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子宫内膜异位症无创性诊断的研究进展
目前对子宫内膜异位症(EMT)诊断的金标准仍是腹腔镜下直视、活检证实,尚缺乏敏感性及特异性较高的无创诊断手段.本文对近年有关EMT无创性诊断方法包括血清中的标志物、宫颈分泌物、影像学等方面的研究新进展加以综述,以期指导临床.
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中医药治疗2型糖尿病的现代生物学
2型糖尿病是全世界的健康难题,西医西药在治疗糖尿病中存在局限性,中医治疗糖尿病历史悠久,其整体观念和辨证论治更符合系统生物学对糖尿病的认识,在糖尿病的治疗中具有重要的价值.但是由于文化背景不同和科学技术的限制,中医药治疗糖尿病的疗效和机制还未被国际广泛认可.中医病机与疾病的病理生理机制能够用现代生物学理论有机的联系起来,用中西医结合观认识糖尿病,用现代生物学理论去解释病因病机、法理方药,用组学、质谱技术、基因测序技术等破解对中医药糖尿病治疗中的科学疑问,把中医的精华展现出来,为中医药治疗糖尿病的研究提供理论依据.
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从新时代患者视角思考中医药研究
中医药的传承发展在国家中医药现代化号角下已然蓬勃发展几十年,多元发展与争论并存,然而研究者却鲜有从新时代患者角度去思考新形势下的中医药事业.文章从患者需求出发讨论中医药的优势与劣势,并提出以具整体观的组学技术桥接中西医诊疗研究,以统计方法整合量化多平台数据的思路.希望在完整保有中医诊疗体系的基础上,合理量化中医诊疗结果、桥接现代研究诊断指标,以更好服务患者;同时也为中医快速准确诊断、中药研究机制可视化、疗效与疾病转归可预测提供参考和新思路.
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道地药材品质形成机制的组学研究思路
道地药材一直是中药材的“品质标杆”,地位不可撼动.道地药材的品质形成从分子层面的基因遗传到终产物的代谢表型都有涉及,其次生代谢产物的生物合成途径至今并未完全阐明.近年来,不断丰富的组学技术在揭秘复杂生物系统如何运作上功不可没,也同样适用于道地药材复杂的品质形成机制探索.为了缓解道地资源日益匮乏的现状,科学地指导优质品种的移栽,该文综述了组学在解读道地药材从基因到表型的变化过程、次生代谢产物的生物合成途径、与人体的相互作用和品质评价的新方法这些方面的研究成果,为更好地保护和利用中医药资源提供思路.
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用系统方法探讨中医证的本质
在反思过去研究中受朴素还原论错误影响的基础上试用系统方法 探讨中医证的本质.中医的证可以理解为整体作为一个系统对病因作出反应所处的一种状态,这种整体反应状态从系统科学角度看是一种整体涌现现象.
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从系统生物学角度研究肾虚证概况
系统生物学主要研究生物体的组成成分及其在特定条件下相互之间的关系,它以生物系统各组学研究的发展为基础.根据系统生物学的特点及方法对中医肾虚证研究取得的成果进行论述,并对肾虚证研究发展的前景予以展望.
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运用组学手段探索EBV相关性与非相关性胃癌的可能差异分子
目的 运用组学手段探索 EBV相关性胃癌( EBVaGC)与EBV非相关性胃癌( EBVnGC)间的分子差异,为EBVaGC治疗选择提供依据.方法 显色原位杂交检测胃癌患者手术标本和移植瘤组织EBV RNA状态.靶向捕获测序和蛋白质谱分析EBV阳性和阴性胃癌组织中差异分子,免疫组织化学验证组织中PD-L1的表达.结果 与EBVnGC相比,EBVaGC中存在PIK3CA高突变率和TP53低突变率. EBVaGC中转录后调控分子表达上调,而代谢和氧化磷酸化分子下调. PD-L1在EBV阳性移植瘤中表达显著升高(76.92% vs 25.00%;P＜0.05).结论 EBV相关性与非相关性胃癌在基因变异和蛋白表达上存在很大差别.
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组学方法在昆虫杀虫剂抗性机制研究中的应用
长期以来杀虫剂在卫生和农业害虫防治领域的广泛使用,使昆虫杀虫剂抗性的产生成为进化的一种必然结果,昆虫杀虫剂抗性的防控和新型杀虫剂的研究均有赖于对杀虫剂抗性机制的研究.近年来,随着基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学的发展和应用,昆虫对杀虫剂抗性机制的研究已经取得较多新进展.该文对组学方法在昆虫杀虫剂抗性机制研究中的应用作一综述,并对组学研究在昆虫杀虫剂抗性研究中的意义和应用前景进行总结与展望.
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组学在宫颈癌中的研究进展
宫颈癌以其高发病率和高死亡率严重威胁着全球女性的生命健康.然而,宫颈癌的筛查、诊断、治疗和预后判断等方面仍然存在诸多问题.高通量组学技术的迅猛发展为解决上述问题提供了新的可能.本文将从基因组、转录组、表观遗传组、蛋白组和代谢组等方面对组学技术在宫颈癌中的新研究结果做一综述.
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精准医学时代的乳腺癌研究
精准医学是指根据个体的分子变异指导疾病的预防和治疗。肿瘤的精准医学研究需要整合临床信息和多组学技术，鉴定与肿瘤生物学行为和治疗应答密切相关的分子标志物，并在设计合理的临床试验中验证，指导肿瘤的精准分型和精准治疗。乳腺癌是一种高度异质性的肿瘤，分子分型指导的治疗已经取得初步成效。肿瘤的耐药和肿瘤异质性仍是乳腺癌基础和临床研究面临的巨大挑战。精准医学时代的乳腺癌研究方向和研究进展值得关注。
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基于组学数据库整合工具的代谢通路分析应用
组学技术方法和工具研究系统生物学的发展产生海量的基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等组学数据. 基于多平台组学数据整合的代谢通路分析为全面深刻了解生物医学系统提供了前提条件. 本文综述了近年来基于组学数据库和整合工具的代谢通路分析方面的研究进展,包括新的数据整合方法和数据库分析平台.
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红豆杉药物资源的生物学和化学研究进展及趋势分析
红豆杉是抗癌药紫杉醇及其半合成前体的重要来源,近几十年受到了广泛关注.我国拥有多种特有的红豆杉物种,研究者已经对其进行了多学科综合研究.本文结合作者近年研究,综述了多种红豆杉药物资源的,生物学和化学研究技术、现状及具体面临的问题,运用信息计量方法考察红豆杉相关SCI文献的词频分布,为红豆杉研究趋势的分析预测提供定量依据.本文结合近年系统生物学和组学技术的研究进展,指出应尽快深入研究各种红豆杉及其内生真菌的基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和生物信息学,全面推动红豆杉药物资源的可持续开发利用.
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系统生物学的研究现状及应用
系统生物学是一门将生物作为一个系统来进行研究的科学,其整合了多个学科知识,通过对生物进行全方面的定量数据收集后,模拟和预测生物系统,以期能更好的认识、理解甚至调控、设计生命过程.目前的系统生物学还处于萌芽阶段,其研究和应用局限于对生物某个方面的系统分析,对生命总体研究尚不能实现.但应看到许多大型的计划正在实施当中,大量人力物力的投入,新技术的不断涌现,不少理论成果已应用到实际阶段.系统生物学必将有长足的发展并终造福人类.
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基于文献挖掘视角的组学研究脉络梳理
目的:梳理组学研究脉络,分析组学研究热点趋势,帮助科研工作者把握研究方向,为科研管理部门在组学研究方面的资助提供决策支持.方法:利用E-utilities下载1986-2016年PubMed数据库收录的含有"-Omics/Omic/Omes/Ome"的题录信息27040819条,在题录信息的题目和摘要中对以"-Omics/Omic/Omes/Ome"结尾的词进行标注、筛选,并利用词频分析法、共现分析法、社会网络分析法对筛选结果进行分析.结果:获得组学相关记录共346977条,文献发表量逐年递增,自2000年后呈井喷式增长.各类单一组学的文献发表量均呈逐年递增的趋势,其中基因组学文献发表量多.2014年之后,转录组学的文献发表量赶超了蛋白质组学,成为继基因组学之后的第二大组学类型.转录组学、线粒体基因组学与基因组学共现的文献量在某一时间节点后呈井喷式增长,其余组学类型与基因组学共现的文献量都稳定增长.结论:后基因组时代把组学研究推向了高潮,无论是数量还是种类都出现了井喷式的增长.多类型组学的融合研究越来越受科研人员的关注.
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中药组分配伍理论与IGD 13C-NMR偶联指纹图谱
中药组分配伍理论经过近20年的研究,己越来越完善,越来越成熟.组学、配伍、指纹是中药组分配伍理论的3个关键词,即中药组分配伍理论将现代“组学”理念与传统“配伍”理念通过“指纹”图谱紧密地结合起来.中药现代化已经发展到了在中药组分配伍理论指导下,采用指纹图谱特别是反门控去偶(inverse gated decoupling,IGD) 13C-NMR偶联指纹图谱方法,研究现代中药的阶段.
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高维组学变量筛选方法的稳定性评价方法及应用
目的 在高维组学变量筛选过程中,当数据发生轻微变化时,变量筛选方法筛选出的变量会发生一定的变化.本文探索如何评价筛选变量的结果是否稳定.方法 通过模拟实验,分析对比了HD、SCSR、TD、KI、CW、RCW六种稳定性评价方法的准确性及变异程度,并通过实例结合PLS、svmRFE和RF三种变量筛选方法对SCSR方法进行了考察.结果 当变量排序为随机产生时,SCSR、KI和RCW三种方法基本能够在取各种变量数目情况下始终接近于小值0.对于置换标签和变量值后的数据集,PLS、RF、svmRFE三种方法的稳定性几乎完全相同,SCSR、KI和RCW三种稳定性评价指标在取不同筛选阈值时都达到了小期望值.在评价指标的稳定性上,HD和SCSR能够保持很小的变异,具有更好的稳健性.结论 SCSR的准确性和稳定性好,推荐作为稳定性评价指标.
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肾阴虚证本质的现代医学研究进展
肾阴虚证作为中医学的基本证型之一,得到了大家的广泛关注.该文从神经内分泌、免疫调节以及组学应用的角度,总结整理关于肾阴虚的新研究进展.
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糖尿病肾病临床分子标志物研究进展
糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)是导致终末期肾脏疾病的主要原因,占透析人群的25％～45％.30％～40％的1型糖尿病及30％的2型糖尿病患者终会发展成为DN.蛋白尿和估算肾小球滤过率(estimated glomerular filtration rate,eGFR)是目前临床中常用的DN诊断和预后判断标志物,但其缺乏足够的敏感性和特异性.近年来,有研究在不断地寻找新型DN早期诊断和预后判断的分子标志物.新的研究方法,如基于多组学图谱的生物标志物研究,通过利用不同阶段DN患者生物样本,寻找和验证新的分子标志物,这不仅可以进一步阐明DN分子机制,并且有助于构建DN分子诊断体系,提高DN诊治水平,改善患者预后.而一些新发现的DN分子标志物,仍需要利用大样本的前瞻性研究,证实其临床转化应用价值.文章就近年来DN分子标志物研究进展以及相关研究策略进行总结.
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肠道菌群对高血压的作用
肠道微生物对机体的健康起重要作用,肠道菌群失调不仅引起胃肠道疾病,还对包括高血压在内的心血管疾病等造成影响.研究表明,用益生菌或其发酵产品干预后,可以调节肠道微生态,高血压状态也得以改善.关于益生菌降压的机制,有产生肽类等降压物质,改善血管氧化和炎症水平,短链脂肪酸的作用,肠道菌群与神经系统相互作用等.深入研究肠道菌群与高血压的关系,为高血压的营养治疗提供了一种新途径.
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从系统生物学角度研究脾气虚证概况
系统生物学是在基因组学、蛋白质组学等新型科学发展基础上孕育而成的,它的灵魂在于“整合”,这与中医的“整体观念”异曲同工.人类个体的基因等存在差异性,对其研究亦同于中医的“辨证论治”.该文将根据系统生物学的特点及研究方法,对中医脾气虚证研究取得的成果进行论述和展望.
