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丹皮酚对甲状腺未分化癌 FRO细胞相关 lncRNA表达的影响
目的：探讨中药丹皮酚对人甲状腺未分化癌FRO细胞相关lncRNA表达的影响。方法：选取不同浓度的丹皮酚作用于人甲状腺未分化癌FRO 细胞，采用MTT法检测细胞的存活率，对细胞形态学的改变采用倒置相差显微镜观察，qRT－PCR检测不同浓度的中药丹皮酚作用于FRO细胞后H19、HOT、PCA三种癌症相关lncRNA的表达水平。结果：不同浓度的丹皮酚能够在不同程度上抑制甲状腺未分化癌FRO细胞的生长，经过药物处理后48h，检测发现FRO细胞中H19、HOTAIR、PCA3的表达显著增高，且随浓度增加而逐渐升高。结论：丹皮酚可以抑制甲状腺未分化癌细胞的生长，不同浓度的丹皮酚对甲状腺未分化癌细胞中的lncRNA表达有影响，说明中药提取物丹皮酚可能通过lncRNA对肿瘤的发生发展产生影响，相关机制需要进一步研究。
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lncRNA的作用机制及其在自身免疫性疾病中的研究进展
lncRNA(long non-coding RNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA,其能与DNA、RNA和蛋白质相互作用发挥多种生物学功能,包括参与表观遗传调控、细胞周期调控、细胞分化调控和免疫应答等.越来越多的研究表明,lncRNA的表达失调与自身免疫性疾病的发生息息相关.lncRNA作用机制复杂多变、特异性强的特点为其深入研究带来了很多阻碍,目前绝大部分lncRNA的功能和机制仍不明确.已有的研究表明lncRNA的亚细胞定位不同往往涉及不同的作用机制,了解其亚细胞定位与作用机制之间的关联,将推动LncRNA在多种疾病包括自身免疫性疾病中的深入研究.
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胚胎干细胞向心肌细胞分化过程中的表观遗传调控
干细胞向心肌细胞分化是一个复杂、动态的过程.在这个过程中,相关基因的激活和关闭都受到严格的调控,并随着分化的不同阶段呈现规则有序的表达规律.表观遗传在调节基因激活和关闭过程中起着非常重要的作用,其中DNA的甲基化、组蛋白的表观遗传修饰、长链非编码RNA以及microRNA是胚胎干细胞向心肌细胞分化过程中表观遗传调控的关键作用方式.因此,对心肌细胞分化过程中表观遗传调控的探索将有助于了解心脏发育的生理过程以及相关心脏疾病的发病机制.
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肿瘤高扩增区域上的lncRNA-PVT1研究进展
随着科技的快速发展,全基因组测序技术已经证实了许多非编码RNA可以参与肿瘤的发生发展.然而,相较于短链非编码RNA的大量研究,长链非编码RNA的功能仍存在更大的未知性.PVT1,一个长链非编码RNA,由人类PVT1基因编码,位于染色体8q24这个与肿瘤相关的“基因沙漠区”.该lncRNA在肿瘤中已被证实存在3种作用机制,即参与DNA的重排,编码microRNA以及与MYC互作调控其稳定性.双微体是基因的主要扩增形式之一,可承载多种致癌基因以及耐药基因,PVT1位于多种细胞系的双微体上.针对PVT1与肿瘤的研究表明,PVT1在多种肿瘤中都是潜在的致癌基因.然而,其在肿瘤中的分子机制尚未明确.
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基于lncRNA-mRNA网络识别高血压相关的lncRNA及其功能
目的 高血压是常见的慢性病,也是心脑血管病主要的危险因素,很多长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)在心血管系统中具有重要作用.然而在高血压中lncRNA的研究却很缺乏.本课题的目的是识别高血压疾病相关的lncRNA并研究其在高血压中的功能,进而为高血压机制研究提供更多信息.方法 通过ceRNA理论构建全局lncRNA-mRNA网络.首先从GEO数据库中下载高血压疾病表达谱进行重注释,进而识别高血压相关差异表达基因和lncRNA,将其映射到全局lncRNA-mRNA网络上获得高血压特异的lncRNA-基因网络.对该网络拓扑性质进行分析得到高血压相关的lncRNA.对于高血压相关lncRNA,将其在高血压相关网络中所连接的基因用DAVID工具进行通路富集分析,预测高血压相关lncRNA的功能.结果 构建了高血压特异的lncRNA-基因网络(58个lncRNA、431个基因及4737条边).通过对其拓扑性质分析识别了在高血压中发挥非常重要作用的lncRNA:MALAT1,研究发现MALAT1可能通过TNF信号通路、MAPK信号通路来发挥其调控功能.结论 lncRNA MALAT1在高血压疾病中扮演重要作用,其可能通过TNF信号通路、MAPK信号通路来发挥其调控功能.
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LncRNA D5在卵巢癌组织中的表达及其功能研究
目的:探讨LncRNA D5在卵巢癌组织中的表达及其对卵巢癌细胞糖代谢的影响和与卵巢癌患者预后的关系.方法:采用实时定量聚合酶链反应法(qRT-PCR)测定62例卵巢癌患者组织LncRNA D5表达,Kaplan-Meier生存分析其表达与患者预后的关系,设计合成LncRNA D5/pEX-2真核过表达质粒,分别在卵巢癌细胞SKOV3、A2780中进行转染,实验分为空白对照组及转染组,48h后测定卵巢癌细胞SKOV3、A2780的葡萄糖摄取能力、糖酵解速率、氧耗以及乳酸排除率.结果:LncRNA D5在良性卵巢肿瘤或正常卵巢组织中表达比较均一,其在卵巢癌中的表达与良性卵巢肿瘤或正常卵巢组织相比,具有显著差异(P＜0.05).LncRNA D5表达下调的卵巢癌患者总生存期和无瘤生存期均较LncRNA D5表达上调的卵巢癌患者明显缩短(P＜0.05).通过转染上调A2780、SKOV3中的LncRNA D5,细胞的葡萄糖摄取能力、糖酵解速率以及乳酸排出显著上调,而细胞的氧消耗明显下降(P＜0.05).结论:LncRNA D5在卵巢癌中表达异常,与卵巢癌患者的预后不良相关,LncRNA D5对卵巢癌细胞的糖酵解能力具有一定的调控作用.
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长链非编码RNA CASC2抑制肿瘤发生发展的研究概况
长链非编码RNA(lncRNA)包括大部分人类DNA的非编码信息,占整个基因组的90%以上.lncRNA由超过200个核苷酸组成,通常缺乏开放阅读框并参与肿瘤的病理生理过程.lncRNA能调控各种肿瘤基因表达、印记、转录和翻译后修饰等.2004年在子宫内膜癌(EC)中首次发现lncRNA癌易感性候选基因2(Cancer susceptibility candidate 2,CASC2)可能是潜在的抑癌基因.而后发现CASC2在诸如宫颈癌、大肠癌、胃癌、肝癌、非小细胞肺癌、肾细胞癌、膀胱癌、神经胶质瘤和甲状腺癌等中都表达下调,而CASC2过表达时能抑制肿瘤细胞增殖,这说明CASC2有抑癌作用.在肾上腺癌等其他肿瘤中CASC2的转录水平不变,表明CASC2的抑癌作用具有组织特异性.本文对CASC2在肿瘤中的抑癌作用及相关机制做一综述.
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LncRNA与胃肠道肿瘤化疗耐药的研究进展
胃肠道肿瘤化疗耐药使得许多患者治疗失败,而其机制不清.随着长链非编码RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)被发现可在转录、转录后及表观遗传学等多个方面调控机体的病理生理过程,许多研究发现LncRNA与胃肠道肿瘤耐药也密切相关.LncRNA不仅与肿瘤的十大特征有着密切联系,并且可通过影响药物转运体,以竞争内源性RNA的作用方式,影响肿瘤细胞凋亡和调节上皮间质转化等过程调控胃肠道肿瘤耐药.本文就近年来发现的与胃肠道肿瘤耐药相关的LncRNA及其参与胃肠道耐药的机制作一综述.
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LncRNA 在结直肠癌中的研究进展
随着基因研究的进步，现已发现长链非编码RNA（ Long non－coding RNA，LncRNA）在很多肿瘤的发生发展中起到关键的调节作用，其自身的各个片段能具有各不相同的调节效果；某些LncRNA甚至能在多种肿瘤中起到不同的调控作用。那么诸多新近发现的LncRNA在结直肠癌的表达情况如何？本文就LncRNA在结直肠癌中的研究进展做一综述。
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长链非编码RNA MEG3在人胶质瘤细胞中的表达及作用研究
目的 探究LncRNA MEG3对人胶质瘤细胞活力和凋亡的影响及其作用机制.方法 RT-qPCR检测人胶质瘤细胞系(U87)和正常星形胶质细胞系(NHAs)中MEG3、microRNA-21(miR-21)的表达;U87细胞单独转染MEG3质粒或同时转染MEG3质粒与miR-21 mimic后采用CCK-8检测细胞活力、TUNEL检测细胞凋亡、Western blot检测细胞内Bcl-2/Bax和Cleaved caspase-3表达.结果 与NHAs细胞相比,U87细胞中的MEG3表达明显下降,且miR-21表达明显上升.过表达MEG3明显降低U87的miR-21表达,抑制U87的活力,降低Bcl-2/Bax的水平,提高Cleaved caspase-3的含量,促进凋亡;共过表达MEG3和miR-21可明显增加U87的活力,提高Bcl-2/Bax的水平,降低Cleaved caspase-3的含量,抑制凋亡.结论 过表达MEG3通过抑制miR-21降低胶质瘤细胞的活力并促进其凋亡.
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基于基因功能相似性预测小分子药物与lncRNA的相关关系
目的 开发靶向表达失调的非编码RNA的小分子药物,以提供一种全新的癌症治疗策略.方法 通过整合小分子与lncRNA的靶基因数据,基于基因功能相似性,构建小分子与lncRNA关联关系模型,预测小分子潜在相关的lncRNAs,对显著相关的小分子-lncRNA关联网络进行拓扑性和功能性分析,依据数据库和文本挖掘评价预测的小分子-lncRNA关系.结果 得到280个小分子与79个lncRNA之间805对显著相关关系;网络中小分子节点呈现幂律分布;同一小分子靶向的lncRNA对共享疾病(5.0995×10-6),同一lncRNA关联的小分子对共享疾病(3.1577×10-28)和副作用(2.1668×10-67),并具有相似的化学结构(2.053×10-62);在慢性骨髓白血病、恶性胃肠道间质瘤中,MEG3、H19、HOTAIR与伊马替尼存在潜在关联;FENDRR与Glisoxepide在糖尿病肾病治疗中存在潜在关联.结论 基于基因功能相关性为预测小分子相关lncRNAs提供了一条新途径,促进了癌症靶向治疗的发展.
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长链非编码RNA LINC00308在前列腺癌中的表达及意义
目的 本研究通过分析前列腺癌(prostate cancer,Pca)患者癌及癌旁组织中差异表达的lncRNA,筛选出与Pca发生发展密切相关的lncRNA,结合lncRNA在癌和癌旁组织中的表达水平探讨其意义,为Pca的诊断和预后提供新的生物标志物和治疗靶点.方法 利用TCGA数据库获取499例Pca和52例癌旁组织的基因数据,利用Perl提取lncRNA的矩阵,通过对差异表达的lncRNA进行生存分析,筛选出具有显著意义的lncRNA;通过对相关lncRNA在癌与癌旁组织中的表达水平的分析,比较其表达水平的差异性;通过生物信息学分析得到可能存在的lncRNA与靶基因的调控关系,初步阐明lncRNA对Pca患者的诊断和预后的意义.结果 通过生物信息学分析筛选出具有显著性意义的差异表达的LINC00308,经过分析LINC00308在Pca的表达显著高于癌旁组织(P<0.001),且与PCA3表达水平具有相关性(Spearman系数=0.11,P=0.0096).结论 在Pca中LINC00308表达水平显著升高,其可能与Pca的发生发展密切相关,可能成为新的肿瘤标志物.
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lncRNA作为ceRNA在恶性肿瘤EMT发生过程中的研究进展
恶性肿瘤的死亡原因主要是远处转移.竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)在基因表达调控中发挥重要作用,影响着恶性肿瘤的发生发展.上皮间质转化(Epithelial-Mesenchymal Transition,EMT)是上皮细胞转变为间质细胞的过程,它赋予肿瘤细胞转移和入侵的能力,lncRNA作为ceRNA,通过竞争性结合micorRNA调节靶基因,影响EMT的发生,进而影响恶性肿瘤的侵袭和转移.
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长链非编码RNA与肿瘤关系研究进展
目的 长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是指长度大于200核苷酸且无编码蛋白质功能的RNA.近年研究发现lncRNA广泛的参与细胞内大量生物学过程,在肿瘤发生发展过程中扮演重要角色.另外,lncRNA在肿瘤治疗方面也取得了重大进展.Gayatri Arun等人和Ionis制药公司合作设计了靶向lncRNA Malat1的药物,能显著在乳腺癌模型鼠身上抑制肿瘤进程.更深入研究lncRNA有望为肿瘤的治疗开启新的思路.本文结合中外文献报道对lncRNA和肿瘤关系研究进展做一综述.
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lncRNA作为竞争性内源RNA调控肝癌及中药作用机制研究进展
针对lncRNA作为ceRNA与miRNA (lncRNA/miRNA/mRNA)相互作用调控肝癌的进展进行综述,包括lncRNA/miRNA/mRNA在肝癌发生发展进程中的功能、机制,lncRNA/miRNA/mRNA调控通路与中药作用机制研究.lncRNA/miRNA/mRNA丰富了肝癌的发生、发展机制,为肝癌诊断及治疗提供新思路.
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lncRNA与自身免疫病关系的研究进展
长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是长度超过200 nt非编码蛋白的ncRNA,参与调节生物学过程如基因转录、蛋白合成.研究发现lncRNA可通过与相关的DNA、RNA和蛋白质相互作用调节基因表达,通过各种机制与人类疾病密切相关,尤其与系统性红斑狼疮、类风湿关节炎等多种自身免疫病相关.了解它们之间的关系,有助于我们进一步了解自身免疫病的分子机制,为开发治疗药物提供帮助.本文综述lncRNA的分类、结构和作用机制,以及近年来关于lncRNA参与自身免疫病发生发展的研究进展.
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长链非编码 RNA 与胃癌相关性的研究进展
长链非编码 RNA（lncRNA）因其长度大于200个核苷酸，缺乏编码蛋白能力而得名。在表观遗传学控制、转录和转录后调控等多个层面，lncRNA 参与了机体多种生理及病理过程的调节。研究已经证明， lncRNA 在胃癌生物学的调节过程中起关键的作用，lncRNA 与胃癌的发生、发展、侵袭、转移及预后密切相关。该文对 lncRNA 在胃癌中的研究进展作一综述。
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MALAT-1在肿瘤中的作用及其机制
肺腺癌转移相关转录1(metastasis-associated lung adenocarcinoma,MALAT-1)自首次发现以来,其在肿瘤中作用逐渐成为非编码长链RNA(long non-coding RNA,lncRNA)研究中的热点.MALAT-1主要通过调控可变剪接及直接调控编码蛋白质基因表达,参与肿瘤相关基因的表观遗传调控及相关信号转导通路,影响肿瘤生长、侵袭及转移、抗凋亡、耐药形成.本文就MALAT-1结构、生物学功能特点及其在肿瘤发生、发展中的作用和机制进行筒述.
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长非编码RNA在头颈部鳞状细胞癌中的研究进展
长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类大小在200bp～100kbp之间的非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA).LncRNAs参与表观遗传修饰,在基因转录及转录后水平进行调控,在头颈恶性肿瘤发生、发展过程中发挥作用,lncRNAs或可作为肿瘤早期诊断及患者预后评估的生物标志物.本文就与头颈部恶性肿瘤有关的lncRNAs的特征、在肿瘤中的作用及其分子机制等进行简要综述,为头颈部恶性肿瘤的基因诊断和治疗提供新的思路.
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过表达 LncRNA-MEG3对肠癌细胞 Lovo增殖活性的影响
目的：用PCR扩增长链非编码RNA-MEG3，构建MEG3真核表达载体，将重组质粒转染人肠癌细胞Lovo，观察MEG3含量改变对Lovo细胞增殖活性的影响。方法用293细胞提取人总RNA，反转录制备cDNA，PCR扩增MEG3基因并构建克隆，阳离子脂质体法转染重组质粒至Lovo细胞，转染后48 h通过荧光标记物GFP观察细胞转染效率。 RealTime-PCR检测转染后细胞内MEG3含量变化。 CCK-8检测肿瘤细胞对数生长期基因干预对于增殖活性的影响。结果成功获取了MEG3基因并构建了重组表达载体；成功转染Lovo细胞，转染后48 h，细胞转染效率约为60％；转染后细胞内MEG3含量明显升高，与空质粒转染组比较，相对含量上升约6．8倍，差异有统计学意义（P＜0．01）；外源MEG3的高表达可抑制Lovo细胞增殖活性，基因干预后48、72 h，与未转染组及转染对照组细胞比较，差异有统计学意义（P＜0．01）。结论 LncRNA-MEG3可显著抑制Lovo细胞增殖活性。
