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2016年大同市手足口病病原学特征分析
目的 了解大同市手足口病病原学特征,为本地区手足口病的防控提供依据.方法 收集2016年大同市各县区送检的手足口病病原学监测标本,应用Real-Time检测技术对肠道病毒通用型、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(CA16)的特异性核酸进行检测.并对各区县的检出率、0～15岁不同年龄、性别、标本运送和保存时间关联性等进行了相关统计学分析.结果 2016年共收集手足病患者标本217份,检出肠道病毒通用型核酸阳性170份,检出率为78.34％(170/217),其中EV71病毒核酸阳性43份,CA16病毒核酸阳性86份,未分型(即其他肠道病毒)41份,分别占肠道病毒感染阳性的25.29％(43/170),50.59％(86/170),24.12％(41/170).不同年龄和性别样品阳性检出率差异无统计学意义(P＞0.05);不同运送和保存时间检出率差异无统计学意义(P＞0.05);不同的采集人员和采集时间差异阳性率结果差异显著(P＜0.05).结论 2016年大同市手足口病主要为柯萨奇病毒A组16型为主.样品采集时间的选择以及采样人员的操作对样品的阳性检出率至关重要.
关键词： 手足口病 Real-time RT-PCR 肠道病毒 -
威海市504例手足口病标本核酸检测结果分析
目的:对威海市504例手足口病( HFMD)患儿粪便样本实验室检测结果进行分析,了解威海地区HFMD病原特征,为今后制定HFMD防治措施提供依据.方法:对送检的504例临床诊断为HFMD患者标本,应用实时荧光( Real - time) RT - PCR法检测标本中的人肠道病毒(HEV)、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(CVA16)特异性核酸.结果:504例HFMD患者标本中,EV71阳性率为50.99％,CVA16阳性率为18.25％,其它HEV阳性率为17.26％；46例HFMD重症病例中,EV71阳性率84.78％,CVA16阳性率6.52％.结论:威海地区手足口病病原体以EV71和CVA16为主.EV71型是引起重症病例的优势病毒型,应加强监测,特别是4岁以下婴幼儿的监测.
关键词： HFMD Real-time RT-PCR HEV EV71 CVA16 -
金华市2008年流感病毒Real-Time RT-PCR检测
目的:对疑似流感疫情标本进行核酸检测、明确感染因子.方法:采用Real-Time RT-PCR法对可疑咽拭子标本进行甲型流感病毒通用、甲1型流感病毒、甲,型流感病毒和乙型流感病毒检测.结果:36份可疑咽拭子标本中有25份流感病毒核酸阳性,阳性率69.44%,其中甲型流感病毒通用阳性13份,甲1型流感病毒阳性12份,甲,型流感病毒阳性12份,乙型流感病毒阳性12份.结论:2008年金华市检出的流感病毒株以甲1型流感病毒和乙型流感病毒为主.Re-al-Time RT-PCR技术是疑似流感疫情或临床病例可靠的快速诊断方法.
关键词： 流感病毒 流行性感冒 Real-time RT-PCR 检测 -
miR-221在结直肠癌中的表达及意义
目的 探讨micorRNA-221( miR-221)在结直肠癌与癌旁组织中差异表达状况及其与临床病理特征之间的关系.方法 选取南方医院经手术切除的原发性结直肠癌标本30例,常规抽提肿瘤及对照癌旁组织中总RNA,应用Real-time RT-PCR检测标本中miR-221表达状况,并以Northern blot进行验证.结果 30例结直肠癌与癌旁组织相比,miR-221表达明显上调(2.041±1.401 vs.0.806±0.341),差异具有统计学意义(P＜0.01),且Real-time RT-PCR与Northern blot检测结果具有高度相关性(r2=0.948,P＜0.01)；miR-221表达水平与肿瘤TNM分期(P=0.032)以及浸润深度(P=0.021)有关.结论 miR-221在结直肠癌中表达上调并可能参与了结直肠癌的发生发展,miR-221有望成为结直肠癌患者预后判断的潜在标志物；Real-time RT-PCR相比较Northern blot是一种较精确的miRNA定量检测方法,具有样本需求量小、操作流程简化、高效性等优点.
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用real-time RT-PCR技术检测肺癌淋巴结的隐匿性微小转移
目的评价一种简单客观敏感的检测淋巴结中扩散的肿瘤细胞方法:real-time RT-PCR.方法从手术的30例非小细胞肺癌病人获得纵隔淋巴结100组,分别进行常规病理学检查和real-time RT-PCR检测CK19 mRNA的表达.从12例手术的非癌症病人获得纵隔淋巴结18组作为正常对照,用15例肺癌病人原发肿瘤组织作为阳性对照.结果在94(94.0%)组经组织病理学检查未发现肿瘤细胞的淋巴结中,用real-time RT-PCR在26(27.7%)组检测到CK19 mRNA的表达.6组经组织病理学检查有肿瘤细胞扩散的淋巴结中全部检测到CK19 mRNA的表达.组织病理学检查22例病人为pN0期,用real-time PCR方法在这些病人中发现13(59.1%)例病人淋巴结有微小扩散的肿瘤细胞.结论应用real time RT-PCR检测CK19 mRNA的表达是一种在纵隔淋巴结发现扩散肿瘤细胞敏感而特异的方法.
关键词： 肺癌 隐匿性微小转移 Real-time RT-PCR 角质蛋白19 -
衡阳市2010年手足口病实验室检测结果分析
目的 对衡阳市2010年4-12月手足口病(HFMD)实验室检测结果进行分析,了解衡阳市HFMD流行特征,为今后制定或调整HFMD防治措施提供参考.方法 对2010年4-12月衡阳市各县区疾病预防控制中心(CDC)及各类医疗机构送检的625例临床诊断为HFMD患者标本,应用实时荧光(Real-time)RT-PCR法检测标本中的人肠道病毒(HEV)、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(CVA16)特异性核酸.结果 625例HFMD患者标本中,EV71阳性率为26.08%(163/625),CVA16阳性率为8.80%(55/625),其它HEV阳性率为19.84%(124/625);95例HFMD重症病例中,EV71阳性率(67.80%,40/95)高,并且男性阳性率(50.85%)略高于女性(27.78%),未检出CVA16型;9例HFMD重症死亡病例中,6例为EV71型,阳性率为66.67%.4-7月为HFMD高发期,3岁以下为高风险年龄组,重症病例及重症死亡病例比其它年龄组高.结论 衡阳市2010年HFMD发病率较高,EV71型是引起重症及重症死亡病例的优势病毒型,应加强监测,特别是3岁以下婴幼儿的监测.
关键词： HFMD Real-time RT-PCR HEV EV71 CVA16 -
广西首起诺如病毒感染性腹泻病原基因测序分析
目的 对广西首起诺如病毒急性胃肠炎疫情进行病原基因测序分析,以确证其病原体,并对其基因分型.方法 采用荧光定量PCR法对8份疫情病例样本进行诺如病毒RNA检测,取其中4份阳性标本再经RT-PCR扩增,然后纯化、克隆、测序和进化树分析.结果 8份标本均测出诺如病毒RNA,阳性率100%;其中4株病毒的N/S区序列与GenBank中的雪山病毒参考株同源性高,达95%.结论 序列测定结果证实广西大新县的急性胃肠炎疫情是诺如病毒感染所致,其病毒基因型为GⅡ.2型.
关键词： 诺如病毒 Real-time RT-PCR 进化树分析 -
幼儿甲型H1N1流感的Real-time RT-PCR检测及临床分析
[目的]探讨泉州市甲型HlNl流感幼儿患者的流行病学特征以及临床治疗,为甲型H1Nl流感的防控措施及临床治疗提供借鉴和理论依据. [方法]对2009年泉州市1例幼儿患者的呼吸道咽拭子标本进行Real-time RTPCR检测甲型流感病毒M基因、H1HA、A(H1N1)流感病毒核酸及临床资料分析. [结果]①本实验经Real-timeRT-PCR检测患儿d 1、d 6、d 7、d 8的呼吸道咽拭子标本,呈现Real-time RT-PCR检测甲型流感病毒、H1HA、A(H1N1)核酸阳性,且表达量随着奥司他韦抗病毒等治疗,先增加后下降,于d 9转阴;(②本实验显示:SWH1HA-1阳性,伴随着H1HA、FluA阳性,而且转阴时,三者皆为阴性. [结论](①在体内,奥司他韦可拮抗甲型H1N1流感病毒的感染;②泉州市确诊甲型H1N1流感患者的临床资料显示,甲型H1N1流感发病多见于青壮年,且幼儿病程可能较成人长;③SWH1HA-1可能含有H1HA、FLU-A基因的某些片段.
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2014-2015年昆明市175件市售海产品中诺如病毒污染状况检测
目的 调查昆明市售海产品中诺如病毒的污染状况,为市民消费海产品提供建议,为昆明市售海产品食用安全性提供依据.方法 2014年7月至2015年7月,采集市售海产品175件,应用real-time RT-PCR法分别检测诺如病毒的GⅠ和GⅡ两个亚型,并对不同类型、不同季节、不同产地市售海产品中诺如病毒的污染情况进行比较.结果 175份市售海产品中诺如病毒总检出率为1.14％(2/175),从基因分型看,2份阳性样品均为GⅡ型.结论 2014年-2015年昆明市售海产品中检出GⅡ型诺如病毒,存在通过食用海产品感染的风险.
关键词： 昆明市售海产品 诺如病毒 Real-time RT-PCR 污染状况 基因分型 -
金钗石斛生物总碱对小鼠肝组织细胞色素P450的影响
目的 研究金钗石斛生物总碱对小鼠肝组织细胞色素P450的影响.方法取昆明种小鼠分为金钗石斛生物总碱空白组、金钗石斛生物总碱高剂量组、金钗石斛生物总碱低剂量组,分别灌胃6d,麻醉后处死动物,分别检测肝功能,肝脏病理.并取肝脏测定小鼠肝组织P450相关基因.结果①金钗石斛生物总碱对小鼠肝脏病理及肝功能无影响.②金钗石斛生物总碱对CYP4A14有上调作用(P＜0.05)且对CY P7A1有明显的抑制作用(P＜0.05)；金钗石斛生物总碱低剂量对CYP4A10有明显的抑制作用(P＜0.05),金钗石斛生物总碱高剂量对CYP4A 10有上调作用;金钗石斛生物总碱低剂量对CYP2B10有抑制作用,高剂量对CYP2B10有明显的上调作用(P＜0.05)；而金钗石斛生物总碱对CYP1A1、CYP1A2、CYP3A25、CYP1B1、CYP2E1、CYP3A11基因无显著性影响(P＞0.05).结论金钗石斛生物总碱对CYP4A10、CYP4A14、CYP2B10、CYP7A1有显著性影响(P＜0.05),对于临床用药的指导性意义待进一步研究.
关键词： 金钗石斛生物总碱 小鼠 肝脏 细胞色素P450 Real-time RT-PCR -
安宫牛黄丸对小鼠肝脏细胞色素P450酶系统亚型RNA表达的影响
目的 探索安宫牛黄丸对小鼠肝脏细胞色素P450酶系亚型mRNA表达的影响.方法 将健康雄性小鼠随机分为3组:空白对照组、安宫牛黄丸低剂量组(1.5 g/kg)、安宫牛黄丸高剂量组(3.0 g/kg),灌胃给药8d,每天1次,末次给药后1h断头取肝脏.提取、纯化总RNA,采用real-time RT-PCR方法 测定肝脏细胞色素P450酶系部分亚型mRNA的表达.结果 安宫牛黄丸高剂量增加Cyplaí mRNA的表达;低、高剂量均明显增加Cyp2a4、Cyp3a11、Cyp4a10 mRNA的表达;Cyp7b1 mRNA的表达随给药剂量的增加而减少;而对Cyp2e1、Cyp2j5 mRNA的表达几乎没有影响.结论 安宫牛黄丸可诱导小鼠肝脏Cyp1a1、Cyp2a4、Cyp3a11、Cyp4a10 mRNA的表达;抑制Cyp7b1mRNA的表达;但对Cyp2e1、Cyp2j5的表达几乎无影响.
关键词： 安宫牛黄丸 细胞色素P450 Real-time RT-PCR 小鼠 -
miR-21在外阴鳞癌组织中的表达及临床意义
目的:探讨微小RNA-21(miR-21)在外阴鳞癌(vulvar squamous cell carcinoma,VSCC)组织中的表达及临床意义.方法:采用茎环实时荧光逆转录聚合酶链反应(real-time RT-PCR)检测25例外阴鳞癌组织、30例外阴上皮内非瘤样病变组织(外阴增生性营养不良15例、外阴萎缩性营养不良15例)及10例正常外阴组织标本中miR-21的表达.结果:miR-21在外阴鳞癌组织中的相对表达量为(5.505±2.163),明显高于外阴上皮内非瘤样病变组织(2.520±1.260)及正常外阴皮肤组织(1.478±0.601)(P＜0.05),而miR-21在外阴上皮内非瘤样病变组织及正常外阴组织间表达量无明显差异.在不同临床分期、不同组织学分级的外阴鳞癌组织中miR-21表达量有统计学差异(P＜0.05).结论:外阴鳞癌组织中miR-21的表达升高,提示miR-21可能在外阴鳞癌的发生发展中发挥致癌基因的作用.
关键词： 外阴鳞癌 微小RNA-21 Real-time RT-PCR -
一步法Real-time RT-PCR检测结直肠癌前哨淋巴结CK20 mRNA的表达
目的 探讨结直肠癌前哨淋巴结定位和检测CK20 mRNA的意义.方法 对49例结直肠癌患者术中注射美蓝定位前哨淋巴结,用一步法Real-time RT-PCR检测前哨淋巴结CK20 mRNA表达以确定转移病灶.结果 49例结直肠癌患者中成功确定了前哨淋巴结47例,共115枚,每例1～5枚,平均2.4枚/例,检出成功率为95.92％.47例患者前哨淋巴结中,常规病理学证实有11例为肿瘤细胞所浸润,阳性检出率为23.40％；一步法Real-time RT-PCR检测有20例CK20呈阳性表达,阳性检出率为42.55％.两种方法的阳性检出率有显著差异(P＜0.05).结论 利用一步法Real-time RT-PcR技术检测CK20 mRNA表达可明显提高结直肠癌前哨淋巴结转移病灶的检出率.
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Quantitative detection of metastasis-associated1mRNA and protein expression in breast cancer
Objective Understanding the mechanism of breast cancer metastasis will benefit those patients in need of aggressive treatment and avoid side effects caused by chemotherapy over treatment.Recently,a potential metastasis-associated gene and its product,the metastasis-associated 1 (MTA1),were identified; this gene has been found to be overexpressed in a variety of cancers.Methods In the present study,therefore,the level of expression of MTA1 mRNA has been assessed by LightCycler quantitative real-time RT-PCR in 160 cases of invasive carcinoma of the breast.MTA1 protein expression level was also detected by immunohistochemistry from available paired tissues of 154 cases.Associations between MTA1 mRNA and protein expression and clinicopathological factors were analyzed.Results It was found that MTA1 mRNA was expressed at significantly higher levels in patients with negative lymph node status,with ER and PgR positive and HER2 negative tumor.No difference was found between patient age,tumor size and histological grade groups.Patients with high levels of expression of MTA1 mRNA had a better prognosis than those with low expression.However,no difference was found between the protein level and clinicopathological factors.Univariate and multivariate prognostic analysis did not demonstrate that MTA1 mRNA was an independent prognostic factor for breast cancer.Conclusion In breast cancer,inconsistent with other tumor types,MTA1 gene expression is correlated with non-invasive clinicopathological factors and longer survival,which might suggest MTA1 gene is a tumor type specific metastasis associated gene.
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Quantitation of HDAC1 mRNA expression in invasive carcinoma of the breast
Estrogen is well-established as a mitogenic factor implicated in the tumorigenesis and progression of breast cancer via its binding to the estrogen receptor a(ERα). Recent data indicate that chromatin inactivation mediated by histone deacetylation(HDAC) and DNA methylation is a critical component of ERα silencing in human breast cancer cells. The aim of this study was to determine the expression of the HDAC1 gene in malignant human breast tissue and to correlate our observations with available clinical information. In the present study, the level of expression of HDAC1 mRNA was assessed by LightCycler-based quantitative real-time reverse transcriptase (RT)-PCR analvsis in 162 cases of invasive carcinoma of the breast. Associations between HDAC1 mRNA expression and different clinicopathological factors were sought. It was found that HDAC1 mRNA was expressed at significantly higher levels in tumors from patients over 50 years of age and in those tumors without axillary lymph node involvement, that are less than 2 cm, that are of a non-high histological grade, that are HER2 negative and that are ERα/PgR positive. Patients with tumors displaying high levels of HDAC1 mRNA expression tended to have a better prognosis in terms of both disease-free and overall survival. However, univariate and multivariate analysis did not show HDAC1 mRNA expression level to be an independent prognostic factor for either disease-free or overall survival. These results imply that HDAC1 mRNA expression could have potential as an endocrine response marker and may have prognostic implications for breast cancer progression.
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芜湖市首例人感染H7N9禽流感病原检测分析
目的 了解芜湖市首例人感染H7N9禽流感病例病原情况.方法 采集病例呼吸道标本并提取RNA,进行流感病毒特异性基因的PCR扩增,毒株提交CNIC进行基因测序.结果 患者呼吸道吸取物的样本FluA和H7N9基因核酸扩增结果阳性.病毒HA和NA基因序列与其他已知H7N9禽流感分离株序列具有高度的一致性(HA:99.4％～99.8％;NA:99.2％～100.0％),HA基因核苷酸相似性高毒株为KM054796-A/chicken/Jilin/2014,NA基因相似度高的毒株为KP414837-A/chicken/Jiangxi/2014.HA和NA基因遗传进化关系近的都为毒株KP414837-A/chicken/Jiangxi/2014.结论 芜湖市首例人感染H7N9禽流感病例的病毒株HA和NA序列均与已知H7N9禽流感病毒高度同源.
关键词： 禽流感 H7N9 Real-time RT-PCR 基因序列
