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河南省结核病分子流行病学调查研究
目的探讨河南省结核分支杆菌的分子流行病学分布特征.方法样本的获得采用全省范围等比例分层整群随机抽样;构建以IS6110 RFLP DNA指纹方法和以DR为基础的Spoligotyping DNA指纹方法;采用Gel compare4.1软件对DNA指纹图谱进行聚类(cluster)分析.结果共获得186株可进行IS6110 RFLP DNA指纹分析的结核分支杆菌;其中59.14%(110/186)用Spoligotyping DNA指纹方法鉴定为"北京基因型"菌株.结论北京基因型结核分支杆菌在河南省呈较高水平的流行.
关键词： 分支杆菌 分子流行病学 Spoligotyping 聚类分析 -
114例HIV/MTB双重感染病例结核分枝杆菌Spoligotyping基因分型研究
目的 了解HIV/MTB双重感染病例中结核分枝杆菌基因型构成情况以及北京家族基因型菌株所占的比例,为HIV/MTB双重感染病例结核病预防控制提供分子流行病学依据.方法 收集HIV/MTB双重感染病例结核分枝杆菌临床分离株114株,利用间隔寡核苷酸分型(Spoligotyping)技术对所收集的临床分离株进行分型研究,分析HIV/MTB双重感染病例中结核分枝杆菌基因型构成情况及主要流行型.结果 114例HIV/MTB双重感染病例结核分枝杆菌成2个大的基因家族,即北京家族(Beijing Family)和非北京家族(non-Beijing Family),分别占66.7％(76/114)和33.3％(38/114),共30种基因型.其中,非北京家族包括T家族共18株,H家族共5株,EAI5基因家族1株,CAS1_DEHLI基因家族1株及12种在数据库中没有对应基因家族或没有匹配的结果的新基因型13株.结论 HIV/MTB双重感染病例中,结核分枝杆菌基因型呈明显的多态性,北京家族基因型菌株仍为HIV/MTB双重感染病例中结核分枝杆菌主要流行菌株.
关键词： HIV/MTB 结核分枝杆菌 Spoligotyping -
河南省结核分枝杆菌IS6110DNA指纹图谱特征分析
目的:从分子流行病学角度探讨河南省结核分支杆菌的分布特征.方法:样本的获得采用全省范围等比例分层整群随机抽样;构建以IS6110 RFLP DNA指纹方法和以DR为基础的Spoligotyping DNA指纹方法;采用Gel compare4.1软件对DNA指纹图谱进行聚类(cluster)分析.结果:共获得66株可进行IS6110 RFLP DNA指纹分析的结核分支杆菌;其中 59.09%(39/66) 用Spoligotyping DNA指纹方法鉴定为"北京基因型"菌株.结论:北京基因型结核分支杆菌在河南省呈较高水平的流行.
关键词： 结核分支杆菌 DNA指纹 Spoligotyping 聚类分析 -
结核分支杆菌基因分型技术的应用研究进展
由于耐药菌株蔓延、HIV感染、流动人口骤增,全球结核病疫情雪上加霜,2005年新发感染结核患者900万,死亡160万[1].中国的结核病例数和死亡率已经位居各种感染性疾病之首.由于传统流行病学方法不能很好地揭示其传播规律,多种基因分型技术用于结核分支杆菌(mycobacterium tuberculosis,MTB)的疫情监测、传染源追踪、传播途经查证、复发菌株鉴定、实验室交叉污染的检测等研究中.目前使用为广泛的是IS6110-RFLP、Spoligotyping和VNTR技术.
