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抑郁症预后与circRNA表达水平、社会支持、应对方式之间的关系
目的 探讨重症抑郁症预后与circRNA表达水平、社会心理因素的关系.方法 采用基因芯片技术筛查抑郁症患者与健康者间差异表达的circRNA,运用qPCR检测30例抑郁症患者外周血circRNA表达水平;并用汉密尔顿抑郁量表(HAMD)、中国社会支持量表(CSSS)、特质应对方式问卷(TCSQ)对患者进行评估.结果 circRNA_104600的△CT值与焦虑/躯体化、绝望感减分率呈负相关(P＜0.05).CSSS中客观支持因子分与HAMD绝望感减分率呈负相关(P＜0.05);支持利用度因子分与HAMD总分、认知障碍、睡眠障碍的减分率呈正相关(P＜0.05);TCSQ中消极应对因子分与HAMD总减分率呈负相关(P＜0.05);积极应对因子分与焦虑/躯体化、体重减分率呈正相关(P＜0.05).circRNA_103964、CSSS中支持利用度对HAMD总减分率有预测作用(P＜0.05),可解释因变量变异的64.1％;circRNA_100018、circRNA_104121、circRNA_104600、circRNA_103964对HAMD焦虑/躯体化减分率有预测作用(P＜0.叭),可解释因变量变异的88.0％;circRNA_103964对HAMD认知障碍减分率有预测作用(P＜0.05),可解释因变量变异的57.0％;circRNA_103964、CSSS中支持利用度、TCSQ中积极应对对HAMD绝望感有预测作用(P＜0.05),可解释因变量变异的74.0％.结论 抑郁症预后与circRNA_104600、circRNA_103964表达水平、客观支持、支持利用度及积极应对方式有密切的关系.
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抑郁症患者外周血circRNA表达水平与认知功能障碍的相关性研究
目的 探讨重度抑郁症患者外周血差异表达的 circRNA与认知功能的关系.方法首先分别选取5例抑郁症患者和健康人进行基因芯片筛查,确定10种存在差异表达的circRNA,在100例抑郁症患者(病例组)和100例健康人(健康对照组)进行进一步的PCR验证,并对其施测蒙特利尔认知评估(北京版).结果 病例组在视空间与执行功能、注意与计算、语言、抽象、延迟记忆的得分显著低于对照组(t=-3. 89~-1. 91,P<0. 05). circRNA_002143表达水平与注意与计算呈显著负相关(r=-0. 645,P<0. 01);circRNA_103636、circRNA_100679、circRNA_104953表达水平与视空间与执行功能、注意与计算、语言、抽象、延迟记忆显著正相关(r=0. 462~0. 589,P<0. 05或0. 01). cir-cRNA_100679、circRNA_104953对视空间与执行功能有显著预测作用(t=9. 49、9. 31,P<0. 01),对视空间与执行功能的解释率为 29. 0%;circRNA_104953 对抽象能力有显著预测作用(t=8. 22,P=0. 009),对抽象变异的解释率为28. 5%. ROC曲线分析表明,抑郁症患者circRNA_103636、circRNA_100679、circRNA_104953表达水平对认知障碍具有中等水平的预测效应(0. 7
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抑郁症外周血circRNA的生物信息学分析
目的采用生物信息学方法预测hsa_circRNA_102802和hsa_circRNA_104597相对应的miRNA的靶基因,并分析其所参与的生物学过程及信号通路.方法应用targetscan,miranda和mirbase预测上述2个circRNA对应的miRNA的靶基因,各个miRNA的预测结果分别取交集后,再取其合集,应用FunNet进行功能富集分析和信号通路富集分析.结果用3个在线数据库得到hsa_circRNA_102802对应的miRNA(has_miR_204_5p,has_miR_809,has_miR_520_5p,has_miR_423_5p,has_miR_617,has_miR_877_5p)的靶基因的合集为199个,hsa_circRNA_104597对应的miRNA(has_miR_659_3p,has_miR_9_5p,has_miR_661,has_miR_576_3p,has_miR_548d_5p,has_miR_548a_5p,has_miR_548b_5p,has_miR_876_5p,has_miR_744_5p)的靶基因的合集为410个;靶基因所涉及的生物学过程广泛,包括多项与中枢神经系统相关的条目,如皮层发育、轴突导向和延伸、突触传递、以及学习和记忆过程等(P<0.05);所涉及的信号通路包括轴突导向、谷氨酸能突触、Wnt信号通路、ErbB信号通路、mTOR信号通路、VEGF信号通路等与抑郁症存在密切联系;hsa_circRNA_102802和hsa_circRNA_104597在抑郁症中可能起着更加重要的作用.结论hsa_circRNA_102802和hsa_circRNA_104597可能与抑郁症的发病机制密切相关.
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膀胱癌新型基因和生物标记物研究进展
膀胱癌是常见的恶性肿瘤之一,在我国的恶性肿瘤中排名第十.膀胱癌是一个多因素,多步骤的复杂变化过程,与多种环境因素有关.一些特异性膀胱癌相关分子生物标记物能提高膀胱癌早期诊疗敏感性和特异性,并可以此为靶点寻找新的抗肿瘤药物和方法.分子标记物应用于预测膀胱癌进展比应用于早期诊断更有价值.近年来,随着分子生物学标记物不断被发现,对膀胱癌有了更深入的认识,目前国内相关综述报道尚少.因此,本文对膀胱癌分子生物学标记物研究进展作一综述.
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脑梗死患者循环circRNA表达谱的分析
目的 采用高通量芯片检测技术研究脑梗死患者循环circRNA的差异表达谱,分析其可能的病理机制和临床相关情况.方法 选取40例脑梗死患者为脑梗死组,人院后抽取血标本,另设40例健康者作对照(健康组).两组均运用芯片检测循环circRNA表达谱,进行组间比较,并运用生物信息学技术探讨其功能机制,同时对显著差异表达的前10个circRNA建立生物信息分析.结果 和健康组比较,脑梗死患者外周血中表达上调和下调的circRNA有348个(P＜0.01或0.05),其中上调186个,下调162个.通过生物信息网络资源检索发现,上、下调的前10位circRNA均储存于中枢及外周等多个部位.结论 脑梗死患者外周血中circRNA的表达异于健康者,提示circRNA可能参与调控脑梗死的发生、发展以及修复等过程.
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灯盏乙素对乳腺癌细胞中环状RNA OXNAD1与SMARCA5的影响
目的 检测灯盏乙素对乳腺癌MDA-MB-231细胞中的环状RNA(Circular RNA,circRNA)的相对表达量的影响,进一步探索灯盏乙素对肿瘤的作用机制.方法 采用实时荧光定量PCR的方法,检测对照组与不同剂量组的灯盏乙素处理后的乳腺癌细胞中circRNA OXNAD1与SMARCA5的相对表达量.结果 灯盏乙素在低剂量(1、10、25μm)的情况下,使得乳腺癌MDA-MB-231细胞中circRNA OXNAD1的表达量显著降低(P＜0.05),在高剂量(100μm)时显著升高(P＜0.05).灯盏乙素在低剂量(1、10、25、50μm)的情况下,使得乳腺癌MDA-MB-231细胞中环状RNA SMARCA5的表达量显著降低(P＜0.05),在高剂量(100μm)时显著升高(p＜0.05).结论 灯盏乙素影响circRNA OXNAD1与SMARCA5的表达,并且存在剂量反应关系,低剂量与高剂量呈现出相反的表达量变化.
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非编码RNA与增生性瘢痕的研究进展
增生性瘢痕不仅影响美观，特殊部位的瘢痕还会影响患者的生活质量，给他们带来生理和心理的双重压力。目前，其治疗手段从单纯的手术治疗逐渐转向联合治疗以及基因治疗。近年来，非编码RNA的研究如火如荼，其在增生性瘢痕中的作用亦逐渐被重视，研究非编码RNA有可能为增生性瘢痕的治疗提供新的思路和方向。
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circRNA在中国人群消化道肿瘤中诊断价值的Meta分析
目的:系统评价环状RNA(circular RNA,circRNA)在中国人群消化道肿瘤中的诊断价值.方法:在PubMed、Cochrane Library、Medline、Embase、万方、知网、维普等数据库检索,筛选2017年6月17日之前发表的可纳入的文献.利用诊断准确度的质量评价工具(QUADAS-2)对文献质量进行评价.采用STATA 14.0软件对灵敏度和特异度进行合并,以及绘制、分析综合受试者工作曲线(SROC)及曲线下面积(AUC).结果:按照纳入、排除标准,共纳入10篇文献.合并后的灵敏度和特异度为0.68(95％CI:0.57～0.78),0.76(95％CI:0.68～0.83),曲线下面积为0.79(95％CI:0.75～0.82).亚组分析示肿瘤类型和样本量是异质性的主要来源.Deeks'漏斗图示本研究存在发表偏倚(P=0.01).结论:circRNA具有成为诊断消化道肿瘤的新型生物标志物的潜能.
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circRNA应用于体液斑鉴定的技术可行性研究
目的 利用circRNA检测技术,探索circRNA分子应用于体液斑迹鉴定的可行性.方法 制备精液、唾液、阴道分泌物三种体液斑迹样本,以Qiagen RNeasy Micro试剂盒提取总RNA,经RNase R消化后得到circRNA,进行逆转录PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳检测分析. 结果 制备的体液斑迹样本均可检测到circRNA分子,提示circRNA普遍存在于法医常见体液斑迹中,具备一定的应用价值. 结论 circRNA的检测可与现有DNA检测技术兼容,利用其组织特异性,可成为体液斑迹鉴定的新标记,具备重要的研究价值.
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基因表达调控分子circRNAs的研究进展
环状RNA(circRNAs)作为一类内源性非编码RNA广泛存在于多种生物细胞中.环状封闭结构、无poly A尾巴是circRNAs结构上的特征,使其不易被核酸外切酶降解,能够逃脱腺苷酸脱支酶脱帽效应.circRNAs参与转录或转录后的基因表达调控,尤其是作为miRNA抑制剂,充当竞争性内源RNA抑制靶标基因的表达.circRNAs结构上的特异性和调控基因表达的生物学功能,可以在疾病易感性检测、疾病诊断、预后和治疗方面发挥作用.本文就circRNAs的分类、特征、已知的生物学功能、致病机制及其临床应用作一综述.
