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IRF6基因rs642961位点多态性与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂的相关性研究
目的 探讨中国北方人群干扰素调节因子6(IRF6)基因rs642961位点多态性与非综合征性唇裂伴或不伴腭裂(NSCL±P)的相关性.方法 收集中国北方人群88个病例核心家庭和116个正常儿童作对照,用四引物扩增受阻突变体系聚合酶链反应(tetra-primer ARMS-PCR)的方法,进行IRF6基因rs642961检测;用人群关联研究、传递不平衡检验(TDT)、单倍型相对风险率(HHRR)、家庭为基础的关联检验(family-based association test,FBAT)等进行统计分析.结果 子代、父亲、母亲三个亚组人群的IRF6基因rs642961位点的基因型在NSCL±P组与对照组的分布差异具有统计学意义(P＜0.05),OR值及其95％可信区间均不包含1,提示IRF6基因rs642961位点的变异能增加NSCL±P发病的危险.核心家庭资料TDT和HHRR的结果均显示有统计学差异(P＜0.05),FBAT分析提示可能存在加性传递模式(P＜0.05),进一步支持IRF6基因rs642961位点的突变和NSCL±P发生相关.结论 在中国北方人群中,IRF6基因rs642961位点多态性与NSCL±P发病相关.
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复杂疾病病因研究中基因间交互作用分析:基于基因型传递不平衡的多因子降维法
介绍复杂疾病病因研究中分析基因-基因交互作用的一种新方法:基于基因型传递不平衡的多因子降维法(MDR-PDT).文中简述MDR-PDT的基本原理、步骤及特点,并结合研究实例说明其应用过程.MDR-PDT是原始MDR的扩展,可用于多种结构类型的核心家系资料分析基因-基因交互作用.结论 MDR-PDT具有非参数、无需遗传模式的特点,并能充分利用家系中多个家庭成员的信息,在复杂疾病病因研究中分析基因-基因交互作用具有良好的效能.
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鼻咽癌核心家系EB病毒VCA-IgA抗体检测结果分析
目的:分析鼻咽癌核心家系成员EB病毒VCA-IgA抗体检测结果.方法:采用酶联免疫法检测254个鼻咽癌核心家系成员血清EB病毒VCA-IgA抗体滴度,对照组采用广西境内高发区自然人群.结果:鼻咽癌核心家系共254个,核心家系先证者父母与对照组的EB-VCA-IgA情况比较有显著性差异(P＜0.01).结论:核心家系先证者父母的EB-VCA-IgA抗体检测结果显著高于正常人群对照组,有待我们进一步用分子遗传学方法来进一步阐述鼻咽癌的病因.
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REML法和MCMC法在数量性状核心家系遗传方差分量模型中参数估计的比较
目的比较限制性大似然估计(REML)和马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)方法在数量性状遗传方差分量模型中参数估计的偏差和精度.方法计算机模拟50个数量性状核心家系数据集,运用SAS软件中的PROC MIXED程序和WinBUGS软件进行参数估计,比较不同样本含量时两法参数估计结果.结果在本试验参数指定条件下,对固定效应参数,两法估计的相对偏差低于2%;对随机效应,估计偏差较高.小样本时,MCMC法估计结果比REML法更接近真值.结论在模拟数量性状方差分量模型时,大样本家系资料可根据实际情况选用两法;小样本家系资料,MCMC法可得到比REML法更稳健的估计,推荐使用.
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汉族儿童孤独症核心家系血浆谷氨酸和γ-氨基丁酸水平的对照研究
目的 探讨血浆谷氨酸(Glu)和γ-氨基丁酸(GABA)水平异常与汉族儿童孤独症的关系.方法 采用高效液相色谱法测定33个汉族儿童孤独症核心家系和36个正常对照核心家系的血浆Glu和GABA水平,组间比较并进行亲代与子代血浆Glu、GABA水平的相关分析.结果 子代及父母血浆Glu水平在汉族儿童孤独症核心家系与正常对照核心家系之间差别无统计学意义(ι值分别为0.905、1.186、-0.878;P值分别为0.369、0.241、0.383),血浆GABA水平差异也无统计学意义(ι值分别为1.283、0.385、-0.030;P值分别为0.205、0.702、0.976);汉族儿童孤独症核心家系血浆GABA水平具有家族相关性,患儿血浆GABA水平=26.400+0.810×母亲血浆GABA水平(标准化回归系数为0.511,ι=4.871,P=0.000),汉族儿童孤独症核心家系血浆Glu水平无家族相关性;正常对照核心家系血浆Glu和GA-BA水平均无家族相关性.结论 汉族儿童孤独症不存在血浆Glu及GABA水平的异常,但血浆GABA系统可能参与了孤独症的遗传机制,宜对其作进一步研究.
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不同糖尿病家系肾虚证分布及其基因表达谱比较
目的 探讨不同T2DM家系肾虚证遗传基础的差异性.方法 筛选两个2型糖尿病(type 2 Diabetes Mellitus,T2DM)核心家系,对家系中先证者的一级亲属进行辨证和理化检测,选择两个家系一级亲属中的糖尿病肾虚证患者各3例为病例组,家系中的正常人为对照组,作基因芯片实验；采用SAM芯片数据分析软件筛选两个家系的显著表达基因,并利用FatiGO数据库对筛选到的2组显著表达基因的功能和涉及的疾病作比较.结果 两个家系一级亲属中的T2DM患者均为肾虚证,T2DM肾虚证患者分别占先证者及其一级亲属的50.0％和57.1％；通过SAM软件分别筛选到两个家系T2DM肾虚证相关的473和529个显著表达基因,基因功能注释比较结果提示免疫反应和糖代谢类生物学过程存在差异；在筛选到的显著表达基因中,家系2中与糖尿病肾病和糖尿病酮症酸中毒相关的基因各有1条,而家系1中与此两个糖尿病并发症相关的基因为0条.结论 T2DM家系中肾虚证和T2DM有伴发倾向；两个T2DM家系肾虚证的生物学差异主要集中在免疫反应及糖代谢方面,不同的家系对T2DM并发症的易感性不同.
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瘦素基因启动子区-2548G/A功能多态性与抗精神病药源性肥胖的核心家系关联研究
目的:探讨瘦素(leptin)基因启动子区-2548G/A功能多态性是否与首次抗精神病药物(antipsyehotie agents,APS)治疗精神分裂症(schizophrenia,SCH)惠者急性期体质量增加相关.方法:APS(利培酮或氯丙嗪)单药治疗10周,治疗前后测量体质量并计算体质量指数(body mass index,BMI).采用PCR-RFLP技术分析84例首次治疗精神分裂症患者(包含完整核心家系70个)瘦素基因-2548G/A基因型和等位基因分布频率,APS治疗所致体质量增加与瘦素-2548G/A多态性的关联分析及核心家系关联分析,采用传递不平衡检验(TDT)和数量性状传递不平衡检验(QTDT).结果:治疗后患者体质量增加是基础体质量的(8.00±6.13)%.体质量增加≥7%和<7%患者组间瘦素基因-2548G/A多态性的等位基因在两组的分布差异有统计学意义(X2=4.031,P=0.045).核心家系分析采用TDT发现,在体质量增加≥7%组患者组存在传递不平衡,等位基因A更多的由杂合子父母传递给体质量增加≥7%的患者.结论:瘦素基因启动子区-2548G/A功能多态性与APS急性期治疗致精神分裂症患者体质量增加相关,-2548A等位基因可能是APS治疗所致肥胖的危险因素.
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双相障碍Ⅰ型核心家系认知功能遗传度研究
目的 通过核心家系探讨双相障碍Ⅰ型(bipolar I disorder,BD-I)认知功能的遗传性以及与BD可能相关的认知内表型.方法 纳入79例稳定期BD-Ⅰ型患者及其健康父母组成的核心家系,以及正常对照140名.采用数字符号测验、数字广度、视觉再生、连线测验(trail making test,TMT)A和B、威斯康星卡片分类测验、言语流畅性、汉诺塔(tower of Hanoi,TOH)评估被试的注意力、处理速率、工作记忆和执行功能等认知功能,采用亲代和子代数量性状回归系数计算家系中各认知指标的遗传度(h2),并与对照组比较,筛选BD组受损的认知指标.结果 控制年龄和受教育年限的混杂影响后,TMT-A错误数(h2=0.54)、TOH总分(h2=0.37)、完成任务数(h2=0.35)的遗传性有统计学意义(均P<0.05).与对照组比较,患者组上述有遗传性的认知指标中TOH总分、完成任务数指标受损有统计学意义(P<0.05).结论 认知功能中处理速率和执行功能在BD核心家系中可能有遗传性,执行功能指标中TOH总分和完成任务数损害与BD疾病可能相关,可作为BD的内表型.
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精神分裂症核心家系与脑源性神经营养因子基因C270T多态性研究
目的 研究脑源性神经营养因子(brain-derived neurotrophic factor,BNDF)基因C270T多态性与精神分裂症的关系.方法 在91个精神分裂症核心家系中,以聚合酶链反应和限制性片段长度多态性的方法对BDNF基因C270T多态性进行检测.采用单体型相对风险(haplotype relative risk,HRR)和传递不平衡检验(transmission/disequilibrium test,TDT)对精神分裂症与BDNF基因C270T多态性位点进行关联分析,以及分析该位点与阳性和阴性症状量表(positive and negative syndrome scale,PANSS)各因子分的关系.结果 HRR分析显示,BDNF基因C270T多态性与精神分裂症无关联(?掊 2 ＝ 3.39,P ＞ 0.05).TDT分析未发现BDNF基因C270T多态性位点在精神分裂症患者中存在传递不平衡(?掊 2 ＝ 3.2,P ＞ 0.05).携带T等位基因(CT和TT基因型)的患者阳性症状分高于未携带T等位基因(CC基因型)的患者(t ＝ -2.11,P ＝ 0.04).结论 本研究未发现BDNF基因C270T多态性和精神分裂症关联,但发现T等位基因可能与阳性症状存在关联.
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广西先天性心脏病家系筛查研究
目的 为先天性心脏病(CHD)监测干预、遗传研究提供资料和参考.方法 对广西各地市医院确诊的CHD患者140例(简称先证者)及其血缘亲属进行调查,了解其年龄、性别、民族、病种等情况,并采集外周静脉血提取DNA,绘制高发家系谱图.每1个CHD患者确定1个CHD核心家系,1个核心家系内有2个或2个以上CHD患者则为高发家系.结果 140例CHD中,男性患者比率为57.86%,略高于女性(42.14%),但差异无统计学意义(P＞0.05);室间隔缺损发病率较高(51.43%),其次为房间隔缺损(23.57%).140个CHD核心家系中高发家系49个(35.00%).高发家系亲属患者与先证者的病种构成差异无统计学意义(P＞0.05),完全一致的有15个家系(30.61%).结论 CHD有家族聚集现象,但亲属患者的病种与先证者不一定完全一致;遗传因素在CHD的发生中起重要作用.
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鼻咽癌核心家系成员VCA-IgA抗体检测结果分析及家系标本库的建立
目的 分析家系成员EB病毒VCA-IgA抗体检测结果.方法 对经县级及以上医院确诊的鼻咽癌先证者及其血缘父母进行调查和填写调查表,并采集外周静脉血8 mL,其中抗凝血5 mL分离、冻存,3 mL非抗凝血进行血清EB病毒VCA-IgA抗体滴度;对照组采用广西境内高发区自然人群.结果 共收集鼻咽癌核心家系254例,建立家系成员资料数据库,并分析家系成员VCA-IgA抗体检测结果,其中先证者父母EB-VCA-IgA抗体阳性率显著高于对照组(P＜0.01).结论 建立规范的鼻咽癌核心家系数据库为今后进一步利用分子遗传学方法来研究鼻咽癌的病因打下基础.
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泸州地区22例RhD阴性供血者家系调查
为了了解RhD阴性供血者的家系中RhD阴性分布情况及传递方式.RhD抗原检测用玻片凝集法,确认及表现型用戴安娜卡式检测法.RhD阴性家系成员中RhD阴性率30.67%;仅在同胞中检出RhD阴性的家系数为50%;核心家系成员RhD阴性率41.28%;非核心家系成员RhD阴性率2.4%.RhD阴性的家系成员是极高分布人群;同胞中出现的频率高,核心家系是RhD阴性的聚集群体.
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北京市朝阳区超重肥胖儿童腹型肥胖指标的核心家系研究
目的 分析儿童腹型肥胖相关指标与父母相应指标的相关性,比较不同指标在反映儿童肥胖与父母肥胖关系中的作用.方法 采用分层整群抽样方法在北京市朝阳区抽取94个6～13岁超重/肥胖儿童核心家系家庭,测量超重、肥胖儿童及其父母的腰围(waist circumference,WC)、臀围(hip circumference,HC)指标,并计算腰围身高比(waistheight ratio,WHtR)、腰臀比(waist-hip ratio,WHR)衍生指标,分析儿童WC、HC、WHtR、WHR指标与其亲生父母相应指标的关系.结果 儿童的WC、HC、WHR、WHtR与父母的相应指标均呈正相关(相关系数为0.201～0.397,P＜0.05);多元线性回归分析显示:调整年龄、性别因素后,父亲、母亲WC、HC与儿童的WC、HC有关,回归系数均有统计学意义(P＜0.05),父亲WC值每增加4.05 cm,或母亲WC值每增加2.09 cm,其子女WC值将增加1 cm;母亲WHtR、WHR与儿童的WHtR、WHR有关,回归系数有统计学意义(P＜0.05),父亲WHtR、WHR指标的回归系数无统计学意义(P＞0.05).结论 儿童的腹型肥胖指标与其父母的相应指标关系密切,WC与HC更倾向于反映儿童体型与父母双方体型的相关性;WHR、WHtR更倾向于反映儿童体型与母亲而非父亲体型的相关性.
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核心家系孤独症患儿FOXP1基因的突变及CNV分析
[目的]研究转录因子FOXP1在汉族孤独症患儿核心家系中的外显子突变,并进行初步的功能预测.[方法]288例孤独症患儿及生物学父母进行FOXP1外显子区域基因测序和拷贝数变异(copy number variation,CNV)检测；使用POLYPHEN及SIFT等软件进行功能预测. [结果]4例患儿的FOXP1基因外显子区域发现4个错义突变,包括P42S,H53Q,L68R和M590V.在CNV检测中为阴性结果.通过功能预测发现,FOXP1的四个罕见突变可能不会对FOXP1编码蛋白产生重要影响. [结论]汉族人群中,FOXP1基因可能不是孤独症的主要致病基因.
