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  • TNF-α-308A/G单核苷酸多态性与皮肌炎相关性的Meta分析

    作者:高香;吕玲;李志玲;包黎明;沈丁丁

    目的: Meta分析TNF-α-308A/G单核苷酸多态性与皮肌炎相关性。方法在PubMed、EBSCO、EMBASE、中国学术期刊全文数据库(CNKI)、中国生物医学文献数据库(CBM)、万方数据库中查询肿瘤坏死因子α-308(TNF-α-308)位点多态性与皮肌炎相关性的文献。用Meta分析的方法分析基因型AA vs. GG,GA vs. GG,AA vs. GG+GA,GA+AA vs. GG和A vs. G在皮肌炎组与对照组中是否有差异。结果共纳入5篇文献进入本研究(462例皮肌炎患者,763例健康对照)。对总体人群进行Meta分析,发现TNF-α-308A等位基因与皮肌炎相关(OR=2.48,95%CI=2.00~3.07,P<0.001);将人群按照种族分层,发现-308A与高加索人群皮肌炎相关(OR=2.50,95%CI=1.99~3.14,P<0.001)。基因型AA vs. GG,GA vs. GG,AA vs. GG+GA,GA+AA vs. GG在皮肌炎组与对照组中均有统计学差异。结论 TNF-α-308A等位基因或基因型与高加索人群皮肌炎相关,TNF-α-308A等位基因或基因型可能是高加索人群皮肌炎的易感因素。

  • 经皮冠状动脉介入治疗术后患者的氯吡格雷抵抗与药物相关代谢基因多态性的相关性研究

    作者:马硝惟;顾智淳;沈珑;陈小颖;王亚楠;李敏

    目的:联合分析氯吡格雷药物代谢相关基因CYP2C19、ABCB1、PON1单核苷酸多态性位点与经皮冠状动脉介入治疗术后患者氯吡格雷抵抗发生及其血小板聚集抑制率之间的关系。方法回顾性研究2015年4至12月入住上海交通大学医学院附属仁济医院心内科且进行介入治疗的299例患者。采用血栓弹力图测定患者( ADP )诱导的血小板聚集抑制率,采用数字荧光杂交测定CYP2C19(rs4244285与rs4986893)、ABCB1(rs1045642)、PON1(rs662)位点的基因型。根据患者血小板聚集抑制率的大小分为氯吡格雷抵抗(CR)组(17例)和非氯吡格雷抵抗(NCR)组(282例)及氯吡格雷低反应(CLR)组(54例)和非氯吡格雷低反应(CLR)组(245例)。根据CYP2C19(rs4244285与rs4986893)分为快代谢型(EM)、中间代谢型(IM)、慢代谢型(PM)。 CR组的年龄(71.1±11.1)岁高于NCR组(65.02±10.51)岁,且差异有统计学意义(t=2.559,P<0.05)。结果 CYP2C19的PM组与EM+IM组相比血小板聚集抑制率下降且有统计学意义(Z=-2.065,P=0.039)且此差异并不由年龄引起(Z=0.405,P>0.05)。 PON1(rs662)位点的基因多态性与CR(χ2=0.175,P=0.916)、CLR (χ2=1.589,P=0.452)的发生及血小板聚集抑制率水平不具有相关性( Z=-0.030,P=0.976)。ABCB1(rs1045642)与CR(χ2=1.722,P=0.423)、CLR(χ2=0.176,P=0.916)的发生及血小板聚集抑制率水平不具有相关性(Z=-0.331,P=0.741)。结论 CYP2C19弱代谢型与氯吡格雷诱导的血小板聚集抑制率下降具有相关性;ABCB1(rs1045642)、PON1(rs662)位点的基因多态性与氯吡格雷抵抗不具有相关性。同时,在CYP2 C19弱代谢型患者上也不会加重其血小板聚集抑制率的降低。

  • 维生素 D 结合蛋白基因 rs2282679A/C多态性与慢性阻塞性肺疾病的相关性研究

    作者:王美芹;张建志;王莉

    目的:探讨维生素D结合蛋白(VDBP)基因rs2282679 A/C多态性与慢性阻塞性肺疾病(COPD)的相关性。方法选取2012年3月—2014年5月衡水市哈励逊国际和平医院住院治疗的男性 COPD患者120例为COPD组,另选取同时期衡水市疾病预防控制中心体检健康男性112例为对照组,采用酶联免疫吸附试验( ELISA)法检测血清25羟维生素D〔25( OH) D〕水平,采用TaqMan-聚合酶链反应检测VDBP基因rs2282679 A/C等位基因频率及基因型分布。结果对照组25(OH) D水平(55.1±5.8) nmol/L高于COPD组的(37.3±2.3) nmol/L (t=31.220, P<0.001)。对照组与COPD组VDBP基因rs2282679 A/C等位基因频率与基因型分布比较,差异均有统计学意义( P<0.05)。对照组与COPD组AA、 AC、 CC基因型者组间25(OH) D水平比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。对照组和COPD组组内AA、 AC、 CC基因型者25( OH) D水平比较,差异均有统计学意义( P<0.05);其中AC、 CC基因型者低于AA基因型者, CC基因型者低于AC基因型者( P<0.05)。调整年龄、吸烟指数后, AA基因型比AC基因型COPD易患率低18.3%〔OR=0.374,95%CI (0.197,0.708), P=0.002〕; AA基因型比CC基因型COPD易患率低35.8%〔OR=0.260,95%CI (0.106,0.640), P=0.002〕; AC基因型比CC基因型COPD易患率低16.7%〔OR=0.201,95%CI (0.849,4.744), P=0.109〕。结论 VDBP基因rs2282679 A/C多态性与COPD具有相关性,其中CC基因型与COPD易患性、25( OH) D水平关系紧密,或可作为COPD易患性筛选的突变位点。

  • 白介素6受体基因rs4129267位点多态性与汉族儿童哮喘易患性及血清IgE水平的关联研究

    作者:李增清;杨东新;周真;赵小琴;赵慧;谢丹宇;郭素华;胡兢晶;王波

    背景有研究证实,白介素6受体( IL-6R)基因中的rs4129267位点多态性与哮喘易患性显著相关,但尚无评估rs4129267位点多态性在汉族儿童中分布情况及其与血清IgE水平相关性的研究。目的研究IL-6R基因rs4129267位点多态性与汉族儿童哮喘易患性及血清IgE水平的关系。方法选取2013—2014年于广东省妇幼保健院儿科就诊的哮喘患儿410例为哮喘组,同期选取广东省妇幼保健院住院的非哮喘患儿513例为对照组。提取两组患儿基因组DNA,采用 SNaPshot 法对IL-6R基因 rs4129267、 rs527236128位点进行基因分型,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测两组患儿血清总 IgE水平。结果两组患儿rs4129267位点和rs527236128位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(χ2=3.264、2.135, P>0.05)。两组患儿rs4129267位点基因型频率和等位基因频率比较,差异有统计学意义( P<0.05)。两组患儿rs527236128位点基因型频率和等位基因频率比较,差异无统计学意义( P>0.05)。 Logistic回归分析结果显示, TT基因型是儿童哮喘的影响因素(P<0.05)。对照组患儿血清总IgE水平低于哮喘组(P<0.05)。对照组、哮喘组组内不同基因型患儿血清总IgE水平比较,差异无统计学意义(P>0.05);对照组各基因型患儿血清总IgE水平均低于哮喘组(P<0.05)。结论 IL-6R基因rs4129267位点多态性与汉族儿童哮喘易患性有关,而与哮喘患儿血清IgE水平无关。

  • 葡萄糖激酶调节蛋白基因 rs1260326多态性与新疆维吾尔族人群2型糖尿病的相关性研究

    作者:王黎;马琦;房彬彬;朱筠;王淑霞;张朝霞;姚华

    目的:探讨葡萄糖激酶调节蛋白( GCKR )基因 rs1260326多态性与新疆维吾尔族2型糖尿病(T2DM)的关系。方法选取2012年6月—2013年3月新疆医科大学第一附属医院确诊为T2DM的维吾尔族患者1000例为T2DM组,同期选取该院的体检健康者1008例为对照组。收集所有受试者身高、体质量、臀围、腰围(WC)、收缩压(SBP)、舒张压(DBP)等一般临床资料,计算体质指数(BMI)、腰臀比(WHR)。检测并比较其生化指标〔总胆固醇(TC)、三酰甘油(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、空腹血糖(FPG)〕。采用Sequenom Mass ARRAY系统对GCKR基因rs1260326位点进行基因分型,比较T2DM组和对照组GCKR基因rs1260326位点基因型分布及等位基因频率差异;采用Logistic回归分析GCKR基因rs1260326多态性与T2DM的关系。结果 T2DM组BMI、 WHR、 WC高于对照组( P<0.05);两组SBP、 DBP比较,差异无统计学意义( P>0.05)。 T2DM组TC、 FPG高于对照组, HDL-C、 LDL-C低于对照组( P<0.05);两组TG比较,差异无统计学意义(P>0.05)。两组GCKR基因rs1260326位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(P>0.05),说明两组样本具有群体代表性。 T2DM组与对照组rs1260326位点基因型分布、 rs1260326位点等位基因频率比较,差异无统计学意义( P>0.05)。 Logistic回归分析结果表明, GCKR基因rs1260326隐性遗传模式是T2DM的影响因素( P<0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,入选主效应模型的变量有性别、 WHR、 TC、 TG、 HDL-C、 GCKR基因rs1260326隐性遗传模式( P<0.05)。结论在新疆维吾尔族中, GCKR基因rs1260326多态性与T2DM相关, TT基因型可能是新疆维吾尔族人群T2 DM发生的保护因素。

  • 抑郁症患者多巴胺转运体基因可变串联重复序列多态性研究

    作者:唐洪燕;郭宗君;李玉焕;杨虎梅;徐圣芬;赤海娇;陈娟

    目的:探讨抑郁症患者多巴胺转运体( DAT)基因3′非翻译区域的40 bp可变串联重复序列( VNTR)多态性。方法选取2011年10月—2014年3月就诊于青岛大学附属医院和青岛市精神卫生中心住院及门诊的抑郁症患者116例作为抑郁组,同期选取青岛大学附属医院体检健康者172例作为对照组。应用聚合酶链反应-VNTR多态性分析技术行DAT基因VNTR多态性检测。结果共检测出520、480、440、380、360 bp 5种等位基因,分别为DAT基因的VNTR 多态性11、10、9、7.5、7次重复序列。6种基因型分别为:480 bp/480 bp、480 bp/440 bp、520 bp/480 bp、480 bp/380 bp、480 bp/360 bp、440 bp/440 bp。抑郁组和对照组的基因型分布和等位基因频率符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(抑郁组:χ2=1.380, P=0.848;对照组:χ2=0.051, P=0.990)。抑郁组与对照组基因型分布比较,差异有统计学意义( P<0.05);其中两组480 bp/480 bp和480 bp/440 bp基因型比较,差异有统计学意义(χ2=24.375, P<0.001;χ2=4.976, P<0.05)。两组等位基因频率比较,差异有统计学意义( P<0.05)。结论 DAT基因VNTR多态性可能与抑郁症的发病相关,为进一步的临床研究提供了借鉴。

  • N-back任务功能性磁共振成像探讨亚甲基四氢叶酸还原酶基因 C677 T多态性对精神分裂症患者工作记忆的影响研究

    作者:姜思思;阎浩;田霖;张艳玲;卢天兰;闫俊;岳伟华;张岱

    目的:应用N-back任务功能性磁共振成像探讨亚甲基四氢叶酸还原酶( MTHFR)基因C677T多态性对精神分裂症患者工作记忆相关脑区功能的影响。方法选取2007年2月—2008年8月北京大学第六医院住院或门诊汉族精神分裂症患者33例为病例组,另同时期从社区招募健康志愿者30例为对照组,均接受颅脑功能性磁共振成像检测,功能性磁共振成像扫描时完成N-back工作记忆任务。同时采集受试者静脉血,采用DNA测序方法检测MTHFR基因C677T位点基因型。经过头动校正及空间标准化质控,终病例组纳入20例,对照组纳入27例。使用统计参数图( SPM8)软件进行全因子分析,比较诊断(对照组、病例组)及MTHFR基因型对工作记忆相关脑区激活的作用。结果对照组与病例组性别、年龄、 MTHFR基因型、2-back正确反应率比较,差异均无统计学意义( P>0.05)。病例组受教育时间较对照组缩短( P<0.05)。全因子分析结果显示,右侧岛叶、右侧角回、左侧额中回、左侧岛盖的激活存在诊断主效应;事后分析显示,病例组右侧岛叶、左侧额中回、左侧岛盖的激活均较对照组增强( P<0.001)。病例组和对照组右侧尾状核、左侧角回和左侧壳核的激活存在MTHFR基因型主效应;事后分析显示, MTHFR基因CT和CC基因型携带者上述工作记忆相关脑区的激活均较 TT基因型携带者增强(P<0.001)。病例组MTHFR基因CT和CC基因型携带者右侧尾状核、左侧角回、左侧苍白球的激活较TT基因型携带者增强( P<0.001)。未发现工作记忆相关脑区激活诊断和MTHFR基因型存在交互作用。结论工作记忆任务中,与健康者相比,精神分裂症患者多个脑区存在“低效”的激活增加。精神分裂症患者MTHFR基因C677T多态性可能影响双侧基底核区、左侧顶下小叶在工作记忆任务中的激活。

  • 葡萄糖转运体9基因 rs3733591(C>T)的单核苷酸多态性与我国汉族人群原发性痛风发病的相关性研究

    作者:李敏;杨静;周京国;青玉凤;谢文光;杨其彬;赵明才;江丹

    目的探讨葡萄糖转运体9(SLC2A9)基因 rs3733591(C>T)的单核苷酸多态性(SNPs)与我国汉族人群痛风发病及血尿酸水平的相关性,并分析其多态性与痛风患者、健康体检者 PBMCs SLC2A9 mRNA 表达的相关性。方法①采用 TaqMan?探针法检测痛风组(297例原发性痛风性关节炎患者)和健康对照组(211名健康体检者) rs3733591(C>T)位点的基因型,χ2检验比较2组基因型及等位基因分布频率,计算比值比(OR)及95%可信区间(95%CI)。②采用实时荧光定量-PCR(RT-qPCR)法检测46例间歇期痛风患者及40名健康对照组 PBMCs SLC2A9 mRNA 的表达水平,非参数检验比较各组变量间的差异,并分析与 rs3733591(C>T)多态性的相关性。结果 rs3733591(C>T)位点的 TT 基因型在痛风组的分布频率显著低于健康对照组(37.7%与48.3%,P=0.017),携带 TT 基因型的个体罹患痛风的相对风险OR 为0.647(95%CI:0.452~0.925)。而等位基因 T 在痛风组中的分布频率为60.9%,显著低于健康对照组的69.2%(χ2=7.324,P=0.007),携带等位基因 T 的个体罹患痛风的相对风险 OR 为0.695(95%CI:0.533~0.905);等位基因 C 在痛风组中的分布频率为39.1%,显著高于健康对照组的30.8%(χ2=1.440,P<0.05)。痛风组中携带 TC 基因型个体的外周血单个核细胞 SLC2A9 mRNA 的表达水平显著高于携带 TT 基因型者,而痛风组及健康对照组携带其他基因型的个体 SLC2A9 mRNA 的表达差异无统计学意义(P>0.05)。有痛风石(30例)痛风患者与无痛风石(190例)痛风患者的基因型及等位基因分布频率差异无统计学意义(P>0.05)。结论本研究提示 SLC2A9基因 rs3733591(C>T)位点的多态性可能与我国汉族人群原发性痛风的易感性相关,而与痛风患者痛风石形成无关;等位基因 C 可能为痛风发病的风险因子,而 TT 基因型及 T 等位基因可能对痛风发病具有保护作用;其多态性可能通过影响 SLC2A9基因的转录表达水平来参与痛风的发病。

  • 白细胞介素-1β+3953位点基因多态性与肺结核疾病易感性关系的Meta分析

    作者:黄铁军;余琼华;戴列军

    目的:探讨白细胞介素(IL)-1β+3953位点基因多态性与肺结核疾病易感性的关系。方法计算机检索数据库,收集有关IL-1β+3953位点基因多态性与肺结核疾病易感性关系的病例对照研究,提取纳入文献的相关数据进行Meta分析,以病例组和对照组IL-1β+3953位点各种基因模型的比值比( OR )为效应指标,漏斗图检测发表偏倚。结果共8篇研究符合纳入标准,累计病例数1160例,对照组1216例。Meta分析表明IL-1β+3953位点基因多态性与肺结核疾病易感性无明显关联性。结论IL-1β+3953位点基因多态性与肺结核疾病易感性无明显关联性。

  • 中国汉族人群DNMT基因单核苷酸多态性与弱精子症的相关性研究

    作者:李琦;欧光鑫;杨学习;余庆锋;叶禄伟;毛向明

    目的:探讨DNMT 基因(DNA methyltransferase)单核苷酸多态性(SNP)与弱精子症男性不育的关系。方法本研究检测了中国南方人群中DNMT1(rs2114724, rs2228611, rs2228612, rs8101866, rs16999593), DNMT2(rs11254413),DNMT3A (rs1550117, rs11887120, rs13420827, rs13428812, rs6733301), DNMT3B (rs2424908,rs2424913)和DNMT3L (rs113593938)14个SNPs与弱精子症的相关性。运用Sequenom MALDI-TOF-MS 平台技术对特发性弱精子症不育患者(病例组,n=195)和正常精子活力男性(对照组,n=184)精液样本DNA进行基因分型。通过遗传平衡检验(Hardy-Weinberg Equilibrium test, HWE)样本结果,卡方检验和logistic回归分析所有基因型分布和等位基因频率。结果这些检测的SNPs中,DNMT3A基因rs13428812位点与弱精子症相关(OR=1.54;95%CI:1.02-2.13; P=0.039)。其余位点未检查出与弱精子症的相关性。结论 DNMT3A基因rs13428812位点可能与弱精子症密切相关,但是机制尚不明确。

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