首页 > 文献资料
-
接尘工人对含矽粉尘的基因易感性研究
目的 探讨人类白细胞抗原A位点、B位点、DRB1位点等位基因与矽肺易感性的关系.方法 应用聚合酶链式反应-序列特异性引物(PCR-SSP)的原理,利用DNA对HLA-Ⅰ类、Ⅱ类抗原的等位基因进行分型检测,分析45名矽肺病人和50名正常人群对照组基因型及分布频率等差异.结果 矽肺组与对照组A、B、DRB1位点相同基因型分布频率的卡方检验,差异均无统计学意义.但矽肺组与对照组A、B、DRB1位点均有独有的某基因型.如矽肺组A位点32型4例(4.4%),36型1例;B位点40型3例(3.3%),55型6例(6.7%),8型、12型、15型、56型各1例(1.1%);DRB1位点3型4例(4.4%).正常对照组A位点69型1例,B位点37型1例,38型5例(5%),71型5例(5%);DRB1位点17型3例(3%).经卡方检验,各工龄组与矽肺期别之间差异无统计学意义.结论 接尘工龄长短与矽肺期别无关(P＞0.05).矽肺组B位点55与对照组相比差异有统计学意义,提示此位点可能参与矽肺的发病.而对照组中,B位点38、B位点71出现频率较高,但无统计学意义.各工龄组与矽肺期别之间差异无统计学意义.
-
广东地区CML患者中HLA-A,B,DRB1的表达与分析
为了调查慢性髓系白血病(CML)患者中HLA-A、B、DRB1基因多态性的表达,探讨HLA与CML之间的可能关联,采用DNA扩增基础上的反向序列特异性寡核苷酸杂交(PCR-RSSO)技术,对广东地区293例CML患者和随机同期采集的406名汉族健康献血者的HLA-A、B、DRB1位点进行基因多态性分型,并对2组间基因频率进行了比对分析.结果显示:CML组HLA-A*24基因频率为15.53%,显著低于对照组22.09%(RR=0.63,P=0.005),HLA-B*13基因频率为10.41%,与对照组6.74%相比则显著增高(RR=1.68,P=0.016),HLA-DRB1*14基因频率为7.51%.与对照组11.89%相比显著降低(RR=0.58,P=0.008).结论:HLA-A*24、HLA-DRB1*14在广东地区CML患者中表达较正常人明显减低,HLA-B*13在广东地区CML惠者中表达较正常人明显升高.I-ILA-A*24、HLA-DRB1*14是否为广东地区CML患者的保护性基因标记及HLA-B*13是否为其易感性基因标记尚需进一步研究明确.
-
HLA-B无效等位基因B*5408N的核苷酸序列分析
本研究探讨HLA新的等位基因HLA-B*5408N的分子基础.采用商用抽提试剂盒抽提样本DNA,利用单链特异性引物PCR方法扩增先证者HLA-B基因的第2-4外显子,对PCR扩增产物直接进行第2、3、4外显子双向测序分析.结果表明:先证者样本测序得到两个等位基因,其中一个等位基因为HLA-B*1527,另一个经blast验证其为新的等位基因,新的等位基因序列已递交GenBank(DQ295998,DQ295999,DQ296000).与接近的HLA-B*5401等位基因序列相比,新的等位基因仅在第3外显子上有1个核苷酸不同,即第553位G→T,这导致第161位氨基酸Glu(GAG)→终止密码(TAG),蛋白质的翻译提前终止.血清学方法未能检出HLA-B54抗原.结论:该等位基因为HLA-B无效表达等位基因,已被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*5408N.
-
寡核苷酸芯片用于HLA-B分型的初步研究
HLA基因具有复杂的多态性.本研究根据HLA-B基因序列的多态性,设计了一套寡核苷酸探针,并用基因芯片点样仪点样到醛基修饰的载玻片上,制成寡核苷酸芯片用于HLA-B基因的分型.本研究以克隆并已测序的HLA-B基因序列作为标准样品,经PCR分别扩增其具有多态性的第二和第三外显子,PCR扩增产物与芯片进行杂交,利用分析软件将杂交模式转变成为HLA-B基因型.结果表明,利用芯片进行分型的结果与标准样品序列结果完全符合.结论:寡核苷酸芯片用于HLA-B基因分型是一种简便、快捷和有前景的方法.
-
中国人HLA-A和B位点血清学分型错误的分析
对27例HLA-A和-B位点血清学分型错误进行分析.结果表明,HLA-A和-B位点的误检型错误均高于漏检型错误(P＜0.05),A和B位点分型间则无显著差别.中国人分型错误频率高的有A1(66.7%),A3(50.0%),A11(13.5%),A9(11.8%)和A19(7.1%)及B16(50.0%),B48(43.9%),B15(16.7%),B40(11.1%),B13(10.0%)和B17(9.1%)等抗原.结论:血清学分型方法应与基因分型技术互为补充.
-
新的HLA-B*4061等位基因的核苷酸序列分析
本研究探讨HLA 新的等位基因HLA-B*4061的分子基础.采用盐析法抽提样本DNA,利用PCR方法扩增先证者HLA-B基因的第1-8外显子,PCR产物直接经TOPO克隆到质粒载体中得到单链,对所得克隆进行HLA-B基因第2、3、4外显子双向测序分析.应用PCR-SSP方法证实测序所发现的突变.结果表明:先证者样本克隆测序得到2个等位基因,其中1个等位基因为B*4601,另1个经blast验证其为新的等位基因,新的等位基因序列已递交GenBank(DQ089628,DQ089629,DQ089630).与接近的B*400101等位基因序列相比,新的等位基因仅在第2外显子上有1个核苷酸不同,即第272位C→A,导致第67位氨基酸Ser→Tyr.结论:HLA-B*4061等位基因为新的HLA-B等位基因,已荣获世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名.
关键词： HLA-B HLA-B*4061 等位基因 序列分析 -
中国鲁南地区汉族人群HLA-A,B,DRB1高分辨等位基因多态性分析
本研究旨在分析中国鲁南地区汉族人群HLA-A、B、DRB1等位基因的高分辨多态性分布特征.采用PCR-SBT对中国鲁南地区688名无血缘关系的汉族健康人群进行HLA-A、B、DRB1位点高分辨基因分型,并对分型结果做统计学分析.结果表明:688例样本A、B、DRB1座位分别检出31、63、39个等位基因,其中频率大于0.05的常见等位基因为A *24∶02、A*30∶01、A*11∶01、A*02∶01、A*33∶03、A*02∶06、B*13∶02、B*44∶03、B*51∶01、B*46∶01、B*15∶01、B*58∶01、DRB1*07∶01、DRB2*15∶01、DRB1 *09∶01和DRB1*08∶03.上述A、B、DRB1位点常见等位基因累计基因频率分别为0.7223、0.4432、0.5453.常见的A*-B*-DRB1*单倍型是A*30∶01-B*13∶02-DRB1*07∶01 (0.1151),常见的两位点连锁单倍型分别是A*30∶01-B* 13∶02(0.1303)、A*30∶01-DRB1*07∶01(0.1157)和B*13∶02-DRB1 *07∶01(0.1307).结论:获得了中国鲁南汉族人群HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因和单倍型分布特征,为评估该地区患者找到HLA匹配供者的机率,为合理选择移植供者及移植免疫、HLA与疾病相关性研究提供了参考数据.
-
结节病患者HLA-A、HLA-B、HLA-DRB1等位基因多态性
结节病是多系统受累的非干酪性类上皮细胞肉芽肿性疾病.病因尚不清楚,目前认为,结节病主要是遗传易感人群暴露于原因未明的可传播因素,引起过度的细胞免疫反应导致肉芽肿所致~[1].人类白细胞抗原(HLA)具有多态性,是人体免疫功能的细胞分子学基础.在不同的种族研究中发现,结节病与HLA基因有一定的相关性~[2].本研究对华东地区汉族结节病患者进行HLA-A、HLA-B、HLA-DRB1基因分型,探讨HLA基因多态性与汉族结节病的相关性.
-
冀南地区HLA-B等位基因多态性与慢性丙型肝炎的相关性
目的 从基因水平了解冀南地区慢性丙型肝炎与HLA-B位点等位基因频率的相关性,初步探索慢性丙型肝炎的保护性基因和易感性基因,为慢性丙型肝炎治疗策略的制定、预后的评估及疫苗的研制提供科学依据. 方法 应用PCR-序列特异性引物技术(PCR-sequence primers,PCR-SSP)进行HLA-B等位基因分型测定,采用病例对照研究,比较冀南地区慢性丙型肝炎患者219例与健康对照者212例之间HLA-B等位基因频率分布的差异,进一步采用卡方检验分析HLA-B等位基因频率在HCV感染后自发清除组和持续感染组之间是否有差异,从而获得丙型肝炎病毒感染与HLA-B基因多态性的关联性. 结果 冀南地区丙型肝炎患者的HLA-B*15/35/55等位基因频率明显高于健康对照组(P＜0.05);丙型肝炎患者的HLA-B*40/58等位基因频率明显低于健康对照组(P＜0.05),其他各等位基因在两组间的表达频率差异均无统计学意义;HCV感染后自发清除组患者的HLA-B*15/40等位基因频率明显高于HCV持续感染组患者(P＜0.05),HCV感染后自发清除组患者的HLA-B*55等位基因频率明显低于HCV持续感染组患者(P＜0.05);其他各等位基因在两组间的表达频率差异均无统计学意义. 结论 HLA-B*15/35/55等位基因可能为HCV感染的易感基因,HLA-B *40/58等位基因可能为HCV感染的保护性基因;携带HLA-B15/40等位基因的人群感染HCV后容易发生自发清除,而携带HLA-B*55等位基因的人群可能更易转为慢性丙型肝炎.
关键词： 丙型肝炎病毒(HCV) HLA-B 慢性丙型肝炎 自然转归 -
苯妥英的遗传药理学进展
目前研究认为基因多态性是抗癫(癎)药物苯妥英个体差异的重要原因,基因多态性导致癫(癎)患者个体出现不同的苯妥英药理、毒理作用.随着遗传药理学的不断深入研究,研究者对苯妥英用药有了新的认识.本文介绍了苯妥英的遗传药理学研究进展.
-
用PCR-SSP作HLA-B位点分型及B22亚型分析
目的:用DNA分型弥补血清学HLA-B位点分型的欠缺并了解南方汉族B22亚型分布情况. 方法:采用标准细胞作参照,建立B位点的PCR-SSP分型方法;并对血清学B22阳性标本进行B22亚型分析.结果:104株标准细胞PCR-SSP分型结果与已知结果完全一致,17例白血病人及同胞分型与血清学一致,1例不符;B22亚型以B*5401多,B*5601较少,1例分型格局异常,可能为新B22等位基因或错配的DNA双链.结论:PCR-SSP可用于B位点的DNA分型,比血清学更直观精确,操作简便,不受疾病状态影响.
-
原发性肾病综合征与HLA-A、HLA-B、HLA-DRB1基因相关性的研究
目的 探讨HLA-A、HLA-B、HLA-DRB1位点基因与山西汉族激素抵抗肾病综合征(SRNS)的相关性.方法 用聚合酶链反应序列特异性引物法,对30例SRNS患者(成人22例,儿童8例)和45例正常对照者进行了HLA-A、HLA-B、HLA-DRB1等位基因分型,并分析了A、B、DRB1基因在各组的分布.结果 SRNS患者组HLA-B*15、B*44基因频率较正常对照组增高(P＜0.05);成人SRNS患者组HLA-DRB1*07、B*44基因频率较正常对照组增高(P＜0.05),成人SRNS患者组HLA-DRB1*15基因频率较正常对照组降低(P＜0.05);儿童SRNS患者组HLA-DRB1*10基因频率较正常对照组增高(P＜0.05).结论 SRNS发病可能与HLA-B*15、B*44基因有关,成人SRNS发病可能与HLA-DRB1*07、B*44基因有关,HLA-DRB1*15对成人SRNS发病可能有保护作用,儿童SRNS发病可能与HLA-DRB1*10基因有关;HLA与SRNS的相关性不仅与人种、国家和地区有关,还可能与发病年龄有关.
-
汉滩病毒感染血管内皮细胞后上调HLA I类分子的表达
目的:观察汉滩病毒感染血管内皮细胞(EVC304)前后,HLA-I类分子中HLA-A、HLA-B、HLA-Cw3、HLA-Cw5表达上的差异.方法:以汉滩病毒76-118株感染EVC304细胞作为实验组,以无任何刺激的EVC304细胞作为阴性对照组.6h后用RT-PCR的方法对HLA-A、HLA-B、HLA-Cw3、HLA-Cw5的mRNA进行反转录和基因片段的扩增,在mRNA水平上检测其表达差异.结果:在HTNV感染以后,EVC304细胞中HLA-A、HLA-B、HLA-Cw3、HLA-Cw5 mRNA表达均呈升高现象,其中HLA-A、HLA-B和HLA-Cw5的mRNA表达与未感染细胞相比明显升高.结论:HTNV感染血管内皮细胞后,可以诱导HLA-A、HLA-B、HLA-Cw3、HLA-Cw5的表达升高,从而诱发机体特异性免疫应答,导致免疫损伤的发生.这或许是肾综合症出血热的发病机制之一.
-
K562细胞转染HLA-B分子对NK细胞杀伤功能的影响
为了研究不同HLA-B分子对NK细胞杀伤活性的影响,我们分别构建pcDNA3-HLA-B*39052、B*2704、B*51022基因真核表达载体;借助脂质体将各质粒转染入K562细胞,经G418筛选,分别获得阳性表达细胞株;并应用LDH法检测转染细胞对不同个体外周血NK细胞杀伤活性的抑制效应.结果显示:与转染了空质粒的对照组相比,外周血NK细胞对K562-B39的杀伤率无明显影响,而对K562-B27,K562-B51的杀伤率降低.当使用针对NK细胞受体KIR3DL1的单抗DX9封闭NK细胞后,此抑制效应大部分消失.提示靶细胞表达HLA-Bw4分子可明显抑制NK细胞的杀伤效应,而表达HLA-Bw6分子对NK细胞杀伤功能无明显影响.
-
HLA-B血清学纯合型标本的PCR-SSP基因分型
目的探讨血清学和PCR-SSP 2种方法在HLA-B位点分型的应用价值.方法对血清学分型HLA-B位点纯合型标本,用PCR-SSP方法进行基因分型.结果血清学分型为纯合型的75例标本中,PCR-SSP方法基因分型有12例为杂合型.结论HLA-B的PCR-SSP基因分型结果准确、可靠,而血清学分型方法成本低,快速简便.
-
贵州地区麻风与人白细胞抗原A及人白细胞抗原B等位基因的小样本关联性研究
目的:研究分析人白细胞抗原(HLA)-Ⅰ类基因HLA-A、HLA-B等位基因与贵州地区麻风相关性.方法:采用序列特异性引物聚合酶链反应法(PCR-SSP)对43例麻风患者及23例健康对照组进行HLA-A、HLA-B等位基因的检测、分型,采用x2检验比较分析两组之间等位基因频率的差异.结果:麻风组HLA-A*02等位基因频率低于健康对照组,差异有统计学意义(P＜0.05);瘤型麻风组HLA-A*02等位基因频率低于健康对照组,差异有统计学意义(P＜0.05);瘤型麻风组HLA-B*46等位基因频率低于健康对照组,差异有统计学意义(P＜0.05).结论:HLA-B*46可能是瘤型麻风的保护基因;HLA-A*02可能是麻风的保护基因.
-
HLA-B新等位基因B*51:02:03的确认和分析
人类白细胞抗原系统(HLA)在造血干细胞和器官移植中具有重要意义,供受者HLA相合程度与移植后移植物抗宿主病(GVHD)的发生率以及移植物的存活率等密切相关[1-2],目前已有多个国家建立造血干细胞捐献者资料库,作为临床患者造血干细胞移植的供者来源.笔者近期在常规的造血干细胞捐献者标本分型中,采用Luminex PCR-SSO分型方法发现1例HLA-B疑难分型标本,进而测序分析发现其为新的等位基因,被世界卫生组织HLA命名委员会正式命名为HLA-B*51:02:03,现将结果报道如下.
-
HLA新等位基因HLA-B*35∶155的确认
目的 发现和认定一个人类白细胞抗原(HLA)新等位基因.方法 应用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction-sequence based typing,PCR-SBT)进行HLA常规分型,HLA-B位点分型结果与等位基因B*35∶03∶01,51∶01∶01在112位有一个碱基不匹配,不能指定为任何HLA-B位点等位基因,用针对于B* 35、B*51的序列特异性SSSP引物测序,确认与同源性高的HLA等位基因序列的差异.结果 测序结果表明该等位基因与其同源性高的等位基因B*35∶03∶01的差异是在第2外显子112位的C＞T,其突变导致密码子CGG＞TGG,结果造成B*35∶03∶01氨基酸序列中14位的精氨酸(R)变为色氨酸(W).结论 该等位基因为HLA-B位点的一个新等位基因,世界卫生组织(WHO)HLA命名委员会将其正式命名为HLA-B* 35∶155.
-
大疱性类天疱疮与HLA-A、B等位基因的相关性
目的:确定山东汉族大疱性类天疱疮(BP)与HLA-A、B等位基因的相关性.方法:运用聚合酶链反应-序列特异性引物寡核苷酸探针杂交(PCR-SSOP)方法,对山东地区43例汉族BP患者和125例健康对照进行了HLA-A、B等位基因分型.结果:BP患者组HLA-A*24频率高于对照组(P=0.033,Pc＞0.05);HLA-A*33、B*44在患者组中频率低于正常对照组(P值分别为0.040和0.024,但Pc值均＞0.05).结论:大疱性类天疱疮的遗传易感基因可能与HLA-A、B等位基因无相关性.
-
河北汉族终末期肾功能衰竭患者HLA-A、B位点基因多态性分析
目的:研究河北汉族终末期肾功能衰竭患者HLA-A、B位点基因多态性,寻找HLA-A、B位点与终末期肾功能衰竭相关基因.方法:采用聚合酶链反应序列特异性引物(PCR-SSP)分型方法对河北汉族490例终末期肾功能衰竭患者进行HLA-A、B位点基因分型,计算基因频率,利用Haldane相对危险度修正公式计算该基因与终末期肾功能衰竭发生的相对危险度,相对危险度与1的显著性检测利用Fisher精确P值法计算,为避免偶然性造成的显著性差异,乘以该位点所比较的抗原总数对P进行修正.结果:490例终末期肾功能衰竭患者中共检出HLA-A位点抗原15个,检出频率高的等位基因为A* 02(0.341155),其次是A* 24(0.212161)、A*11(0.203201)、A*30(0.077001)、A*03(0.053136)、A* 01(0.050996);HLA-B位点抗原35个,基因频率高的为B*13(0.146657),其次是B*4002G(0.080303)、B* 1501G(0.077001)、B* 51(0.068252)、B* 4001G(0.066078)、B*35(0.062825),以上12个基因为HLA-A、B位点常见等位基因(基因频率GF＞0.05).患者组A*11、A* 24、B*13的RR与1的显著性检测结果差异有统计学意义,且其RR均＞1,证明这3个基因与终末期肾功能衰竭的发生显著关联.结论:推测A*11、A* 24、B* 13是河北汉族终末期肾功能衰竭的易感基因.
