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蛋白质组学研究的分离技术及其进展
蛋白质的分离技术是蛋白质组学研究的核心技术,目前应用于蛋白质分离的方法主要包括二维电泳分离技术、液相色谱-质谱分离技术以及蛋白质芯片.作者通过文献复习,对以上三种技术的基本原理、方法及其进展进行综述.
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应用蛋白质芯片检测骨性关节炎患者基质金属蛋白酶-13的初步研究
目的:探讨应用蛋白质芯片技术检测骨性关节炎(OA)患者关节液和血清中基质金属蛋白酶-13(MMP-13)的方法.方法:应用低密度蛋白质芯片方法同时检测32例OA患者关节液和血清中MMP-13表达水平,24例正常关节作为对照组,进行蛋白质芯片荧光强度的对比研究.结果:OA患者关节液和血清中的MMP-13在蛋白质芯片上的荧光强度明显高于对照组关节液的荧光强度(P<0.001).OA患者关节液中MMP-13在蛋白质芯片上的荧光强度明显高于其血清的荧光强度(P<0.001).结论:OA患者关节液和血清中MMP-13表达明显高于对照组.应用低密度的蛋白质芯片技术检测OA患者关节液及血清中MMP-13的水平具有一定临床应用价值.
关键词： 蛋白质芯片 骨性关节炎 基质金属蛋白酶-13 -
SELDI-TOF MS技术及其在传染性疾病研究中的应用
SELDI-TOF MS(surface-enhanced laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱)技术,是随着蛋白质组学的兴起而出现的新技术,是一种基于蛋白质芯片和质谱技术的蛋白质指纹图谱分析平台.本文就SELDI-TOF MS技术的原理、特点及其在传染性疾病研究中的应用进行综述.
关键词： 传染性疾病 蛋白质组学 SELDI-TOF MS 蛋白质芯片 质谱 -
蛋白质芯片技术及其在传染病研究中的应用进展
蛋白质芯片是一种新型的蛋白质功能分析技术,具有高通量、快速、敏感、准确、微型化和自动化等特点.它在传染病病原体的检测、毒力及致病机制、耐药机制的研究、宿主免疫机制的阐明、新替代疫苗的研制、新抗生素靶位的发现等方面将有着巨大的应用前景.本文就蛋白质芯片技术及其在传染病研究中的应用进展作了概述.
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多种肿瘤标志物蛋白质芯片诊断系统在体检人群中的临床应用
恶性肿瘤在我国人口中的死亡率为108.39/10万,占总死亡人数的17.9%,高居死亡原因的第二位[1].由于多年来各实验室一直使用单指标肿瘤标志物(TM)检测,存在特异性不强、灵敏度低、分析费用昂贵、需要多指标检测时用血量大等缺点,尤其在对正常人群作体检筛查.本院于2003年引进了可一次性联合检测12项肿瘤标志物的C-12型多种肿瘤标志物蛋白质芯片诊断系统.本文旨在对该系统在体检人群中的筛查价值作一评估.
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血清蛋白质谱模型对胃腺癌诊断的应用性研究
[目的]探讨用蛋白质芯片技术筛选胃腺癌患者血清蛋白质表达谱,寻找血清中的标志性蛋白.[方法]采用蛋白质生物芯片表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI)技术,运用SAX2 (Strong Anionic Exchanger)蛋白质芯片检测胃腺癌患者、胃炎患者和健康者血清,建立诊断模型,然后进行单盲模型验证.[结果]发现59 10Da、5084Da和8691Da的三个蛋白质荷比峰(M/Z)在胃腺癌和健康组比较中具有显著性差异.5910Da、6440Da的两个蛋白质荷比峰(M/Z)在胃腺癌和胃炎组中比较具有显著性差异.[结论]建立了胃腺癌的血清蛋白指纹质谱,为以后的胃癌蛋白质组学研究奠定了一定的基础,建立了以5910Da、5084Da、8691Da和6440Da四个蛋白质峰为模型区分胃腺癌与非胃腺癌的血清蛋白表达质谱诊断模型,为胃腺癌的临床诊断提供了一条崭新的途径和方法.
关键词： 表面增强激光解析电离-飞行时间质谱 蛋白质芯片 生物标记 胃腺癌 -
血清蛋白质指纹图谱模型在乳腺导管内癌诊断中的应用
[目的]探讨蛋白质检测技术在乳腺导管内癌患者诊断中的应用价值.[方法]用SELDI-TOF-MS技术及配套蛋白质芯片检测40例乳腺导管内癌患者及40名健康者的血清蛋白质指纹图谱,建立诊断模型.[结果]3个蛋白质峰(质/荷比分别为4487.9、6468.1和7575.1)组合构建的诊断模型可鉴别乳腺导管内癌患者和健康者,灵敏度为92.50％(37/40),特异性为90.00％(36/40),阳性预测值为90.24％ (37/41),阴性预测值为92.30％(36/39),准确率为91.25％(73/80).[结论]SELDI-TOF-MS在乳腺导管内乳头状癌诊断尤其是早期诊断以及候选标志物筛选等方面具有一定价值,值得进一步深入研究.
关键词： 表面增强激光解析电离—飞行时间质谱 蛋白质芯片 乳腺肿瘤 -
蛋白质芯片技术的研究及应用现状
随着蛋白质组学研究的不断深入,蛋白质芯片技术作为一种高通量、微型化、自动化的蛋白质分析技术应运而生并得到广泛应用.现对这一技术的基本原理、分类及应用现状进行介绍,并探讨其目前存在的问题和发展前景.
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SELDI-TOF-MS技术对胃炎诊断的应用
目的 采用蛋白质剖析技术同时解析和分析多种蛋白质,从而找出更好的生物标记物,用于检测胃炎.方法 用SELDI-TOF-MS技术及配套蛋白质芯片检测30例慢性胃炎和64例非胃炎疾病患者的血清蛋白质指纹图谱,建立诊断模型.结果 2个蛋白质峰[5084和8691质荷比(m/z)]组合构建的诊断模型鉴别慢性胃炎和健康志愿者,灵敏度为96.66%(29/30),特异性为93.55%(29/31).2个蛋白质峰(5910和6440 m/z)组合的诊断模型鉴别胃炎和胃癌患者的灵敏度为96.6%(29/30),特异性为90.9%(30/33).结论 SELDI-TOF-MS在慢性胃炎的诊断尤其是早期诊断及候选标志物筛选等方面具有一定价值,值得进一步深入研究.
关键词： 表面增强激光解析电离-飞行时间质谱 蛋白质芯片 生物标记 胃炎 -
肿瘤标志物CA19-9和CA242联合检测在胆管癌中的诊断价值
目的研究多肿瘤标志物蛋白质芯片联合检测CA19-9和CA242在胆管癌中的应用.方法应用多肿瘤标志物蛋白质芯片诊断系统检测75例胆管疾病患者,经术中和(或)术后病理学证实,其中胆管癌40例、胆管良性病变35例.检测两种肿瘤标志物糖类抗原19-9(CA19-9),糖类抗原242(CA242)的改变.结果75例患者中,糖类抗原19-9和糖类抗原242同时阳性者39例,其中胆管癌患者33例,其中糖类抗原19-9大于500 U/ml者28例;胆管良性病变中,有6例为糖类抗原19-9和糖类抗原242同时阳性,一例糖类抗原19-9大于500 U/ml者.当糖类抗原19-9和糖类抗原242同时阳性时,诊断胆管癌敏感性为82.5%,特异性为82.9%.结论应用多肿瘤标志物蛋白质芯片诊断系统检测胆管癌,当糖类抗原19-9和糖类抗原242同时阳性时,敏感性和特异性均较好,可作为临床诊断胆管癌的较好指标.
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低密度蛋白质芯片在医药研究中的应用
蛋白质芯片技术日趋成熟,研究重点已由对整个蛋白质组的观察,转变为对具有重要功能的蛋白质的研究.低密度蛋白质芯片技术的建立为这一研究转变提供了有力工具,具有交叉影响小,信号强度高,结果准确性好的特点.文章综述了低密度蛋白质芯片在疾病诊断和监控,药物发现和检测,分子相互作用和信号通路等医药研究中的应用.
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SELDI蛋白质芯片在肿瘤标志物筛选中的应用进展
随着人类进入后基因组时代,蛋白质组学成为生命科学的一大研究热点.蛋白质芯片作为蛋白质组学研究中一项有前景的技术,被广泛应用于肿瘤的标志物筛选、早期诊断、分期及疗效、预后评价方面.本文就表面增强激光解吸电离(surface enhanced laser desorption /ionization, SELDI)蛋白质芯片的原理及近年来在肿瘤标志物筛选中的应用做一简要综述.
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蛋白质芯片-飞行质谱技术及其在临床医学中的应用
蛋白质组学研究是终揭示生命现象本质的关键,如今该学科已步入生命科学研究的前沿.与之相伴随着的生物高新技术发展催生了一项新型生物芯片技术,即蛋白质芯片飞行质谱技术--表面加强激光解析电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectra, SELDI-TOF-MS).该技术将蛋白质芯片和质谱技术相结合,集样品分离、纯化、检测和数据分析为一体,具快速和高通量,成为目前蛋白质表达及蛋白质组学研究的有力工具.其可望为众多疾病的机理阐明及攻克提供理论依据和解决途径,在临床疾病诊断和防治方面发挥重要作用,显示了良好的发展前景和广泛的应用前景.本文对蛋白质芯片-飞行质谱技术的原理、特点及部分疾病的基础和临床研究等进行文献综述.
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血清蛋白质谱模型的建立及在乳腺癌诊断中的应用
目的 建立健康女性人群、乳腺癌患者血清蛋白质谱模型,并探讨对乳腺癌诊断的临床意义.方法 应用表面加强激光解析电离化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,以弱阳离子交换芯片(CM10)结合血清蛋白质,分析60例乳腺癌患者、60例健康对照女性的血清样本,得到其蛋白质谱,用BioMarker Pattern软件分析蛋白质谱图,建立分类树模型并进行盲筛验证.结果 乳腺癌患者与健康对照女性比较,筛选出12个差异蛋白质峰(P＜0.001),其中6个标志蛋白呈高表达,6个标志蛋白呈低表达.BioMarker Pattern软件在设定条件下自动选取3个标志蛋白用于建立乳腺癌诊断的分类树模型,此模型灵敏度为91.90%,特异度为81.25%.结论 利用SELDI-TOF-MS技术可筛选出乳腺癌患者和健康对照女性血清蛋白质谱存在的差异蛋白质峰,可作为乳腺癌检测、随访监测的指标.
关键词： SELDI-TOF-MS 蛋白质芯片 乳腺肿瘤 蛋白质组学 -
生物蛋白芯片技术及其在ToRCH综合症诊治中的应用与展望
生物芯片(biochip)的设想起始于80年代中期,包括基因芯片、蛋白芯片及芯片实验室三大领域[1].随着人类基因组计划(humangenomeproject,HGP)的发展与完成[2],以功能研究为核心的人类后基因组计划时代已经到来,建立新型、高效、快速的检测和分析技术已势在必行,这些高效的分析与测定技术已有多种,如DNA质谱分析法,荧光单分子分析法,杂交分析等,其中以生物芯片技术为基础的许多新型分析技术发展快也具发展潜力.1996年美国affymertrix公司创造了世界上第一块基因芯片;1998年,美国开发成功世界上第一块蛋白质芯片;2003年,我国南京大渊生物技术工程有限责任公司成功开发了大渊ToRCH蛋白芯片和大渊蛋白芯片检测系统.目前世界上有数千家大公司在从事生物芯片的研究和开发工作,这将给生命科学、医学、化学、新药开发、生物武器战争、司法鉴定、食品与环境监督等众多领域带来巨大的革新甚至革命.本文就生物蛋白芯片技术及其在ToRCH综合症诊治中的应用与展望作如下综述.
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多肿瘤标志物联合检测在妇科恶性肿瘤临床治疗中的应用研究
目的 探讨多肿瘤标志物联合检测在妇科恶性肿瘤治疗过程中的应用价值.方法 采用多肿瘤标志物蛋白质芯片系统(C-12),检测了35例卵巢癌、38例宫颈癌和26例绒癌患者治疗前及治疗1个月后的血清肿瘤标志物含量,以肿瘤标志物含量的变化来评估治疗措施.结果 治疗1个月后多数患者体内肿瘤标志物含量降至正常范围,但仍有40.1%的卵巢癌、34.2%的宫颈癌、23.1%的绒癌患者治疗后呈阳性,说明部分患者临床疗效不明显,建议改善治疗措施.结论 肿瘤标志物联合检测对妇科恶性肿瘤卵巢癌、宫颈癌、绒癌具有高度敏感性,监测治疗前后患者体内的肿瘤标志物含量,对指导临床治疗妇科恶性肿瘤有很大的应用价值.
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SELDI蛋白芯片技术筛选卵巢癌血清肿瘤标志物的研究
目的寻找卵巢癌患者血清中新的肿瘤标志物.方法采用表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,选用WXC2蛋白质芯片对53例卵巢癌及50例对照血清标本进行检测以筛选卵巢癌患者血清中差异表达蛋白质.结果在分子量0～50 000D范围内,检测出275个差异蛋白峰.卵巢癌差异表达明显的蛋白峰6个(P＜0.05),其中低表达的5个,相对分子量分别为6 432、6 879、8 554、8 682、13 726 D,高表达的1个,相对分子质量为11450 D.早期与晚期卵巢癌比较,发现差异表达明显的蛋白峰2个,相对分子量分别为6 190、6 448 D,均在早期卵巢癌中高表达.将发现的差异蛋白峰在Swiss蛋白数据库中搜索,发现11 450 D蛋白峰与S100 Z protein相符.S100 Z protein属于S100蛋白家族,可能通过与S100 P相互作用,促进卵巢癌的发生.其它的差异峰在数据库中没有与之相匹配的蛋白,提示可能为新的蛋白质.结论SELDI-TOF-MS蛋白质芯片技术是1种快速、简单易行、用量少和高通量分析方法,能够直接检测出卵巢癌患者血清中相对特异的肿瘤标志物,其对于卵巢癌的早期诊断具有一定的临床意义.
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结直肠癌的早期诊断及蛋白质芯片技术的应用
结直肠癌(colorectal cancer)是常见的消化道恶性肿瘤之一,目前已上升为全球第3位常见癌症.老年人随着年龄的增高其结直肠癌发病率会不断上升,另外青年期结直肠癌的发病率也有升高趋势,且症状隐匿,病情发展快,误诊率高,多数患者被诊断为结直肠癌时已属中晚期.
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蛋白质芯片在蛋白质组分离分析中的应用
目的介绍及评价蛋白质芯片技术在蛋白质组分离分析中的应用.方法综述近年来国内外相关文献.结果蛋白质芯片作为一种新型蛋白质分离分析技术,在受体-配体反应的检测、筛选药物以及评价药物效能和毒性等方面具有巨大的应用前景.结论蛋白质芯片技术是一种高通量、高灵敏度、高精度的技术平台,必将获得长足发展和广泛应用.
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蛋白质组学在乳腺癌研究中的应用
蛋白质组学在肿瘤研究中的应用是近几年的研究热点,许多新方法也不断应用于蛋白质组学的研究中,包括组织芯片、蛋白质芯片、差异显示双相凝胶电泳以及新的表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片技术,这些新方法在乳腺癌的早期诊断、预后评价以及信号转导等方面都取得一定进展.
