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可移动遗传元件:耐药基因的载体
细菌通过各种可移动遗传元件(质粒、转座子、整合子、噬菌体、插入序列共同区等),以基因水平转移的方式从其它细菌获得外源性耐药基因,整合在自身基因组上而产生获得性耐药.本文主要阐述各种可移动遗传元件介导获得性耐药的机制,理解可移动遗传元件在耐药性发展和传播上的作用,是设计和执行干预方法来减少细菌感染威胁的前提条件.本文还介绍了一种新发现的可移动遗传元件:基因转移因子,它与细菌耐药基因水平转移的关系值得研究.
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产超广谱β-内酰胺酶大肠埃希菌耐药机制研究
目的 研究临床分离产ESBLs大肠埃希菌的耐药机制和分子流行病学情况.方法 PCR检测大肠埃希菌的Ⅰ类整合酶、插入序列共同区(ISCR/orf513)、产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)基因;以肠杆菌科间的重复序列(ERIC)为引物进行基因扩增,SPSS13.0分析其遗传多态性.结果 102株产ESBLs的大肠埃希菌中,Ⅰ类整合酶阳性菌有59株(57.8%),orf513阳性菌有6株(5.9%),ESBLs中的TEM型有91株(89.2%),SHV型有0株,CTX-M型有35株(34.3%).根据指纹图谱,可以把102株大肠埃希菌基因型分为82种,经SPSS系统聚类分析,可归为17个大类. 结论 产ESBLs大肠埃希菌的整合酶阳性率较高;整合子和ISCR可以共存;ERIC-PCR是一种效果较好的基因分型方法 .
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铜绿假单胞菌的耐药性分析及Ⅰ类整合子和插入序列共同区调查
目的：了解临床分离的铜绿假单胞菌的耐药性及其Ⅰ类整合子和插入序列共同区（ISCR）携带率，为临床治疗提供参考依据。方法收集从临床患者标本分离得到的106株铜绿假单胞菌，使用WHONET5．6软件分析其临床分布和耐药性，采用PCR和电泳技术对其进行Ⅰ类整合子和ISCR的检测。结果临床分离的铜绿假单胞菌科室来源以肺病科为主，占48．11％；标本来源以痰液为主，占73．58％。铜绿假单胞菌对氨基糖苷类抗菌药物的敏感率为85％左右，对亚胺培南的敏感率为65．09％，Ⅰ类整合子和ISCR的携带率分别为84．91％和76．42％。结论该院铜绿假单胞菌的科室来源以肺病科为主，标本来源以痰液为主，对氨基糖苷类抗菌药物的敏感性相对较好，Ⅰ类整合子和ISCR可能与铜绿假单胞菌的耐药性产生有关。
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耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌 Ⅰ 类整合子及ISCR1与细菌耐药性的相关性研究
目的 探讨耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌临床分离株 Ⅰ 类整合子和插入序列共同区(ISCR1)的分布情况以及所携带耐药基因的种类,分析其结构及其与耐药性关系.方法 收集并鉴定临床分离非重复碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌株44株.采用VITEK2 COM PACT全自动微生物鉴定药敏分析仪和纸片扩散法进行常规药物敏感试验,聚合酶链反应(PCR)检测整合酶 Ⅰ 、ISCR1及二者可变区携带的耐药基因.结果 44株肺炎克雷伯菌32株 Ⅰ 类整合子阳性,未检出 Ⅱ/Ⅲ 类整合子基因,29株 Ⅰ 类整合子可变区阳性,携带耐药基因aa-dA;6株ISCR1阳性,其中1株ISCR1携带的耐药基因sul1;5株同时携带 Ⅰ 类整合子和ISCR1基因的菌株有1株显示两种元件以串联的形式存在于耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌中.药敏试验结果显示,携带 Ⅰ 类整合子菌株比未携带 Ⅰ 类整合子菌株耐药性高.结论 Ⅰ 类整合子广泛存在于耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌中,对菌株耐药性有影响.ISCR1携带较少,其中两种元件以串联形式存在的复合结构影响耐药基因在不同耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌株间的水平传播.
关键词： 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌 Ⅰ类整合子 插入序列共同区 耐药性 -
耐碳青霉烯铜绿假单胞菌耐药机制和传播机制研究
目的 阐明南方医科大学南方医院耐碳青霉烯铜绿假单胞菌的耐药机制和传播机制.方法 采用聚合酶链反应(PCR)-限制性核酸片段长度多态性分析分型和测序技术对临床分离的59株耐碳青霉烯铜绿假单胞菌进行整合子Ⅰ、插入序列共同区(ISCR1)和常见碳青霉烯酶基因研究,采用肠杆菌科间重复一致性序列(ERIC)-PCR技术研究传播机制.结果 59株菌株中20株(34%)整合子Ⅰ阳性,17株(29%)整合子Ⅰ可变区阳性;9株(15%)ISCR1阳性,5株(8%)ISCR1可变区阳性且均携带qnrA1和ampR耐药基因盒.1株检出复杂性整合子Ⅰ,3株检出VIM-2基因,2株检出IMP-1基因.ERIC-PCR聚类分析在80%相似水平上聚为52个类群.结论 整合子Ⅰ、ISCR1和碳青霉烯酶在铜绿假单胞菌介导多重耐药方面有重要作用,ERIC-PCR是进行铜绿假单胞菌同源性分析的有效方法.
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携带blaKPC-2基因泛耐药肺炎克雷伯菌可移动遗传元件分析
目的 了解临床分离的携带blaKPC-2型碳青霉烯酶基因泛耐药肺炎克雷伯菌中可移动遗传元件(mobile genetic elements,MGEs)存在情况.方法 在2008年11月至2009年7月从住院患者中分离19株携带blaKPC-2型碳青霉烯酶基因泛耐药肺炎克雷伯菌,通过分析3种基因gyrA、parC和mdfA序列对菌株进行分子鉴定.采用PCR方法检测4种可移动遗传元件遗传标记基因,分别为:泛宿主性接合性质粒遗传标记trbC、转座子Tn1548遗传标记tnpU、Ⅰ类整合子遗传标记qacE△1-sul1和插入序列共同区遗传标记ISCR1基因;对扩增阳性的4种遗传标记基因PCR产物采用双向测序,测序结果用Chromas软件直接作BLASTSearch比对分析.结果 本组19株gyrA、parC和mdfA基因PCR扩增均阳性,其基因序列经GenBank中的BLASTn程序进行同源性比较分析,证实19株均为肺炎克雷伯菌.19株中,4种可移动遗传元件遗传标记trbC、tnpU、qacE△1-sul1和ISCR1基因阳性率均为100.0％,经对该4种遗传标记基因PCR阳性产物进行测序比对,发现与GenBank中己发布的4种相对应基因trbC、tnpU、qacE△1-sul1和ISCR1序列完全相同(同源性均为100.0％),均得到确认.结论 可移动遗传元件在携带blaKPC-2型碳青霉烯酶基因泛耐药肺炎克雷伯菌中广泛存在.
