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中国人群先天性白内障突变谱的建立
目的:基于PubMed和CNKI文献知识库建立中国人群先天性白内障突变谱.方法:从PubMed和CNKI文献库中检索先天性白内障基因突变相关文献,基于中英文文本挖掘的方法提取基因、变异、人群信息,并根据句级共现性建立不同信息间关联,分别在基因、外显子和突变进行频率分布分析,观察中国人群和世界其他人群突变谱的差异.结果:建立中国人群先天性白内障的突变谱,先天性白内障相关的169个变异分布在32个基因的60个外显子或内含子可变剪切区域上面.结论:基于PubMed和CNKI,通过计算机文本挖掘和人工检查相结合的方法,建立中国人群先天性白内障基因变异数据库并获得突变谱可行.该方法可为中国人群其它单基因病突变谱的获得提供借鉴.
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感音神经性聋的诊断和防治
耳聋是影响人类健康和生活的常见疾病之一,也是临床上常见的遗传病.据各国统计,每1000个新生儿中就有1～3例聋儿,其中大约60%的新生聋儿可能由遗传因素所致,部分可能为环境因素导致,绝大部分儿童耳聋是感音神经性聋.目前认为,多数遗传性聋属于单基因病,耳聋相关基因很多、突变谱广泛,这一类耳聋也有可能通过基因检测获得明确诊断,环境因素所致的耳聋尚缺乏确定性诊断方法.
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基因突变谱修正子宫内膜癌病理分级的辅助作用
目的:确定不同亚型的子宫内膜癌的基因突变谱,提高对子宫内膜癌分级的性能.方法:随机选取子宫内膜癌患者385例作为研究对象,对这些病例进行组织学分型和病理分级后,对ARID1A,PTEN,PIK3CA,KRAS,CTNNB1,PPP2R1A,BRAF,TP53,和PPP2R5C进行测序.结果:与低级别子宫内膜样腺癌(EEC)相比,高级别子宫内膜样腺癌(EEC-3)发现了更高频率的PTEN,ARID1A,PIK3CA,KRAS,PPP2R1A,和TP53突变.Logistic回归分析发现PTEN和TP53突变可以显著区分EEC-3和低级别EEC.子宫浆液性癌(ESC)病例中,TP53 (67.6％)和PPP2R1A(43.2％)突变构成了这个亚型的主要突变类型.然而未发现任何可用于区分ESC和ECC-3的回归模型.TP53 (67.6％)和PPP2R1A(43.2％)突变构成了子宫内膜癌肉瘤亚型的主要突变类型.PTEN突变可以显著区分EEC-3和癌肉瘤,还可以显著区分ESC和癌肉瘤.结论:明显的分子特征可有助于子宫内膜癌的诊断分类,使诊断更具有可重复性.
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32497例正常听力孕龄女性耳聋基因携带率与突变谱调查
目的 在正常听力孕龄人群中开展耳聋基因携带率与突变谱调查,为耳聋基因筛查、遗传咨询、疾病管理提供数据. 方法 32 497例听力正常且无耳聋家族史的孕龄女性在我院医学遗传中心门诊接受遗传咨询后,接受耳聋基因芯片筛查.对于检测结果提示为常染色体隐性遗传耳聋基因突变携带者,建议其配偶进行进一步耳聋基因检测.对于夫妇均为耳聋基因突变携带的家庭,给予遗传咨询与风险评估,必要时提供产前耳聋基因诊断. 结果 32 497位听力正常且无耳聋家族史的孕龄女性中,1 181例携带遗传性耳聋基因突变,携带率为3.63％.其中,1 117例携带常染色体隐性遗传的耳聋基因杂合突变,包括4种常见的GJB2基因突变665例,2种常见的SLC26A4基因突变407例,GJB3基因突变45例.此外,64例携带与氨基糖甙类药物诱导性耳聋密切相关的线粒体DNA 12S rRNA基因突变. 结论 在正常听力的孕龄人群中开展耳聋基因携带率与突变谱的研究,对优生优育与遗传咨询具有重要意义.
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贵州地区β-地中海贫血基因突变类型分析
目的 了解贵州地区β-地中海贫血(简称β-地贫)基因突变类型及分布情况.方法 542例经血常规检测发现平均红细胞体积和平均血红蛋白含量降低、血红蛋白电泳提示可能为β-地贫的贵州籍患者,应用反向斑点杂交技术检测中国人群中8种常见和9种少见共17种β-地贫基因突变类型.对β-地贫表型阳性、但未检出17种突变类型的样本,经β-珠蛋白基因全长序列分析,查找是否存在罕见突变类型.对检出的β-地贫基因突变类型及其分布频率进行分析.结果 在542例患者中,460例经基因检测确诊为β-地贫,其中杂合子352例,突变纯合子41例,双重杂合子67例.共检出12种基因突变类型,按分布频率依次为:CD17(40.74％)、CD41-42(33.69％)、IVS-Ⅱ-654(13.76％)、-28(3.70％)、βE(3.35％)、CD71-72(1.94％)、CD43 (1.06％)、IVS-Ⅰ-1(0.71％)、CD27-28 (0.35％)、-29(0.35％)、CAP (0.18％)、CD121(0.18％),其中前6种突变类型所占比例为97.18％.1例杂合子中检测出的显性突变CD121 (GAA＞TAA)为国内首次发现的突变类型.结论 贵州地区的β-地贫突变谱与其他地区有所不同,CD17为常见的突变类型;CD121GAA＞TAA突变丰富了中国人群的β-地贫突变谱.本研究为贵州地区β-地贫的防治提供了有价值的基础数据.
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天津及周边地区苯丙氨酸羟化酶基因突变谱和新突变分析
目的 分析天津地区人苯丙氨酸羟化酶(phenylalanine hydroxylase gene,PAH)基因突变谱,明确本地区该基因突变类型和特点,为遗传咨询和产前基因诊断提供科学依据.方法 用聚合酶链反应-单链构象多态、变性高效液相色谱法和DNA测序法对天津及河北等地99例已确诊各种类型苯丙酮尿症患儿基因组DNA进行PAH全基因13个外显子分析.结果 全基因共检出41种突变,含错义突变22种、无义突变7种、剪接位点突变9种和缺失突变3种.其中新突变6种(IVS3nt+1g→a、A165D、Q301X、G344D、P362L和R413G).198个PAH等位基因突变总检出率为93.94%.结论 天津及周边地区PAH基因突变谱广、遗传异质性高,一些常见突变的发生频率与以往报道的地域分布略不同.
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根据解剖位置以及遗传不稳定类型,大肠癌的典型Wnt信号通路表现出不同的突变谱
Albuquerque C、BaltazarC、Filipe B等人研究分析了52例大肠肿瘤的Wnt信号基因的突变,发现不同类型的肿瘤突变谱有显著差异.已完成的研究表明,家族性腺瘤性息肉中APC基因突变体决定肿瘤形成的Wnt信号级别.研究发现APC突变至少包括2个β-连环蛋白的下调序列(20个氨基酸的重复序列),且突变在不稳定的微卫星(MSI-H)中的频率远高于稳定的微卫星(MSS).此外,以防检测到2个命中的APC,突变的选择保留了2个20个氨基酸重复序列的累计.
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小鼠淋巴细胞hprt基因突变检测的研究进展
肿瘤的发生、发展与突变事件密切相关.人类在环境中接触的突变剂的检出依赖于致突变试验.以次黄嘌呤鸟嘌呤磷酸核糖基转移酶 (hypoxanthine-guanine phosphoribosyl transferase, hprt)基因为报告基因的 hprt突变试验是几个重要的致突变试验之一,其优点在于不仅能检测出突变剂的致突变能力大小,还可以对突变体进行突变谱分析,并且能为多种与 hprt基因突变相关的人类疾病提供研究资料.以小鼠啮齿动物为试验模型的淋巴细胞 hprt基因突变试验近年来得到广泛应用,本文对其研究进展作一综述.
