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miR-146a和miR-196a2前体区遗传多态性与焦炉工人遗传损伤的关系
目的 探讨miR-146a和miR-196a2前体区遗传多态位点rs2910164 G＞C和rs11614913 T＞C与焦炉工遗传损伤的关联性.方法 于2010年9月至10月,选取湖北省武汉市某焦化厂工龄在1年以上,无肿瘤,无吸烟习惯的焦炉作业工人,共575名.收集一般人口学资料并采集外周静脉血和尿液；采用胞质分裂阻滞试验计算外周血淋巴细胞的微核率来评价染色体损伤的程度；采用TaqMan探针对miR-146a前体区rs2910164 G＞C和miR-196a2前体区rs11614913 T＞C多态位点进行分型分析；采用三明治ELISA测定血浆中苯并[a]芘二氢二醇环氧化物-白蛋白(BPDE-白蛋白)加合物的浓度；并进行数据分析,并计算频率比(FR)及其95％ CI值.结果 共纳入575名工人.与携带野生型rs2910164 GG基因型的工人的外周血淋巴细胞微核率(4.02±3.09)相比,携带rs2910164CC基因型工人的微核率(4.38±3.46)增加(FR=1.18,95％CI:1.04～1.34),且有明显的等位基因剂量-效应关系(P趋势=0.025).按研究对象不同特征分层后,发现男性(FR=1.11,95％ CI:1.02～ 1.20)、不饮酒(FR=1.07,95％ CI:1.00 ～1.14)、工龄＜20年(FR=1.12,95％CI:1.03 ～ 1.22)和低BPDE-白蛋白水平组(FR=1.11,95％CI:1.02～1.21)中,rs2910164C等位基因与微核率的增加具有等位基因剂量-效应关系(P趋势分别为0.011、0.044、0.006和0.020).此外,与携带rs11614913TT基因型的工人(3.90±3.32)相比,携带rs11614913 TC基因型工人的外周血淋巴细胞微核率增加(4.27±2.91)(FR=1.12,95％CI:1.02 ～ 1.23).以同时携带rs2910164 GG及rs11614913TT基因型的工人组作为对照,同时携带rs2910164CC与rs11614913 CC基因型个体的外周血淋巴细胞微核率(5.32±4.94)是对照组(3.75±3.01)的1.51(1.21 ～1.89)倍.结论 miR-146a前体区域rs2910164C等位基因及miR-196a2前体区域rs11614913 C等位基因与焦炉工遗传损伤水平增加有关.
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miR-196a2单核苷酸多态与乳腺癌易感性关系
miRNA是一类长约21-24bp、内源性、非编码、单链RNAs,进化上高度保守,广泛存在于动、植物细胞中.可以调节基因表达[1].miRNAs可以与靶mRNAs互补序列配对结合,有效并且稳定地降低mRNAs的翻译活性.哺乳动物成熟mRNAs大多通过不完全互补配对与靶mRNA 3′-UTRs结合,调节靶基因的表达,有时也可以直接将靶mRNAs切断.生物信息学数据表明一条单链miRNA可以结合多达200条靶基因,并且这些基因的功能不尽相同[2].
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微小RNA-30c、196a2基因多态性与宫颈癌关系的病例-对照研究
[目的]探讨微小RNA(miR)-30c和miR-196a2基因多态性与宫颈癌的相关性.[方法]于2012年9月-2014年9月以病例-对照研究的方法收集来自盐城市第一人民医院的104例宫颈癌患者及186例对照,采用多重聚合酶链反应(PCR)和多重连接酶检测反应(LDR)技术对病例组和对照组的miR-30c rs928508和miR-196a2 rs11614913基因多态性进行分析,采用卡方检验分析各基因型与宫颈癌发生之间的相关性. [结果] miR-30c rs928508 GG、AG和AA基因型在病例组和对照组中的分别为16.3％、51.9％、31.8％和29.0％、47.3％、23.7％,差异具有统计学意义(P＜0.05).与GG基因型比较,携带AG和AA基因型的个体患宫颈癌的风险明显升高(P＜0.05),其中携带AA基因型个体危险度增加至2.38(95％CI:1.17.～4.83).未发现miR-196a2 rs11614913多态性与宫颈癌发生具有相关性(P＞0.05).[结论]miR-30crs928508基因多态性与宫颈癌发生相关.
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miR-196a2单核苷酸多态性与白血病发病风险的初步研究
背景与目的：miR-196a2在肿瘤的发生、发展中起类似于原癌基因的生物学功能。其表达升高会促进肿瘤细胞的增殖、侵袭和转移，有望成为重要的肿瘤标志物。该研究旨在探讨miR-196a2基因多态性位点rs11614913与白血病发病风险的关系。方法：采用病例-对照分析方法，收集2009年1月—2015年7月在烟台山医院检查确诊的210例白血病患者(病例组)及同期体格检查健康的250名正常体检者(对照组)的骨髓血或外周血，限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism， PCR-RFLP)检测miR-196a2基因多态性位点rs11614913的基因型，应用χ2检验比较各基因型频率在病例组和对照组中的差异，采用Logistic回归分析计算SNP的等位基因的比值比(odds ratio，OR)和95%CI表示各基因型发生白血病的风险度。结果：病例组和对照组相比，miR-196a2 rs11614913的T/T、C/C、C/T基因型频率的分布差异有统计学意义(P<0.05)，携带突变型纯合子C/C基因型的个体患白血病风险是野生纯合子T/T基因型个体的2.661倍，差异有统计学意义(P<0.05)。结论：miR-196a2基因多态性位点rs11614913与白血病发病风险有关，突变型纯合子C/C或携带C等位基因可能是白血病发生的危险因素。
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miR-196a2成熟区单核苷酸多态性对靶基因LSP1表达的影响
目的:研究miR-196a2成熟区单核苷酸多态性rs11614913(T/C)对预测靶基因LSP1表达的影响.方法:构建含有不同基因型miR-196a2的真核表达载体pCDNA3.1-miR196a2-C和pCDNA3.1-miR196a2-T;同时利用化学合成含有不同基因型的成熟miR-196a2探针miR-196a2-C和miR-196a2-U.将靶基因LSP1的3'UTR序列克隆至pMIR-REPORTTM Luciferase载体中而获得LSP1报告基因载体pMIR-LSP1.采用所构建的miR-196a2真核表达载体以及化学合成的成熟miR-196a2探针分别与靶基因LSP1报告基因载体组建两套转染体系.分别共转染于HEK293、A549和CHO 三种细胞后进行荧光素酶活性分析.结果:miR-196a2真核表达载体与靶基因LSP1报告基因表达载体共转染于HEK293、A549和CHO三种细胞后进行荧光素酶活性分析.pCDNA3.1-miR196a2-C等位基因荧光素酶相对活性与pCDNA3.1-miR196a2-T等位基因相比均有显著降低(P<0.05);含不同基因型的化学合成的成熟miR-196a2探针与靶基因LSP1报告质粒共转染HEK293、A549和CHO三种细胞,miR-196a2-C等佗基因荧光素酶活性与miR196a2-T等位基因相比也有显著降低(P<0.05).结论:荧光索酶活性强弱间接反映了miR-196a2与靶基因LSP1结合能力的大小.当miR-196a2成熟区rs11614913位点为C时,miR-196a2可能更为有效地与预测靶基因LSP1结合,从而在转录后水平调控靶基因表达.
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miR-196a2T＞C基因多态与宫颈癌易感性的关系研究
目的:探讨miR-196a2 T＞C基因多态与江苏人群宫颈癌遗传易感性的关系.方法:选择经组织学确诊的509例新发宫颈癌患者作为病例组,与病例组人群不存在生物学相关的562例正常人群作为对照组,利用Taqman实时荧光定量PCR技术检测基因型;选择宫颈鳞状细胞癌标本20例,实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测各基因型miR-196a的表达量;Logistic回归模型计算基因型与人群罹患宫颈癌的风险比(odds ratio,OR)及其95％的可信区间(95％CI).结果:携带miR-196a2突变纯合子CC个体罹患宫颈癌的风险明显高于TT基因型个体(OR=1.45,95％CI:1.04～2.09),携带TC/CC基因型个体增加约33％的宫颈癌发病风险(OR=1.33,95％CI:1.06～1.81);对宫颈鳞状细胞癌(cervical squamous cell carcinoma,CSCC)分析,与TT基因型比较,含突变纯合子CC个体罹患CSCC的风险明显升高(OR=1.49,95％CI:1.05～2.11),携带TC/CC基因型个体增加约31％的CSCC发病风险(OR=1.31,95％CI:1.00～1.73);RT-qPCR显示,在宫颈鳞癌组织中CC及CT/CC基因型与TT基因型相比,成熟miR-196a的表达水平明显升高.结论:MiR-196a2T＞C多态变异与中国江苏人群宫颈癌遗传易感性关联密切.
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miRNA196a2基因多态与食管鳞状上皮细胞癌相关性研究
目的:探讨miR-196a2基因(rs11614913)多态性及吸烟﹑饮酒在食管鳞癌发病中的交互作用,为食管鳞癌高危人群的筛选提供依据.方法:样品来自南通大学附属医院和南通市肿瘤医院病理检查确诊为食管鳞癌152例患者与同时期入住的152例非肿瘤患者或体检中心健康对照.抽取随机静脉血2 mL,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法,检测miR-196a2的基因rs11614913位点的多态性,同时调查各研究对象的吸烟、饮酒情况,并结合基因多态性将上述因素进行分层分析.结果:携带突变型纯合子C/C基因型个体罹患食管鳞癌风险是携带野生型纯合子T/T基因型个体2.108倍(95%CI=1.032~4.305),差异有统计学意义(P=0.041).结论:miR-196a2的基因rs11614913位点为突变型纯合子C/C或携带C等位基因者,罹患食管鳞癌风险增加,很可能是食管鳞癌发病的重要危险因素之一.
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miR-196a2基因多态性在广西人群中的分布
目的 探讨广西人群miR-196a2T＞C(rs11614913)等位基因及基因型频率分布情况,分析其与不同民族种族之间的差异性. 方法 利用单碱基延伸PCR技术(polymerase chain reactionsingle base extension,PCR-SBE)和DNA测序技术,检测303例广西人群中miR-196a2 T＞C的基因型,并比较其与人类基因组计划(human genome project,Hapmap)数据库中公布的非洲人、欧洲人、日本人和中国北京人群的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)数据,揭示这5个不同民族种族人群的等位基因及基因型频率分布规律. 结果 miR-196a2T＞C等位基因和基因型频率在广西男女间分布无差异性(P＞0.05).广西人群miR-196a2 T＞C多态性基因型及等位基因频率与非洲人、欧洲人、日本人比较有统计学差异意义(P＜0.05),但与北京人群无差异性(P均＞0.05). 结论 广西人群miR-196a2T＞C存在基因多态性,与别的民族种族人群比较有明显的差异性,这种差异性对于基因组水平上疾病的研究可能会起到积极重要作用.
