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LncRNA NEAT1在恶性肿瘤中的研究进展
近年来,越来越多的研究显示长链非编码RNA(lncRNA)与恶性肿瘤的发生、发展过程密切相关.因此,lncRNA成为目前肿瘤研究的新热点.lncRNA NEAT1在许多恶性肿瘤中呈异常表达,发挥着重要的作用.本文就lncRNA NEAT1在各种恶性肿瘤中的表达、作用以及调控机制作一综述.
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结直肠癌发病相关的lncRNA筛选及GAPLINC对HCT116细胞的作用
目的 筛选结直肠癌(CRC)差异性表达的长链非编码RNA(lncRNA),并进行临床标本验证,研究其对结肠癌细胞HCT116功能的作用.方法 利用lncRNA PCR芯片对3对CRC组织和癌旁对照组织筛选差异性表达的lncRNA,确定候选研究lncRNA GAPLINC,RT-qPCR对21例临床样本进行验证其表达的差异性;同时构建GAPLINC表达质粒及其沉默体siRNA转染HCT116细胞,研究其对细胞凋亡、迁移及侵袭能力的影响.结果 lncRNA芯片实验结果提示CRC组织中存在大量的差异性表达的lncRNA,其中GAPLINC在CRC组织表达稳定增加,21例临床样本进一步验证了其在肿瘤组织中表达增加(P<0.05);转染GAPLINC表达质粒后,HCT116细胞凋亡被抑制,同时其迁移及侵袭能力增强,转染siRNA抑制GAPLINC的表达后,则出现相反的结果.结论 利用lncRNA芯片可对CRC差异性表达lncRNA进行批量筛选,GAPLINC在CRC组织中表达稳定增加,具有促癌作用,在CRC发生发展中可能起着重要作用.
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长链非编码RNA反义泛素C端水解酶L1在结直肠癌中的表达及其临床意义
目的:探讨长链非编码RNA(LncRNA)反义泛素C端水解酶L1(UCHL1-AS1)在结直肠癌中的表达及其临床意义.方法:利用RT-PCR方法检测48例结直肠癌及相应癌旁组织中UCHL1-AS1的mRNA表达水平,分析其与临床病理特征的关系.结果:与癌旁组织相比较,UCHL1-AS1 mRNA在结直肠癌中表达明显下调(P<0.05).UCHL1-AS1 mRNA在结直肠癌组织表达下调与年龄、淋巴结转移、神经侵犯、分化程度相关(P<0.05),与性别、大小、部位、临床分期、癌栓形成无关.结论:UCHL1-AS1 mRNA在结直肠癌组织中表达下调,为下一步研究其在结直肠癌中的作用机制奠定了基础.
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SNHG11在结直肠癌中的表达及功能预测
目的 探究SNHG11在结直肠癌中的表达与临床病理之间的关系,并预测SNHG11参与结直肠癌发生发展的机制.方法 从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)下载结直肠癌临床病理及基因表达谱信息.通过HGNC(HUGO gene nomenclature committee,HGNC)中长链非编码RNA(IncRNA)数据库选出差异表达的lncRNA分析,通过cBio Portal for Cancer Genomics 网站对差异基因进行表达量的变化,分析SNHG11在结直肠癌中的表达情况,并探讨SNHG11表达和临床病理学参数的相关性.采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)方法预测SNHG 11可能参与的代谢通路.结果 SNHG11的表达水平与结直肠癌T分期(P=0.028)、淋巴结转移(P=0.005)、远处转移(P=0.000)及TNM分期(P=0.001)显著相关.SNHG11高表达癌症样本显著富集到RNA聚合酶、RNA降解、前体RNA剪切、嘧啶代谢等相关基因集.结论 SNHG11可能通过调RNA合成,前体RNA的剪切等过程,从而参与了结直肠癌的发生与发展.
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外泌体lncRNA在肿瘤中的研究进展
外泌体(exosome)是由细胞内多泡体与细胞膜融合后释放到细胞外基质中的一种直径为30～100 nm的膜性囊泡,广泛分布于各种体液中.其含有蛋白质、核酸(mRNA、miRNA、lncRNA、DNA等)和脂质等物质,是细胞间通讯的重要介质.大量研究表明,外泌体lncRNA在肿瘤的发生、发展、侵袭和转移过程中扮演重要角色.本文就外泌体lncRNA在肿瘤发生发展、诊断、治疗及预后中的研究进展进行综述.
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LPS诱导的急性肺损伤中早期标志物表达研究
目的 探讨长链非编码RNA在内毒素诱导的急性肺损伤早期表达.方法 应用脂多糖(Lipopolysacharide,LPS)在健康昆明小鼠气管内滴注建立急性肺损伤动物模型;查找文献,筛选小鼠肺组织在炎症后差异表达的lnc RNAs,选取部分lnc RNAs(LncRNA IL-7R、LncRNA H19、LncRNAHotair、LncRNA Maltal1、LncRNA acta-1、LncRNA Cot2)进行实时荧光定量PCR验证和生物信息学分析,验证可能与LPS诱导的急性肺损伤发生相关的lnc RNAs表达的变化,及其与LPS诱导急性肺损伤主要信号通路TLR4-MYD88-NF-kb P65通路的相关成员的变化水平,为其在急性肺损伤发生中的机制研究提供前期基础.结果 气道内直接滴入LPS 24 h后,TLR4、MYD88、LncRNAH19在LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型的肺组织中,实验组较对照组的基因表达水平增高(P<0.05);LncRNA IL-7R、LncRNAHotair、LncRNA Maltal1、LncRNA acta-1、LncRNA Cox2基因水平的表达,两组比较无明显差异性(P>0.05).经地塞米松干预后,在急性肺损伤炎症小鼠肺组织中,干预组TLR4、DYD88、LncRNA H19的基因表达水平均较实验组出现不同程度降低(P<0.05).结论 LncRNA H19、LncRNA IL-7R可能通过信号通路TLR4-MYD88-NF-kb P65参与内毒素诱导的急性肺损伤中早期表达,但其与肺损伤的关系有待进一步研究.
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马尔尼菲蓝状菌感染支气管上皮细胞后lncRNAENST00000413528及炎症基因表达的研究
目的:研究马尔尼菲蓝状菌(TM)感染支气管上皮细胞早期长链非编码RNA(lncRNA) ENST00000413528与白三烯B4(LTB4)、叉头基因3A(FOXO3A)、血红素加氧酶基因1(HMOX1)等基因的表达.方法:将支气管上皮细胞(EBAS-2B细胞)分为空白对照组和实验组,实验组用TM孢子感染EBAS-2B细胞(感染复数为10～20∶1)4h,空白对照组不做任何处理,采用荧光定量PCR(qPCR)法检测两组lncRNA ENST00000413528、LTB4、FOXO3A、HMOX1的表达.将携带ENST00000413528基因的慢病毒颗粒感染EBAS-2B细胞为过表达组,以空载体慢病毒感染的EBAS-2B细胞为阴性对照组,qPCR检测过表达组和阴性对照组ENST00000413528、LTB4、FOXO3A、HMOX1的表达.结果:与空白对照组比较,实验组中lncRNA ENST00000413528的表达显著下调(P＜0.05),而LTB4、FOXO3A、HMOX1的表达上调(P＜0.05).lncRNAENST00000413528过表达后,LTB4的表达明显增加,而HMOX1、FOXO3A的表达明显下降(P＜0.05).结论:TM感染支气管上皮细胞早期lncRNA ENST00000413528和炎症相关基因LTB4、FOXO3A、HMOX1存在差异表达,lncRNAENST00000413528可能对LTB4、FOXO3A、HMOX1基因有调控作用.
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lncRNA和Hippo-YAP通路调控脂肪干细胞成骨分化机制的研究进展
脂肪干细胞(adipose-derived stem cells,ADSCs)经外界刺激后生物学特性的变化受到越来越多的关注.ADSCs具有多向分化能力和较明确的成骨潜能,因此成为骨组织工程中重要的种子细胞.Hippo-Yes相关蛋白(Yes-associated protein,YAP)信号通路去磷酸化时,其效应分子YAP聚集在细胞核内通过不同的机制来调控基因的表达,从而调控细胞的大小和数量,已被证实参与了肿瘤的发生和发展.虽然目前ADSCs成骨分化机制与Hippo信号通路YAP磷酸化的关系尚未见报道,但有研究表明,敲减YAP后的ADSCs成骨分化能力明显增强[妇.研究发现,长链非编码RNA (longnon-coding RNA,lncRNA)在ADSCs成骨分化中发挥潜在的调节作用,并与Hippo信号通路之间存在相互作用[2].阐明lncRNA和Hippo-YAP信号通路调控ADSCs成骨分化的机制,提高ADSCs成骨分化的效率,为骨损伤的治疗提供新的策略.本文就ADSCs和lncRNA特性及lncRNA与Hippo-YAP信号通路调控ADSCs成骨分化机制的研究进展综述如下.
关键词： LncRNA Hippo-YAP信号通路 脂肪干细胞 成骨分化 -
长链非编码RNA-H19调控人肝癌HepG2细胞增殖与凋亡
目的 探讨长链非编码RNA-H19(lncRNA-H19)能否调控人肝癌细胞HepG2增殖和凋亡.方法 以人肝癌细胞株HepG2作为转染对象,分别设空白对照组(人肝癌细胞HepG2+培养基)、阴性对照组(人肝癌细胞HepG2+培养基+空载体)和沉默组(人肝癌细胞HepG2+培养基+慢病毒);采用含10％胎牛血清的RPMI-1640培养基,培养人肝癌细胞HepG2,使用慢病毒转染技术沉默人肝癌细胞HepG2的lncRNA-H19表达,荧光实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测人肝癌细胞HepG2的lncRNA-H19表达;四甲基偶氮唑蓝(methyl thiazolyl tetrazolium,MTT)法检测人肝癌细胞HepG2增殖能力;流式细胞术检测人肝癌细胞HepG2凋亡率.结果 qRT-PCR检测lncRNA-H19的相对表达量,三组比较差异具有统计学意义(F=383.961,P<0.01);沉默lncRNA-H19后,用MTT法分别于24 h、48 h和72 h检测人肝癌细胞HepG2吸光度的表达量,三组比较差异具有统计学意义(F=266.198,P<0.05),其抑制作用72 h>48 h>24 h,表现为时间依赖;沉默lncRNA-H19后,3次流式细胞术检测细胞凋亡率均数,三组比较差异具有统计学意义(F=68.823,P<0.001).表明沉默lncRNA-H19可促进肝癌细胞HepG2细胞增殖,抑制细胞凋亡.结论 Ln-cRNA-H19可以调控人肝癌HepG2细胞的生长,能抑制肝癌细胞HepG2的增殖,其抑制作用呈时间依赖,促进HepG2细胞凋亡.
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铁离子对幽门螺杆菌感染的胃上皮细胞LncRNA的影响
目的 探讨铁离子对幽门螺杆菌(Hp)感染的胃上皮细胞(GES-1)长非编码RNA(LncRNA)的影响.方法 以胃上皮细胞作为对照A组,Hp感染胃上皮细胞作为B组,硫酸铁与胃上皮细胞共培养为C组,硫酸铁与Hp和胃上皮细胞共培养为D组,采用表达谱基因芯片检测各组GES-1细胞的LncRNA和mRNA基因差异表达.结果 与A组LncRNA基因数相比:B组上调76个LncRNA基因,下调45个基因;C组上调40个基因,下调123个基因;D组上调124个基因,下调159个基因.各组间差异基因主成分分析显示B组比C组和D组的离散程度高.在功能富集分析显示,TNF信号通路中,C组和D组与B组比较,相关mRNA基因多数下调.结论 铁离子可能影响胃上皮细胞Ln-cRNA调控作用进而影响Hp感染的发病情况.
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LncRNA在急性冠脉综合征中的研究进展
LncRNA是一种长度大于200 nt、不编码蛋白质、由RNA聚合酶Ⅱ合成的一类功能性RNA分子,在基因表达调控中起着重要作用,广泛参与调控个体的生长发育以及细胞分化、增殖、凋亡等生命活动,广泛参与机体的生理及病理过程.目前LncRNA的数量、功能和作用机制尚不完全清楚.近来许多研究显示,LncRNA在急性冠脉综合征中起着潜在作用.本文就LncRNA在急性冠脉综合征中可能发挥的作用综述.
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DNA甲基化、lncRNA在子宫内膜异位症中的研究进展
子宫内膜异位症是育龄期女性常见的妇科疾病,其发病机制尚不明确.近年来研究表明表观遗传调控在子宫内膜异位症的发病过程中发挥了一定的作用,如DNA甲基化、组蛋白修饰、mircoRNA和lncRNA的调控.本文主要对DNA甲基化、lncRNA在子宫内膜异位症中的研究进展做一综述.
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骨关节疾病中lncRNA的表达及研究进展
目前长链非编码RNA (lncRNAs)作为各种调节剂或者结构基因在分子研究中广泛运用，而且它在某些疾病中特异性的上调或下调存在着很大的研究价值。研究发现lncRNA在骨关节疾病发生发展过程中起着重要的作用，未来有可能会成为一些难治性骨关节疾病的治疗靶点，如自身免疫病、退行性病变等。更加深入研究lncRNA与各种疾病的关系具有重要的意义。
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先天性巨结肠肠管lncRNA-mRNA共表达谱芯片初步筛查研究
目的:研究先天性巨结肠 (Hirschsprung's disease, HD) 病变段肠管与正常段肠管lncRNA-Mrna表达谱的差异.方法:采用lncRNA-Mrna共表达谱芯片筛查5例HD肠管和5例配对的正常肠管差异表达的lncRNA和Mrna, 并以17对样本对其中显著差异的5个lncRNA进行q RT-PCR验证, 同时应用生物信息学的方法构建lncRNA-Mrna共表达网络, 预测差异lncRNA的靶基因, 并对预测的靶基因进行基因本体论 (gene ontology, GO) 分析和通路 (pathway) 分析.结果:lncRNA-Mrna共表达谱芯片筛查出HD肠管中存在353个表达上调, 474个下调的lncRNA, 以及865个上调, 461个下调的Mrna.并验证出5个差异表达的lncRNA.lncRNA与Mrna相互关联, 通过调控相应的靶Mrna, 参与包括细胞增殖、分化和迁移等多种生物学过程, 与HD的发病有一定相关性.结论:HD肠管中存在大量差异表达的lncRNA和Mrna.lncRNA和Mrna之间具有广泛的联系, 形成共表达网络, lncRNA可能是通过调控相应的靶Mrna参与HD的发病.
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LncRNA在甲状腺癌中的异常表达和功能研究进展
甲状腺癌是常见的内分泌恶性肿瘤,近几十年来发病率迅速增加,并已成为一个主要的健康问题.近年来,对甲状腺癌发生的分子机制的理解取得了重大进展,在诊断、预后和治疗方面都有巨大的进步,但仍有些病例具有发展为更具攻击性和致命性的甲状腺癌的风险.长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的发现极大地改变了我们对细胞生物学的理解,尤其是癌症的病理生理学.一些研究已经证明了它们在基因表达、细胞生物学行为和致癌作用中具有关键的调节作用.已经在包括甲状腺癌在内的各种类型的癌症中观察到lncRNA的表达水平失调,然而它们在甲状腺癌中的作用和分子机制仍然很不清楚.在这篇综述中,总结了近的文献,以突出这类长期非编码lncRNA在甲状腺癌中的现状.
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长链非编码RNA Gm4419通过NF-κB信号通路调控高糖下系膜细胞炎症因子的表达
目的 探讨长链非编码RNA Gm4419通过核转录因子-kappa B(nuclear factor-kappa B,NF-κB)信号通路对高糖培养的肾小球系膜细胞炎症因子表达的影响.方法 在高、低糖培养的小鼠肾小球系膜细胞中,采用RT-qPCR检测Gm4419的亚细胞分布及NF-κB亚基p50和p65的表达水平;采用RT-qPCR及免疫荧光检测上、下调Gm4419后炎症相关因子TNF-α和MCP-1的表达;采用生物信息技术分析Gm4419与p50和p65关系;采用Western blot检测上、下调Gm4419后细胞核中p50和p65的表达水平,以及检测特异性p50抑制剂对过表达Gm4419影响MCP-1表达的作用.结果 Gm4419在肾小球系膜细胞高糖组表达水平显著高于低糖组(P＜0.05),且主要分布在系膜细胞的细胞质中.同时,在低糖组过表达Gm4419后MCP-1、TNF-α表达水平显著增加(P＜0.01);而在高糖组沉默Gm4419后MCP-1、TNF-α表达水平显著减少(P＜0.01).此外,Gm4419与NF-κB亚基p50和p65均存在潜在结合位点,过表达Gm4419后胞核p50和p65蛋白表达水平显著增加,NF-κB活化增强(P＜0.01);而沉默Gm4419后胞核p50和p65蛋白表达水平显著降低,NF-κB活化减弱(P＜0.01),且过表达Gm4419增加MCP-1表达的效应可被特异性p50抑制剂阻断.结论 Gm4419可能在促进高糖下系膜细胞炎症因子表达中扮演重要角色,其机制可能涉及NF-κB信号通路.
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七氟醚预处理在二尖瓣置换手术的心肌保护作用:一项随机对照研究及lncRNA分析
目的 探讨七氟醚(sevoflurane)预处理对体外循环下行二尖瓣膜置换患者的心脏保护作用及其机制.方法 纳入我院心脏外科2017年5-11月收治的40例接受二尖瓣置换手术的患者(17例男性和23例女性),平均年龄48岁,BMI:(22.7-2.6) kg/m2.根据随机数字表法将患者分为七氟醚预处理(SEV)组和对照(CON)组(n=20),SEV组患者体外循环前接受七氟醚持续吸入维持麻醉,而CON组采用丙泊酚维持麻醉.采集术前、术后2、24 h血液,检测cTnI浓度;心脏彩超评估术前、术后24h左室缩短分数和射血分数,记录ICU停留时间及住院时间;分别在体外循环开始前取得两组患者取心房肌标本(n=5),进行lncRNA测序和分析.结果 SEV组患者:术后2h[0.58 (0.33,0.90) ng/mL vs 1.06(0.55、2.16) ng/mL,P＜0.05]和24 h[0.66(0.38、1.02) ng/mL vs 1.09 (0.72、1.54) ng/mL,P＜0.05]的cTnI浓度均显著低于CON组;术后24h左室缩短分数值[(39.8±3.3)％ vs(33.9±2.8)％,P＜0.05)和左室射血分数[(70.5±4.0)％ vs(62.7±4.2)％,P＜0.05]显著高于CON组;ICU停留时间[(68±18)h vs(83 ±26)h,P＜0.05]显著短于CON组.两组患者的住院时间差异无统计学意义(P＞0.05).lncRNA分析出73个上调和95个下调基因,结果提示心肌细胞凋亡相关的IncRNA通路可能参与七氟醚心脏保护.结论 体外循环前七氟醚预处理对行二尖瓣置换手术的患者具有早期心肌保护作用;心肌细胞凋亡相关lncRNA通路可能是七氟醚预处理心肌保护的潜在作用靶点.
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LncRNA 在子宫脱垂组织中表达谱的变化
目的：筛选出与子宫脱垂相关的长链非编码RNA（long non－coding RNA，lncRNA），为探讨lncRNA参与子宫脱垂的发生与发展提供实验依据。方法选取2015年1～6月在武汉市人民医院进行手术的6例子宫脱垂组织和6例未脱垂的正常子宫组织，应用高通量lncRNA 芯片技术检测两组子宫组织中lncRNA表达谱的变异。结果分析两组lncRNA表达谱的变化，发现与正常子宫组织相比，子宫脱垂组织中的lncRNA和mRNA表达量均表现出上调和下调。上调mRNA（Fold＞2）参与了多细胞生物过程、信号传导和细胞交流等生物过程，下调mRNA（ Fold＞2）参与了细胞器形成、细胞周期和细胞分裂等生物过程。通过GO聚类分析着重分析了变化差异性明显的10个lncRNA，寻找出了与其变化密切相关的mRNA。通过荧光定量聚合酶链反应对4个变化明显的 lncRNA （ BC008359、 RP11－521B24．5、BRE －AS1和 RP11－229P13．15）进一步验证，与芯片检测结果一致。结论子宫脱垂组织中lncRNA的变化情况说明，4个变化明显的lncRNA（BC008359、RP11－521B24．5、BRE－AS1和RP11－229P13．15）在子宫脱垂组织中发挥重要作用，为探讨lncRNA参与子宫脱垂的发生与发展提供实验依据和理论基础。
关键词： 子宫脱垂 LncRNA 高通量lncRNA芯片技术 荧光定量PCR -
非编码RNA调控精子发生的研究进展
随着基因组学研究的发展,发现生物体基因组内存在大量不编码蛋白质的基因.这些基因的转录产物称为非编码RNA(Noncoding RNA,ncRNA).以前认为ncRNA是基因组中无用的序列,但是研究表明ncRNA在很多生命活动中起到很重要的作用.按照转录产物的序列长短ncRNA分为短链非编码RNA(Small ncRNA)和长链非编码RNA(LncRNA).精子发生包括精原细胞增殖,精母细胞减数分裂以及精子成熟等一系列受到精确调控的生理发育过程.精子发生需要相关基因的适时表达,并受到转录和转录后水平的调控.但是精子发生过程的调控机制目前还未完全研究清楚.新研究发现在精子发生过程ncRNA起到很重要的作用,即使在成熟精子细胞中也有ncRNA的表达.表明ncRNA参与调控精子发生的过程,并且这些父源ncRNA可能在接下来的受精和胚胎发育中起到重要的调节作用.结合新研究进展,本文综述了ncRNA在精子发生过程所起的作用,以期为精子发生过程中ncRNA的进一步研究提供参考.
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非编码RNA在恶性血液病中的发病机制及临床意义
现已研究证明,在细胞内能够稳定存在的转录产物中信使RNA不超过2％,其余绝大部分为非编码RNA,而非编码RNA依据其分子的大小又可分为长链非编码RNA和小分子非编码RNA,其经典的作用机制是通过与靶mRNA互补配对,从而促进mRNA的降解或抑制蛋白质的翻译.研究表明,其表达的异常与体内多种肿瘤相关,因此对其功能的深入研究将具有重大的科学意义和临床价值.现就非编码RNA在血液肿瘤中的基础与临床研究进展进行综述.
