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分子配伍理论科学内涵及在现代中药研发中的应用
提出分子配伍理论,为现代中药研究提供理论指导.阐述分子配伍理论产生的背景、必然性和科学内涵,及分子配伍理论的特征.论述分子配伍理论指导下的现代中药(成分中药)的特征.结果显示分子配伍理论具有3个特征:①分子配伍理论体现了中西医的有机结合；②分子配伍理论系统思维与分析还原法的有机结合；③坚持中医药理论的整体观.现代中药具有5个特征:①方中所有成分化学结构、分子式、分子量均清楚；②分子配伍符合方剂学君臣佐使的原则；③作用机制清楚、疗效确切、剂型先进、质量稳定可控；④多通道、多途径、多层次、多靶点对患病机体产生网络药理作用；⑤对复杂性、系统性疾病疗效明显,副作用小.中药现代化的关键是中医药理论现代化.分子配伍理论的提出,是时代发展的必然产物,必将促进中医药事业的繁荣昌盛.
关键词： 分子配伍 现代中药(成分中药) 网络药理 复杂性疾病 -
基于网络药理学方法探讨双鱼颗粒治疗上呼吸道感染的作用机制
目的:研究双鱼颗粒中治疗上呼吸道感染的活性成分和作用机制.方法:利用分子对接、网络分析,挖掘双鱼颗粒与上呼吸道感染相关靶标的相互作用,来阐明其可能的活性分子群和相应分子作用机制.结果:双鱼颗粒所含化合物在化学结构上具有类药性,双鱼颗粒治疗上呼吸道感染可能的活性分子为甾体类化合物,其作用的可能机制与抑制病毒复制、抑制炎症反应及其信号转导有关.结论:初步揭示出双鱼颗粒通过抗病毒、抗炎等功效来治疗上呼吸道感染.
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基于分子对接及生物网络功能模块识别的复方丹参滴丸的网络药理学研究
目的 运用分子对接及生物网络功能模块识别等网络药理学技术,阐述复方丹参滴丸治疗动脉粥样硬化的物质基础和作用机制.方法 首先通过分子对接技术确定复方成分和靶点的对应关系,结合由分子相似性构建的复方成分-成分网络,以及靶点相互作用网络,建立了二阶异质网络;然后经模式分析,将二阶异质网络拆解为不同功能的模块.结果 模块分析结果显示,复方丹参滴丸治疗动脉粥样硬化的机制涉及炎症、免疫和氧化应激;进一步分析复方成分作用通路,得出了复方主要作用成分,包括丹参素、原儿茶醛、丹参酮Ⅵ等.结论 本方法为阐释中药复方多成分、多靶点、多途径的作用机制等同类研究提供了参考.
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基于网络药理学预测四妙勇安汤干预心力衰竭的作用机制研究
[目的]借助网络药理学技术预测并筛选四妙勇安汤干预心力衰竭的主要活性成分及其潜在靶点,探讨四妙勇安汤对心力衰竭的疾病-多靶点-多成分的干预作用机制.[方法]依据在线中医药生物信息学分析工具(BAT-MAN-TCM)疾病分类预测和筛选四妙勇安汤活性成分的作用靶点.采用Cytoscape软件构建四妙勇安汤活性治疗心力衰竭的成分-靶点网络.[结果]在四妙勇安汤中筛选出89个活性成分,共涉及心力衰竭等15个靶点,且活性成分与预测的靶点有较好的相互作用,预测的15个靶点主要与ACE、ADRA2A、ADRA2B、等靶点有关.[结论]表明四妙勇安汤改善心功能的机制可能与血管紧张素Ⅱ(AngⅡ)抑制肾素血管紧张素系统(RAS)活性、调节交感神经系统等有关,并且在四妙勇安汤治疗心力衰竭中金银花药味的贡献度可能大.
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基于网络药理学的海蓬子活性成分抗糖尿病作用机制
目的 利用网络药理学技术预测海蓬子抗糖尿病有效成分、潜在靶点及通路,探讨其“多成分-多靶点-多通路”的抗糖尿病作用机制.方法 通过查阅大量文献获取海蓬子内15种具有相关活性的化学成分信息,利用Pharm-Mapper和DrugBank数据库筛选海蓬子抗糖尿病的潜在靶点,采用MAS 3.0生物分子功能软件获取潜在靶点和通路的相关信息,后采用Cytoscape软件构建海蓬子治疗糖尿病的“成分-靶点-通路”网络模型.结果 海蓬子的15个成分可能是通过MAP2K1、MAPK、GSK3B、AKT等30个糖尿病相关靶点调控胰岛素、血管内皮生长因子、T细胞受体、FcεRI信号通路等72条信号通路,从而参与调节免疫、炎症反应、脂质代谢、细胞凋亡等过程来发挥治疗糖尿病及其并发症的作用,呈现出海蓬子“多成分-多靶点-多通路”的抗糖尿病作用机制.结论 本研究为解析海蓬子复杂体系、阐释其抗糖尿病作用的科学内涵提供了新的思路和方法,为下一步其作用靶点及机制的验证实验指明了方向.
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肺动脉高压时肺血管内皮间质转化相关miRNAs网络调控的生物信息学分析
目的：探索肺动脉高压( pulmonary hypertension,PH)时肺血管内皮间质转化( EndMT)相关miRNAs及其下游靶点的网络调控。方法利用文献挖掘PH相关基因及End-MT/EMT相关miRNAs。利用Biological General Repository for Interaction Datasets( BioGRID)数据库得到基因相互作用关系。利用生物信息学( DIANA3、Miranda4、PicTar5、Tar-getScan6、miRDB7和microT-CDS8)预测相应miRNAs的靶基因关系,超几何分析预测与肺动脉高压 EndMT 相关 miR-NAs,通过对miRNAs参与功能分区中的情况筛选评分高的miRNAs并选择部分进行实验验证,利用Cytocape 3软件构建miRNAs与其下游靶点的相互作用网络。结果根据文献挖掘出与PH有关的基因230个,与EndMT/EMT相关miRNAs共189个,对应成熟体322个。其中98个miRNAs可能与PH时EndMT有关。其中,仅有22个miRNAs同时参与了TGF-β/BMP、低氧和炎症3个功能通路,评分高,分别为 miR-let-7家族、miR-124、miR-130家族、miR-135、miR-144、miR-149、miR-155、miR-16-1、miR-17、miR-181家族、miR-182、miR-200家族、miR-204、miR-205、miR-21、miR-224、miR-27、miR-29家族、miR-301a、miR-31、miR-361和 miR-375。对let-7g、miR-21、miR-124及miR-130家族进行实时荧光定量PCR验证发现其在低氧诱导PH大鼠肺动脉中表达均明显变化。结论利用生物学信息技术从大量 miRNAs中筛选得到的22个miRNAs同时参与TGF-β/BMP、低氧和炎症信号通路,可能与PH时EndMT相关,为后续深入研究PH时EndMT提供了重要的理论依据。
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中药及其组分配伍的整合作用研究实践与进展
中药现代化研究的重要任务之一即明确中药(方剂)复杂药效物质基础及其配伍机制,但几十年来大部分中药的确切机制仍没有被阐明.原因一,中药的靶点不是西方人所理解的病的靶点,而是证的靶点.证强调疾病表型之间的关联,故中药的靶点是联系的靶点,组合的靶点;原因二,中药药效的物质基础不是一种有效单体,而是多种成分的有效组方.方是在证的基础上进行合理配伍和加减而建立的,是有规律和规则的,相应的中药不是孤立地作用于病的靶点而是系统地作用于证的靶点.西医有可以治疗该疾病相应靶点的药物,那么中医就有该证相应组合靶点的复方.目前认为,中药配伍的意义在于通过由特定活性物质群介导的多靶点、多途径整合作用发挥方证对应的终末效应.同时将中药配伍筛选为有效组分配伍,利用有效组分配伍阐明中药整合作用已成为近年来的普遍研究模式.而在传统的实验药理上,融合数学、生物信息学等多学科的定量药理学、逆向药理学、多向药理或网络药理学有助于理解中医药在治疗复杂性疾病中体现的整体性、系统性特点.
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药物——疾病复杂网络的模块化解构
对抗复杂疾病强调药物联合干预.网络药理学利用网络分析药物复杂作用机制,该网络的模块化解构是我们关注的焦点.希望通过对模块相关概念、划分方法和模块间结构特点的简要介绍,使我们能够了解如何利用模块解码药物干预疾病的复杂机制,以便明确模块化分析方法的优势.
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芪参颗粒治疗心血管疾病的“成分-靶点调控网络”研究
目的:采用网络药理学方法探索芪参颗粒治疗心血管疾病的药-效调控网络机制.方法:采用在线中医药生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)预测和筛选芪参颗粒干预心血管疾病的活性成分及其作用靶点.采用Cytoscape软件构建芪参颗粒及其主要单味药治疗心血管疾病的成分-靶点网络.利用韦恩图(Venny 2.1)进一步研究芪参颗粒中主要药味——黄芪、丹参治疗心血管疾病的机制.结果:芪参颗粒中筛选出29个活性成分,共涉及心血管疾病相关的14个靶点,且活性成分与预测的靶点有较好的相互作用,预测的14个靶点主要包括:ADRB1、AGTR1、CES1、CYBB等.芪参颗粒中丹参的靶点数占全方治疗心血管疾病总靶点数的57.14％,其余5味药的独有靶点占42.86％.结论:芪参颗粒改善心血管疾病的机制可能与抑制RAS系统、缓解机体氧化应激等有关,在芪参颗粒治疗心血管疾病中丹参的贡献度可能大.
