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膀胱癌组织中KIAA0101的表达和临床意义
目的 检测膀胱尿路上皮癌组织中KIAA0101的表达情况,探讨KIAA0101的表达与膀胱尿路上皮癌生物学行为的相关性.方法 采用RT-PCR检测63例膀胱癌组织和癌旁组织中KIAA0101的mRNA水平表达情况,采用Western blot方法 检测上述癌组织中KIAA0101的蛋白表达水平.将KIAA0101基因表达水平与患者临床病理学特征及预后进行相关性分析.结果 癌组织中KIAA0101的转录和翻译水平均高于正常组织,两者有统计学差异(P<0.01).KIAA0101的表达与肿瘤临床分期和浸润深度有关,KIAA0101高表达者预后较差(P<0.001).结论 KIAA0101基因的表达水平增高可能与膀胱尿路上皮癌的发生、临床分期及其浸润深度有关,且有望成为判断膀胱尿路上皮癌预后的一个重要指标.
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小干扰RNA沉默KIAA0101的表达对皮肤鳞状细胞癌SCL-1细胞增殖和迁移的影响
目的 探讨KIAA0101蛋白表达下调对皮肤鳞状细胞癌(SCC)SCL-1细胞增殖和细胞侵袭能力影响的分子机制.方法 将KIAA0101 siRNA和对照siRNA分别转染SCL-1细胞,将SCL-1细胞分为3组:未转染组、对照siRNA组和KIAA0101 siRNA组.Western印迹检测3组细胞中KIAA0101蛋白的表达,CCK-8试剂检测细胞增殖,用Boyden小室检测细胞侵袭能力,Western印迹检测细胞增殖和细胞侵袭相关蛋白的表达.结果 KIAA0101 siRNA组中KIAA0101蛋白的相对表达量为0.062±0.095,显著低于未转染组(0.359±0.044)和对照siRNA组(0.379±0.025),P＜0.05,SCL-1细胞的增殖和侵袭能力亦降低(P＜0.05).此外,与未转染组和siRNA对照组相比,KIAA0101 siRNA组中p21蛋白表达显著上升,而基质金属蛋白酶2表达显著下调(P＜0.05).结论 KIAA0101表达下调介导的SCL-1细胞增殖抑制和侵袭能力降低与p21和基质金属蛋白酶2表达变化相关.
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KIAA0101调控胃癌细胞周期的相关基因筛选
目的 筛选KIAA0101基因对细胞周期影响的相关基因.方法 以RT-PCR方法分析胃癌组织相对于配对癌旁组织中KIAA0101基因表达量,利用DAVID数据库对差异基因进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,使用KEGG绘制通路图,将与KIAA0101表达模式相关的基因列表回带入TCGA cBioPortal进行基因之间相互网络作用的关系研究,并借由系统生成基因拓扑关系图.后采用RT-PCR方法对候选基因进行筛选.结果 癌组织中KIAA0101 mRNA表达水平为1.104±0.379,显著高于配对癌旁组织(0.421±0.172;P=0.0179).系统通过汇总分析全部基因探针的表达强度,对来自478例组织中与KIAA0101相关的基因进行了筛选.GO功能分析显示差异基因主要富集在蛋白磷酸化、RNA加工、细胞周期、DNA代谢过程、蛋白质转运、乙酰化、细胞凋亡、蛋白质水解、氧化还原等功能.KIAA0101表达水平的改变主要影响的胃癌相关通路有:细胞周期、剪接体、DNA复制、p53信号转导通路等.KEGG通路图及基因拓扑图显示,BUB1B、MAD2L1、CDC45、CDK1、CCNE1、CCNB2等与KIAA0101相关的基因也与细胞周期相关,RT-PCR结果证实BUB1B、MAD2L、CDK1、CCNE1、CCNB2 mRNA表达水平显著高于配对癌旁组织(P<0.05),CDC45 mRNA表达水平无显著性差异(P>0.05).结论 KIAA0101可能通过影响BUB1B、MAD2L1、CDK1、CCNE1、CCNB2表达产生对细胞周期的影响,这个结果可以为KIAA0101影响细胞周期的作用机制、肿瘤标志物的筛选和药物靶点的选择提供参考.
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KIAA0101基因在人非小细胞肺癌中的功能预测
目的 应用生物信息学分析方法对肺癌组织中高表达的基冈KIAA0101进行功能预测与分析.方法 通过dChip软件对人肺癌基因表达谱数据集中癌旁组织与癌组织两组样本进行比较,筛选出与KIAA0101基因共表达的差异基因.运用DAVID、GO、STRING等生物信息学软件对筛选基因进行生物学功能分析,并通过GATHER转录因子预测软件预测该组基因的共同转录因子.结果 与癌旁正常组织比较,肺癌组织中KIAA0101等9个基因表达水平升高两倍以上,并且具有相似表达变化趋势;转录因子预测发现该组多数基因启动子区含有转录因子E2F1结合位点.结论 筛选出人非小细胞肺癌组织中与KIAA0101基因共表达的一组基因,其中BUB1B、CDC20、CCNB2等基因与细胞周期的调节密切相关,推测KIAAO101基因可能参与肺癌细胞周期的调节,并且该组基因转录水平表达升高可能受转录因子E2F1的调控.
