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小RNA病毒受体的研究进展
病毒与宿主间的相互作用位点为病毒感染细胞提供可能性, 位于宿主细胞上的结合位点称作受体.目前在宿主细胞的免疫球蛋白超家族、低密度脂蛋白受体家族、补体家族和整联蛋白细胞粘附分子家族等中陆续发现了小RNA病毒的受体.了解各个受体的利用情况, 对理解病毒感染机制、宿主嗜性和抗病毒机理有重要意义.本文主要就已证实的小RNA病毒受体进行分类概述, 以期为深入研究小RNA病毒的致病机理及其防控提供参考.
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小RNA病毒3C蛋白酶研究进展
小RNA病毒科病毒包括数目众多的小RNA病毒,其中很多小RNA病毒是人畜重要的病原体.不同种属的小RNA病毒的3C蛋白酶具有典型的G-X-C-G基序和Cys-His-Asp/Glu催化中心;小RNA病毒3Cpro完成P1区VP2～VP3、VP3～VP1;P2区的2A～2B、2B～2C以及整个P3区成熟剪切;小RNA病毒多聚前体蛋白3Cpro成熟剪切分析显示,3Cpro作用底物具有明显的Q-G/S/A/V/H/R和E-S/G/R/M喜好性及种属特异性;固有免疫应答重要配体分子TRIF、MAVS、IRF3、IRF7和NEMO的3Cpro酶切位点预测显示,不同配体分子具有数目各异的可能酶切位点,其中TRIF和NEMO的3Cpro可能作用位点具有多样性.上述问题的探究,为基于小RNA病毒3Cpro的广谱抗病毒药物研制和小RNA病毒免疫逃逸机制提供资料.
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小RNA病毒3'非编码区结构与功能的研究进展
小RNA病毒基因组的两侧分别为5'非编码区(UTR)和3'UTR.研究表明:5'/3' UTR能形成复杂的RNA结构,如颈-环结构、三叶草结构和假结体结构等,在病毒的复制或翻译过程中发挥重要调节作用.本文即对近10年来有关小RNA病毒3'UTR的结构与功能研究方面的进展情况进行综述.
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腹泻住院患儿中检测到人双埃可病毒
目的 在腹泻住院患儿粪便标本中检测人双埃可病毒(HPeV),探讨HPeV与婴幼儿重症腹泻之间的联系.方法 通过Real-time PCR直接从<5岁未知病原住院腹泻患儿粪便标本中检测HPeV,进而通过基于VP3/VP1连接区的巢式PCR扩增片段的测序结果进行分型.结果 99份腹泻粪便标本,HPeV阳性24例(24%),其中,以HPeV1为主(50%),其次为HPeV3(25%),HPeV4(8.3%),HPeV6(4.2%),还有3例HPeV阳性标本未能分型,未检测到HPeV2、5、7、8.HPeV感染的住院腹泻患儿主要为<1岁患儿.HPeV感染高峰为秋冬季节,10月达到峰值.VP3/VP1连接区基因与已知HPeV的病因构成及深入了解HPeV的病原学及流行病学特点有重要意义.
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小RNA病毒2C基因及其编码蛋白的研究进展
小RNA病毒2C基因保守性较高,其编码的2C蛋白是病毒的非结构蛋白,在小RNA病毒复制过程较早出现,只有在小RNA病毒复制的过程中才能产生;具有AAA+族解旋酶活性,参与自噬通路入侵过程,诱导细胞炎症反应和细胞凋亡,与其他非结构蛋白如2B和3C相互作用从而参与致病进程等.本文对小RNA病毒2C基因及其编码蛋白的研究进展进行总结,以期为开展对其深入研究提供参考.
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小RNA病毒3A基因及其编码蛋白研究进展
小RNA病毒3A蛋白是病毒的非结构蛋白,本文主要介绍3A基因以及其编码蛋白的特点,3A蛋白对细胞蛋白转运中的作用以及与其他蛋白的相互作用,3A蛋白与ARF家族在囊泡运输中作用的机制等.
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参与小RNA病毒感染和复制的宿主及病毒蛋白功能研究进展
阐明宿主和病毒间的相互作用对于理解病毒的复制、致病性和毒力至关重要,本文对小RNA病毒感染和复制过程中参与的宿主蛋白和病毒蛋白的功能新研究进展做一综述.首先讨论病毒衣壳蛋白和宿主细胞受体间的相互作用,然后详述病毒复制过程中参与的病毒蛋白和宿主细胞蛋白.
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Her2(+)/Her2(-)乳腺癌差异表达microRNAs的生物信息学分析
目的 通过文献挖掘与生物信息学分析的方法,探讨Her2(+)/Her2(-)乳腺癌之间差异表达的microRNAs可能涉及的生物学功能和信号通路.方法 在NCBI数据库的GEO子数据库及EBI数据库中的ArrayExpress子数据库开展检索,使用关键词“breast cancer”、“microRNA”进行检索,获取Her2(+ )/Her2(-)乳腺癌之间差异表达microRNAs.利用microRNAs靶基因预测软件预测所有差异表达microRNAs的靶基因,进行通路分析.结果 找到2个在Her2表型不同的乳腺癌中差异表达的microRNAs数据集,利用软件TargetScan预测差异表达microRNAs的靶向基因,取其合集进行富集分析,后将富集得到的基因利用David数据库进行分析,从而得到了上述差异表达的microRNAs可能具有的生物学功能和参与的调节通路.结论 差异表达的microRNAs通过调节靶向基因参与不同信号通路,实现多种生物学功能.
