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λ干扰素在丙型肝炎中的研究进展
IFN-λ是近年来发现的Ⅲ型IFN[1-2],与Ⅰ型IFN -样,均可通过激活Janus激酶信号转导及转录激活子(Janus kinase signal transducer and activator of transcription,JAK-STAT)通路来完成信号传递,因此IFN-λ显示了与IFN-α相似的抗病毒、抑制肿瘤细胞生长以及免疫调节等生物学活性,但由于其特异性受体分布的不同而表现出骨髓抑制作用弱、不良反应少、生物学作用长而稳定等优势.全基因关联分析发现,IFN-λ相关的单个核苷酸的多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与原发清除HCV 以及IFN抗HCV疗效之间密切相关,临床试验结果亦显示了IFN-λ的安全性和有效性,因此,IFN-λ有望在不久的将来成为一个新的抗HCV基因工程药物.
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5-HT6受体基因多态与精神分裂症患病风险的关联分析
目的 探讨5-HT6受体基因多态与中国汉族精神分裂症患病风险的关系.方法 入组居住在上海及周边地区的汉族精神分裂症患者333例和健康对照365例,通过TaqMan探针SNP基因分型技术对5-HT6受体基因及基因上游7kb区域的标签SNPs rs3790756和rs4912138进行基因分型,并进行统计分析.结果 发现SNPs rs3790756 和rs4912138的基因型和等位基因频率分布在精神分裂症病例组和健康对照之间差异未达到统计学意义.进一步进行基因型联合分析,rs3790756和rs4912138共组成7种联合基因型,7种联合基因型在病例组和健康对照组间的分布有显著性差异(χ2=13.5,P<0.05),其中rs3790756CC和 rs4912138AG组成的联合基因型在病例组和对照组中的频率分别为18.3%和27.1%,相对危险度为0.603(P<0.05).结论 研究提示5-HT6受体基因多态rs3790756和rs4912138组成的CCAG联合基因型可能与精神分裂症的风险降低有关.
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国内抑郁症遗传学研究
遗传学常用的研究方法包括流行病学调查与分子遗传学研究.流行病学调查包括家系研究、双生子研究、寄养子研究,以及将与先证者有血缘关系亲属的患病率与人群患病率进行比较以推断疾病是否存在家族聚集性、遗传因素在疾病发生中的作用.分子遗传学研究是应用分子遗传学原理在基因水平分析疾病的易感性,包括连锁分析与关联分析.
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肿瘤坏死因子α的单核苷酸多态性与中国汉族人强直性脊柱炎的关联分析
目的:在中国汉族强直性脊柱炎(AS)患者中,检测TNF-α基因中的单核苷酸多态性(SNPs).方法:在107例AS患者和116名正常对照中,用直接测序法和实时动态荧光PCR结合等位基因特异扩增,对TNF-α基因中的3个启动子上的SNPs(-1 031T/C,-863C/A, -857C/T)和 2个内含子上的SNPs (内含子1的+123C/T和内含子3的+51A/G)进行基因分型,分析单个位点的等位基因和基因型频率是否与AS相关.用单倍型推测软件计算上述位点单倍体型频率的分布,分析这些单倍体型是否与AS的发病有关.结果:在AS患者中,TNF-α的-857T和-863A的等位基因频率及它们的基因型频率显著性地超过健康对照组,经Bonferroni校正后仍为阳性.对启动子上3个SNPs位点的两两和3个位点组合的单倍体型频率分析表明,其在AS 患者和对照组中也均存在极其显著的差异(P<0.01).在3个位点推测的单倍体型中,AS患者增加显著的是TNF-1 031T/-863C/-857T单倍体型.结论:TNF-α基因上2个SNPs及单倍体型与中国汉族AS之间存在显著的相关性.
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ANK3基因在精神分裂症认知功能障碍发生中的作用研究
目的·探讨ANK3基因对精神分裂症患者认知功能的影响.方法·收集稳定期精神分裂症患者254例,健康对照者72名,采用重复性神经心理状态测验(RBANS)测试研究对象认知功能,使用TaqMan试验方法对ANK3基因rs10994336位点多态性进行基因分型.结果·病例组与对照组间性别比较差异无统计学意义(P=0.18),年龄及受教育年限比较差异有统计学意义(P＜0.01);RBANS测试中,患者组的即刻记忆、视觉广度、言语功能、注意力、延时记忆及总分评分显著低于对照组(P＜0.01);携带rs10994336位点3种不同基因型患者的RBANS测试中即刻记忆、注意力、延时记忆和总分比较差异有统计学意义(P＜0.01),其中携带T/T基因型者RBANS评分显著低于携带C/C基因型者.结论·ANK3基因与精神分裂症患者认知功能障碍存在显著关联,尤其是即刻记忆、注意和延时记忆方面,提示ANK3基因可能参与了精神分裂症认知功能障碍的形成过程.
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神经肽Y基因多态性和精神分裂症的关联研究
目的·探讨中国汉族人群神经肽Y(NPY)基因多态性与精神分裂症的相关性.方法·采用TaqMan探针基因分型技术对678例精神分裂症患者(病例组)及685例正常对照者(对照组)的NPY基因多态性(rs16148、rs1859290、rs16147、rs16478)进行分型.应用SHEsis在线软件比较各组间的等位基因频率、基因型频率、单倍型频率分布有无差异.结果 ·rs16478位点基因型频率分布在成年起病精神分裂症(AOS)组和对照组间存在边缘统计学差异(χ2=6.66,P=0.036,P校正=0.144).在隐性模式下,rs1859290位点CC基因型的频率分布在男性病例组和对照组间差异有统计学意义(P=0.012,OR=0.97,95％CI为0.94～0.99,P校正=0.048).单倍型CCTA(由rs16148、rs1859290、rs16147、rs16478构成)的频率分布在男性AOS组和对照组间的差异有统计学意义(8.1％vs 13.2％,OR=0.57,P=0.010,P校正=0.040).结论·在中国汉族人群中,NPY基因可能是精神分裂症的易感基因.
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DRD4 exon Ⅲ基因多态性与抽动秽语综合征共病抑郁的关系
目的 了解多巴胺D4受体(DRD4)基因第3外显子48 bp可重复序列多态性(DRD4 exonⅢ48 bpVNTR)与抽动秽语综合征(TS)共病抑郁的关系.方法 选取符合美国精神疾病诊断统计手册第4版TS诊断标准的112例儿童作为研究对象(TS组),以71名健康儿童作为正常对照组.采用聚合酶链反应(PCR)等位基因分型技术检测DRD4 exonⅢ48 bp VNTR多态位点,分析该位点与TS的关联;采用儿童抑郁量表(CDI)测定TS儿童的抑郁水平.结果 112例TS儿童中29例(25.9％)共病抑郁.TS组及其亚组DRD4exonⅢ48 bp VNTR位点基因型及等位基因频率与正常对照组比较,差异均无统计学意义(P＞0.05).在TS组内,携带长重复等位基因组(61例)与短重复等位基因组(51例)CDI总分和因子分比较,差异均无统计学意义(P＞0.05).结论 DRD4 exonⅢ48 bp VNTR与TS共病抑郁之间可能不存在关联.
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肿瘤坏死因子-α基因与精神分裂症的关联研究
目的:探讨肿瘤坏死因子-α(TNF-α)基因rs1800629位点与精神分裂症及其临床特征的关系.方法:采用TaqMan探针SNP基因分型技术对稳定期精神分裂症患者(患者组)254例和健康对照者(正常对照组)339名TNF-α基因rs1800629位点进行分型;采用阳性和阴性症状量表(PANSS)评定患者组精神病性症状,分析比较rs1800629位点3种不同基因型间症状严重程度.结果:患者组与正常对照组TNF-α基因rs1800629位点基因型的观察值和期望值Hardy-Weinberg平衡吻合度良好(χ2=2.70,P=0.10;χ2=2.58,P=0.11);患者组与正常对照组在rs1800629位点基因型和等位基因频率分布比较,差异无统计学意义(χ2=3.16,P=0.21;χ2=3.44,P=0.06);携带A等位基因患者阳性症状分、阴性症状分、一般病理分及PANSS总分较不携带A等位基因患者更高(F=6.03,P=0.015;F=14.82,P=0.000;F=42.02,P=0.000;F=35.19,P=0.000).结论:TNF-α基因rs1800629位点可能与精神分裂症无关;但与疾病的严重程度有关.
关键词： 精神分裂症 肿瘤坏死因子-α基因 临床表型 关联分析 -
丝裂酶原活化蛋白激酶1基因多态性与中国汉族阿尔茨海默病的关联研究
目的：：研究探讨丝裂酶原活化蛋白激酶1(MAPK1)基因在中国汉族阿尔茨海默病(AD)发生过程中的作用。方法：根据《美国精神障碍诊断和统计手册》( DSM-IV)和美国国立神经病、语言功能紊乱和脑卒中研究所及AD和相关疾病协会临床诊断标准(NINCDS-ADRDA)，收集中国东部和西南部人群 AD 患者715例和健康对照者760人。选取 MAPK1基因3个标签多态性位点 rs2276006、rs1063311和rs2006893。采用SNaPshot SNP分型技术对这3个SNP位点进行分析。结果：中国东部和西南部人群AD组与对照组间MAPK1基因各位点基因多态性及等位基因分布频率差异无统计学意义(P>0.05)；东部及西南部人群合并后AD组与对照组间MAPK1基因各位点基因多态性及等位基因分布频率差异无统计学意义(P>0.05)，连锁不平衡检验显示各SNP 位点之间存在强连锁(D'>0.95)，单体型分析结果显示病例组与对照组间单体型估计频率差异无统计学意义(P>0.05)。结论：MAPK1基因可能不是中国汉族AD的主要致病基因。
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壮族人寻常性银屑病与HLA-DQA1和DQB1基因的相关性研究
越来越多的证据表明,遗传因素和免疫学因素在银屑病的发病中起着重要的作用[1].疾病的关联分析和基因扫描技术揭示,多个基因特别是白细胞抗原(HLA)基因某些位点与银屑病的发病有关,并存在种族、地域的差异.
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药物动力学与抗药抗体关联分析在生物类似药DT038相似性评价中的应用
基于临床前药代/毒代/药效动力学(PK/TK/PD)比对研究整体证据,并结合与免疫原性检测结果(主要为抗药抗体ADA)的关联分析,评价候选药DT038与参照药DT038-R的相似性.汇总食蟹猴单次皮下注射给药药代动力学和重复给药毒性比对试验中的PK、TK和临床疗效相关的PD数据,并与个体动物的ADA产生情况进行关联分析,基于证据整体性原则对候选药与参照药在动物体内的相似性做出初步判断.在相同剂量下,候选药和参照药的体内药代动力学参数无统计学差异;药效学生物标志物碱性磷酸酶ALP和骨钙素Osteocalcin的变化趋势均与血药浓度呈现相关性;由于ADA的产生加速了药物的消除和/或中和了药物的活性,候选药和参照药组ADA阳性动物个体的PK/TK参数和药效学标志物均呈现ADA相关性改变.总体来讲,候选药和参照药上述指标的体内变化特征相似.基于候选药和参照药在食蟹猴体内PK/TK/PD指标变化特征整体证据以及与ADA检测结果的关联分析,认为候选药与参照药在动物体内的行为相似,支持其按照生物类似药进行临床相似性研究.
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治疗痛经方药的关联规则分析
目的 应用关联规则方法探讨治疗痛经方药的用药规律. 方法 应用计算机检索中医方剂数据库(源于<中医方剂大辞典>)有关治疗痛经的217首方剂,以EXCEL 2000软件建立数据库,收录每首方剂中的单味药进行统计分析.应用关联规则 方法 中Apriori算法分析方剂中药对的应用规律. 结果 在治疗痛经的217首方剂中共使用427种药物2 450频次.其中,使用频次在10次以上的依次为当归、川芎、延胡索、赤芍、香附等56味中药, 使用总频次为1 622次;关联规则方法分析出使用频次在10次以上的药对当归-川芎、当归-白芍、当归-香附等389对.结论运用用药频率统计与关联规则等数据挖掘方法,能较好地发现中医临床治疗痛经方药的用药规律,为临床遣方用药提供理论指导.
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雌激素受体2基因多态性与青年胃腺癌的关联分析
目的 探讨雌激素受体2基因(ESR2)多态性与盐城地区青年胃腺癌的关联.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术,对盐城地区100例青年胃腺癌患者(胃腺癌组)和100名青年胃溃疡患者(对照组)ESR2第5外显子Rsa Ⅰ酶切多态和第8外显子Alu Ⅰ酶切多态进行分析.结果 (1)ESR2第8外显子Alu Ⅰ酶切多态分析表明,胃腺癌组A等位基因频率明显高于对照组(P＜0.05,OR=1.975),胃腺癌组含等位基因A的Aa+AA基因型频率也明显高于对照组(P＜0.05,OR=2.144);(2)两组ESR2第5外显子Rsa Ⅰ酶切多态基冈型rr、Rr、RR频率和等位基因r、R频率的比较,差异均无统计学意义(P＞0.05).结论 ESR2第8外显子Alu Ⅰ多态可能与盐城地区青年胃腺癌易感性有关,含等位基因A的Aa和AA基因型可能增加青年胃腺癌发病风险;而ESR2第5外显子Rsa Ⅰ多态与盐城地区青年胃腺癌发病风险无关联.
关键词： 胃腺癌 雌激素受体2 限制性片段长度多态性 关联分析 青年 -
BDNF基因多态性与老年抑郁症及认知功能的关联研究
目的:探讨脑源性神经营养因子(BDNF)基因多态性(Val66Met)与老年抑郁症及认知功能的关系.方法:对符合入组及排除标准的老年抑郁症患者组(106例)及健康对照组(175例)进行临床资料收集与血样采集,检测BDNF基因多态性;患者组进行神经心理学测验评估认知功能.结果:中国江苏省汉族老年抑郁症患者BDNF Val66Met基因多态性存在AA/AA、AA/AG和GG/GG型3种基因型,但与患病风险不存在关联性(OR =0.815,95％ CI:0.578～1.149);老年抑郁症患者华文认知能力量表的数字广度、图形类推和巧拼积木在BDNF各基因型之间的差异有统计学意义(F=3.515,4.935,9.79,均P＜0.05).结论:BDNF基因多态性(Val66Met)在江苏汉族老年抑郁症患者中的分布差异无统计学意义,但该基因多态性可能与老年抑郁症患者的认知功能有关.
关键词： 老年抑郁症 BDNF Val66Met 认知功能 关联分析 基因多态性 -
香港地区汉族人群下颌前突与候选基因GHR多态性关联研究
目的 目前国内外对下颌骨前突易感基因定位的研究主要集中在连锁分析研究.文中探讨香港地区汉族人群候选基因生长激素受体(GHR)基因单核苷酸多态性(SNP)与下颌前突的相关性.方法 收集2006年9月至2009年6月期间香港大学牙医学院菲腊牙科医院435例受试者静脉血,其中下颌前突患者211例(下颌前突组)、咬合关系与面型正常患者224例(对照组).挑选7个位于GHR基因的标签SNPs(tSNP).采用MassARRAY系统进行基因分型,对单个SNP和单倍型进行关联分析.结果 SNP rs6898743显示基因型和等位基因频率两组间差异有统计学意义(P=0.036、P=0.015).rs6898743等位基因G频率在下颌前突组比对照组减少,显著性减低下颌前突的风险(OR=0.72、95％CI 0.55～0.94).连锁不平衡分析显示两组间比较单倍型GAA和GAG差异有统计学意义(P=0.014、P=0.012).结论 GHR基因SNP位点rs6898743与香港地区汉族人群下颌前突存在关联性.
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早期生长因子1和晶状体蛋白α-A基因多态与近视的关联性研究
目的 本实验通过关联分析,研究早期生长因子1(EGR1)和晶状体蛋白α-A (CRYAA)基因的标签单核苷酸多态性(tSNPs)与人类近视的关系.方法 实验研究.抽取2870名志愿者外周静脉血并制备DNA,其中包括1052名对照者(对照组)、615名中度近视患者(近视组1)、640名高度近视患者(近视组2)和563名先天性高度近视患者(近视组3).分别用直接测序和限制性片段长度多态性( RFLP)的方法对EGR1基因的1个tSNP(rs11743810)和CRYAA基因的2个tSNPs(rs872331、rs3788061)进行基因型分析；然后用x2检验分析tSNPs与近视易感性的关系.结果 对于EGR1基因的1个tSNP和CRYAA基因的2个tSNPs的基因型和等位基因频率,近视(全部)组和对照组之间差异无统计学意义(rs11743810:P=0.700、0.922;rs872331:P=0.377、0.166；rs3788061:P=0.444、0.303).近视各组与对照组分别进行比较,差异也无统计学意义.结论 EGR1和CRYAA基因的多态与本组人类近视的遗传易感性无关.与动物模型不同,EGR1对人类近视的遗传易感性很可能没有明显影响.
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全基因组关联分析对银屑病遗传学研究的启示
银屑病是一种常见的免疫异常性增殖性皮肤病.临床特征为皮肤表面履盖大量厚实的鳞屑性斑片.虽然已有大量家族性研究资料表明银屑病的发病存在着遗传因素,但是该病的遗传模式至今尚不清楚.大量研究表明:复杂性疾病的遗传学研究除了MHC的一些位点的相关结果比较恒定外,绝大多数的研究结果变异较大.全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)是一种对全基因组范围内的常见遗传变异(单核苷酸多态性和拷贝数变异)进行总体关联分析的方法,在全基因组范围内进行整体研究,能够一次性对疾病进行轮廓性概览,适用于包括银屑病在内的复杂疾病的研究.运用全基因组关联分析对银屑病进行的三个研究,刊登在今年2月的<自然-遗传学>杂志,结果发现了几个银屑病的遗传学易感位点,提示在免疫学和其它领域的几个信号通路可能参与了该病的发病机制.无论是以往的关联研究还是现在的全基因组关联分析研究,均提示银屑病与涉及人类免疫性疾病的免疫反应的MHC位点(如HLA-Cw6和其他MHC变异位点)紧密相关.还有两个与银屑病高度相关的与炎症反应密切关联的非MHC基因(IL-12B和IL23R),也在银屑病的发病机制中起着重要作用.近运用抗IL-12p40的生物制剂有效治疗银屑病的临床试验,进一步证实了IL-12/23在银屑病病理生理过程中关键作用.在中国人群中进行了银屑病易感基因的GWAS研究发现:位于1q21上的晚期角质化包膜(late cornified envelope,LCE)基因簇中LCE3A和LCE3D的区域异常与银屑病显著性相关.与此同时,国际上另一个研究小组对西班牙、荷兰、意大利和美国人群中进行的银屑病易感基因的GWAS研究发现,LCE基因簇中LCE3B和LCE3C区域的缺失与银屑病显著性相关.这些相互独立的研究有力地证实LCE基因参与银屑病的发病.到目前为止,虽然已经有了一些针对某些基因的有效靶向治疗手段,但是将诸如LCE等基因用于未来的靶向性治疗,可能更有意义.对LCE基因认识的不断深化,不仅有利于对新的药物靶位的确定,而且对治疗的个体化也有着十分重要的意义.为了阐明银屑病的内在发病机制,未来我们亟需对更大样本的研究,以及其他易感基因位点的鉴定及其下游的功能研究;同时可以预见,利用全基因组关联分析发现的银屑病的易感基因以及其后续的深入研究,将对阐明银屑病发病机制、疾病预警、临床诊断及新药开发起到决定性的作用.
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基于数据挖掘的沈敏鹤治疗胃癌节气用药规律研究
[目的]探讨沈敏鹤主任中医师治疗胃癌的节气用药规律.[方法]回顾性分析沈敏鹤主任中医师治疗的635例胃癌病案,记录就诊的节气和用药,并进行药性药味、频数、关联和聚类分析.[结果]性味频数多为"温""甘",用药频数多为茯苓.5个节气中共同关联药物是茯苓,其余皆是四君子汤的处方.共形成8类聚类,主要治法是益气健脾法和消食解郁法,其中益气健脾法、渗湿止泻法、平肝补肾法和疏肝和胃法在各个节气间有差异.[结论]沈师治疗胃癌主方为六君子汤,善用甘温药物益气健脾,并重视节气间,尤其是春分、清明和夏至的治法差异.
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基于数据挖掘法探析古方中妇人妊娠禁忌药的破禁现象——以半夏为例
[目的]采用数据挖掘关联分析的方法,从古医籍中探寻古人用半夏增效减毒之法,以期应用于临床.[方法]选取中医e百系统中妊娠期半夏方剂138首,利用Excel软件建期半夏类方"数据库,并用Rapid miner软件对数据库进行关联分析.[结果]妊娠期半夏常见药对为半夏-生姜、半夏-甘草、半夏-人参、半夏-茯苓-生姜、半夏-甘草-生姜.在妊娠期方剂中,半夏经常与解表药、利水渗湿药、补益药和活血药相配伍.古人多从增效减毒两个层面来考虑半夏配伍,如半夏-生姜为常见之配伍,而半夏-甘草、半人参在增强其疗效之时,又有减轻副作用的功效,符合《内经》云"有故无陨,亦无陨也"的原则.[结论]运用数据挖掘方法探究妊娠期方剂中半夏的用药规律,有助于从正反两方面把握妊娠期半夏的使用,为研究其他妊娠期禁忌药如薏苡仁、红花、肉桂等提供借鉴,也为进一步的临床实验研究提供了思路.
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缺血性视神经病变患者血浆D-二聚体的水平与预后的相关性
目的 研究缺血性视神经病变患者血浆D-二聚体的水平与预后的相关性.方法 选择2013年2月至2016年2月于我院诊治的缺血性视神经病变患者180例,所有患者均进行积极治疗,并且测定所有D-二聚体水平数据,另于1个月后以Rankin (mRS)量表展开评分,对比各组患者的预后效果,并且分析预后的效果与D-二聚体水平的相关性.结果 根据对比结果和评分结果显示,预后良好的患者(mRS分小于2分)有96例即标识为A组,预后不好的患者(mRS分高于3分)有84例即标识为B组,而在D-二聚体的指标对比方面,A组患者平均为(391.25 ±29.17)μg/L,而B组患者平均为(372.19±28.21) μg/L.以上数据对比差异显著,符合统计学意义(P＜0.05).结论 结合以上预后情况以及D-二聚体的指标对比可知,D-二聚体的增加会直接影响到缺血性视神经病变患者的预后效果,甚至产生隐患问题.
