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SNP array 精确诊断1型缺失型Angelman 综合征一例
目的：探讨单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array)在Angelman 综合征(Angelman syndrome,AS)基因型与表型对应分析中的应用。方法对1例临床表现为先天畸形、智力低下、发育迟缓等异常的患儿及其父母行外周血染色体核型分析和 SNP array 检测,同时用基于 SNP 信号的孟德尔遗传错误校验进行家系传递分析,之后用荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)检测验证 SNP array 结果。结果患儿 SNP array 结果显示15q11.2q13.1(22770421~28823722)存在6.053 Mb 缺失,与1型缺失型 AS 关键区域完全重叠。患儿父母染色体核型、SNP array 及 FISH 检测结果均未见异常,表明15q11.2q13.1缺失为新发的变异。家系孟德尔遗传错误校验结果提示患儿15q11.2q13.1缺失为母源性片段缺失。结论SNP array 可以精确地分析15q11q13缺失片段的大小、断裂点及其亲源性,从而有效地诊断缺失型 AS,促进 AS 基因型与表型的对应关系分析。
关键词： Angelman综合征 缺失 单核苷酸多态性微阵列 基因型 表型 -
一例1q部分单体并17q部分三体胎儿的遗传学分析
目的 对1例畸形胎儿进行细胞及分子遗传学分析,探讨基因型与表型的关系.方法 对1例产前超声异常的胎儿行G显带染色体核型分析、单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array)及荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)检测.胎儿父母行外周血染色体核型分析及FISH检测.结果 SNP array结果显示胎儿1q44存在4.4 Mb缺失,17q24.3q25.3存在10.4 Mb重复.根据胎儿SNP array和FISH结果及其父母外周血FISH结果,确认胎儿父亲为隐匿性t(1;17)(q44;q24.3)携带者,而胎儿遗传了其中一条衍生的1号染色体der(1)t(1;17) (q44;q24.3).结论 胎儿超声异常特点可能是1q44缺失和17q24.3q25.3重复的结果,其中,1q44微缺失是否对表型的产生起主导作用,需要进一步的研究验证.
关键词： 单核苷酸多态性微阵列 相互易位 携带者 微缺失 微重复 -
一例不明原因智力低下患者的遗传学分析
目的 联合应用三引物PCR(three primer PCR,TP-PCR)和单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array)分析1例智力低下患儿的基因型,并探讨其与表现型的对应关系.方法 采集患儿的外周血样并提取DNA,应用TP-PCR检测其FMR1基因5 '非翻译区(5'-untraslated region,5'-UTR)区CGG重复的拷贝数,应用SNP array对患儿进行全基因组高分辨率分析.结果 TP-PCR检测显示患儿FMR1基因5'-UTR区的CGG重复拷贝数无异常扩增,可排除因脆性X综合征导致的智力低下.SNP array检测提示患儿染色体7q36.1-q36.2区存在0.93 Mb的杂合性重复,而12p13.1-p13.2区则有2.2 Mb的杂合性缺失.结论 杂合性重复或缺失导致患儿智力低下的可能性较大.SNParray分析能够发现微小的染色体缺失或扩增,为临床提供详细的诊断结果,可作为不明原因智力低下的首选检测方法.
关键词： 智力低下 单核苷酸多态性微阵列 FMR1基因 -
应用SNP array诊断一例5p缺失综合征合并11q部分三体胎儿
目的 探讨单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array)在胎儿5p缺失综合征合并11q部分三体诊断中的应用.方法 对1例多发畸形胎儿行羊水G显带核型分析及SNP array分析,以明确染色体异常情况.胎儿父母行外周血G显带核型分析以确定胎儿异常染色体的来源,荧光原位杂交(fluorescencein situ hybridization,FISH)检测验证核型分析的结果.结果 羊水细胞G显带核型分析显示胎儿核型为46,XY,der (5)(?∷p15→qter).SNP array分析结果显示胎儿5p15.33p15.2 (chr5:113 576-14 020 561)缺失,大小为13.907 Mb,缺失区域与5p缺失综合征区域重叠;11q23.3q25 (chr11:116 684 627-134 938 470)重复,大小为18.254Mb,未覆盖已知的疾病综合征.胎儿母亲染色体核型为46,XX;胎儿父亲染色体核型为46,XY,t(5;11)(p15;q23).父亲外周血中期分裂相三色FISH结果验证了5p和11q相互易位.结论 SNP array可以鉴别G显带无法完全辨别的胎儿5p缺失综合征合并11q部分三体,并精确定位断裂点,从而促进表型相关的关键区域定位和候选致病基因的筛选和鉴定,为基因型和表型的关系分析积累数据.
关键词： 单核苷酸多态性微阵列 5p缺失综合征 11q部分三体 -
一例非典型缺失型神经纤维瘤Ⅰ型胎儿的产前诊断
目的 探讨1例胎儿非典型缺失型神经纤维瘤Ⅰ型(neurofibromatosis type 1,NF1)的基因型与异常表型的对应关系.方法 对1例超声检查提示胎儿双足内翻的孕妇进行脐血穿刺.对获取的脐血样本进行G显带核型分析以及单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array)检测,并采用荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)验证SNP array的检测结果.对患儿父母进行外周血FISH检测,以明确胎儿基因组变异的来源.结果 胎儿脐血染色体核型为46,XY.脐血SNP array结果显示染色体17q11.2区存在3.132 Mb的基因组片段缺失.该缺失区域覆盖了NF1微缺失综合征区域.对胎儿及其父母的FISH检测则提示胎儿携带的17q11.2微缺失为新突变.结论 胎儿足内翻可能是不典型缺失型NF1的超声异常表现之一.SNP array可以在胎儿期准确地诊断缺失型NF1.
关键词： 神经纤维瘤Ⅰ型 微缺失 单核苷酸多态性微阵列 足内翻 -
一例Wolf-Hirschhorn综合征合并Jacobsen综合征的产前遗传学分析
目的 应用单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP-array)对1例携带非平衡染色体易位的复杂先天性心脏病胎儿进行检测,分析其基因型与表型的对应关系,探讨其发病原因.方法 采用常规G显带分析胎儿及其父母的染色体核型.应用SNP-array对患儿进行全基因组高分辨扫描,并用多重连接探针扩增(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)进行验证.结果 G显带染色体分析提示胎儿及其父母核型均正常.SNP-array检测显示胎儿4号染色体的短臂存在13.877 Mb的重复(4p16.3-p15.33,48283-13925186),11号染色体长臂存在15.653 Mb的缺失(11q23.3-q25,119291480-134944006).MLPA检测证实了上述变异的存在.结论 4号染色体短臂部分三体(Wolf-Hirschhorn综合征)及11号染色体部分单体(Jacobsen综合征)可能是导致胎儿先天性心脏病的原因,但其父母的染色体核型无助于分析上述染色体异常的成因以及再发风险.SNP-array具有高分辨和高准确度的优点,可为产前遗传学诊断提供更为详细的信息.
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88例稽留流产组织的SNP-array检测结果分析
目的 探讨将单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP-array)应用于早期流产遗传学病因分析的可行性.方法 对于确诊为稽留流产的88例患者,在刮宫术后留取绒毛组织,同时进行SNP-array检测和常规绒毛细胞培养核型分析,比较二者的结果.结果 88例绒毛染色体核型分析的成功率为85.2％(75/88),SNP-array检测成功率100％,二者的差异有统计学意义(P<0.05).染色体分析检出异常核型41例,异常率为54.7％(41/75).SNP-array检出异常染色体47例,异常率为53.4％(47/88).两种方法同时检测成功75例,检测结果完全的一致率为84％(63/75).在12例不完全一致的样本中,包括3例平衡性结构异常、5例嵌合体、2例四倍体、1例拷贝数变异和1例单亲二倍体.结论 稽留流产绒毛组织的染色体异常类型较多,SNP-array虽然具有较高的成功率和准确度,仍需与常规的染色体核型分析联合应用,才能更为准确地揭示稽留流产的遗传学病因.
关键词： 单核苷酸多态性微阵列 稽留流产 绒毛培养 染色体核型分析 -
产前遗传学诊断胎儿重度侧脑室增宽1例及文献复习
目的 报道1例胎儿重度侧脑室增宽的产前遗传学诊断病例,并对相关文献进行复习.方法 患者30岁,妊娠32周超声检查发现胎儿重度侧脑室增宽,左侧宽17 mm,右侧宽19 mm,未发现其他异常.之前的产前检查均未发现异常.行脐静脉穿刺术,取脐血细胞行染色体核型分析及单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array)分析.结果 脐血细胞染色体核型分析未见异常.SNP array分析结果 为arr 9q31.3(113,431,222-113,552,613)x3,14q11.2(20,512,609-22,641,623)x1-2,提示在9q31.3位点存在121 kb的重复,约28%的细胞在14q11.2区段有2.129 Mb片段的缺失,胎儿为该片段缺失的嵌合体.进一步行间期细胞荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)分析证实在13%的细胞中存在该位点的缺失,从而验证了SNP array结果 的准确性.向孕妇及其家属进行咨询之后,孕妇及家属选择终止妊娠,于妊娠34周行利凡诺引产,分娩一死女婴,孕妇及家属拒绝尸检.结论 超声检查发现胎儿孤立性重度侧脑室增宽,应进行产前遗传学诊断.SNP array分析技术是产前诊断新生染色体小片段改变的有效方法 ,FISH是对嵌合体进行验证的有效手段.
关键词： 单核苷酸多态性微阵列 荧光原位杂交 核型分析 重度侧脑室增宽 产前诊断
