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雌激素对大鼠肝脏B族清道夫受体异构体表达的调节作用
0 引言 小鼠和人类血浆中高密度脂蛋白(HDL)胆固醇的水平与动脉粥样硬化性心血管病的发病率呈显著负相关[1].
关键词： 雌激素 SR-B(B族清道夫受体) 可变剪接 -
Fn-EⅢA金标单克隆抗体试纸条的试制和初步应用
目的开发可用于法医病理学损伤时间推断临案的金标Fn-EⅢA单克隆抗体试纸条.方法选取两种敏感、特异的片段特异性Fn-EⅢA单克隆抗体,ELISA方法进行效价观察,标记胶体金后分别采用渗滤法及层析法检测其效果,抽提阳性对照中目标蛋白进行初步测评,并以大鼠皮肤损伤模型进行验证.结果两种单克隆抗体均可用于Fn-EⅢA肽段的金标法检测,以IST9搭配Fn多抗效果佳;正常皮肤组织样本中试纸条检测线不显色,损伤3h后显色,随损伤时间延长,染色逐渐加深.结论该试纸条可靠性、可重复性以及可操作性均佳,可望在法医学损伤时间推断有广阔的应用.
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大鼠皮肤创伤后EⅢA-FN mRNA表达与损伤时间推断研究
目的研究皮肤创伤后不同时间纤连蛋白剪接方式变化及EⅢA剪接异型体的表达.方法提取伤区组织总RNA,RT-PCR方法扩增目的条带.结果大鼠皮肤损伤后表达出正常组织中没有的EⅢA+(526bp)片段,其中伤后1h该条带肉眼可辨认,在伤后24h内,随损伤时间延长其条带亮度相应升高.结论EⅢA-FN剪接异型体表达变化可为法医学损伤时间推断较理想指标.
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大鼠 Fn剪接异型体分布及皮肤损伤后表达研究
目的研究成年大鼠、新生幼鼠纤维连接蛋白剪接异型体 EⅢ A、 EⅢ B体内分布及皮肤切创、挫伤后表达情况 , 以期为法医学损伤经历时间研究探索新指标及选择阳性对照 . 方法组织匀浆后抽提总 RNA, 逆转录聚合酶链反应 ( RT- PCR) 技术扩增目标条带 . 结果 (1)正常皮肤 EⅢ A+ 、 EⅢ B+ 不表达 , 伤后 18h EⅢ A+ 位点高丰度表达 , EⅢ B+ 位点变化不明显 , 两种致伤方式表达结果差别不大 ; (2)成年大鼠各器官分布情况依次为脑、心、肝 . 结论 EⅢ A+ 可作为皮肤损伤研究的敏感指标 .
关键词： 皮肤损伤 纤维连接蛋白 EⅢ A 可变剪接 -
纤维连接蛋白Ⅲ CS片段的剪接、表达以及与创伤修复的关系
纤维连接蛋白在创伤愈合中具有重要的作用 , 其基因在三个区域进行可变剪接 , 分别命名为 EⅢ A,EⅢ B和Ⅲ CS. 它们的功能仍有待于研究 . 本文就纤维连接蛋白的可变剪接片段Ⅲ cs的生物学活性及其在法医学中的应用展望做一粗浅的探讨 .
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应用于精准医学研究的转录组可变剪接分析
精准医学是针对患者的基因组（转录组、表观组等）和个体特点进行防治的未来医学模式。随着人类基因组计划的完成，针对复杂疾病的第三次医药卫生革命—“精准医学”拉开了序幕。近15年来，通过对组学数据与各种临床表型相关性的不断深入解析，人类已经对复杂疾病有了相当深入的认识；同时，千美元基因组测序的实现，使得规模化开展精准医学研究成为可能。RNA-Seq是一种研究转录组的强大工具，在精准医学的研究中有重要作用。它使用第二代测序技术，能够快速获得某个物种或组织在特定条件下所表达的全部转录本序列，相当于一种对RNA的存在和数量的快照技术［1］，可用于研究未知基因、剪接异构体等微阵列技术所无法研究的内容。通过将具有足够深度的RNA-Seq数据与整个基因组或转录组进行比对，笔者可以更为精确地从整体水平研究基因功能及基因结构、分析基因的表达水平、鉴定新的转录本、检测融合基因或单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms, SNPs），以及识别可变剪接等［2］。随着第二代测序技术的广泛应用，得到的测序数据正以惊人的速度扩增，现在每次测序已经可以产生150bp或更长的读段（reads），而且每次运行的通量已达到TB级。高通量测序技术的发展为精准医学的研究带来了前所未有的机遇，但数据的爆发式增长也为后续的分析带来了巨大的挑战。现简要介绍从RNA-Seq数据中鉴定可变剪接，以及后续的差异比较等方面的精准医学领域研究进展。
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RNA-Seq在老年神经退行性疾病研究中的应用
阿尔茨海默病及帕金森病是老年人常见的两种神经退行性疾病,但其发病机制及治疗是研究的热点.随着高通量测序技术的进步及成本的下降,RNA-Seq也成为神经退行性疾病机制研究及生物标志物发现的有力手段.RNA-Seq相对于microarray具有高灵敏度、高准确性、高重复性以及噪声低等优势,在阿尔茨海默病及帕金森病研究中有较为广泛的应用,包括检测差异表达基因,可变剪接、新长链非编码RNA预测分析和miRNAs调控等,但是容易受病理复杂性及样本等因素影响.目前阿尔茨海默病及帕金森病转录组研究相比于癌症等还不够深入,在临床诊断及治疗应用还面临较大挑战.但是随着新技术及新方法 的发展,RNA-Seq将进一步推动神经退行性相关疾病的研究和临床转化.
