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广西首起诺如病毒感染性腹泻病原基因测序分析
目的 对广西首起诺如病毒急性胃肠炎疫情进行病原基因测序分析,以确证其病原体,并对其基因分型.方法 采用荧光定量PCR法对8份疫情病例样本进行诺如病毒RNA检测,取其中4份阳性标本再经RT-PCR扩增,然后纯化、克隆、测序和进化树分析.结果 8份标本均测出诺如病毒RNA,阳性率100%;其中4株病毒的N/S区序列与GenBank中的雪山病毒参考株同源性高,达95%.结论 序列测定结果证实广西大新县的急性胃肠炎疫情是诺如病毒感染所致,其病毒基因型为GⅡ.2型.
关键词： 诺如病毒 Real-time RT-PCR 进化树分析 -
诺如病毒引起的感染性腹泻暴发疫情调查
目的 调查了解诺如病毒引起的感染性腹泻暴发疫情的流行病学特点及传播途径,为制定预防控制对策提供依据.方法 采用流行病学现场调查和统计分析方法、轮状病毒抗原检测、诺如病毒RNA检测以及细菌分离培养常规方法.结果 本次疫情共发生病例444例,其中犯人360例,同时波及周围村屯及矿区工人;首例9月18日,末例10月7日,高峰在9月25～26日,不同区域流行时间不一致;病例分布有一定的区域聚集性;病例以成人为主;临床表现较轻,病程多在2～3天,有一定自限性;血常规多正常,大便常规均无异常;26份粪便标本中24份诺如病毒RNA检测阳性,1份轮状病毒抗原检测阳性,3份同时检出诺如病毒和产毒性大肠埃希菌.结论 证实此为一起由诺如病毒引起的感染性腹泻暴发疫情,传播途径主要系生活接触传播所致.
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湖北省某中学一起诺如病毒感染性腹泻暴发疫情调查
目的 分析湖北省某中学一起诺如病毒感染性腹泻暴发疫情的流行因素,为制定防控措施提供依据.方法 采用现场流行病学方法对病例进行调查,运用描述性流行病学方法、病例对照研究对暴发疫情数据和各种因素进行分析.结果 疫情涉及64例疑似病例和6名隐性感染者,罹患率为4.3％(64/1487).进食2月21日早餐豆皮发病风险增加(OR=2.66,95％CI:1.26—5.62).结论 该事件为一起由诺如病毒引起的感染性腹泻暴发疫情,在诺如病毒感染好发季节,应加强对集体单位、学校开展诺如病毒疫情监测,积极开展健康教育,有效预防诺如病毒感染暴发疫情的发生.
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一起诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情调查分析
目的 对湖北省某小学发生的一起腹泻暴发疫情进行调查和分析.方法 采用现场流行病学方法调查病例发生情况和可疑传播因素.采用RT-PCR法对人体和环境标本进行检测.结果 本次疫情从2017年3月9日开始至3月16日结束,共发现26例病例,均为在校师生,罹患率为1.20％.调查共采集到31份肛拭子样本和3份呕吐物标本,采用荧光定量RT-PCR法进行实验室检测,结果显示为10份肛拭子诺如病毒GⅡ型阳性;采集饮水机桶装水和食堂留样食品未检出诺如病毒核酸和致病菌.疫情特点符合经接触传播传染病特征.结论 本次疫情为一起由诺如病毒引起的腹泻暴发,可疑传染源为首发病例,传播模式主要为接触传播.
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2013—2015年广西食源性疾病监测哨点医院腹泻病人诺如病毒感染情况分析
目的 了解广西腹泻病人诺如病毒感染情况,为制定食源性疾病防控措施提供依据.方法 将2013—2015年哨点医院腹泻病人相关资料作为数据来源,用R软件进行统计分析.结果 接收腹泻病例2236例,其中检测诺如病毒阳性587例,阳性检出率为26.3%,年龄分布以0~5岁的儿童为主,占57.4%(337/587);职业以托幼儿童为主,占35.4%(208/587);阳性检出率高的是桂林市26.5%(95/358);临床症状水样便占89.9%(528/587),呕吐占31.7%(186/587);可疑暴露食品中米面食品类占28.5%(125/439),肉与肉制品占12.8%(56/439).结论 经济发达和人群流动量大的柳州、桂林市诺如病毒活动强度高于其他监测地区.散居儿童、托幼儿童和婴幼儿为主要发病人群.应加强监测,及时发布预警信息,减少社区和托幼机构传播.
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一起诺如病毒引起的急性胃肠炎RT-PCR检测
目的 对急性胃肠炎疫情标本进行疑似诺如病毒核酸RT-PCR检测,以确诊其致病原.方法 从34例病人粪便中提取RNA,用引物JV13i、JV12y进行诺如病毒核酸RT-PCR扩增,再对其扩增产物进行琼脂糖凝胶检测;同时采用ELISA法检测粪便中的诺如病毒抗原,并用基因序列分析进行检测结果验证.结果 34份标本中有26份诺如病毒核酸RT-PCR检测阳性,阳性率为76.5%,经基因序列分析,也证实为诺如病毒;而ELISA只检测到9份标本为阳性,阳性率为26.5%.结论 RT-PCR和ELISA的阳性结果均证实该起疫情为诺如病毒感染所致.RT-PCR法比ELISA法灵敏度高,特异性强,且成本较低,但是操作较为繁琐.
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2017.7-2018.8黔南州中医医院诺如病毒 核酸检测结果分析
目的:了解腹泻病人的病原及流行特点,为疾病的诊断及治疗提供依据.方法:2017年7月至2018年8月采集黔南州中医院门诊及住院的腹泻病人腹泻期间的粪便送检,采用多重荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测诺如病毒核酸,并对检测结果进行分析.结果:135例腹泻病人其中有11例感染了Ⅱ型诺如病毒,感染率为8.1％;其中1例感染了诺如病毒Ⅱ型,感染率为0.7％.结论:腹泻病人中感染诺如病毒主要是以Ⅱ型为主,流行季节为冬春季节.诺如病毒核酸检测快速,且准确度高,可快速辅助医生诊断腹泻病人是否感染了诺如病毒,及时治疗.
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一起医院内诺如病毒感染性腹泻事件的调查
目的 调查分析一起医院内群体性感染性腹泻的原因,为制定防控措施提供科学依据.方法 结合现场流行病学调查,采集粪便标本2份、肛拭子标本5份进行肠道致病菌、诺如病毒检测.结果 本次疫情流行9d,发病22例(住院病人15例,护工1例,清洁工1例,医务人员5例),罹患率23.91％.2份粪便标本、4份肛拭子标本检出GⅡ型诺如病毒核酸阳性.通过采取隔离治疗感染病例、消毒环境及物品、对医务人员及病人卫生宣教等综合措施,疫情得到及时控制.结论 这是一起由诺如病毒感染所致的感染性腹泻事件,密切接触是本起疫情的主要传播途径.
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诺如病毒研究进展
诺如病毒(Norovirus,NVs)能引起人类急性胃肠炎,是群居成人和儿童急性感染性腹泻的主要病原之一[1].诺如病毒具有高度感染性,10～100个病毒颗粒就能引起感染,与流感病毒相似,传播迅速,易引起疾病暴发,因此,被称为"胃肠性流感"[2].近年来,诺如病毒感染性腹泻发病呈逐渐升高的趋势,其危害性越来越受到重视.笔者对该病毒的研究进展综述如下.
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东莞市2010-2016年病毒性腹泻监测及分析
目的 了解东莞市病毒性腹泻的病原体谱构成及流行情况,为东莞市病毒性腹泻防治提供资料依据.方法 2010年7月开始,每周从监测点医院采集感染性腹泻患者的粪便样品,采用ELISA方法检测轮状病毒抗原,荧光PCR方法检测诺如病毒、腺病毒、星状病毒核酸.结果 2010-2016年共检测粪便样品5 026份,全部检测轮状病毒和诺如病毒,其中600份检测腺病毒和星状病毒.4种病原体的阳性率分别为15.96％(802/5 026)、14.56％(732/5 026)、5％(30/600),1.33％(8/600),总检测阳性率为30.18％.轮状病毒、诺如GⅡ型病毒、腺病毒、星状病毒发病集中在2岁以下低龄儿童,各病原体2岁以下儿童感染比例分别为69.10％、62.26％、82.14％、71.43％.轮状病毒每年有1个流行高峰,每年12月份至次年1月达高峰.诺如GⅡ型病毒每年有2个流行高峰,3月和8月达高峰.结论 监测的4种病原体中,轮状病毒和诺如病毒为病毒性腹泻的主要病原体,两者的阳性率相近.诺如病毒以GⅡ型为主.轮状病毒、诺如GⅡ型病毒、腺病毒和星状病毒主要感染2岁以下的婴幼儿,轮状病毒和诺如GⅡ型病毒感染有较强的季节性.
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深圳市2014-2015年病毒性腹泻病原学特征和流行病学分析
目的 了解深圳地区5种主要腹泻病毒的流行状况、分布特征和病原学特点.方法 收集2014年4月-2015年12月市级哨点医院的腹泻粪便标本,采用多重荧光PCR方法进行病毒检测,应用描述性流行病学方法对监测结果进行分析.结果 共采集腹泻粪便标本600份,病毒核酸阳性130份,检出率为21.67％,诺如病毒核酸阳性株检出率高,为62份(10.33％),其次是轮状病毒、星状病毒、札如病毒和腺病毒;其中札如病毒核酸阳性检出率男女差异有统计学意义(P＜0.05);各年龄段均有腹泻病毒核酸检出,1～4岁组和30～39岁组腹泻病毒核酸的总检出率高,分别为34.38％(22/64)和29.59％(29/98),＞60岁组检出率低为11.94％ (8/67);流行病学资料显示,深圳市全年各月份均有病毒性腹泻发生,1月、2月和3月的检出率较高,而8月份的检出率低.结论 深圳市病毒性腹泻全年均可发生,各年龄组男女均可感染,2014-2015年深圳市的优势病毒是诺如病毒Ⅱ型和轮状病毒,5岁以下婴幼儿是腹泻病毒监测的重点人群.
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南宁市朝阳溪污水中诺如病毒检测及其基因型分布
目的 了解南宁市朝阳溪污水中诺如病毒(Norovirus,NV)污染状况及其基因分布.方法 应用实时荧光逆转录-聚合酶链(Realtime RT-PCR)方法对2011年采集的72份朝阳溪污水进行NV检测,阳性标本进行基因克隆和序列测定,并进行亲缘关系分析.结果 72份污水均能检出NV,基因Ⅰ组(Genogroup Ⅰ,GⅠ)NV、基因Ⅱ组(GenogroupⅡ,GⅡ)NV阻性率分别为70.83％和100.00％.经亲缘关系树分析发现,测序成功的239株阳性克隆,共包含有16种不同亚型的NV,GⅠ (GⅠ.1、GⅠ.3、G Ⅰ.4、GⅠ.6、G Ⅰ.9、GⅠ.10、GⅠ.13、G Ⅰ.14、)、GⅡ(GⅡ.1、GⅡ.2、GⅡ.3、GⅡ.4、GⅡ.5、GⅡ.6、GⅡ.12、GⅡ.14)各8种.污水中GⅠ和GⅡNV代表株与广西急性腹泻病例的各亚型代表株的亲缘关系密切.在污水中还检测到37株在广西腹泻病例中未检测到的基因亚型NV,占总NV检出株数的15.48％(37/239),其中GⅠ有6个亚型、GⅡ有2个亚型.NV各亚型中检出比例高的是GⅡ.14,占31.80％ (76/239)、G Ⅰ.4次之,占18.83％(45/239).在污水中同时检出GⅡ.4 2006年变异株与2010年变异株.结论 污水监测能从侧面反映有多个基因亚型NV在南宁市人群中流行,但一些基因亚型的NV可能以隐性感染为主.
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应用荧光定量RT-PCR法检测牡蛎中诺如病毒
目的 建立牡蛎样品中的诺如病毒检测方法.方法 优化甘氨酸缓冲液处理牡蛎匀浆液,摸索PEG沉淀浓缩病毒的浓度,提取病毒RNA,采用荧光定量RT-PCR方法进行诺如病毒检测.应用优化后的方法检测105份牡蛎样本,并用核苷酸序列测定法对阳性PCR产物进行验证.结果 甘氨酸缓冲液pH值为4.5,PEG沉淀浓度为16%时的诺如病毒富集提取效果好,该方法的诺如病毒检出限为1.17×102个质粒拷贝.应用该方法对未知样本进行检测阳性率达14.29%,所得阳性PCR产物经核苷酸序列测序证实为诺如病毒.结论 本研究方法可以应用于牡蛎中的诺如病毒检测,南宁市海鲜市场上的部分牡蛎含有诺如病毒.
关键词： 诺如病毒 牡蛎 富集 荧光定量RT-PCR -
基于磁珠的可视化基因芯片在诺如病毒快速检测中的应用
目的 建立可用于临床样本检测的基于磁珠的可视化基因芯片检测方法.方法 在玻璃芯片上以链霉亲和素包被的磁珠作为标记物,采用生物素标记的核酸为样品,通过链霉亲和素与生物素的亲和作用,进行核酸杂交检测,杂交结果以肉眼或通过普通显微镜观测,验证方法的特异性、灵敏性及重复性. 结果方法检测的灵敏度为50ng,特异性和重复性均较好;对20份临床粪便样本分别进行PCR和芯片检测,芯片检测结果与PCR方法检测结果一致.20份临床样本中,6份阳性,其中1份为诺如病毒Ⅰ型、5份为诺如病毒Ⅱ型,14份阴性. 结论方法显示具有高效、实用和可视化的特点,可同时检测样品中含有的诺如病毒Ⅰ型、诺如病毒Ⅱ型;检测时间短,能够满足口岸诺如病毒的快速检测要求,具有较好的实用价值,对于进一步开发更多指标的微生物检测方法具有很好的示范作用.
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广西首次在急性胃肠炎病例中检出GⅠ型诺如病毒
目的 研究南宁市某医院门诊急性胃肠炎病例中GⅠ型诺如病毒的感染状况.方法应用荧光定量RT-PCR法对2007年1月～2008年12月南宁市某医院门诊腹泻病例标本进行GⅠ型诺如病毒RNA检测,并对GⅠ型阳性标本进行测序验证.结果在所检测的696份粪便悬液标本中,检出4份GⅠ型阳性,经核酸测序证实为GⅠ型诺如病毒.结论在广西的急性胃肠炎病例中存在GⅠ型诺如病毒感染.
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深圳市某小学一起疑似“食物中毒”事件调查
目的 调查某小学一起疑似“食物中毒”事件的特点和流行原因,探讨发病危险因素,快速高效处置疫情.方法 采用现场调查、病例对照方法,结合实验室检测结果对疫情进行分析,提出有针对性的防控措施.结果 该小学2014年9月21-28日,共报告胃肠炎病例37例,罹患率为4.4％(37/849),24日16:00时-25日8:00时为发病高峰,发病主要集中在一年级学生.病例对照研究结果显示在二楼餐厅就餐、在二楼午休房休息是发病危险因素(OR=4.53,3.33).采集患者、厨工肛拭子、咽拭子、粪便及环境涂抹样本共计65份,其中4份检测出诺如病毒.结论 这是一起由诺如病毒引起的胃肠炎暴发,原因是感染了诺如病毒的学生未及时接受治疗和隔离而引起疾病的传播,传播方式可能为气溶胶、人与人密切接触传播及接触被污染的环境物品所导致的传播.
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一起学校诺如病毒感染性腹泻暴发的调查
目的 调查与分析岳阳市平江县两所学校一起感染性腹泻暴发,并探讨病因和可能的危险因素,评价措施效果,为今后的防控提供参考.方法 按照病例定义开展病例搜索,采用描述性流行病学方法进行分析,采用病例对照研究和队列研究验证假设;对学校食堂和饮用水进行卫生学调查;采集病例的肛拭子等生物样品和水源水、出厂水、学校管网末梢水等环境样品开展相关微生物检测.结果 该起疫情共发病116例,A小学罹患率为10.98％(72/656),B中学罹患率为6.96％(33/474),另有学校附近居民病例11例;病例组直接饮用自来水的比例为78.9％,对照组直接饮用自来水的比例为36.0％(OR=6.68,95％CI=3.180～14.030);使用该乡自来水的乡镇街道居民罹患率为2.96％(11/371);周边不使用自来水的居民罹患率为0.33％(1/300),两者比较差异有统计学意义(x2=6.54,P=0.011);检测14例病例肛拭子标本有10例诺如病毒核酸阳性,学校无二次供水,学校管网末梢水卫生学指标超标,水源水和B中学管网末梢水诺如病毒核酸弱阳性.结论 此次疫情为一起诺如病毒引起的感染性腹泻暴发,发病原因为学生饮用被诺如病毒污染的自来水所致.
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东莞市2012年病毒性腹泻监测结果分析
目的 分析东莞市病毒性腹泻中轮状病毒和诺如病毒的感染情况.方法 收集2012年1月至2012年12月东莞市人民医院、高埗医院、寮步医院腹泻门诊病人粪便标本,采用ELISA法检测轮状病毒,采用Realtime RT-PCR方法检测诺如病毒.结果 检测粪便样品共831份,轮状病毒和诺如病毒的检出率分别为15.64％和17.57％.轮状病毒感染有明显的季节特征,秋冬季为发病高峰；诺如病毒感染则无特殊的季节特征,阳性样品以GⅡ型为主.0～3岁年龄组患者的感染率显著高于3岁以上年龄组患者.结论 病毒性腹泻全年均可发生,冬季的感染率较高.各年龄组男女性人群都可感染.应加强对病毒性腹泻,尤其是婴幼儿病毒性腹泻的监测.
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深圳市某区2010～2012年其它感染性腹泻流行特征分析
目的 了解深圳市某区其它感染性腹泻的流行病学特征,为今后制定预防控制措施提供根据.方法 对深圳市某区2010～2012年疾病监测信息报告系统中上报的其它感染性腹泻病例进行描述性流行病学分析.结果 2010～2012年某区共报告其它感染性腹泻病例14 752例,发病率分别为222.05/10万、272.49/10万、235.15/10万；5岁以下病例占全部发病数的86.27％；LG、LC街道两个街道发病率高279.50～766.85/10万.从10～12月份为发病高峰；63.23％为轮状病毒感染；轮状病毒暴发1起,诺如病毒暴发2起.结论 深圳市某区其它感染性腹泻流行主要集中在0～5岁散居儿童,秋冬季是好发季节,轮状病毒是影响其分布的重要因素.
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一起因聚餐引起的诺如病毒感染性腹泻爆发的调查
目的 查找一起群体餐后胃肠炎爆发的原因,为今后预防控制此类事件的发生提供科学依据. 方法 采取流行病学调查和应用酶联免疫法(ELISA)进行诺如病毒抗原检测. 结果 10份粪便标本中检出诺如病毒阳性8份. 结论 该事件为食物或食用具受到污染引起的诺如病毒胃肠炎爆发.
