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云南省1997-2000年及2004年非脊髓灰质炎肠道病毒分子生物学及流行特征分析
目的 描述云南省1997-2000年及2004年5年的肠道病毒(EV)分离状况及型别特征.方法 5年在急性迟缓性麻痹病例中共检测到210株非脊髓灰质炎(脊灰)肠道病毒(NPEVs),其中12株经血清学鉴定为腺病毒.剩余198株经基因测序定型,即病毒VP1区基因序列转变为氨基酸序列后与标准株进行比较.结果 经分子生物学定型:人类EV-A组5株(5个血清型)、EV-B组158株(34个血清型)、EV-C组32株(6个血清型)、未分离到EV-D组病毒.在急性迟缓性麻痹病例监测中,210个分离株,EV-B组病毒占75.2%,为主要型别;EV-C组占12.2%,腺病毒占5.7%,EV-A组占2.4%.结论 云南省EV的流行中,以EV-B组较多.
关键词： 非脊髓灰质炎肠道病毒 分子生物学定型 流行病学 -
云南省新型肠道病毒EV93的分子生物学鉴定
人类肠道病毒(HEV)分为5个组别:HEV-A、HEV-B、HEV-C、HEV-D和脊髓灰质炎病毒(PV).HEV-A由柯萨奇A2(CV-A2)～CV-A8、CV-A10、CV-A12、CV-A14、CV-A16、EV71和4种新型病毒EV76、EV89、EV90、EV91组成[1].
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新型肠道病毒EV75的分子生物学鉴定
人类肠道病毒(HEV)由80多个血清型组成,分为5个组:脊髓灰质炎(脊灰)病毒和肠道病毒A～D组.对肠道病毒进行鉴定的金标准是用敏感的细胞系培养和分离病毒,继而用肠道病毒组合血清进行鉴定.
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宁夏地区1997-2011年急性弛缓性麻痹病例非脊髓灰质炎肠道病毒分型鉴定分析
目的 对1997-2011年宁夏地区急性弛缓性麻痹(AFP)病例中分离的73株非脊髓灰质炎肠道病毒(NPEV)进行分型鉴定.方法 采用简并引物RT-PCR对分离株进行VP1区基因扩增和序列测定,测序结果进行BLAST比较和基因进化分析.结果 经过基因测序分析鉴定,73株NPEV中,有4株无法定型,另69株共包括27个血清型,分别属于A组肠道病毒(HEV-A)和HEV-B组,无HEV-C和HEV-D组毒株,其中HEV-A组毒株包括8个血清型23株,HEV-B组毒株包括19个血清型46株.69株病毒中,以EV71所占比例大(9/69),以CVA4、CVA16、Echo24、Echo6和CoxA9所占比例较高.结论 1997-2011年宁夏地区AFP病例分离的NPEV以HEV-B组为主要型别66.7％(46/69).
关键词： 非脊髓灰质炎肠道病毒 分子生物学定型 流行病学 -
中国国内首次分离出EV73肠道病毒
对云南省与缅甸接壤边境地区健康儿童粪便标本中分离到的2株病毒进行VP1基因序列测定,以了解其分子生物学特点.用肠道病毒通用引物292/222进行RT-PCR,并对扩增产物进行测序.将基因序列提交GenBank进行BLAST搜索,同时运用Mega软件进行同源性分析,并构建基因树.核苷酸和氨基酸同源性比较结果证明,2株病毒为EV73型,为国内首次报道.
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云南省肠道病毒96型的分子生物学鉴定
目的 对云南省9例急性弛缓性麻痹病例的阳性病毒分离物进行分子生物学定型.方法 用肠道病毒(Enterovirus,EV)通用引物187、188、189/222扩增病毒VP1区,直接对聚合酶链反应产物进行测序.所得序列在基因库进行广泛搜索,并与所有EV(包括新发现的EV)基因的相同区域进行比较.结果 9株病毒为EV96型.结论 运用分子生物学方法可以检测出传统方法所无法鉴定的血清型,并能提供病毒遗传学信息.
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云南省人类肠道病毒(EV)B组中新型EV80 EV81和EV83的分子生物学鉴定
目的 按文献报道的方法,对云南省4例急性弛缓性麻痹病例粪便标本的阳性病毒分离物进行分子生物学定型.方法 用肠道病毒(Enterovirus,EV)通用引物187/011、187/222扩增病毒基因组VP1区基因,直接对聚合酶链反应产物进行测序.所得序列在基因库进行Blast搜索,并与所有EV(包括新发现的EV)基因的相同区域进行比较.结果 4株病毒为EV80、EV81和EV83,为人类EV B组中的新型病毒.结论 运用分子生物学方法可以检测出传统方法所无法鉴定的血清型,并能提供病毒遗传学信息.
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浙江省急性驰缓性麻痹相关肠道病毒鉴定分析
目的 对浙江省2006-2008年急性弛缓性麻痹病例(AFP)中的非脊灰肠道病毒(NPEV)分离株进行分子生物学分型鉴定.方法 采用简并引物和逆转录一聚合酶链反应(RT-PCR),对31株非脊灰肠道病毒分离株进行目的基因片段扩增,然后测定序列,将测定的结果与GenBank进行BLAST比较分析,运用DNAMAN软件进行同源性分析,并构建基因树.结果 31株非脊灰肠道病毒分离株经分子生物学分型,其中人类肠道病毒(HEV)-A组5株,有2个血清型;HEV-B组24株,有13个血清型;HEV-C组2株,有1个血清型.结论 浙江省2006-2008年分离到的非脊灰肠道病毒以HEV-B组为主.
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贵州省2012年急性弛缓性麻痹病例非脊髓灰质炎肠道病毒分型鉴定分析
目的 运用分子生物学检测方法对从贵州省2012年AFP (Acute Flaccid Paralysis)病例中分离到的30株非脊灰肠道病毒进行分型鉴定.方法 采用简并引物RT-PCR对分离株进行VP1区基因扩增和序列测定,测序结果进行BLAST比较和基因进化分析.结果 序列分析结果表明,30株NPEV中,有4株无法扩增VP1基因,另外26株共包括11个血清型.包括EV71、ECH06、COXA4、EV96、ECHO14、COXA10、ECH025、ECHO13、ECHO11、COXB5、COXB4.其中EV71有6株,所占比例高.ECH06、COXA4各3株,EV96、ECH014、COXA10、ECH025、ECH013、ECHO11各2株,COXB5、COXB4各1株.结论 贵州省2012年AFP病例的病原谱可能包括多型别的NPEV.
关键词： 非脊髓灰质炎肠道病毒 AFP病例 分子生物学定型
