种氨基糖苷类获得性耐药基因、1种喹诺酮类作用靶位基因、4种喹诺酮类获得性耐药基因、12种可移动遗传元件遗传标记,并对检测结果作样本聚类分析.结果 20株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌对β-内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类耐药率很高,除未检出喹诺酮类药物获得性耐药基因外,其他基因均有阳性检出;共检出4种β-内酰胺类获得性耐药基因、两种膜孔蛋白基因、两种氨基糖苷类获得性耐药基因、1种喹诺酮类作用靶位基因、8种可移动遗传元件遗传标记,且阳性率较高;样本聚类分析提示20株菌可分为A与B两个簇群;A簇群5株,分别为1、2、3、4、16号株,为克隆传播;B簇群分B1、B2二亚簇群,B1亚簇群12株,分别为5、6、7、8、9、10、11、13、14、17、18、19号株,为克隆传播;B2亚簇群3株,分别为12、15、20号株,亦为克隆传播.结论 肺炎克雷伯菌耐药表型与基因型结果相符,菌株呈3个克隆传播特征,为医院感染.
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耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药相关基因分析
目的：探讨耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌耐药基因及可移动遗传元件遗传标记的携带，与菌株间的亲缘性。方法收集2014年1－12月住院患者中分离20株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌，经 gy rA测序比对确认菌种，再采用聚合酶链反应（PCR）及序列分析的方法分析β-内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类共57种耐药相关基因与12种可移动遗传元件遗传标记，后对检测结果作样本聚类分析。结果20株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌每株均检出β-内酰胺酶基因、氨基糖苷类修饰酶基因、喹诺酮类作用靶位基因 gy rA突变以及可移动遗传元件标记；20株菌共检出4种β-内酰胺类耐药基因、4种氨基糖苷类耐药基因、1种16S rRNA甲基化酶基因、1种喹诺酮类耐药基因、6种可移动遗传元件遗传标记，阳性率非常高，且阳性基因可分为6种阳性模式；样本聚类分析发现，20株菌可区分为A、B两个家族，A家族中1号株为孤独株，A1（2和9号株）与A2（10、11、12、13、15、16、17和18号株）子家族均为克隆传播，A3子家族有2株菌；B家族（3、4、5、6、7、8和20号株）亦为克隆传播，并已构成暴发流行。结论本组肺炎克雷伯菌中携带的耐药基因与耐药表表型相对应，样本聚类分析提示本组菌有克隆传播，有的已构成暴发流行。
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多药耐药鲍氏不动杆菌同一病区分离株耐药基因研究
目的：调查同一病区分离的多药耐药鲍氏不动杆菌耐药基因状况及菌株间的亲缘关系。方法收集医院2014年1－12月有呼吸道炎症住院患者痰标本中分离的多药耐药鲍氏不动杆菌25株，先经鲍氏不动杆菌种特异基因PCR检测确认菌种，再用PCR方法分析11种β‐内酰胺类耐药基因、3种β‐内酰胺类耐药基因与插入序列连锁检测、9种氨基糖苷类耐药基因、1种喹诺酮类耐药基因、2种可移动遗传元件标记，再对检测结果作样本聚类分析。结果25株多药耐药鲍氏不动杆菌每株均检出β‐内酰胺类、氨基糖苷类耐药基因和喹诺酮类药物作用靶位 gy rA基因的突变，共检出3种β‐内酰胺类耐药基因（blaT EM、blaS H V、blaA DC），6种氨基糖苷类耐药基因（armA、aac（3）‐Ⅰ、aac（3）‐Ⅱ、aac（6′）‐Ⅰb、ant（3″）‐Ⅰ、ant（2″）‐Ⅰ ），喹诺酮类药物作用靶位 gyrA基因均存在突变，2种可移动遗传元件标记（intⅠ1、ISaba1）；blaA DC基因与ISaba1连锁，连锁率100．0％；样本聚类分析显示，该组菌存在5个克隆传播，25株可分A与B簇群，A簇群又可分为A‐1与A‐2亚簇群，A‐1亚簇群中1‐2‐9‐10‐11号株，A‐2亚簇群中3‐6‐7‐14号株与15‐17为克隆传播，B簇群又可分为B‐1与B‐2亚簇群，B‐1亚簇群中5‐13‐16‐19‐22‐23‐24号株与20‐21为克隆传播。结论多药耐药鲍氏不动杆菌菌株聚集现象明显，5个克隆传播提示有医院感染的存在，将耐药菌检测到的耐药基因阴性与阳性二元结果作样本聚类分析进而解析耐药菌株之间的亲缘关系，对医院感染实时监测和控制医院感染意义重大。
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耐药大肠埃希菌湖北监利分离株常见耐药基因研究
目的 调查一组耐药大肠埃希菌分离株中β-内酰胺类、氨基糖苷类耐药基因与可移动遗传元件遗传标记的携带状况及菌株间的亲缘关系. 方法 收集2016年1-6月医院住院患者痰液标本中分离的耐药大肠埃希菌20株,采用聚合酶链反应(PCR)及序列分析的方法分析15种β-内酰胺酶基因、7种氨基糖苷类修饰酶基因、1种16SrRNA甲基化酶基因、4种可移动遗传元件遗传标记;阳性耐药基因测序后直接作BLAST比对,耐药基因检测结果作样本聚类分析(UPGMA法). 结果 20株耐药大肠埃希菌对头孢类、β-内酰胺类复合制剂、喹诺酮类均耐药,对碳青霉烯类均敏感;20株菌共检出4种β-内酰胺酶基因,4种氨基糖苷类修饰酶基因,4种可移动遗传元件遗传标记,且阳性率较高;样本聚类分析显示20株菌中的18株出现了明显的聚集性,出现4个克隆. 结论 20株耐药大肠埃希菌携带的β-内酰胺酶基因、氨基糖苷类修饰酶基因和可移动遗传元件遗传标记是对β-内酰胺类和氨基糖苷类产生耐药的重要原因;本组菌检出的四个克隆高度疑似医院感染,同一克隆菌株携带相同基因.
