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大豆花叶病毒黄淮5号株系的基因组全序列分析
测定了大豆花叶病毒(SMV)我国黄淮5号(Y5)株系的基因组全序列.该病毒基因组全长9*!585个核苷酸,3′-末端具poly(A)尾,包含单一开放读码框,编码一个349.2kD的多聚蛋白.基因组全序列和美国SMV G2和G7株系的核苷酸同源性分别为97.4%和96.9%.多聚蛋白酶解后产生马铃薯Y病毒属典型的10个成熟蛋白.Y5、G2和G7 3个株系的不同成熟蛋白间氨基酸序列的同源性为89.6%~100%.多重比较分析表明,Y5株系P1蛋白N-末端区域与G2和G7存在明显差异.进一步分析显示,这3个株系的6K1、6K2、NIa-Pro、NIa-VPg、NIb蛋白中心区域和CP蛋白高度保守,P1蛋白N-末端,CI和P3蛋白C-末端以及HC-Pro蛋白变异较大,但是美国G2和G7株系已报道序列P1蛋白区域存在可能的测序错误.
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香蕉束顶病毒DNA组分4的克隆与序列分析
香蕉束顶病毒(banana bunchy top virus,BBTV)基因组中至少含有6个DNA组分,我们实验室已经对BBTV广东两个株系(NS和NSP)基因组中的DNA组分1、3、6进行了测序和报道.现又对NS和NSP的DNA组分4分别进行了克隆和序列分析.
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电离辐射对食管癌细胞系(ECA109和TE13)r-H2AX表达的影响
维持一个完整的基因组对于细胞的稳定性是至关重要的,由电离辐射和类辐射药物产生的DNA双链损伤是主要的细胞毒损伤,如果不能修复这种损伤就会导致基因组不稳定和肿瘤的形成或其他年龄相关疾病[1].体内外的研究都证明H2AX的修饰在调节各种细胞应答DNA双链断裂中起着中心作用[2-4].Giunta等的实验为rH2AX作为DNA双链断裂的标志提供了证据[5].而食管癌ECA109为高分化鳞状细胞癌,TE13细胞为低分化鳞状细胞癌,他们的生物学特征不同,研究r-H2AX在不同食管癌株系的动力学特点将有助于了解DNA双链断裂——这一细胞内致命的损伤的特点与食管癌放疗敏感性之间的关系.
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采用NCCLS M27-A方案微量法检测念珠菌对抗真菌药物的敏感性
为了解我国临床分离菌株对常用抗真菌药物的敏感性、观察氟康唑耐药株对伊曲康唑和酮康唑是否存在交叉耐药[1],本试验采用美国临床实验室标准化委员会(NCCLS) 1997年公布的M27-A方案的微量稀释法测定了6种常用抗真菌药物对80株念珠菌的MIC值。 一、材料与方法 1. 试验菌株:本试验所采用的菌株及其来源如下:受试菌株为80株念珠菌,包括:白念珠菌(Candida albicans) 47株(临床分离株40株、ATCC模式株2株和5株氟康唑耐药株)、近平滑念珠菌 (C. parapsilosis)9株(临床分离株7株、ATCC模式株1株和1株标准株)、热带念珠菌(C. tropicalis) 5株(均为临床株)、克柔念珠菌(C. krusei) 4株(临床分离株2株、ATCC模式株1株和1株标准株)、 光滑念珠菌(C. glabrata)5株(临床分离株4株、ATCC模式株1株)、乳酒念珠菌(C. keyfr) 4株(临床分离株3株、ATCC模式株1株)和季也蒙念珠菌(C. guiliermondii)2株(均为临床株)、葡萄牙念珠菌(C. lusitaniae)2株(1株临床株和1株ATCC模式株)、产朊念珠菌(C. utilis)2株(临床分离株1株、ATCC模式株1株)。其中模式株系北京医科大学真菌和真菌病研究中心保存株;标准株系日本千叶大学真菌医学研究中心(IFM)赠送;耐药株系比利时Janssen制药公司提供。
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侵染花生的辣椒褪绿病毒S RNA全序列分析
番茄斑萎病毒属(Tospovirus)是布尼亚病毒科(Bunyaviridae)中植物病毒组成的一个属, 病毒粒子为球状,直径80~110nm,粒体外层由一层脂质包裹.基因组属于负单链RNA,由三个片段组成,分别被称为L RNA、M RNA、和S RNA.L RNA为负链、含单个开放阅读框架(ORF),M RNA和S RNA均为双义RNA, 有2个ORF,反向相连.
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马铃薯Y病毒N株HC-pro基因的序列分析与表达
马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)是马铃薯Y病毒属(Potyvirus)的典型成员,是烟草、马铃薯和辣椒等茄科作物病毒病的主要病原之一,分布于世界各地.近年烟草上的 PVY在全国范围内特别是陕西、黄淮和东北烟区流行呈上升趋势,且以PVY坏死株系(PVY-N)为主,重病田发生率达40%以上,并常与烟草花叶病毒、黄瓜花叶病毒混合侵染,严重影响烟草品质造成巨大的经济损失.
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菘蓝不同四倍体株系有效成分的比较研究
目的:为优良菘蓝四倍体株系选育提供参考.方法:HPLC法分析靛蓝和靛玉红的含量,采用苯酚-硫酸法测定多糖含量,利用氨基酸分析仪测定氨基酸含量.结果:菘蓝四倍体株系根中靛蓝、靛玉红含量大多数高于二倍体株系,而叶中靛蓝和靛玉红含量不高于二倍体;四倍体株系根中的多糖含量均低于二倍体,其中以四倍体株系DB1、DB10和DB15根中多糖含量较高,DB6、DB13和DB15叶中多糖含量高;检测出17种氨基酸,其中必需氨基酸6种,而精氨酸和脯氨酸含量为高.其中DB7、DB8根和叶中的精氨酸含量均高;DB1、DB7和DB12脯氨酸含量高;DB7、DB9和DB12叶中总氨基酸含量高.结论:菘蓝不同四倍体株系有效成分表现不完全一致,生产上根据实际应用情况进行选用.
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枸杞株系硬枝扦插苗生长势比较研究
目的:对44个枸杞株系进行初选,为新品系的选育奠定基础.方法:单株筛选法.结果:通过对硬枝扦插萌芽率、成苗率的初步测定,筛选出22个较好株系,并进行了扦插苗株高、茎粗、根粗及根长的研究,结果表明,2009-26、2009-21、2009-17、2009-29、2009-2生长势较其他株系旺盛.结论:2009-26除根长外,生长势优于其他株系,可重点进行研究,为枸杞新品系的进一步筛选提供基础性材料.
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贴壁细胞培养过程中支原体污染的几种救治方案疗效比较研究
支原体是细胞培养中常见、不易被察觉和干扰实验结果的污染物,约有30.3%~50.5%的细胞培养物中有支原体污染[1].培养细胞中支原体污染的来源包括:所使用的动物来源的一些产品如血清或已被支原体污染的细胞株系.
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疟原虫动合子入侵按蚊中肠激活的先天性免疫防御反应
在观察疟原虫-蚊媒相互作用的过程中,发现一些很有趣的现象.经遗传选育的两个冈比亚按蚊抗性株,一个株系可通过黑化包被反应杀死入侵按蚊中肠上皮细胞的疟原虫动合子,另一个株系可将入侵中肠的动合子溶解.在疟原虫易感蚊株中也可见到通过尚未明白的机制使移行发育的疟原虫明显减少[1,2].
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类风湿因子对ELISA法检测肝炎病毒IgM类抗体的影响
类风湿因子(RF)是对变性免疫球蛋白IgG所产生的自身抗体,属多株系的自身抗体,主要为IgM型.在病毒性肝炎中RF阳性检出率较高,而人们已关注到RF在某种情况下可干扰部分病毒性肝炎免疫指标特别是IgM类抗体的检测.本实验用ELISA法测定肝炎病毒IgM类抗体阳性血清中的RF,然后用单抗人IgM诊断血清进行中和RF,再用ELISA法进行重复检测,以了解RF对IgM类抗体检测的影响.