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高频等位基因不平衡位点D6S1581与鼻咽癌的遗传易感性研究
目的探讨鼻咽癌高频等位基因不平衡位点D6S1581及在其附近克隆的鼻咽癌相关基因FBXO30与鼻咽癌发生的关系. 方法应用基因扫描技术,对12个湖南鼻咽癌高发家系、85例散发鼻咽癌患者及181名正常对照D6S1581位点进行了基因分型、参数/非参数连锁分析及关联分析.结果在鼻咽癌家系中D6S1581与鼻咽癌发病连锁,Lods值高为2.611436 (P=0.00245),关联分析结果也提示家族性鼻咽癌D6S1581等位基因频率与正常对照组差异有显著性(P<0.005).结论 D6S1581与湖南家族性鼻咽癌的发病之间可能有着密切的联系,该基因附近可能存在一个或多个与鼻咽癌发生发展有关的基因,FBXO30基因很可能就是其中之一.
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中国汉族人群四个STR的多态性及其与IDDM的相关性研究
目的 获得D15S657、D11S1369、D6S2420、D6S503位点在中国成都汉族人群中的群体遗传数据,并研究上述4种短串联重复序列(short tandem repeats,STR)的多态性与胰岛素依赖型糖尿病(insulin-dependent diabetes mellitus,IDDM)的关系.方法 应用PCR-polyacrylamide gel electrophoresis(PAGE)结合产物直接测序的技术,对105名无亲缘关系的成都地区正常汉族人和48例IDDM患者的上述4种STR的多态性进行分析.结果 D15S657位点发现7种等位基因,D11S1369位点发现5种等位基因,D6S2420位点发现7种等位基因,D6S503位点发现4种等位基因;4个STR位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡,杂合度分别为0.7524、0.6000、0.6286、0.6571,多态信息量分别为0.7616、0.4430、0.5345、0.5932.在IDDM组中,D15S657的等位基因A5,D11S1369的等位基因A5和D6S2420的等位基因A4的频率显著高于正常对照组(P值校正值均小于0.05).结论 4个STR均适合作为疾病关联分析、法医学鉴定和人类遗传学研究的遗传标记;中国汉族人群中D15S657、D11S1369、D6S2420的多态性与IDDM相关.
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MTHFR基因与精神分裂症及其认知功能障碍的关联研究
目的 探讨MTHFR基因677C/T位点对精神分裂症及相关认知功能的影响.方法 采用重复性神经心理状态测验(repeatable battery for the assessment of neuropsychological status,RBANS)测试254例稳定期精神分裂症患者、339名遗传学正常对照者、72名认知功能评估正常对照者的认知功能,应用PCR-限制性片段长度多态性方法技术,对677C/T位点进行基因分型.结果 病例组与对照组在677C/T位点基因型和等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05);在RBANS评估中,病例组的即刻记忆、视觉广度、言语功能、注意、延时记忆及总分评分显著低于对照组,差异有统计学意义(P<0.01);携带677C/T位点3种基因型患者的RBANS测试中即刻记忆、注意和总分比较,差异有统计学意义(P<0.05).结论 本研究结果并不支持MTHFR基因作为精神分裂症的易感基因,但提示该基因参与了精神分裂症认知功能障碍的形成过程,尤其是即刻记忆和注意异常.
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20号染色体与X染色体上的8个SNP位点与云南汉族雄激素性脱发的相关性
目的 探讨20号染色体上4个SNP位点(rs6152、rs16990427、rs1352015、rs1385699)以及X染色体上4个SNP位点(rs6137444、rs2180439、rs913063、rs1160312)与云南汉族雄激素性脱发的相关性.方法 采用病例-对照关联分析,建立8-SNPs复合扩增体系,应用SNaPshot方法检测115例男性雄激素性脱发患者和125例健康男性20号染色体及X染色体基因上8个SNPs位点的基因型.采用SPSS17.0、Haploview4.2、SHEsis和MDR软件进行统计学分析.结果 X染色体上的4个SNP位点的分布在病例组与对照组之间无差异.rs2180439、rs913063、rs1160312基因型频率在两组中的差异具有统计学意义(P＜0.05),病理组rs2180439 T等位基因显著多于对照组(P＜0.05),病理组rs913063和rs1160312 A等位基因显著高于对照组(P＜0.05).由rs6137444-rs2180439-rs913063-rs1160312构建的C-T-C-G、T-C-C-G和T-T-A-A单倍型的分布在两组中的差异具有统计学意义(P＜0.05),rs6137444、rs21804393与rs1160312之间存在较强的协同交互作用.结论 X染色体可能与云南汉族雄激素性脱发无相关性.rs2180439、rs913063、rs1160312多态性与云南汉族雄激素性脱发相关联,携带rs2180439 T等位基因、rs913063和rs1160312 A等位基因者更易发生雄激素性脱发.
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云南地区HLA-G基因3'非翻译区三个位点多态性与系统性红斑狼疮的关联研究
目的 探讨云南地区人群系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)与HLA-G基因3'非翻译区(3' untranslated region,3'UTR)3个位点(+2960 14 bp插入/缺失、+3035C/T和+3142C/G)多态性的关联性.方法 应用DNA序列测序法对云南地区206例SLE患者及212名健康对照者的HLA-G基因上述3个多态性位点进行基因分型.结果 HLA-G 3'UTR区14 bp插入/缺失和+3142C/G等位基因和基因型频率在SLE组和对照组间的差异均无统计学意义(P＞0.05),+3035T等位基因在SLE组的频率显著高于对照组,差异有统计学意义(P=0.002,OR=1.604,95％CI:1.186～2.169).在显性遗传模式下,SLE组中(CT+TT)的OR值为2.004 (95％CI:1.345～2.987,P=0.0006).结论 HLA-G 14 bp插入/缺失和+3142C/G多态性与云南地区人群SLE易感性无显著相关性,而+3035C/T多态性与云南地区系统性红斑狼疮易感性相关,+3035T等位基因可能是云南地区SLE发生的危险因素.
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ETS1基因与中国北方汉族人群系统性红斑狼疮的相关性研究
目的 验证ETS1基因在北方汉族人群系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)发生中的作用.方法 应用病例-对照关联研究,在山东汉族人群中收集231例SLE患者和474名正常对照,采用Taqman探针对ETS1基因3’非翻译区区域单核苷酸多态位点rs1128334与rs4937333进行基因分型,并对数据进行统计学计算和单倍型分析.结果 rs1128334等位基因A在病例组中的频率显著高于对照组(42.8％ vs.29.1％,OR=1.824,95％CI:1.445～2.302,P＜0.01),rs4937333等位基因T在病例组中的频率显著高于对照组,差异具有统计学意义(47.6％ vs.38.1％,OR=1.478,95％CI:1.181～1.851,P＜0.01).两位点的单倍型分析显示单倍型A-T与SLE的发病风险显著相关(P＜0.05,OR=0.738,95％CI:0.564～0.964),而单倍型G-C可以显著降低SLE的发病风险(P＜0.01,OR=0.296,95％CI:0.232～0.378).结论 ETS1基因rs1128334和rs4937333位点与北方汉族人群系统性红斑狼疮相关.
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精神分裂症与NOS1多态性的关联研究
目的 探讨一氧化氮合酶1(nitric oxide synthase 1,NOS1)基因多态性与精神分裂症易感性的相关性.方法 选取NOS1区域的28个标签单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,应用Illumina GoldenGate定制芯片对382例汉族精神分裂症患者和448名正常人的DNA进行分型,并分析其与精神分裂症的相关性.结果 单位点分析提示SNP位点rs1520811与精神分裂症存在关联,但是经过Bonferroni多重校正后差异无统计学意义(P＞0.05).单体型分析未发现单体型与精神分裂症的相关性.结论 未证实NOS1为精神分裂症的易感基因.
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OX40基因rs2298212位点与汉族人群冠状动脉粥样硬化疾病的关联研究
目的 探讨OX40基因(TNFRSF4)rs2298212G/A位点与山东汉族人群冠状动脉粥样硬化疾病的相关性.方法 在山东大学齐鲁医院心内科和健康体检中心分别收集到冠状动脉粥样硬化疾病患者536例和正常对照544名,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法 对OX40基因rs2298212G/A多态性位点进行基因分型,并对数据进行统计分析.结果 基因型与等位基因频率分布在病例组与对照组之间差异均无统计学意义(P＞0.05).在回归校正了年龄、性别、体重指数、收缩压、舒张压、血糖、总胆固醇及甘油三酯等因素的影响后,基因型频率分布差异仍无统计学意义(P＞0.05).在对冠状动脉受累支数进行的分层分析发现,受累1支与受累3支之间,基因型与等位基因频率分布差异均有统计学意义(P＜0.05).结论 OX40基因rs2298212G/A多态位点同山东汉族人群冠状动脉粥样硬化疾病之间无关联性存在,但该位点可能与冠状动脉粥样硬化的严重程度相关.
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单胺氧化酶A基因多态性与精神分裂症的关联研究
目的 探讨河南地区汉族人群单胺氧化酶A(monoamine oxidase A,MAOA)基因多态性与精神分裂症的关系.方法 参照CCMD-3诊断标准,选取212例精神分裂症患者与168名正常对照,应用聚合酶链反应及限制性片段长度多态性技术检测MAOA基因多态性,采用病例-对照的关联分析方法对精神分裂症患者及正常对照的基因型和等位基因频率进行分析.结果 (1)MAOA基因的基因型在患者组和对照组中均符合Hardy-Weinberg平衡定律(χ2=0.618,df=2,P＞0.05;χ2=3.173, df=2,P＞0.05).(2)MAOA基因的基因型和等位基因频率在患者组与对照组间的分布差异无统计学意义(P＞0.05).(3)按性别分组,男性患者组中CT基因型分布频率显著高于男性对照组(χ2=7.654,P=0.022).(4)MAOA基因的基因型和等位基因频率在家族史阴、阳性间的分布差异无统计学意义(P＞0.05).结论 没有发现MAOA基因多态性与汉族精神分裂症的发病有关联,但对性别发病有影响,基因型CT可能是男性精神分裂症发病的易感因素.
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雌激素受体2基因多态性与妊娠期肝内胆汁淤积症关联分析
目的 探讨雌激素受体2基因(estrogen receptor 2,ESR2)多态性与成都地区妊娠期肝内胆汁淤积症(intrahepatic cholestasis of pregnancy,ICP)的关联.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术,对成都地区100例ICP患者(ICP组)和100名正常孕妇(对照组)ESR2第5外显子RsaⅠ酶切多态和第8外显子AluⅠ酶切多态进行分析.结果 (1) ESR2第8外显子AluⅠ酶切多态分析表明ICP组A等位基因频率显著高于对照组(P=0.031,OR=1.975),ICP组含等位基因A的Aa+AA基因型频率也显著高于对照组(P=0.028,OR=2.144);(2)两组ESR2第5外显子RsaⅠ酶切多态基因型rr、Rr、RR频率和等位基因r、R频率的比较,差异均无统计学意义(P＞0.05).结论 ESR2第8外显子AluⅠ多态可能与成都地区ICP易感性有关,含等位基因A的Aa和AA基因型可能增加ICP发病风险;而ESR2第5外显子RsaⅠ多态与成都地区ICP发病风险无关联.
关键词： 妊娠期肝内胆汁淤积症 雌激素受体2 限制性片段长度多态性 关联分析 -
COL1A1基因PCOL2和Sp1结合位点多态与先天性髋脱位的关联分析
目的研究Ⅰ型胶原α1链 (collagen typeⅠalpha 1, COL1A1)基因PCOL2和Sp1结合位点多态性在中国北方人群中的分布,并探讨其与先天性髋脱位(congenital dislocation of the hip, CDH)的关系.方法在81个CDH核心家系的243名成员中,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析方法,对位于 COL1A1基因启动子内的PCOL2多态(-1997 G/T)和转录调控区第1内含子内的Sp1多态(1546 G/T)进行基因分型,并进行传递不平衡检验.结果 COL1A1基因PCOL2结合位点G/T多态与CDH不存在明显关联(P=0.537),中国人PCOL2多态位点的基因型和等位基因频率分布与西班牙白人群和美国白人群差异存在统计学意义;Sp1结合位点只检测到SS基因型,未检测到Ss或ss基因型.结论 COL1A1基因PCOL2和Sp1结合位点多态存在种族差异,PCOL2和Sp1结合位点多态可能与中国人CDH的发病风险无关.
关键词： 先天性髋脱位 Ⅰ型胶原α1基因 限制性片段长度多态性 关联分析 -
血管紧张素原基因M235T多态性与肥厚型心肌病的关系
目的探讨血管紧张素原(angiotensinogen,AGT)基因M235T变异与肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)的关系. 方法对72例HCM患者与80名正常对照者进行病例-对照研究.采用聚合酶链反应与限制性片段长度多态性技术检测AGT基因M235T变异.同时通过M型二维超声心动图分别测量室间隔、左室后壁和心尖部心肌厚度.结果 (1)经PCR扩增及Tth 111 Ⅰ酶切,AGT基因型有3种形式:MM、TT与MT基因型.两组AGT基因型的分布均符合Hardy-Weinberg平衡.(2)AGT基因M235T基因型在HCM组与对照组的分布差异有显著性(χ2=6.090, P＜0.05).HCM组TT基因型与T235等位基因的频率均高于对照组 (TT基因型:0.63 vs 0.45,OR=2.037,95% CI:1.064～7.899,P＜0.05;T235等位基因:0.78 vs 0.64,OR=1.990,95%CI:1.197～3.308,P＜0.01).(3)HCM组TT基因型患者左室壁厚处平均厚度明显大于MM、MT基因型患者[(19.1±4.8)mm vs (15.3±2.6)mm 与(16.2±5.1)mm,F=4.261,P＜0.05].结论 AGT基因M235T变异与HCM的发病显著相关,TT基因型或T235等位基因可能是参与HCM发生及加重心肌肥厚的一个遗传方面的危险因素.
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基质金属蛋白酶9基因多态性与汉族女性青少年特发性脊柱侧凸的关联分析
目的 探讨基质金属蛋白酶9 (matrix metalloproteinase 9,MMP9)基因多态性与汉族女性青少年特发性脊柱侧凸(adolescent idiopathic scoliosis,AIS)发生和发展的关系.方法 以rs17576、rs2250889、rs1805088 3个标签单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)作为遗传标记,通过TaqMan荧光探针法对190例AIS患者和190名年龄匹配汉族女性正常对照进行等位基因分型.对结果进行Hardy-Weinberg遗传平衡检验、Pearson x2检验、非条件Logistic回归分析、连锁不平衡检验和单倍型分析,并分析基因型与表型的关系.结果 正常对照组rs17576、rs2250889、rs1805088 3个位点基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05)；基因型-表型分析发现rs2250889位点基因型为CC的患者的大Cobb角(48.50°)大于基因型为GG(25.98°)或GC(28.35°)者(P＜0.05),其侧凸程度较严重.结论 目前尚不能认为MMP9基因是汉族女性AIS的易感基因,但rs2250889纯合变异者脊柱侧凸较严重,提示MMP9异常可导致脊柱侧凸的进展.
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线粒体基因突变糖尿病家系资料及致病基因突变研究的统计模型探讨
目的探讨线粒体基因突变糖尿病致病基因突变研究资料的合适统计模型,探索线粒体基因突变糖尿病的致病基因突变点,为疾病防治提供科学依据.方法采用关联分析、多水平模型和广义估计方程,对线粒体基因突变糖尿病相关基因突变点与该病的关系进行分析和比较.结果家系内关联分析发现nt3434 A-G的突变有统计学意义.多水平模型未发现有统计学意义的突变点,广义估计方程分析发现nt3434 A-G和nt3205 A-C的突变都有统计学意义,且两突变分属于两个不同的家系.结论 nt3434 A-G有可能为线粒体基因突变糖尿病的基因诊断提供有意义的突变点,nt3205 A-C也不容忽视.线粒体基因突变糖尿病存在遗传异质性.
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虎骨及其替代品的聚类分析和关联分析
目的探讨虎骨及其替代品之间的相互关系,为虎骨替代品的研究提供科学依据.方法应用模糊数学中的聚类分析和关联分析方法,对虎骨、熊骨、豹骨、黄牛骨、猪骨、狗骨和猫骨的15种微量元素和18种氨基酸含量进行分析.结果虎骨及其替代品的聚类分析和关联分析结果表明,在虎骨的替代品中,狗骨与虎骨为接近.结论狗骨来源丰富,是虎骨的佳替代品.
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白术类方的药证关联分析
应用关联规则的方法,通过对321首白术方的数据挖掘试验,深入剖析了药物与药物、药物与证之间的关联,发现白术类方的药物配伍规律及白术的临床用药特点对大量白术方的方药和证候进行了分析处理,发现在治疗脾胃病证的方剂中,白术的用药规律及其药证特点,为临床及实验研究提供了进一步探索的线索和目标.
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PRDM16、TRPM8、TSPAN2及MMP16等基因多态性与无先兆偏头痛关联性研究
目的：探讨中国西南地区汉族人群中PRDM16、TRPM8、TSPAN2及MMP16等基因多态性与无先兆偏头痛遗传易感性关系。方法共收集512例无先兆偏头痛和535例健康正常对照,运用病例-对照分析,荟萃分析目前国内外报道的全基因组关联分析( genome-wide association studies,GWAS),单碱基延伸法( SNaPshot)进行多个基因11个SNP 位点的基因分型。结果 rs2651899(PRDM16),rs10166942(TRPM8),rs12134493(TSPAN2)和rs10504861(MMP16)与无先兆偏头痛发病具相关性。结论本研究重复了以前GWAS结果,PRDM16, TRPM8, TSPAN2, MMP16基因的SNP位点与无先兆偏头痛发病相关。
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亚甲基四氢叶酸还原酶基因C677T多态性与川东北人群缺血性脑卒中的关联
目的 探讨亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T多态性与川东北地区人群急性缺血性脑卒中(IS)发病的相关性.方法 以70岁以下的大动脉粥样硬化脑梗死为研究对象,采用PCR-RFLP(限制性片段长度多态性)方法检测C677T的基因型,在3个遗传模式下分析C677T多态性与IS的相关性.结果 180例患者和173例对照纳入分析,发现TT基因型(OR:1.965,95％CI:1.100～3.511,P=0.022)和T等位基因(OR:1.364,95％CI:1.009～1.845,P=0.044)增加了IS的发病风险.结论 MTHFR基因C677T多态性与四川东北人群IS发病密切相关.
关键词： 缺血性脑卒中 脑梗死 亚甲基四氢叶酸还原酶 MTHFR 关联分析 -
IL1R1和IL1R2基因多态性与缺血性脑卒中患病风险的相关性
目的:研究IL1R1和IL1R2基因多态性与缺血性脑卒中患病风险的相关性.方法:选择缺血性脑卒中患者及同期健康人群各300例分别作为病例组和对照组,采用Sequenom MassARRAY SNP基因分型技术检测2组受试者外周血中IL1R1和IL1R2基因单核苷酸多态性(SNP)位点rs11674595、rs3218896、rs3218977、rs2072472、rs 10490571、rs956730、rs3917225及rs3917318的多态性,以相对优势比(OR)及95％可信区间(95％CI)评估SNP与缺血性脑卒中患病风险的关系;引入共显性、显性、隐性和加性4个遗传模型,评估有相关性的SNP位点等位基因风险.结果:通过比较病例和对照组之间各位点的小等位基因频率,结果显示3个位点与增加缺血性脑卒中风险具有相关性,分别是rs11674595位点(OR=1.344,95％ CI为1.083～1.668,P=0.007)、rs10490571位点(OR=1.284,95％CI为1.018 ～ 1.620,P=0.035)和rs3917225位点(OR=1.282,95％ CI为1.059 ～1.553,P=0.011);遗传模型分析结果显示,在显性模型下有3个位点与缺血性脑卒中患病风险显著相关,其中rs11674595位点携带C/T和C/C基因型的个体患缺血性脑卒中的风险显著增高,是携带T/T基因型的1.55倍(OR=1.55,95％ CI为1.16～ 2.06,P=0.002 8);rs1 0490571位点携带C/T和T/T基因型的个体患缺血性脑卒中的风险显著增高,是携带C/C基因型的1.51倍(OR=1.51,95％ CI为1.12 ～2.02,P=0.0068);rs3917225位点携带A/G和G/G基因型的个体患缺血性脑卒中的风险显著增高,是携带A/A基因型的1.50倍(OR=1.50,95％ CI为1.12 ～2.03,P=0.005 9).结论:IL1R1基因上rs10490571、rs3917225位点和IL1R2基因上rs11674595位点与缺血性脑卒中患病风险增高具有相关性.
关键词： 缺血性脑卒中 白细胞介素-1受体基因 遗传模式 单核苷酸多态性 关联分析 -
OBFC1基因多态性与脑胶质瘤患病风险的相关性
目的:研究OBFC1基因多态性与脑胶质瘤患病风险的相关性.方法:选择脑胶质瘤患者200例和健康对照人群200例,分别采集血样,采用MassARRAY方法对OBFC1基因的rs9325507、rs3814220、rs12765878、和rs11191865位点的基因型进行测定,采用x2检验比较两组被检者四个位点等位基因频率差异,统计基因多态性与脑胶质瘤患病风险的相关性.结果:OBFC1基因rs9325507位点的等位基因“T”,rs3814220位点的等位基因“G”,rs12765878位点的等位基因“C”和rs11191865位点的等位基因“A”均显著降低脑胶质瘤的患病风险(P＜0.05);引入遗传模型后,在佳模型-显性模型下rs9325507位点携带T/C和T/T基因型个体的脑胶质瘤患病风险显著降低,是携带C/C基因型的0.62倍;rs3814220位点携带G/A和G/G基因型个体的脑胶质瘤患病风险显著降低,是携带A/A基因型的0.62倍;rs12765878位点携带C/T和C/C基因型个体的脑胶质瘤患病风险显著降低,是携带T/T基因型的0.62倍;rs11191865位点携带A/G和A/A基因型个体的脑胶质瘤患病风险显著降低,是携带G/G基因型的0.65倍;单体型分析结果显示TGCA单体型会显著降低脑胶质瘤的患病风险.结论:OBFC1基因上rs9325507、rs3814220、rs12765878、和rs11191865位点与降低脑胶质瘤的患病风险可能具有相关性.
