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  • 噬菌体生物扩增法检测尿液结核分枝杆菌对肾结核的诊断价值探讨

    作者:何建;陈冬云;魏娇

    目的 利用噬菌体生物扩增法检测尿液结核分枝杆菌,评价其对肾结核诊断价值.方法 对肾结核患者63例应用涂片抗酸染色法检测结核分枝杆菌、结核分枝杆菌培养、噬菌体生物扩增法进行尿液结核分枝杆菌检测,聚合酶链反应法检测结核菌DNA.同时选正常人群21人作为对照组行尿液噬菌体生物扩增法检测结核分枝杆菌,聚合酶链反应法检测结核分枝杆菌DNA.结果 肾结核患者尿液行噬菌体生物扩增法检测结核分枝杆菌阳性率明显高于涂片杭酸染色法检测结核分枝杆菌及结核分枝杆菌培养(P<0.01).与PCR法比较差异无统计学意义(P>0.05),噬菌体生物扩增法检测尿液中结核分枝杆菌对肾结核诊断有较高的特异度(95.2%)和灵敏度(69.8%).结论 噬菌体生物扩增方法检测尿液结核分枝杆菌对肾结核诊断具有重要的参考价值.

  • 噬菌体生物扩增法检测结核分枝杆菌阿米卡星耐药性方法的建立及应用评价

    作者:李同心;崔振玲;汪小黎;陆俊梅;王洁;胡忠义

    目的 建立结核分枝杆菌阿米卡星(Am)耐药性的噬菌体生物扩增法(PhaB)快速检测技术,并探讨其临床应用价值.方法 通过不同菌量及药物浓度的筛选,建立PhaB测定结核分枝杆菌阿米卡星药敏检测方法;用该方法对108株结核分枝杆菌临床分离株进行了阿米卡星药敏检测,同步进行Bactec-MGIT960的Am药敏检测,对2种方法的检测结果进行比较分析.结果不符合的菌株测定其Am的低抑茵浓度(MIC).结果 以细菌接种量10(-3)mg/ml、药物浓度2ug/ml、37℃作用48h为药敏佳检测条件,噬菌体检测108株结核分枝杆菌临床分离株阿米卡星敏感82株、耐药26株,BactecMGIT960检测敏感80株、耐药28株;2法测定均为敏感79株、均为耐药25株.以Bactec MGIT 960测定结果为判断标准,则PhaB的敏感性、特异性、阳性和阴性预测值及符合率分别为89.3%、98.8%、96.2%、96.3%、96.3%.结论 PhaB检测结核分枝杆菌的Am耐药性有较高的敏感性、特异性和准确性,整个检测只需3d,且操作简单、不需特殊仪器设备,可作为M.TB临床分离株Am药敏快速检测备选方法之一.

  • 人高迁移率族蛋白B1原核表达及其高亲和噬菌体融合肽的筛选

    作者:丁宁;肖慧;许立新;余守章

    目的 构建谷胱甘肽巯基转移酶(GST)标记的人高迁移率族蛋白B1(HMGB1)融合蛋白表达载体并在原核细胞中表达.应用噬菌体展示技术筛选HMGB1的高亲和肽.方法 用RT-PCR方法扩增HMGB1 cDNA,构建于原核表达载体pGEX4T-1并转化大肠杆菌,以异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导GST-HMGB1蛋白表达;Ni2+-NTA和多粘菌素B亲和层析柱进行纯化重组HMGB1蛋白.以重组HMGB1蛋白为靶分子,进行4轮噬菌体展示环七肽库的筛选,从第4轮洗脱物中随机挑选20个单克隆噬菌体扩增后进行ELISA鉴定,用酶标仪测定450 nm处的吸光度值.对获得的阳性单克隆噬菌体分别进行扩增、纯化,并对DNA测序,以确定插入七肽的氨基酸序列.结果 RT-PCR扩增HMGB1 cDNA大小约648 bp,成功构建了pGEX4T-1-HMGB1重组质粒并纯化了HMGB1蛋白,其相对分子质量为65000.经过4轮筛选后,噬菌体富集了74倍(第4轮与第1轮回收量分别为5.2×108、7.0×106 pfu),随机挑取的20个噬菌体克隆中9个可与HMGB1结合,测序发现其中的6个序列一致,均为DYFVSSV.结论 筛选到1个可与HMGB1高亲和结合的噬菌体展示七肽,其对HMGB1活性的拮抗效应有待进一步阐明.

  • 人源抗乙肝表面抗原基因工程抗体的研究

    作者:刘洋;孙丽娜;李川;张福顺;梁米芳;李德新

    目的 研制人源抗乙肝表面抗原(HBsAg)基因工程抗体.方法 采集多个HBsAg加强免疫后表面抗体阳性(HBsAb+)志愿者的外周血,分离淋巴细胞,构建人源抗HBsAg Fab噬菌体抗体基因文库.用纯化的HBsAg对抗体库进行富集筛选,经过序列测定确定抗体轻重链型别,分别克隆入真核细胞表达载体pAc-FcR和HL51-14,转染昆虫Sf9细胞和293T细胞,利用杆状病毒/昆虫细胞系统和哺乳动物细胞系统实现全抗体的分泌型表达.结果 成功筛选出20株抗HBsAg的人源Fab抗体并制备出其中6株的IgG全抗体,竞争性ELISA结果显示6株全抗体针对的是HBsAg 3个不同表位.结论 成功筛选并获得了6株针对3个不同表位的抗HBsAg的IgG全抗体,为治疗性抗体和新疫苗的研制奠定了基础.

  • 鼠源抗haPrP23-231噬菌体抗体库的构建和初步鉴定

    作者:黄银霞;韩俊;董辰方;孙力;高晨;王小凡;韩露;周伟;张宝云;姜慧英;梁米芳;董小平

    目的 构建和鉴定鼠源抗haPrP23-231噬菌体抗体库.方法 利用纯化的朊蛋白抗原免疫BALB/c小鼠,取脾,提取细胞总RNA,逆转录cDNA,以其为模板进行免疫球蛋白Fab区基因的特异性PCR扩增,将轻链和重链Fd段基因分别构建到pComb3质粒,构建噬菌体抗体库.结果 经过四轮"吸附-洗脱-富集"的过程后获得了12株阳性克隆.挑取5株进行序列分析,并将结果与GenBank中已知序列库中的IgG序列进行比较,得到了两株不同的抗体,并进行了初步鉴定.结论 本研究为朊病毒病的研究奠定了基础.

  • 人源抗狂犬病毒P蛋白基因工程抗体的研究

    作者:刘洋;孙丽娜;李川;梁米芳;李德新

    目的 筛选针对狂犬病毒人源基因工程抗体.方法 采集狂犬疫苗免疫人群外周血并分离淋巴细胞,构建抗狂犬病毒Fab噬菌体抗体库,用纯化狂犬病毒CTN株富集筛选,ELISA初步鉴定阳性克隆,测序确定抗体轻重链型别,构建IgG全抗表达载体,转染293T细胞并纯化IgG抗体,采用竞争ELISA、Western Blot和IFA鉴定抗体功能.结果 筛选出1株抗狂犬病毒的人源Fab抗体并表达纯化IgG全抗体,IFA结果显示抗体特异针对狂犬病毒,竞争性ELISA,Western Blot结果显示新筛抗体针对磷蛋白.结论 首次通过Fab噬菌体抗体库技术获得针对狂犬病毒磷蛋白人源抗体,为磷蛋白功能机制研究和狂犬病的诊断提供了新的抗体.

  • 泛耐药鲍曼不动杆菌宽宿主谱噬菌体vB_AbaP_PD-AB9的生物学特性分析

    作者:刘一力;郭晓奎;石毅;汤瑾;陈斌;刘芳芳;范惠清;严育忠;徐英

    目的:探讨从医院污水中分离出针对泛耐药鲍曼不动杆菌的宽宿主谱噬菌体,并对其生物学特性进行研究。方法2013年12月至2014年7月在上海多家医院检验科收集的泛耐药鲍曼不动杆菌为宿主菌,采用双层琼脂法从这些医院收集的污水中分离噬菌体,对宽宿主谱噬菌体进行生物学特性分析,包括电镜形态的观察,温度、pH稳定性及佳MOI(感染复数)的测定,吸附性曲线、一步生长曲线和感染曲线的绘制,以及噬菌体基因组DNA的序列测定。结果分离出1株泛耐药鲍曼不动杆菌宽宿主谱噬菌体vB_AbaP_PD-AB9(PD-AB9),电镜形态属短尾噬菌体科。 PD-AB9在4℃~50℃、pH 4~11范围保持稳定,其佳MOI为0.001。吸附试验中,5 min内PD-AB9吸附率达95%以上。 PD-AB9潜伏期为4 min,爆发量为213。 PD-AB9能明显抑制宿主菌的生长,且高MOI组( MOI=1,0.1,0.01)比低MOI组( MOI=0.001,0.0001)作用更快。 PD-AB9基因组为40938 bp大小的线性双链DNA,GC含量39.34%。结论 PD-AB9温度稳定性好、pH耐受范围广、吸附极快、潜伏期短、爆发量大、感染后迅速明显抑制宿主菌生长,有望作为新型抗菌制剂控制耐药鲍曼不动杆菌感染,其基因组生物学信息尚待进一步研究。(中华检验医学杂志,2016,39:296-300)

  • 四种检测方法对结核病临床诊断价值的探讨

    作者:吴龙章;蔡杏珊;吴幸怡;黎燕琼;关玉华;关平;竺澎波

    目的 探讨转录酶主导基因TB-RNA扩增法、噬菌体裂解法、3D培养法和涂片法4种实验室检测方法对结核病临床诊断的应用价值.方法 用以上4种方法对临床每份送检标本同时进行同步检测.其中痰液110份、胸腔积液54份、咽拭子37份、支气管冲洗液31份、脑脊髓液13份、尿液12份、颈部淋巴液8份和其他体液(包括腹腔积液、血液、心包积液、脓性分泌物和大便等)20份以及妇科标本(包括白带、经血等)6份等共计291份.后对上述4种方法检测结果进行评估.结果 291份送检标本中,转录酶主导基因TB-RNA扩增法的总阳性率为37.1%,噬菌体裂解法为28.9%,3D培养法为27.5%和涂片法为10.3%;4种方法检测的敏感度、特异度分别依次为:54.3%和100%、41.7%和98.9%、31.7%和83.5%以及14.6%和98.9%.结论 转录酶主导基因TB-RNA扩增法对结核病临床诊断有较高的应用价值;涂片法阳性率低但其成本低廉且能在实验室中广泛开展;噬菌体裂解法的阳性率略高于培养法;而培养法阳性率远低于转录酶主导基因TB-RNA扩增法和略低于噬菌体裂解法,且需时较长,但培养出的分枝杆菌可做药物敏感性试验和菌型鉴定.

  • 噬菌体生物扩增法对结核性胸膜炎的诊断价值

    作者:何建;李博文;向启云;罗世珍

    目的 利用噬菌体生物扩增法检测胸腔积液(胸液)标本,评价其对结核性胸膜炎诊断价值.方法 对本院住院结核性胸膜炎患者126例(结核性胸液组)、肿瘤患者38例(癌性胸液组)的胸液应用噬菌体生物扩增法进行结核分枝杆菌检测.结果 采用噬菌体生物扩增法检测结核分枝杆菌,酶偶联法检测腺苷脱氨酶浓度,结核性胸液组的阳性率均明显高于癌性胸液组.结核抗体检测结果显示,结核性胸液组与癌性胸液组比较差异无统计学意义.采用噬菌体生物扩增法检测结核分枝杆菌、结核分枝杆菌抗体检测、腺苷脱氨酶检测诊断结核性胸膜炎的特异度分别为100%、57.9%、84.2%,灵敏度分别为42.1%、55.6%、55.6%.结论 噬菌体生物扩增法检测胸液具有极高的特异度,可以快速、可靠地检测结核分枝杆菌,对早期诊断及抗结核效果观察具有重要的参考价值.

  • 人源性阿尔茨海默病噬菌体单链抗体库的构建

    作者:李楠;王建平

    目的:构建人源性阿尔茨海默病(AD)噬菌体单链抗体(scFv)库,为筛选β淀粉样蛋白(Aβ1‐42)的人源性特异性抗体奠定基础。方法采集18例AD患者的外周血40 ml ,提取总RNA ,应用RT‐PCR法得到人抗体可变区重链(V H )和可变区轻链(V L )基因。将 V H 和 V L 由连接肽连接得到 scFv 片段,将所得片段双酶切后,克隆至pCANTAB5E噬菌体载体,大肠埃希菌TG1感受态细胞经电击转化,辅助噬菌体 M13K07拯救后构建scFv型噬菌体抗体库。结果总RNA经逆转录PCR扩增VH和VL可变区基因的凝胶电泳显示,PCR产物长度分别为360 bp和300 bp ,其连接形成的scFv片段长度为750 bp ,终构建了库容为2.4×109的scFv库。BstNⅠ酶切鉴定构建的scFv库,经凝胶电泳可见,酶切片段长度差异性大,显示scFv库具有良好的多样性。结论成功构建人源性AD噬菌体scFv库,为进一步筛选Aβ特异性抗体,继而为AD的治疗研究奠定基础。

  • 噬菌体对鲍曼不动杆菌所致小鼠肠源性脓毒症的治疗效果

    作者:李菁华;余静丹;史红艳;王丹;逯茵茵;张哲;孙延波

    目的 观察噬菌体对鲍曼不动杆菌引起的小鼠肠源性脓毒症的治疗效果.方法 采用双层琼脂法从环境中分离鲍曼不动杆菌噬菌体.通过腹腔注射氨苄青霉素和环磷酰胺的方法,同时经口感染耐氨苄青霉素鲍曼不动杆菌,建立小鼠肠源性脓毒症模型.在细菌感染前1d、感染结束后2d,以及感染结束后6d给予噬菌体治疗,观察小鼠的存活情况.另取未给予噬菌体治疗小鼠作为对照.各组分别设6只小鼠.采用成组设计的两样本均数t检验比较噬菌体治疗组和对照组小鼠外周血和肝脏内炎症因子水平,以及肝脏和脾脏内的细菌数量.结果 鲍曼不动杆菌引起肠源性脓毒症小鼠全部死亡的小致死量为1×107 CFU/mL.在感染前、结束后2d和6 d给予噬菌体治疗,分别有2,4,3只小鼠存活,对照组全部死亡.噬菌体治疗组小鼠外周血白细胞介素(IL)-1β、肿瘤坏子因子(TNF)-α和IL-6水平分别为(105±6) ng/L,(105±11)ng/L和(104±12) ng/L,明显低于对照组(t=5.04,9.05和9.33,P<0.01);噬菌体治疗组小鼠肝脏内的IL-1 β和TNF-α水平分别为(104 ±9) ng/L和(104±11)ng/L,亦低于对照组(t=13.70和12.80,P<0.01),但IL-6水平治疗组与对照组比较差异无统计学意义(t=1.06,P>0.05);噬菌体治疗组小鼠肝脏和脾脏内细菌数量分别为(2.9±1.3)×103CFU/g和(8.3±7.6)×102 CFU/g,明显低于对照组(=9.16和8.96,P<0.01).结论 噬菌体治疗鲍曼不动杆菌引起的肠源性脓毒症确切有效.

  • 随机十二肽噬菌体展示文库筛选血型B抗原模拟多肽的实验研究

    作者:李许锋;罗敏;邹建军;岑东芝;何克菲;张积仁

    目的:筛选出替代血型B抗原的模拟多肽,用多肽抗原替代糖类抗原.方法:抗血型B抗原的单克隆抗体作为固相筛选靶分子,对随机十二肽噬菌体展示文库进行生物淘选(bio-panning),经包被-结合-洗脱-扩增等循环3轮,对筛选的克隆ELISA鉴定,并通过剂量依赖实验验证其结合特异性.后提取DNA测序,确定模拟肽氨基酸序列.结果:3轮筛选结束,得到2个亲和力较强的十二肽序列TKNMLSL-PVGPG和HSLKHTQMSYSS.结论:经过生物筛选得到模拟多肽序列,利用噬菌体展示技术筛选糖类抗原的模拟肽具有可行性,为糖类抗原的研究提供一种新思路.

  • 抗人肺癌噬菌体展示可溶性ScFv的筛选与鉴定及其序列测定

    作者:岳文涛;赖百塘;张春燕;湛秀萍

    目的:制备抗人肺癌单链抗体(single chain Fv ferment antibody,ScFv),并对抗体生物学特性进行初步研究.方法:以人肺腺癌细胞系A2为抗原,对5 F-11杂交瘤细胞噬茵体抗体库进行富集和筛选.以人肺腺癌细胞系A2和正常人淋巴细胞为抗原,进行酶联免疫吸附试验,从富集后的噬菌体抗体库中筛选出只与A2细胞结合的阳性克隆.筛选的噬茵体克隆转染大肠埃希茵HB2151,得到可溶性单链抗体分泌克隆.可溶性抗体分泌克隆测序.应用 ELISA、竞争性ELISA、SDS-PAGE及蛋白质印迹法对其中的2A7-1克隆进行初步鏊定.结果:以肺腺癌细胞A2为抗原进行了4轮富集.进一步筛选得到18个仅识别A2细胞而与人淋巴细胞无反应的融合抗体分泌克隆.转染大肠埃希茵HB2151后筛选到能与A2细胞特异结合的可溶性抗体分泌克隆2A7-1.竞争性ELISA结果显示,5F-11能强烈抑制2A7-1与A2细胞的结合.SDS-PAGE蛋白质印迹法显示得到大小约为30×103的单链抗体.结论:通过噬菌体抗体技术成功分离到了鼠单抗5F-11的可溶性ScFv分泌克隆,为进一步的抗体应用研究奠定了基础.

  • 铜绿假单胞菌噬菌体PaP3生物学特性的研究

    作者:周莹冰;申晓冬;李明;黄建军;胡晓梅;饶贤才;胡福泉

    目的 测定铜绿假单胞菌噬菌体PaP3的佳感染复数、一步生长曲线和吸附K值及交叉吸附K值等基本生物学特性.方法 按照感染复数(MOI)分别为0.000 1、0.001、0.01、0.1、1和10加入噬菌体纯培养液和宿主菌,充分裂解细菌后,测定噬菌体滴度;以MOI=10的比例加入噬菌体及宿主菌,进行一步生长实验;纯化PaP3颗粒,免疫家兔,获得抗血清,通过中和反应实验测定PaP3和其抗血清之间的吸附反应常数K值.同时,利用抗血清交叉中和试验确定本室分离的三株噬菌体之间的血清学关系.结果 当MOI=0.001时PaP3感染其宿主菌产生的子代噬菌体滴度高;根据一步生长实验结果绘制一步生长曲线;通过血清交叉中和反应得出不同的吸附常数.结论 PaP3佳感染复数为0.001,感染宿主菌的潜伏期是20min,爆发期是60min,平均爆发量约为31,其抗血清反应的吸附常数K值为262.

  • 噬菌体展示技术筛选甲型H1N1流感病毒抗原模拟表位的研究

    作者:蔡炯;钟彦伟;荆霞;陈丽;李方;徐东平

    目的 筛选特异性甲型H1N1流感病毒抗原模拟表位.方法 应用噬菌体表面展示技术,以2009年甲犁H1N1流感康复患者的血清作为固相筛选分子,对人工合成的噬菌体随机环七肽库进行3轮"吸附-洗脱-扩增"筛选.从顶部琼脂噬菌斑中随机挑取32个克隆至处于对数生长期的大肠埃希菌中培养,采用ELISA,交叉反应以及竞争抑制性实验筛选并鉴定阳性克隆,对阳性克隆进行DNA序列分析,对其编码的展示于噬菌体表面的氨基酸序列与流感病毒血凝素(HA)基因进行同源性比较.确定甲型H1N1流感病毒抗原的模拟表位.结果 从随机挑选的32个克隆中得到12个阳性克隆,确定氨基酸序列PLHARLP为甲型H1N1流感病毒抗原的模拟表位,其表位由HA的第52,53,59,60,61,83,271位氨基酸共同构成.结论 用噬菌体环七肽库筛选得到甲型H1N1流感病毒的模拟表位,为开展用流感病毒模拟表位探索新的流感防治方法奠定了基础.

  • 人破伤风免疫噬菌体单链抗体库的构建及体外亲和筛选

    作者:王晗;于蕊;张晓鹏;任军;谢娜;樊红艳;张金龙;房婷;于长明;陈薇

    目的 构建人破伤风免疫噬菌体单链抗体库,筛选抗破伤风毒素重链C端(TeNT-Hc)的特异性单链抗体(scFv).方法 利用RT-PCR从5名破伤风抗体滴度较高的健康献浆员外周血淋巴细胞中获得全套人破伤风抗体VH和VL基因,经过重叠PCR将VH和VL基因连接获得scFv片段.将scFv片段克隆至pCANTAB5E载体,电转化大肠TG1感受态菌,获得抗体库.以TeNT-Hc为抗原对抗体库进行3轮筛选,获得特异性人源性抗TeNT-Hc单链抗体.scFv由pET32a(+)表达载体表达,产物包涵体采用HisTrap FF预装柱纯化并透析复性.采用非竞争酶免疫实验法测定scFv亲和常数(affinity constant,KD值).检测scFv抑制TeNT-Hc与神经节苷脂GT1b结合的体外中和活性,计算抑制率.结果 构建库容量为1×108的人破伤风免疫噬菌体单链抗体库,经过筛选获得3株特异性较好的人源性抗TeNT-Hc单链抗体.原核表达结果显示,3株scFv均以包涵体形式存在,表达量占菌体总蛋白的40%~45%.包涵体经洗涤、纯化和复性后,scFv均保持了与TeNT-Hc的特异结合活性,1L培养物经纯化后可获得4 ~6 mg scFv蛋白.亲和力测定结果,27G、22D和S-4-7H-scFv的KD值分别为(1.25×10-7),(2.31×10-7)和(1.97×10-7)mol/L.3株抗体对TeNT-Hc与神经节苷脂GT1b结合的抑制率分别为64.5%,58.6%和51.5%.结论 人破伤风免疫噬菌体单链抗体库的构建及具有体外中和活性的特异性抗TeNT-Hc单链抗体的获得,为人破伤风基因工程中和抗体的制备奠定了良好基础.

  • CRISPR系统与哺乳动物免疫系统的比较及其功能的研究进展

    作者:刘鸿博;李浩;邱少富;宋宏彬

    原核生物防御噬菌体入侵的机制与哺乳类免疫防御机制有很多相似之处,尤其是特异性免疫机制,原核生物的特异性免疫系统即成簇规律间隔短回文重复序列( clustered regularly interspaced short palindromic repeats, CRISPR)与哺乳类特异性免疫系统在很多环节体现了相似的规律。通过比较,能够加深对CRISPR的免疫功能的认识。近年发现,除了发挥特异性免疫功能,CRISPR系统还参与了许多细菌生长代谢过程的调控机制,调控基因表达的能力更是受到广泛的关注。 CRISPR系统功能的复杂程度远远超出免疫防御的范畴,值得深入研究。

  • 噬菌体裂解与BACTECMGIT960检测结核菌方法比较

    作者:张红;郑秀云;姜行云

    目的:比较两种检测结核菌方法的差异.方法:我院肺结核患者痰标本160份分别做噬菌体裂解法与BACTECMGIT960法.结果:噬菌体裂解法阳性率为50.6%,BACTECMGIT960法阳性率为51.8%.结论:两种方法有高度一致性,但噬菌体裂解法特异性高,报告时间短,操作简单,无需昂贵的自动化仪器,便于在一般实验室使用.

  • 肿瘤干细胞表面标记物CD133高亲和结合肽的筛选

    作者:孙晋敏;张超;李学农

    目曲:应用噬菌体肽库技术筛选肿瘤干细胞表面标记物CD133特异性结合短肽,为干细胞研究、肿瘤治疗及抗肿瘤转移研究提供新的技术和工具.方法:利用链霉亲和素与生物素的高度亲和力,以生物素标记的鼠CD133细胞外段(bio-CD133)为靶,对噬菌体七肽库进行液相筛选,应用夹心ELISA选择出结合较强的克隆,提取DNA并测序,通过竞争性阻断实验验证其特异性.结果:通过三轮体外液相筛选,得到结合能力较强的高亲和结合肽,5条完全一致的重复序列为APSPMIW和3条完全一致的重复序列为LQNAPRS,竞争性阻断实验证实其特异性较强.结论:利用噬菌体肽库技术成功地筛选出具有较高亲和力和特异性的CD133结合肽,表明以生物素标记的小分子多肽为靶筛选结合肽的技术具有可行性.

  • 丙型副伤寒沙门氏菌噬菌体SPC-P1在不同血清型中的分布及整合位点分析

    作者:赵潘;彭宜红;邹清华

    目的:确定丙型副伤寒沙门氏菌( Salmonella paratyphi C, SPC)噬菌体SPC-P1在其他血清型中是否存在,并确定其在宿主菌基因组中的整合位点. 方法:以丙型副伤寒沙门氏菌RKS4594基因组中SPC-P1为模板,设计6对引物,分别在11株伤寒沙门氏菌、11株甲型副伤寒沙门氏菌、12株乙型副伤寒沙门氏菌和23株丙型副伤寒沙门氏菌中进行SPC-P1片段的扩增. 同时下载美国国立生物技术信息中心( National Center for Biotechnology Informa-tion,NCBI)基因组数据库中全基因组序列完成的100株20个血清型的沙门氏菌全基因组序列,通过Mauve 2. 3. 1软件进行比对,以确定SPC-P1在各个血清型中的分布. 根据SPC-P1在RKS4594基因组中的整合位点,设计引物,对10株SPC-P1阳性的丙型副伤寒沙门氏菌进行扩增,并对产物测序,根据测序结果分析SPC-P1 整合情况. 结果:SPC-P1广泛存在于丙型副伤寒沙门氏菌基因组中,14株能够扩增到所有的6个片段,2株扩增到3~5个片段,所有扩增阳性的片段与预期大小吻合. 在伤寒沙门氏菌、甲型副伤寒沙门氏菌和乙型副伤寒沙门氏菌中,6个片段均阴性或仅存在1~2个片段,并且片段均比预期小. Mauve比对结果显示,仅在与丙型副伤寒沙门氏菌进化关系较近的猪霍乱沙门氏菌中存在接近完整SPC-P1的片段,但序列相似性存在差异. SPC-P1在丙型副伤寒沙门氏菌基因组中的整合位点是固定的,位于两个相邻基因 pgtE 和yfdC之间. 结论:SPC-P1是丙型副伤寒沙门氏菌独特的致病因子,其存在可能使得丙型副伤寒沙门氏菌的宿主范围、致病性大小等功能方面有别于其他沙门氏菌.

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