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杭州市两起诺如病毒GⅡ17型暴发疫情分子流行病学特征
目的 对杭州市两起诺如病毒感染暴发疫情开展调查及病原分子鉴定分型.方法 对两起暴发疫情开展流行病学调查,采集病人肛拭子标本及外环境标本进行诺如病毒GⅠ/GⅡ型检测,对阳性标本的病毒基因VP1区部分核酸序列进行扩增测序,利用生物信息学软件进行多序列比对排列及构建进化树.结果 两起疫情分别发生在残障人士福利院及农村中学,报告病例数为54例及161例,感染原因分别为接触传播及桶装水污染传播.采集29人份病人肛拭子标本、5份桶装水标本和10份食品及涂抹物标本,结果19人份肛拭子标本诺如病毒阳性,对其中6份阳性标本进行序列比对及进化分析,病毒株均为诺如病毒GⅡ17型,与2014年美国株(KY424350)、2014年中国湖北株(KU310887)、2015年中国台湾株(KT732275)同源性高.结论 两起暴发疫情均由诺如病毒引起,基因型别为GⅡ17型.
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北京市2011-2016年肠道门诊腹泻患者中诺如病毒检出率的时间分布特征分析
目的 了解北京市肠道门诊腹泻患者中诺如病毒检出率的时间分布特征,为诺如病毒胃肠炎的防控提供依据.方法 采用集中度与圆形分布法对北京市2011-2016年肠道门诊腹泻患者中诺如病毒检出率的时间分布特征进行分析,并结合北京市病原学检测结果判断新变异株的出现对诺如病毒检出率的影响.结果 2011-2016年诺如病毒检出率集中度M=0.179.圆形分布分析结果为:高峰日在1月25日,高峰期为10月10日至次年5月12日.在新变异株出现的年度,诺如病毒检出率较高,集中度M＞0.29,检出率高峰期小于6个月.而在没有新变异株出现的年度,诺如病毒检出率较低,集中度M＜0.17,检出率高峰期大于7个月.结论 冬春季北京市肠道门诊腹泻患者中诺如病毒检出率较高.新变异株出现的年份诺如病毒检出率的季节性更加明显.
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上海市浦东新区2011-2014年诺如病毒检测情况分析
目的 了解上海浦东新区诺如病毒相关病毒性腹泻的流行病学特点.方法 收集2011年7月至2014年7月间14家哨点医院肠道门诊腹泻病例的粪便样本,应用real-time RT-PCR法分别检测诺如病毒的GⅠ和GⅡ两个亚型,并对其流行特征进行分析.结果 在6 392份样本中,GⅠ型共检出70例,检出率1.10％,呈低位流行、全年散发状态,无明显的季节分布;GⅡ型共检出962例,检出率15.05％,显著高于GⅠ型,存在明显的季节分布,每年的10月是感染的高月份,3～4月是另一个感染的小高峰.GⅠ和GⅡ型双重感染共21例,检出率0.33％,多见于中年人群.人口密集的沿江片区,诺如病毒的检出率显著高于人口稀疏的沿海片区.结论 秋季要密切监测人口密集地区诺如病毒的感染情况,防止诺如病毒感染而造成的聚集性事件.
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甘肃武威地区腹泻住院患儿A组轮状病毒和诺如病毒流行情况调查
目的 分析武威地区腹泻患儿中A组轮状病毒(RV)和诺如病毒(NV)发病状况及临床特征,为早期诊治提供科学依据.方法 收集2011-2012年在武威市凉州区人民医院就诊的585例腹泻患儿的粪便标本和临床资料,采用酶联免疫吸附试验(ELISA)方法检测A组RV和NV抗原.结果 585例患儿中,A组RV感染205例(35.04％),NV感染120例(20.51％),A组RV和NV混合感染28例(4.79％).A组RV和NV感染组在发热表现和日均腹泻次数上比较差异有统计学意义(x2=11.850,P=0.003;t=2.258,P=0.025; t=4.981,P＜0.01),其他临床症状如呕吐、脱水和病程等均相似.混合感染组除在发热例数上与其他两组比较差异有统计学意义(x2 =11.850,P=0.003)外,其余临床表现比较差异均无统计学意义(P＞0.05).A组RV流行季节为9～12月.NV流行呈现3个高峰,在1～2月、4月及7月.结论 武威地区秋冬季婴幼儿腹泻主要由A组RV引起,而春夏季病毒性腹泻的病原主要为NV.A组RV腹泻发热表现较NV重、日均腹泻次数较NV多.
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天津市2007-2009年感染性腹泻病人诺如病毒感染状况分析
目的 了解天津市诺如病毒(NV)腹泻发病状况及其临床和流行病学特征.方法 在天津市不同区域设立5所医院,对就诊的成人和儿童其他感染性腹泻(除霍乱、细菌性和阿米巴性痢疾、伤寒和副伤寒以外的感染性腹泻)患者按设计的调查内容现场询问获得资料,同时收集患者粪便标本,采用ELISA方法检测NV抗原,并以RT-PCR方法做型别分析.结果 1085例患者中129例检出NV抗原,阳性率为11.89％,其中≤5岁患者的阳性率达23.05％ (68/295).基因型以GⅡ为主,占80.62％ (104/129).感染不存在区域间的聚集性,冬春季节高发.散居儿童患者的阳性率达22.60％ (66/292).患者在发病15d内就诊可以检测出诺如病毒.NV腹泻患者每日腹泻的次数明显多于非NV腹泻患者,且多为水样便.便常规检测97.25％(813/836)的NV腹泻患者的白细胞数≤10/高倍镜视野(400倍).结论 天津市其他感染性腹泻患者中11.89％为NV所致,≤5岁患者该比例更高达23.05％,这已成为一个公共卫生问题.
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液相芯片检测轮状病毒和诺如病毒方法的建立
目的 建立一种多重PCR结合液相芯片技术同时检测A型轮状病毒、GI型诺如病毒和GII型诺如病毒的方法.方法 建立多重PCR扩增方法,将PCR产物与偶联核酸探针的微球混合物进行杂交,利用Luminex 200液相芯片检测仪来检测杂交结果.对建立的A型轮状病毒、GI型诺如病毒和GII型诺如病毒液相芯片检测方法进行灵敏度、干扰性分析,并应用该方法对68份粪便样品的核酸进行检测.结果 灵敏性实验结果表明,该方法对GII型诺如病毒的检测灵敏度较高,检出限为10 pg/PCR;对轮状病毒的检出限为100 pg/PCR;该方法对GI型诺如病毒的检测灵敏度较低,检出限为1 ng/PCR.干扰性实验结果表明,轮状病毒、GI型诺如病毒和GII型诺如病毒的液相芯片检测,当病毒之间的模板量不同时(1,1、1,2、2,1、1,5、5,1、1,10、10,1、1,100、100,1),仍能够准确检测;对68份临床粪便样品的核酸进行检测,检测出A型轮状病毒样品19份,GI型诺如病毒样品1份,GII型诺如病毒样品18份;轮状病毒和GII型诺如病毒混合感染1份,GI和GII型诺如病毒混合感染1份.结论 本研究建立的轮状病毒和诺如病毒液相芯片检测方法通过一次检测能间时检测A型轮状病毒、GI型诺如病毒和GII型诺如病毒,有助于诊断病毒引起的急性腹泻.
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诺如病毒结构和进化研究进展
诺如病毒属于杯状病毒科,无包膜病毒,是全球病毒性肠胃炎的主要病原体.目前认为组织血型抗原是诺如病毒的受体.诺如病毒疫苗研究主要是重组表达病毒衣壳蛋白组装的病毒样颗粒,其与天然病毒结构相似.不同基因型的GⅡ.4的病毒样颗粒,由于在受体结合区域氨基酸的序列差异,可导致病毒与不同受体结合以及抗原性发生改变.了解病毒的结构、中和表位和抗原变异对于疫苗的研发和质控具有重要意义.
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人诺如病毒疫苗的研究进展
人诺如病毒属于杯状病毒属,是全球病毒性胃肠炎的主要病原体.据世界卫生组织(WHO)估计,每年约有超过1亿人由于诺如病毒感染而发病并且疾病导致数万人死亡.由于缺乏特效药物,疫苗研发是防控诺如病毒暴发和流行的关键手段.虽然诺如病毒存在着基因多样性、难以体外培养、缺乏动物模型等问题,但近年来诺如病毒疫苗的研究不断改进,并且一系列临床研究的开展为今后的疫苗研发提供了重要基础.
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诺如病毒感染暴发调查和预防控制技术指南(2015版)
诺如病毒变异快、环境抵抗力强、感染剂量低,感染后潜伏期短、排毒时间长、免疫保护时间短,且传播途径多样、全人群普遍易感,因此,诺如病毒具有高度传染性和快速传播能力.诺如病毒感染发病的主要表现为腹泻和/或呕吐,国际上通常称之为急性胃肠炎.我国一直将其列入丙类传染病中"其他感染性腹泻病(除霍乱、细菌性和阿米巴性痢疾、伤寒和副伤寒以外的感染性腹泻病)"进行报告管理,这在一定程度上影响了以呕吐为主要症状的诺如病毒感染病例及其暴发的报告.诺如病毒是全球急性胃肠炎散发病例和暴发疫情的主要致病原,疾病负担严重[1-2].2013年以来,我国其他感染性腹泻病暴发多以诺如病毒暴发疫情为主,尤其是2014年冬季以来,诺如病毒暴发疫情大幅增加,显著高于历年水平.
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北京市学校及托幼机构诺如病毒急性胃肠炎疫情现场消毒指南
诺如病毒急性胃肠炎的主要症状为呕吐、腹泻、恶心、腹痛,通常持续2～3 d,为自限性疾病.诺如病毒具有高度传染性和快速传播能力,是全球急性胃肠炎散发病例和暴发疫情的主要致病原[1-2].近期,学校、医院、养老院和幼儿园等人员密集的场所由诺如病毒引起聚集性疫情频发[3-8],为了指导和规范学校及托幼机构对诺如疑似病例的处置,减少疫情的发生,特制定本操作指南.
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2016年北京市诺如病毒感染暴发疫情流行病学调查分析
目的 探讨2016年北京市报告的5起诺如病毒感染暴发疫情的流行病学特征.方法 采用统一的调查表对所有疑似病例进行流行病学调查;开展现场卫生学调查并采集典型病例及部分密切接触者、病例关联性餐饮人员等人群粪便标本或呕吐物标本,采用RT-PCR法对标本进行诺如病毒核酸检测.采用x2检验对疫情的流行病学特征进行分析.结果 5起诺如病毒感染暴发疫情中1起由GⅠ病毒感染导致,4起由GⅡ病毒感染导致;共搜集到疑似病例378例,罹患率为8.67％～84.00％,共搜集实验室诊断病例36例;疫情集中在春季和冬季;不同年龄组的呕吐、腹泻、发热、恶心、腹痛等5种症状统计结果差异有统计学意义;5起疫情中有3起由食物导致暴发的可能性较大,1起不能排除直接人传人导致暴发的可能,1起由某种公用媒介导致暴发的可能性较大.结论 北京市2016年诺如病毒感染暴发疫情集中在学校,涵盖了幼儿园到大学所有阶段,是防控工作的重中之重.加强学校食品安全、日常清洁消毒和因病缺勤制度以及病例早发现早报告等是北京市学校诺如病毒感染疫情的防控措施.
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2011-2017年北京市朝阳区5岁以下儿童病毒性腹泻病原学研究
目的 分析北京市朝阳区2011-2017年5岁以下儿童腹泻病毒多病原流行特征,比较其病原谱流行变化规律,为制定该地区病毒感染性腹泻的预防控制措施提供科学依据.方法 收集北京市朝阳区2011-2017年首都儿科研究所送检的婴幼儿腹泻粪便监测样本,应用real-time PCR和PCR法进行诺如病毒、肠道腺病毒、星状病毒核酸检测,应用ELISA法进行轮状病毒抗原检测.结果 2011-2017年共收集5岁以下婴幼儿腹泻粪便监测样本1 451份(男性977份,女性474份).经确诊,轮状病毒感染374例,诺如病毒感染237例,肠道腺病毒感染100例,星状病毒感染69例,其中复合感染者75例.轮状病毒冬春季高发(11月～次年3月),诺如病毒全年均可发生,但秋冬季多见(10～ 12月),肠道腺病毒和星状病毒流行季节性不明显.结论 北京市朝阳区2011-2017年监测结果显示腹泻患儿轮状病毒和诺如病毒感染率较高,应加强对病毒性腹泻的监测,预防暴发疫情尤其是轮状病毒和诺如病毒感染的发生.
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芜湖市2012～2016年幼托儿童法定传染病流行特征分析
目的 了解芜湖市2012～2016年幼托儿童传染病发病特点,探讨科学的针对性更强的防控对策和措施.方法 收集2012～2016年芜湖市幼托儿童法定传染病报告发病资料,采用描述性流行病学方法,分析幼托儿童传染病发病的流行病学特征,暴发疫情发生特点及防控面临问题.结果 2012～ 2016年芜湖市共报告幼托儿童法定传染病17个病种10 274例,无甲类传染病报告.年平均报告发病率为23.99‰.报告死亡1例,为2016年狂犬病死亡.手足口病、流行性腮腺炎、其它感染性腹泻、细菌性痢疾和流行性感冒为发病主要病种.发病呈现季节性,发病高峰为4～6月,次高峰为11月.城镇地区幼托儿童报告发病数占54.59％.Ⅰ类疫苗针对传染病712例,报告发病率为1.66‰,远低于非Ⅰ类疫苗针对性传染病的报告发病率.2012 ～2016年芜湖市幼托机构传染病暴发疫情20起,罹患率为6.11％;其中手足口病暴发18起,诸如病毒感染暴发疫情2起.结论 芜湖市幼托儿童报告传染病发病率比较高,手足口病、流行性腮腺炎、流行性感冒是幼托儿童的主要传染病.有效地预防接种对降低传染病发病水平具有重要作用.
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一起诺如病毒引起的感染性腹泻暴发疫情调查分析
目的 分析集体单位发生诺如病毒感染性腹泻的流行特征,为预防、控制此类疫情提供科学依据.方法 收集2017年3月1日至3月15日,某校医院接诊的所有腹泻病例信息,采用现场和回顾性流行病学调查方法,结合生物和环境样本实验室检测.结果 此次疫情历时15 d,累计发病110例,罹患率1.06％.经对病例及食堂从业人员的180份生物样本检测,诺如病毒核酸检测阳性29份,其中学生病例粪检阳性8份,阳性率42.11％ (8/19),食堂从业人员粪检阳性21份,阳性率13.04％ (21/161).结论 食堂从业人员诺如病毒隐性感染是导致此次疫情爆发的主要原因.
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诺如病毒GⅡ.17和GⅠ.3基因型引起急性胃肠炎疫情的病原分析
目的 对安庆市某中学暴发的急性胃肠炎疫情进行病原鉴定,并进一步对部分基因序列测序分析,以确定其基因亚型.方法 对采集的13份肛拭子,3份生活饮用水标本,采用实时荧光定量RT-PCR方法进行诺如病毒GⅠ/GⅡ型检测,对阳性标本的病毒VP1区部分核酸序列测序和基因库数据比对,并采用MAGA5.0软件构建进化树.结果 在13份肛拭子样本7份诺如病毒阳性中,6份属于GⅠ.3型,1份属于GⅡ.17型;3份生活饮用水样本GⅠ.3和GⅡ.17型均有检出.结论 该起疫情由诺如病毒感染引起,为GⅠ.3和GⅡ.17基因亚型.
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安徽省诺如病毒GⅡ.4/Sydney 2012变异株分子特征分析
目的 了解安徽省某高校一起急性胃肠炎暴发疫情的病原体基因分型和分子特征.方法 采用实时荧光定量PCR法(Real-time PCR)对6份粪便/肛拭子标本检测诺如病毒核酸,检出的阳性标本经传统RT-PCR扩增衣壳蛋白区(ORF2)部分序列、基因测序和型别鉴定,利用ClustalX 2.0和Mega 6.0软件对测定序列进行核苷酸同源性比对和构建基因进化和亲缘性关系树.结果 检出4份标本诺如病毒核酸阳性,阳性率为66.67％ (4/6);基因序列比对和进化亲缘性关系显示:诺如病毒基因型为GⅡ.4型;2毒株序列之间核苷酸同源性为100％;与2014～2015年上海株、香港株核酸同源性高,均为100％;与2012澳大利亚Sydney株(JX459908)同源性为99.6％;与上海和香港两地区毒株亲缘性关系近,聚为独立一簇,同属GⅡ.4/Sydney 2012分支.结论 引发该起急性胃肠炎暴发的病原体为GⅡ.4型诺如病毒,且属于GⅡ.4 Sydney 2012变异株.
关键词： 诺如病毒 GⅡ.4基因型 Sydney 2012 分子特征 -
一起水源性诺如病毒引起的急性胃肠炎疫情的调查分析
目的 通过对怀宁县一起以诺如病毒感染引起的急性胃肠炎暴发疫情调查分析,探讨疫情暴发的原因和流行病学特征,为制定防控措施提供科学依据.方法 制定病例定义,开展病例搜索进行流行病学调查,采集病例及有关标本检测,调查疫情暴发危险因素等.结果 本次疫情累计发病99例,持续时间11d,发病曲线呈单峰带拖尾,发病集中在3月1日至2日,示点源暴露,3月3日以后仍有少量病例不排除因接触传播出现二、三代病例;男性罹患率为0.39％,女性罹患率为0.32％,发病年龄、性别均无显著差异;各村发病率不同,存在统计学差异(x2=72.469,P＜0.01),管网距离自来水厂越近罹患率越高;饮用该镇水厂自来水人群罹患率0.81％,饮用其它水源人群罹患率0.03％,不同水源人群发病差异有显著性(RR=26.238,x2=114.692,P＜0.01).采取病例28份粪便、肛拭子和呕吐物标本中27份诺如病毒核酸阳性,阳性率为96.43％;基因序列分析为诺如病毒GⅡ.17型.结论 本次疫情为一起因自来水受到污染,诺如病毒GⅡ.17型引起的急性胃肠炎暴发疫情,农村地区乡镇自来水厂水源水选址不当、缺乏保护,一旦出现大雨则易造成水源水污染,加之基层自来水厂监管不力是该类事件的危险因素.
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某小学诺如病毒胃肠炎聚集性疫情调查报告
诺如病毒(Norovirus)属于杯状病毒科诺如病毒属,是世界上引起散发性和暴发性非细菌性胃肠炎的主要病原体,全球80％ ～ 95％的胃肠炎均是由诺如病毒感染引起的.诺如病毒早由Kapikian于1972年在美国诺瓦克地区流行的急性胃肠炎患者粪便中被检出,因而命名为Norwalk Virus[1-4],此后世界各地陆续有病例报道,直到2002年第八届国际病毒命名委员会将该病毒正式命名为Norovirus.研究表明诺如病毒传播速度快,传播途径多样,人群普遍易感,已经成为重要的公共卫生问题.2017年2月镜湖区某小学校发生了由诺如病毒引起的胃肠炎聚集性疫情,现将流行病学调查结果报道如下.
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一起小学诺如病毒感染性腹泻暴发疫情的调查报告
诺如病毒,又称诺瓦克病毒,感染后主要表现为急性肠胃炎症状,在成人中主要引起腹泻,儿童发生呕吐更为常见[1].患者、隐性感染者和病原携带者为本病的传染源,可以通过食物、水、生活接触或吸入悬浮在空气中的气溶胶传播,传播速度极快,易在短时间内造成大规模暴发流行,极易引起学校感染性腹泻疫情的暴发[2].2017年2月,芜湖市某小学出现以呕吐、腹泻为主要症状的急性胃肠炎聚集性病例,经调查确认是由诺如病毒感染引起的腹泻暴发疫情,现将调查结果报道如下.
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一起医院内感染性腹泻暴发疫情的调查分析
诺如病毒感染性腹泻由诺如病毒属病毒引起,诺如病毒传染性强,潜伏期短,冬春季是该病毒感染高发季节,可通过食物、水、生活接触、气溶胶等途径传播[1],具有发病急、传播速度快、涉及范围广的特点,是引起非细菌性腹泻暴发的主要病因.美国每年在所有的非细菌性腹泻暴发中,60％～90％是由诺如病毒引起.1995年,我国报道了首例诺如病毒感染,之后山西、北京、安徽、福州、武汉、广州等地区相继有医院、社区、学校、家庭发生诺如病毒引起感染性腹泻暴发的报道[2-7].2013年12月30日,安庆市某医院发生了一起诺如病毒引起的聚集性感染性腹泻疫情,现将结果报道如下.
