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微卫星锚定PCR及其在寄生虫学中的应用
微卫星DNA是新近发现的一种DNA遗传标记,已初步应用于寄生虫学研究中.要扩增出目标微卫星DNA,往往需要根据已知的模板序列来设计一对特异性引物,在目前对寄生虫基因组还知之甚少的情况下,这无疑给研究带来了极大的困难.微卫星锚定PCR不需要事先知道模板的序列,而是利用引物与微卫星DNA序列互补结合(在引物的3′端或5′端锚定一个或几个寡核苷酸分子),进而扩增出微卫星DNA之间的序列,从而揭示物种基因组DNA的差异.微卫星锚定PCR克服了一般PCR、RFLP以及RAPD等方法的某些不足,具有操作简便、DNA用量少、重复性好、特异性高等优点,已被用于分子生物学方面的研究.本文概述了微卫星DNA的概念、结构特点,微卫星锚定PCR的实验原理和方法及其在寄生虫学研究中的实际应用.
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虫源性蛋白酶在寄生虫感染与免疫作用的研究进展
蛋白酶是一类广泛分布于微生物、植物和动物中具催化蛋白质肽键水解活性的酶的总称.近年来,随着寄生虫基因组和后基因组研究的深入,发现了一批在寄生虫感染与免疫中发挥重要作用的虫源性分子,寄生虫蛋白酶就是其中的典型代表.
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寄生虫基因组计划的启动
从1993年至1994年,发展中国家及发达国家的科学家制定并启动了许多寄生虫基因组计划,并在已有的合作基础上建立了几个绘制及测序这些中等大小基因组的联合组织.资金及其它支持来自WHO/TDR,如WelcomeTrust及其它基金.因而,恶性疟原虫、曼氏血吸虫、克氏锥虫、布氏锥虫、利什曼原虫、马来丝虫及其它致病线虫的基因组已在研究之中.从初阶段网络系统的建立、作图、资源的建库(EST、GSS、噬菌体、粘粒、BAC及YAC文库的构建),测序工作以基因发现为开端,很快发展到小片段染色体,现在则是整个成熟基因组阶段.蛋白质组学,功能分析,基因操作及微阵列分析都在不同的水平上进行,由于用于全基因组测序的经费是固定的,因此除大型测序中心外大多参与此项计划的实验室,都开始定位于后基因组学.为了资料的处理、注解及深层分析,生物信息学网络在包括发展中国家扩展开采.