分子诊断与治疗杂志
Journal of Molecular Diagnosis and Therapy 분자진단여치료잡지
- 主管单位： 中山大学
- 主办单位： 中山大学
- 影响因子： 0.65
- 审稿时间： 1个月内
- 国际刊号： 1674-6929
- 国内刊号： 44-1656/R
- 论文标题 期刊级别 审稿状态
-
海南省低收入女性人乳头瘤病毒感染状况及亚型研究
目的 了解海南低收入女性宫颈人乳头瘤病毒(human papillomavirus,HPV)感染的现状及亚型分布情况. 方法 于2016年1月至2016年12月,由海南省总工会及各市县工会组织本省15个市县的1 373名低收入困难女职工进行健康体检,其中汉族935人、非汉族438人.采用基因芯片导流杂交技术对妇女宫颈脱落细胞进行21种HPV基因分型检测. 结果 在所研究的1 373例妇女中,HPV感染者为192例,总感染率为13.98％(192/1 373).共检测出19种HPV亚型,HPV感染率排在前5位的亚型从高到低依次为HPV52 (3.35％,46/1 373)、HPV51(1.97％,27/1 373)、HPV58(1.97％,27/1 373)、HPVcp8304(1.75％,24/1 373)、和HPV53(1.60％,22/1 373).不同市县人群的HPV感染率有所不同,差异有统计学意义(P＜0.05),HPV感染率高的市县为海口市(32.35％,11/34),其次是昌江县(24.63％,33/134),不同市县人群HPV感染的优势型别也有所不同.汉族和非汉族人群的HPV感染率分别为14.12％(132/803)和13.70％(60/378),二组相比,差异无统计学意义(P＞0.05). 结论 海南省低收入女性富颈HPV感染率相对国内普通人群较低,不同市县人群的HPV感染率及感染型别有所不同,应加强在HPV高感染率地区进行宫颈癌的防控工作.
-
广东潮汕地区地中海贫血基因突变谱分析
目的 了解潮汕地区地中海贫血的基因突变类型及构成比,为更准确地进行地贫诊断提供理论依据. 方法 应用跨越断裂点聚合酶链反应(Gap-polymerase chain reaction,Gap-PCR)、反向斑点杂交(reverse dot blot,RDB)技术和PCR+导流杂交法,分析潮汕4个地理区域(汕头、潮州、揭阳、汕尾)的地贫基因突变类型. 结果 2 057例地贫样本中,检出14种α-地贫突变基因和19种β-地贫突变基因,同时检出α和β复合型地贫13种.α-地贫中常见的基因型为东南亚缺失型(--SEA),β-地贫以IVS-Ⅱ-654M位点突变为常见,其次是41/42M.结论 潮汕地区地中海贫血的基因突变类型呈多样化,本研究的数据可为本地区开展地贫诊断和研究提供参考资料.
-
广东江门地区汉族人群23个STR基因座遗传多态性
目的 调查研究广东江门地区汉族人群23个STR基因座遗传多态性,为法医学个体识别、亲权鉴定等提供基础研究数据. 方法 采集475个无关个体的血液样本,采用HuaxiaTTMPlatinum PCR试剂盒对DNA进行复合扩增,统计23个基因座的遗传多态性参数. 结果 研究显示,23个常染色体STR基因座的基因频率介于0.001 1～0.586 3之间.各基因座的杂合度(H)介于0.534 7～0.884 2之间,匹配概率(MP)值分布在0.015 8～0.233 7之间,个体识别能力(DP)值介于0.984 2～0.766 3之间,非父排除率(PE)在0.219 7～0.763 3之间.经计算累积无关个体偶和概率(CMP)为3.158 4 ×10-28,累积个体识别能力(TDP)为1-3.158 4×10 28,累积非父排除率(CPE)为1-3.143 9×10-10. 结论 本文涉及的23个常染色体STR基因座在广东江门汉族人群中均具有高度多态性,研究所得数据可为江门地区汉族人群法医学个体识别和亲权鉴定提供结果评估依据,并为完善STR基因库数据和为研究人类群体遗传学提供基础数据.
-
佛山市南海区地中海贫血基因类型分析
目的 通过调查佛山市南海区地中海贫血基因的基因类型和构成比,了解本地区的地中海贫血基因型的分布,为防控本地区重型地贫的出现提供依据. 方法 采用gap-PCR法检测--SEA/αα,-α3.7/αα,-α4.2/αα 3种常见缺失型α地贫;采用反向斑点杂交法,可以检测αQSα,αCSα,αWSα 3种常见突变型α地贫;采用反向点杂交法检测β-地贫常见的17种点突变,包括-29、-28、17、βE、41-42、43、71-72、654、Int、14-15、27/28、Ⅰ-1、Ⅰ-5、31、-30、CAP、-32. 结果 检测α-地中海贫血缺失型1 359例标本,检出阳性标本490例,阳性率为36.06％ (490/1359).主要缺失类型是--SEA/αα、-α3.7/αα、-α4.2/αα;进行α-地中海贫血突变型检测的有1 210例,阳性率为2.8％(35/1 210).进行β-地中海贫血突变型检测的有1 073例,阳性率为24.98％ (268/1 073),主要类型是CD41-42、IVS-Ⅱ-654、CD17、-28;共检出41例复合型地贫,其中α缺失合并αt突变的有4例,α-地贫合并β-地贫有37例. 结论 本研究为佛山市南海区的遗传咨询和制定该地区人群筛查的地贫预防计划提供了有价值的基础资料.
-
乳腺浸润性筛状癌与筛状结构导管原位癌的临床病理及免疫组化对比分析
目的 探讨乳腺浸润性筛状癌(invasive cribriform carcinoma,ICC)与筛状结构导管原位癌(ductal carcinoma in situ,DCIS)的临床病理及免疫表型特点. 方法 收集12例浸润性筛状癌及12例筛状结构导管原位癌的临床资料,对它们进行形态学观察,免疫组化检测,并进行比较.选用的抗体包括CK5/6、CK(34βE12)、P63、Calponin、ER、PR、HER2、E-cad、Ki67. 结果 临床资料显示ICC患者的平均发病年龄较筛状结构DCIS的大,临床可触及肿物,而ICC腋窝淋巴结转移少见,预后均良好.镜下两者具有极相似的筛状结构,免疫组化结果显示,ICC导管周围肌上皮标记均为阴性,而筛状结构DCIS周围肌上皮标记阳性. 结论 ICC与筛状结构DCIS有相似的组织学特征,免疫组化对鉴别诊断有重要意义.
-
基于三种检测方法的17α羟孕酮临床检测比对
目的 评价具有不同检测原理的3个17α羟孕酮试剂盒,分析其临床检测结果的相关性和一致性. 方法 收集2015年2月至10月临床确诊为先天性肾上腺皮质增生症患者的血清120例,设为试验组;收集同期体检健康者血清120例,设为对照组.分别采用3个产品的17α羟孕酮试剂盒进行定量检测,对检测结果进行统计分析. 结果 3个产品的相关性R2分别为0.82、0.76和0.77,临床的阳性符合率为100％、100％和99.2％,阴性符合率为97.5％、98.3％和98.3％,总符合率为98.8％、99.2％和98.8％.3个产品的临床符合率差异无统计学意义(P＞0.05). 结论 不同检测原理的3个产品的17α羟孕酮试剂盒的临床检测结果具有等效性,符合临床应用要求.
-
曼氏迭宫绦虫中亮氨酸氨基肽酶基因的生物信息学分析和转录水平检测
目的 检测曼氏迭宫绦虫的3个亮氨酸氨基肽酶亚类(leucine aminopeptidases of Spirometra mansoni,SmLAPs)基因在虫体不同发育阶段的转录水平,为进一步病原诊断研究奠定基础.方法 运用生物信息学相关软件对3个亮氨酸氨基肽酶亚类编码蛋白的氨基酸序列的功能区域、免疫学特征、信号肽和跨膜区预测分析.应用Real time PCR方法检测SmLAPs在曼氏迭宫绦虫的成节、孕节和裂头蚴阶段的转录水平. 结果 对SmLAPs编码氨基酸序列的保守区域进行比对,SmLAPa与SmLAPb、SmLAPc的氨基酸序列一致性均为38％,SmLAPb和SmLAPc的一致性也只有44％.多功能位点分析发现,SmLAPs均含有底物结合位点、锌离子结合位点和多肽结合位点.在B细胞线性表位预测结果显示,SmLAPa有13个、SmLAPb有14个、SmLAPc有13个.T细胞表位预测中,SmLAPa有12个、SmLAPb有13个、SmLAPc有14个.3个SmLAPs亚类序列中均含有一个强烈的信号肽,并且均没有跨膜区域.在虫体各个发育阶段的转录水平检测中,在成节阶段,SmLAPb的转录水平是SmLAPa的1.34倍,SmLAPc的转录水平是SmLAPa的46.53倍.在孕节阶段,SmLAPb的转录水平是SmLAPa的1.96倍,SmLAPc的转录水平是SmLAPa的56.89倍.在裂头蚴阶段,只有SmLAPc有转录,没有检测到SmLAPa和SmLAPb的转录. 结论 在3个SmLAPs亚类基因中,SmLAPc是裂头蚴病更有价值的免疫诊断分子.
-
致死性侏儒症p.R248C突变热点的快速检测和三例TD-Ⅰ型高危胎儿的快速产前诊断
目的 针对致死性侏儒症Ⅰ型(thanatophoric dysplasia type Ⅰ,TD-Ⅰ)FGFR3基因的突变热点“p.R248C”,建立快速特异的酶切鉴定法(restriction endonuelease testing,RE)和扩增受阻突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)/RE法,并应用于后续3例疑似TD-Ⅰ高危胎儿的快速产前诊断,以及时防止患胎出生,同时为今后的胚胎植入前遗传学诊断(preimplantation genetic diagnosis,PGD)打下良好基础.方法 首先,针对突变热点p.R248C突变前后的序列特点,选择合适的内切酶“AfeI”,建立酶切鉴定法.其次,没计双错配碱基特异引物结合Apa LI酶切,建立ARMS/RE双重特异鉴定法.对阴性和阳性结果均再用普通引物扩、测的结果进行验证. 结果 用AfeI酶切FGFR3基因exons (6-7)普通引物的PCR产物(535 bp),正常对照及非p.R248C突变的TD病例均能被切成255 bp和280 bp 2个片段,而胎1～胎3均切出255 bp、280 bp和535 bp 3个片段.用特异引物E7(p.R248C)扩增,正常对照和非p.R248C突变的TD病例均扩增阴性,无法进一步做酶切鉴定;而p.R248C突变均扩增阳性,当再用Apa LI酶切PCR产物(365 bp)时,胎1～胎3均切出22 bp和343 bp 2个片段.通过引物扩、测结果显示:胎1～胎3均是p.R248C杂合突变. 结论 该法快速特异、准确可靠,可用于p.R248C突变热点的快速检测及含该突变高危胎儿的快速产前诊断.该法还可用于含p.R248C突变TD-Ⅰ型家系的PGD.胎1～胎3都是TD-Ⅰ患胎,建议尽早终止妊娠.
-
DA8600测序平台对EGFR基因检测低DNA用量的探讨
目的 基于DA8600测序平台,探讨AmpliSeq建库方法检测EGFR基因突变所需低样本DNA用量,以评估下一代测序(next generation sequencing,NGS)检测技术的性能. 方法 本研究选择10例EGFR突变的石蜡包埋组织样本,分别取1 ng、5 ng、10 ng、20 ng样本DNA进行文库构建,使用DA8600半导体测序仪进行检测,并比较检测结果. 结果 10 ng和20 ng DNA用量均可全部准确检出EGFR基因突变;5 ng DNA用量准确检出7例EGFR基因突变,1例文库质量不合格无法进行测序,1例无法检出EGFR突变,1例测序数据量不足检测失败;1 ng DNA用量构建文库全部质量不合格,无法进行测序. 结论 通过对10例样本不同DNA用量构建文库的检测结果分析,说明10 ng DNA即可采用AmpliSeq建库方法在DA8600半导体测序仪进行EGFR基因突变检测.
-
致死性侏儒症Ⅰ型高发突变发生机制浅析
致死性侏儒症(thanatophoric dysplasia,TD)是重型短肢畸形病中相对常见的致死性遗传性骨病,分为TD-Ⅰ和TD-Ⅱ 2型,它们都是由于FGFR3基因发生致死突变所致.TD-Ⅰ型存在多种致病性突变,其中以c.742C＞T/p.R248C突变为常见.本病为常染色体显性遗传(autosomal dominant,AD),杂合突变即可致死,但为何表型、基因型正常的父母会生出带有p.R248C突变的患胎并且是纯合突变的死胎？如果是新生突变,又为何会接连数胎生出同样的患胎？p.R248C高发突变的机制是什么？本文重点围绕这些问题,从“FGFR3 (Fibroblast growth factor receptor 3)基因和FGFR3受体(Fibroblast growth factorreceptor 3)的结构和功能,TD-Ⅰ型p.R248C高发突变的发生机制,正常父母生出纯合致死突变的可能机制”几方面进行剖析,指出:①FGFR3基因及其受体蛋白结构和功能的特殊性是高发突变发生的物质基础;②位于IgⅡ和IgⅢ结构域连接区的氨基酸是极性很强的亲水氨基酸,很容易与带电离子结合而影响α螺旋结构,故易受外来理化因素的攻击、诱变而发生改变;③正常父母生出纯合致死突变,推测有两种可能:一种是夫妇一方的生殖腺已带有该高发突变,当胎儿从亲代遗传了一次突变后,只需在另一位点上再发生一次新生突变即可产生;另一种是夫妇双方的生殖腺都是该突变的嵌合体,当两者结合在一起,就有可能产生纯合突变.此外,还对未来发展趋势进行了展望.本文旨在探讨c.742C＞T/p.R248C高发突变和纯合突变发生的机制,进而为其今后的诊断和防治工作提供理论依据.
-
MiRNA-3p/5p在肿瘤中的研究进展
Pre-miRNA经Dicer酶剪切产生2个产物,分别是miRNA-3p和miRNA-5p,以往的研究多数都是以单一的miRNA-3p或者miRNA-5p为主,而miRNA-3p/5p成对调控肿瘤的发生发展却少有报道.本文就近年来miRNA-3p/5p与肿瘤的研究进展做一综述.
-
蛋白质组学在肺癌相关标志物挖掘中的应用
肺癌是全球发病率和死亡率高的恶性肿瘤,其5年生存率仅为15％,但早期诊断出的肺癌患者5年生存率可达52％.缺乏早期诊断及有效治疗手段使得肺癌的死亡率很高.因此,寻找新的早期诊断和预后标志物为治疗打开新途径迫在眉睫.蛋白质组学技术具有足够的灵敏度,特异性和可重复性,它正成为肺癌生物标志物和治疗靶点研究的一个重要工具.本文就近年来肺癌的蛋白质组学研究进展包括肺癌的预防、早期诊断和治疗方法等进行综述.
-
地中海贫血产前基因诊断技术的临床应用
地中海贫血是全球广为流行的遗传性溶血性疾病,是常见的单基因遗传病之一.因缺乏理想的治疗手段,在高发地区通过对高风险夫妇进行产前基因诊断以避免重症地中海贫血患儿的出生,是国际上公认的首选预防措施.目前,临床广泛应用侵入性手术取得胎儿DNA并采用多种分子检测技术进行基因诊断,但有一定胎儿流产和宫内感染的风险.以胎儿游离DNA为检测标靶的无创产前诊断技术的迅速发展,为建立一种安全快速、简便准确的早期地中海贫血产前基因诊断方法带来可能.本文就目前应用于地中海贫血产前基因诊断的多种技术作一述评.
-
如何开展医疗器械注册检验
“注册证是进入市场的入场券”.在我国,第二、三类医疗器械要投入销售、使用,须先按照《医疗器械注册管理办法》或《体外诊断试剂注册管理办法》的相关规定向食药监部门申请产品注册,取得医疗器械注册批件,从而获得进入市场的资格.
关键词：
