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猪链球菌分子生物学分型研究进展
猪链球菌(Streptococcus suis)是重要的人畜共患病病原,在世界范围内广泛分布,因在屠宰或猪肉加工环节中接触病猪而感染该菌,病例的临床表现主要是败血症、脑膜炎、心内膜炎、关节炎、休克及永久性耳聋等[1].猪链球菌可以在正常猪的鼻腔、扁桃体、上呼吸道等处存在,这种无症状携带被认为是猪链球菌传播和扩散的重要原因之一[1].
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沙眼衣原体分子生物学分型方法研究进展
沙眼衣原体(chlamydia trachomatis,CT)引起的泌尿生殖感染是常见的细菌性性传播疾病之一.明确CT分子生物学特征对衣原体疾病病理生理机制的阐明具有重要意义.CT的传统分型方法为血清型分型.CT的分子生物学分型方法主要基于编码CT主要外膜蛋白的ompA基因的序列分析.随着时间进展,新的高分辨率基因分型方法,如多位点序列分析技术、多位点数目可变串联重复序列分析技术、DNA-杂交技术、DAN芯片技术和全基因序列分析技术等为CT分型提供了极大的分辨率.本文对当下应用的多种CT分子生物学方法做一综述,从中获得的信息有助于衣原体相关疾病的针对性预防和治疗优化,旨在减少疾病传播.
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第十四届世界肺癌大会掠影
2011年7月6日第14届世界肺癌大会在荷兰首都阿姆斯特丹隆重召开,会议发表论文3000余篇,有来自世界各地的近4000位专家参加了此次大会.本届大会讨论了肺癌预防、影像诊断和早期发现方面的新进展;分析肺癌分子生物学和药物基因组学方面的进展对肺癌个体化治疗的影响;国际肺癌研究协会(International Association for the Study of Lung Cancer,IASLC)新分期系统在胸部恶性肿瘤中的应用;根据分期、临床和分子生物学特征,制定手术治疗、放疗、全身治疗相结合的综合治疗计划;公布了有关肺癌、间皮瘤和胸腺瘤的临床试验的新结果;肺癌的姑息治疗的新进展.本届大会内容丰富,涉及范围广泛,涵盖了肺癌的方方面面,从预防到烟草控制,从基础、转化性医学到临床,其中肺癌的靶向治疗进展无疑是本届大会的重点之一.本文将对本次大会肺癌靶向治疗的进展与动态作一介绍.
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9株O139群霍乱弧菌的药敏试验、CT基因检测及分子生物学分型结果分析
目的：通过对一起霍乱疫情中分离的9株 O139群霍乱弧菌进行药敏试验，为疫情防控提供科学依据。方法运用K-B法检测9株O139群霍乱弧菌对七种抗生素的敏感性，实时荧光定量PCR检测霍乱毒素基因，采用PFGE对19株O139群霍乱弧菌分子分型。结果9株O139群霍乱弧菌对环丙沙星、头孢噻肟、头孢哌酮、诺氟沙星和庆大霉素敏感，部分菌株对阿莫西林和四环素两种药物耐药；霍乱毒素基因检测阳性。19株O139群霍乱弧菌有17株属于同一PFGE型别。结论这次霍乱疫情的原因可能是卤菜拼盘制作（卤牛肉、卤牛肚等卤制品和凉菜）过程中受到霍乱弧菌的污染所致，头孢噻肟可作为此次疫情首选治疗和预防用药。
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我国耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分子流行病学研究进展
金黄色葡萄球菌是人体皮肤黏膜的常见定植菌群，主要引起化脓性感染。甲氧西林于1959年用于临床治疗金黄色葡萄球菌产酶株的感染，但在1961年，英国的Jevons就发现了耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（ MRSA）。之后MRSA的检出率不断增加，已成为全球范围内院内感染的重要病原菌。2002年发现对万古霉素耐药的MRSA，其广泛耐药给临床治疗带来较大困难。分子生物学的发展为我们提供了快速、准确的检测手段，通过对菌株进行分型，能够更好的分析菌株的流行病学特征及来源，从而更有效率的制定应对措施。本文对我国MRSA分子流行病学研究进行综述，为MRSA的防控提供参考。
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湖南省B群脑膜炎奈瑟菌药物敏感性及分型
近年来,湖南省流行性脑脊髓膜炎(简称流脑)流行以C群脑膜炎奈瑟菌(Nm)为主[1],2009年2月,首次从流脑患者身上分离出B群脑膜炎奈瑟菌,2010年在健康人群流脑咽拭子中,同时分离到4株B群脑膜炎奈瑟菌.为掌握湖南省B群脑膜炎奈瑟菌的分子生物学特征,为有效的预防和控制其流行提供依据,本研究采用传统检验方法和聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)、脉冲场凝胶电泳(pulsedfield gel electrophoresis,PFGE)等方法对上述B群流脑奈瑟菌分离株进行了鉴定和分型分析.现将结果报告如下.
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脉冲场电泳分析布鲁菌标准菌株
目的 探索一种布鲁菌分型的快速、准确、可靠的分子生物学方法.方法 建立脉冲场凝胶电泳(PF-GE)的分子生物学分型方法,比较染色体限制性内切酶图谱,确定菌株的亲缘关系.结果 在分析的19株布鲁菌标准菌株中,6种布鲁菌的PFGE图谱各不相同,但猪种菌和犬种菌的PFGE图谱只有1条带不同.羊种菌和猪种菌内各生物型均可在各自种内被区别,但牛种菌各生物型被区分为3类.从系统发生的观点来看,羊、牛、猪种菌是从共同祖先进化来的,犬种菌可认为是猪种菌的主要株或是刚从该种布鲁菌进化而来的株.沙林鼠种菌与牛种菌关系密切,而绵羊附睾种菌与猪种5型菌遗传距离也较近.结论 PFGE方法可用于布鲁菌的基因分型的研究,是对传统分型方法一种较好的补充.
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成人和儿童金黄色葡萄球菌感染分子流行病学研究
目的 研究上海交通大学医学院附属仁济医院(简称上海仁济医院)及上海儿童医学中心分离的金黄色葡萄球菌(简称金葡菌)的分子流行病学特征及药物敏感性状况,为临床合理用药提供依据.方法 收集2012年上海仁济医院分离的313株金葡菌和上海儿童医学中心分离的153株金葡菌,采用多位点序列分型(MLST)、葡萄球菌蛋白Aspa基因分型和葡萄球菌染色体rnec基因(SCCmec)分型技术进行分子生物学分型,对其中的耐甲氧西林金葡菌(MRSA)进行SCCmec分型;采用纸片扩散法对金葡菌进行药物敏感性分析.结果 2012年上海仁济医院313株金葡菌有42.49％来自痰样本,其中MRSA 173株,检出率为55.27％;MLST结果MRSA以ST5型为主;spa基因分型结果以t002型多,为90株,占MRSA的52.02％,其次为t030型(42株,24.28％);SCCmec分型结果以Ⅱ型为主.上海儿童医学中心153株金葡菌有62.09％来自痰样本,其中MRSA33株,检出率为21.57％;MLST结果MRSA以ST59型为主;spa基因分型结果以t437型多,为14株,占MRSA的42.42％,其次为t002型(5株,15.15％)及t316型(4株,12.12％);SCCmec分型结果以Ⅳ型为主.药物敏感性试验结果显示上海仁济医院和上海儿童医学中心金葡菌对万古霉素、去甲万古霉素、替考拉宁、利奈唑胺及替加环素5种抗菌药物100％敏感,对其他抗菌药物耐药率比较高.上海儿童医学中心MRSA对环丙沙星、莫西沙星、左氧氟沙星、克林霉素、利福平、庆大霉素的敏感性均明显高于仁济医院MRSA(P ＜0.01),对头孢唑啉及红霉素的敏感性差异无统计学意义(P＞0.01).结论 2012年上海仁济医院MRSA以ST5-t002-Ⅱ为主,上海儿童医学中心MRSA以ST59-t437-Ⅳ为主.相比于甲氧西林敏感金葡菌(MSSA),MRSA的克隆型别相对集中,更容易引起医院内的传播.MRSA在金葡菌中的分离率较高,临床应根据药物敏感性试验结果合理使用抗菌药物.
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50株临床分离金黄色葡萄球菌分子流行病学及药物敏感性分析
目的 研究北京电力医院2009年10月至2010年3月连续分离的金葡菌的分子流行病学特征及药物敏感性状况.方法 收集在此期间临床连续分离的金葡菌,采用多位点序列分型(MLST)和葡萄球菌蛋白A基因(spa)分型技术进行分子生物学分型,同时进行Panton Valentine(PVL)毒素基因检测,并对其中的33株甲氧西林耐药金葡菌(MRSA)进行SCCmec分型；采用琼脂稀释法作MRSA对14种抗菌药物的药敏试验.结果 50株金葡菌中,检出MRSA 33株,占66.0％,其中1株为社区获得性(CA)-MRSA.MRSA有6种克隆型,其中ST239-t030-Ⅲ型占绝对优势,并且发现了国内罕见的新克隆型(ST239-t2270-Ⅲ)的传播；相比较,MSSA分子分型则呈散在分布.药敏试验结果显示,糖肽类抗生素及替加环素对MRSA的抗菌作用强.CA-MRSA携带PVL毒素基因,其耐药谱与医院获得性(HA)-MRSA有较大差异.结论 相比于MSSA,MRSA的克隆型别相对集中,提示MRSA更容易引起医院内的传播.MRSA以ST239-t030-Ⅲ为常见型别,与我国总体趋势一致.
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感染中枢神经系统肠道病毒的分子生物学分型研究
目的 探讨感染中枢神经系统肠道病毒(EV)的分子生物学分型.方法 收集脑炎患儿脑脊液(CSF)样本72例,以EV71、COXB3、ECH030标准病毒株为阳性对照,脑外科手术患儿CSF为阴性对照.采用通用引物和2种分型引物对CSF样本进行扩增,并对扩增产物进行分型研究.结果 利用通用引物1次和2次PCR EV阳性检出率分别为69.44％ (50/72)、73.61％ (53/72),差异无统计学意义(P＞0.05);对VP1段进行PCR扩增,1次和2次PCR后,阳性检出率分别为26.42％ (14/53)、62.26％ (33/53),差异有统计学意义(P＜0.01);对VP2段进行PCR扩增,1次和2次PCR后,阳性检出率分别为16.98％ (9/53)、54.72％ (29/53),差异有统计学意义(P＜0.01);2种分型引物对EV RNA阳性检出率差异无统计学意义(P＞0.05);EV阳性样本与EV标准毒株相关序列同源性均在97％以上.结论 利用分型引物能够检测临床常见EV的大多数血清型,可为防治EV引起的中枢神经系统感染提供临床参考.
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多部位红色毛癣菌感染分离菌株DNA分型研究
目的探讨多部位红色毛癣菌感染不同部位分离菌株基因型的差异.方法采用巢式PCR扩增真菌rDNA非转录间隔区(NTS)中Trs-1片段,检测基因多态性.并比较同一患者不同感染部位分离菌株的基因型差异.结果受试36株菌株按照PCR指纹图共分为10型,基因型分布与感染部位关系不大.在17例受试患者中,8例不同感染部位分离得到的菌株基因型有差异,且与不同感染部位的病程差异无关.结论多部位红色毛癣菌感染可能为多菌株引起,提示部分多部位皮肤癣菌感染患者不同部位皮肤癣菌感染的传染源可能来源于外界,而与机体原已存在的感染灶关系可能不大.
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2007-2010年岳阳市淋病流行病学分析及溯源研究
目的 了解岳阳市淋病流行趋势,并追踪岳阳市淋病的传染源和优势菌株,为有效控制淋病提供科学依据.方法 对全市2007-2010年疫情资料进行统计学分析,通过随机扩增多态性DNA技术(RAPD)对收集的83株淋球菌进行分子分型.结果 2007-2010年岳阳市共报告淋病492例,年平均发病率为2.44/10万,男性淋病发病率均高于女性.淋病病例主要集中在20～50岁的青壮年;职业构成以农民为主.83株淋球菌均产生了较多条带,经聚类分析,可分为8型,以A、B型为主;有3株淋球菌与其他菌株同源性低,各自单独组成RAPD型.结论 岳阳市淋病的传染源主要有2个,同时,可能存在淋病的外源输入.应进一步加强对淋病的监测,并采取有针对性的措施,以有效控制淋病.
关键词： 淋病 分子生物学分型 淋球菌 随机扩增多态性DNA技术 -
岳阳市淋病分子流行病学研究
[目的]追踪岳阳市淋病的传染源和优势菌株,为有效控制淋病提供科学依据.[方法]热裂解法抽提淋球菌染色体 DNA,经rep-PCR扩增,获得相应的指纹图.[结果]83株淋球菌除2侏以外,均产生了较多条带.经聚类分析,可分为12型,以A、B、C3型为主;有6株淋球菌与其他菌株同源性低,各自单独组成 rep-PCR型.[结论](1)rep-PCR 是进行淋病分子流行病学研究的有效工具;(2)岳阳市淋病的传染源主要有3个,同时,可能存在淋病的外源输入.
关键词： 淋病 分子生物学分型 淋球菌 重复序列多聚酶链反应 -
甲真菌病患者多部位红色毛癣菌分离株的DNA分型
目的 探讨甲真菌病患者多部位红色毛癣菌感染不同部位分离菌株基因型的差异.方法 采用PCR扩增红色毛癣菌rDNA非转录间隔区(NTS)中Trs-1片段,检测基因多态性并比较.结果 30株受试菌株按照PCR指纹图共分为3型,基因型分布与感染部位无相关.10例受试患者中,5倒不同感染部位分离出的菌株基因型存在差异.结论 甲真菌病患者多部位红色毛癣菌感染可能为多菌株引起,部分患者可能存在多菌株的混合感染.
