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新疆哈萨克族食管癌DNA甲基化差异基因的初步研究

李磊;田薇;邓彦超;陈艳

摘要: 目的 探讨新疆哈萨克族食管癌癌组织与癌旁正常组织间差异显著的DNA甲基化基因,初步建立哈萨克族食管癌患者特异的异常甲基化谱.方法 采用Illumina公司Human Metylation 450K磁珠芯片,对哈萨克族食管癌癌组织、癌旁正常组织各6例共12个标本进行全基因组甲基化检测,分析二者之间差异显著的甲基化基因,对具有显著差异的甲基化基因进行基因类型(Gene Ontology,GO)分析.结果 食管癌癌组织与癌旁正常组织间具有显著差异的DNA甲基化基因共40个,参与多个生物过程,如信号转导、细胞周期调控及细胞凋亡等.GO分析表明,基因CCND1,CCDC88C参与Wnt信号通路,DLL1参与Notch信号转导等.结论 差异显著的甲基化基因为深入研究哈萨克族食管癌的发生机制提供了理论依据.

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