首页 > 文献资料
-
基因-环境交互作用研究方法:无对照病例研究
从目前的观点来看,可以认为很少有疾病是纯粹由遗传或者环境因素决定的,基因-环境交互作用在许多疾病,特别是常见的慢性疾病或者是所谓的"复杂性状疾病"(complex-trait diseases)的发病中,具有非常重要的意义[1].基因-环境交互作用可以理解为遗传因素对环境因素易感性的影响[2].对于基因-环境交互作用的深入研究,有助于了解人群易感性差异的原因,进而可以对环境与疾病、基因与疾病的关系有更深入的认识.目前许多对复杂性状疾病病因的遗传流行病学研究得到非常不一致的结论[3],没有考虑到基因-环境交互作用应该是重要原因之一.从另一个角度来看,如果能够对基因-环境交互作用有深入了解的话,我们就可以根据个人的基因型,制定更有效的干预措施以及个人保健措施[4].传统研究交互作用应用的方法是病例对照研究,但应用病例对照研究进行基因-环境交互作用的研究需要很大的样本量,同时一些潜在的因素可能会对研究结果有较大的影响.近几年来,研究者提出,可以用其他的研究方法进行基因-环境交互作用的研究,例如无对照病例研究(case-only study),病例-亲本研究(case-parental study)等[5-8].我们将对无对照病例研究作一简单介绍.
-
复杂性状疾病的系统生物学研究
复杂性状疾病,即多基因病,其发生发展是基因,蛋白质,代谢分子,环境等众多因素相互作用的结果,仅仅从基因或蛋白等单层次研究已不能解释其发病规律.系统生物学的出现为从整体出发研究复杂性状疾病提供了新的视角和机会.本文主要介绍系统生物学概况和在复杂性状疾病研究中的应用.
-
一篇好文章——简评“中国汉族人群中IRE1a基因多态性与糖尿病前期风险的相关性研究”
大约二、三年前,我曾应约对发表在本刊的纪立农教授课题组的一篇有关基因多态性与2型糖尿痛相关性的meta分析文章做过推荐和评述.在那篇简评中,笔者就我国糖尿病和其他复杂性状疾病遗传分析的研究中所存在的主要问题进行了初步梳理和阐述.
-
遗传与儿童免疫性疾病
根据遗传因素在发病机制中的作用可将疾病分为单基因遗传病和复杂性状(complex traits)疾病.常见的原发性免疫缺陷病多属单基因遗传病,遵循孟德尔遗传规律,其遗传方式可分为常染色体显性遗传(AD)、常染色体隐性遗传(AR)、X连锁遗传(XL)等.多数自身免疫性疾病[如系统性红斑狼疮(SLE)、类风湿性关节炎(JRA)、川崎病(KD)]和过敏性疾病属复杂性状疾病;它们是由许多相关基因加和作用形成的.复杂性状性疾病目前已成为生命科学中普遍关注的前沿,阐明复杂性状疾病的发病机制,需要解决两个问题:一是明确疾病的主要易感基因,这需要在人类基因组中找寻一种数目多、分布广泛且相对稳定的遗传标记,单核苷酸多态性(SNPs)正是代表了这样的一种标记;二是寻找影响这些基因表达的表观遗传(epigenetic)修饰因子(如DNA甲基化).因此,本文仅在简单介绍一般免疫性疾病遗传学特点的基础上,结合目前的临床基础研究资料,重点讨论表观遗传修饰及SNPs与免疫系统疾病的关系.
-
蒙古族ACE、AGT M235T基因多态性与环境因素对高血压的交互作用
原发性高血压(essential hypertension, EH)是常见的心血管病,也是其他心血管病的重要危险因素,是全球性的公共卫生问题.目前认为,高血压是多种遗传因素和环境因素共同作用而引起的复杂性状疾病[1],在人类遗传易感性的基础上,在环境危险因素的作用下发病.
-
单核苷酸多态性的特点及其在医学中的应用进展
1990年开始启动的人类基因组计划 ( HGP)揭开了人类遗传信息的秘密.随着研究的深入,人类基因组单核苷酸多态性 (SNPs) 的研究应运而生,并且得到迅猛的发展.SNPs数量大、分布广,且在不同人群中的分布频率也有差异, 这些差异可以代表某一种族或人群间的遗传差异.因此, SNPs的研究有助于解释个体间的表型差异、不同群体和个体对疾病,特别是对复杂性状疾病的易感性以及对各种药物的耐受性.此外,SNPs还可用于定位疾病相关基因、分析疾病的关联性、阐明疾病发生的分子遗传机制以及药物基因组学中的用药指导和药物设计等,目前已成为疾病基因组学、功能基因组学、药物基因组学和环境基因组学研究的重要内容.随着人类基因组计划的完成,人们越来越重视SNPs的医学意义及其应用,特别是在应用SNPs进行连锁分析、关联分析、定位和寻找疾病致病基因方面有了很大进展.本文对SNPs的特点及其在医学方面的应用作一综述.
-
单核苷酸多态性与复杂性状疾病
单核苷酸多态性(SNPs)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异而引起的DNA序列多态性,频率大于1%.SNPs在人类基因组中广泛存在,并通常以二等位基因的形式出现,便于进行大规模和高通量分析,因此是继限制性酶切长度多态性(RFLP)和微卫星之后的第三代遗传标记.SNPs在生物学诸多领域具有广阔的应用前景.本文简要叙述了SNPs与复杂性状疾病(如肿瘤、高血压、糖尿病等)的关系,以及SNPs在复杂性状疾病的致病基因定位、发病机制的阐明、个体化用药和药物设计等领域的应用.
-
单核苷酸多态性在复杂性状疾病易感基因研究中的应用
大多数常见病都是一些复杂性状的遗传病,致病机制是由多个遗传易感基因与环境因素相互作用所致.目前认为一些常见的遗传变异,主要是指单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)与复杂性状疾病的易感有关.本文在以下几个方面对SNPs与复杂性状疾病易感基因研究的策略和方法学问题作了较为详细的综述:(1)SNP特点及其有关网上资源;(2)对直接测序法、单碱基延伸法、TaqMan法、基于实时动态荧光(动力学)PCR的等位基因特异扩增法,变性高效液相色谱(DHPLC)法和OLA/PCR 的SNPs基因分型方法的原理、通量和优缺点进行了比较;(3)SNPs与复杂性状疾病易感基因关联研究的策略.