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结核分枝杆菌(H37Rv)分泌性蛋白的生物信息学预测方法
目的:建立一种结核分枝杆菌(H37Rv)分泌性蛋白的预测方法,为后续研究提供参考依据. 方法:以SignalP和TMHMM两个软件对结核分枝杆菌蛋白组进行扫描,基于Visual FoxPro构建"蛋白质数据分析处理系统"对扫描原始数据进行分析处理以识别分泌性蛋白,再经BLASTp完成相似性比对. 结果:预测出了179种分泌性蛋白,其中12种为H37Rv所特有. 结论:生物信息学方法可作为一种研究分泌性蛋白的辅助工具,用于指导实验.
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HE4研究进展
人附睾分泌蛋白 4(Human epididymis gene protein 4)是新近提出的肿瘤标志物,它早由Kirchhoff 等[1,2]在1991 年发现,从人的附睾远端上皮细胞中克隆到HE4基因的cDNA,有学者认为其功能可能与精子成熟或与天然免疫性有关,但对其具体功能仍不清楚[3],本文对HE4的研究进展做一综述.
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Ⅲ型分泌系统的研究进展
细菌通过分泌系统分泌许多蛋白,输送到菌体细胞外,与宿主细胞发生相互作用,发挥其毒性.革兰氏阴性菌主要有4种蛋白质分泌系统.其中Ⅲ型分泌系统与细菌致病性密切相关.受到微生物学者的关注.本文着重对细菌Ⅲ型分泌系统的组成、结构和分泌机制等进行了概述.
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Clara 细胞分泌蛋白在新生儿肺部疾病中的研究进展
近年来,关于新生儿尤其早产儿肺部疾病发病率及死亡率高的现象已引起广泛关注,但其发病早期呼吸道症状和体征不明显,早期诊断和治疗仍存在困难。 Clara 细胞分泌蛋白( clara cell secretory protein,CCSP)主要由细支气管、终末细支气管及呼吸性细支气管上的 Clara 细胞分泌产生,具有抗炎、抗氧化等特性,刚出生时肺泡灌洗液( BALF)及血CCSP 水平可反应肺发育情况,而生后 BALF 中CCSP 水平降低、血浆中 CCSP 水平升高可反映肺泡毛细血管膜完整性被破坏的早期改变,多项研究发现,CCSP 变化在早期识别新生儿肺部疾病中具有重要意义,应用重组 CCSP(rhCCSP)治疗新生儿肺部疾病已取得一定进展,现就 CCSP 在新生儿肺部疾病中的研究进展综述如下。
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正常人前列腺外周带和移行带成纤维细胞差异性基因表达与蛋白分泌的研究
目的:寻找正常人前列腺外周带和移行带细胞在基因表达水平及相关信号通路蛋白表达水平的差异.试图从机理上探求两者在不同前列腺疾病中所占比例不同的原因.方法:用Trizol一步法从外周带(PZ)和移行带(TZ)成纤维细胞中抽提总RNA.通过定量RT-PCR技术测定CXCL1、CXCL2、CXCL3、IGFBP2、IGFBP3、IL-8、TA GLN、MEST的基因表达水平.此外,从PZ、TZ 成纤维细胞条件培养基中收集、浓缩分泌的蛋白,通过Western blotting技术比较分析分泌蛋白的水平.结果:一些分泌蛋白的基因表达水平在PZ与TZ成纤维细胞存在显著差别,其中CXCL1、CXCL2、CXCL3与IL-8的mRNA在TZ成纤维细胞中的表达水平明显高于其在PZ成纤维细胞中的表达水平.而IGFBP2、IGFBP3与TAGLN的mRNA在PZ成纤维细胞中的表达水平明显高于其在TZ成纤维细胞中的表达水平.IGFBP3与TAGLN在PZ成纤维细胞中的蛋白分泌水平明显高于其在TZ成纤维细胞中的蛋白分泌水平.结论:PZ与TZ成纤维细胞中基因表达及蛋白分泌水平的差异可能参与导致前列腺癌与前列腺增生(BPH)发病率在前列腺不同区带的显著区别.
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3种不同的HPV型别宫颈癌细胞株分泌蛋白非标记定量技术分析
目的:分析3种不同HPV型别的宫颈癌细胞株Siha、Caski和C33的分泌蛋白表达及种类,寻找其共性分泌蛋白标志物,为临床早期发现及针对性干预提供依据.方法:采用非标记(label-free)定量技术分析3种不同宫颈癌SiHa、Caski和C33细胞株的分泌蛋白,运用LC-MS/MS和Maxquant的非标记技术,筛选出宫颈癌分泌蛋白的种类及分类.结果:共鉴定肽段数21 609个,蛋白数2 895个.其中3种宫颈癌细胞株共性蛋白共729种,占29.2％;特异性蛋白Siha细胞株含128种,Caski细胞株含143种,C33细胞株含859种.对于结果中729种共性蛋白进行分析,有以下4类较为集中的类型:热休克蛋白类(HSPs)共14种;异质性核糖核蛋白类(HNRP)共8种;层黏连蛋白类(LN)共4种;阿尔多酮还原酶1类(AKR1)共2种.其中,溶酶体信号通路所占比例大(39种).结论:SiHa、Caski和C33细胞株的分泌蛋白中共有729种共性蛋白,其中4类集中的蛋白类型均先后在研究中证实对宫颈癌的进程和发展有影响,并且可能与溶酶体信号通路有关.可为筛选高危型HPV感染的宫颈癌患者的血清标志物提供依据.
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伤寒沙门菌OmpR缺陷变异株制备与分泌蛋白初析
目的观察伤寒沙门菌调节蛋白OmpR的调节作用,制备伤寒沙门菌OmpR缺陷变异株,并比较分析野生株和OmpR缺陷变异株在不同渗透压环境培养下的分泌蛋白.方法用自杀质粒pGMB151介导同源性重组方法制备伤寒沙门菌OmpR缺陷变异株,用PCR方法观察重组现象,变异株经测序和外膜蛋白的SDS-PAG电泳鉴定,用SDS-PAG电泳结合Western blot比较分析野生株和OmpR缺陷变异株在高、低渗透压环境培养下的SipC等分泌蛋白.结果成功制备伤寒沙门菌OmpR缺陷变异株,并发现变异株中,包括SipC、鞭毛素蛋白在内的多种蛋白的表达分泌有明显差异.结论伤寒沙门菌OmpR在不同的渗透压下分别影响SipC、鞭毛素蛋白等多种蛋白的表达分泌.
