中国循证儿科杂志
Chinese Journal of Evidence Based Pediatrics 중국순증아과잡지
- 主管单位： 中华人民共和国教育部
- 主办单位： 复旦大学
- 影响因子： 0.94
- 审稿时间： 1-3个月
- 国际刊号： 1673-5501
- 国内刊号： 31-1969/R
- 论文标题 期刊级别 审稿状态
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基于高通量测序技术的拷贝数变异筛选分析流程的建立及应用
目的 基于高通量测序的CNVs分析流程(PICNIC)与常规拷贝数变异微阵列比较基因组杂交检测方法的检测效率和结果分析.方法 纳人2016年1月1日至2017年12月31日复旦大学附属儿科医院分子诊断中心基于临床需要的、取得患儿家长知情同意的、同时送检了微阵列比较基因组杂交检测和高通量测序分析的病例.以微阵列比较基因组杂交为金标准,PICNIC为待测标准,微阵列比较基因组杂交检测采用安捷伦人类基因组CGH微阵列180K试剂盒,并经其软件进行数据处理和拷贝数变异检测.选择重复片段>500kb,缺失片段>200 kb的CNVs数据分析,经过筛选后,结合患儿表型人工进行结构评判,致病/可能致病(P/LP)为检测到的CNVs已知的表型与患儿表型相符合;临床意义未明(VUS)为检测到的CNVs已知的表型与患儿表型不完全相符合.PICNIC分析流程,从同一测序批次的BAM文件开始,经过外显子覆盖深度计算、质控筛选、CANOES计算CNVs评分并提供候选CNVs.后续从基因水平和区域水平二方面对CNVs进行注释和筛选.比较2种方法问检出率及其敏感性.结果 113例同时送检了微阵列比较基因组杂交检测和PICNIC测序分析流程,平均年龄2岁,发育迟缓82例,惊厥16例,孤独症5例,先天性心脏病3例,遗传咨询病例7例.微阵列比较基因组杂交检测到P/LP为76例,VUS为16例;PICNIC检测到P/LP为92例,VUS为21例;微阵列比较基因组杂交检测到的P/LP和VUS病例,均包含在PICNIC检测到的病例中,16例微阵列比较基因组杂交检测VUS结论的CNVs被PICNIC纳人P/LP,敏感度100％(95％CI:94％～100％),特异度100％(95％CI:81％～100％),阳性预测值82.6％(95％CI:73％～89),阴性预测值56.8％(95％CI:40％～72％).微阵列比较基因组杂交检测到的446个CNVs中,PICNIC也检测到190个,在PICNIC到的236个CNVs中,微阵列比较基因组杂交检测也检测到190个.结论 PICNIC分析流程对于P/LP的CNVs,具有100％的特异性和敏感性,可用于CNVs的临床检测.该方法的建立及临床推广对于进一步挖掘高通量捕获测序数据具有重要意义.
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多中心多学科团队疑难病例讨论(第3例)
1 病例报告1.1 住院病史报告(儿科神经内科魏翠洁)患儿女,3岁2个月,主因"问断呕吐10月余,问断抽搐25 d"于2018-4-20人住北京大学第一医院(我院)儿科,至2018-6-28出院.现病史:患儿10月余前( 2岁4个月)无明显诱因出现问断呕吐,呕吐物为胃内容物,每天呕吐 1～2 次,持续2～3d缓解,之后问隔2d至半个月再次呕吐,不伴发热、腹泻、腹痛,不伴意识障碍、头痛、抽搐,病初未予重视及诊治.8个月前出现食欲减退,伴消瘦,无发热、腹泻,就诊于当地医院,头颅MR、腰穿、胃镜等检查未见异常(未见MR片及报告单),问断予以四磨汤口服液、多潘立酮口服液及中药治疗(具体不详),无明显好转. 患儿仍问断呕吐,食欲欠佳,饮水量亦较少,体重逐渐减轻,并逐渐出现肢体无力,不喜下地,但仍可独走数步.
关键词：
| 年 | 期数 |
| 2018 | 01 02 03 04 05 06 |
| 2017 | 01 02 03 04 05 06 |
| 2016 | 01 02 03 04 05 06 |
| 2015 | 01 02 03 04 05 06 |
| 2014 | 01 02 03 04 05 06 |
| 2013 | 01 02 03 04 05 06 |
| 2012 | 01 02 03 04 05 06 |
| 2011 | 01 02 03 04 05 06 |
| 2010 | 01 02 03 04 05 06 |
| 2009 | 01 02 03 04 05 06 |
| 2008 | 01 02 03 04 05 06 z1 |
| 2007 | 01 02 03 04 05 06 |
| 2006 | 01 02 03 04 |
