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医院内感染耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分型及临床分析
目的 研究天津市第一中心医院内感染耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的clfB分型.方法 对2006-2012年天津市第一中心医院已进行SCCmec分型且MLST分型为ST239的临床非重复分离的MRSA,从ICU(n=35)和非ICU科室(n=7)共选取42株进行clfB分型.结果 42株MRSA均属于clfB的系列3,ICU的35株MRSA可分为6个型别,3-52占42.9％,3-52E占37.1％,3-50占8.6％,3-52C占5.7％,3-50A和3-50E分别占2.9％;非ICU的7株MRSA分属3个型别,3-52占42.8％,3-52E和3-50分别占28.6％;clfB分型联合SCCmec分型效果(分型指数ID=0.767)优于单纯应用clfB(ID=0.688)和SCCmec(ID=0.303),clfB/SCCmec联合分型可以将系列3的42株MRSA分为10个型别,其中SCCmecⅢ-clfB3-52E是主要克隆,占40.4％.相比非ICU科室,ICU感染MRSA的患者住院时间较长、使用抗菌药物治疗时间较长,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 基于可变串联重复序列的clfB分型方法分辨力高,可用于MRSA快速分型.
关键词： 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 凝集因子B 可变串联重复序列 基因分型 -
绵阳地区79株结核分枝杆菌的基因型特征研究
以数目可变串联重复序列(variable number tandem repeats,VNTR)为分子标识而建立的多位点数目可变串联重复序列分析(multiple loci VNTR analysis,MLVA)技术由于操作简便、特异性好、重复性高、分辨率强、数字化结果易于比较,已广泛用于各地结核分枝杆菌基因分型的研究.由于不同VNTR位点及其组合具有地区差异性,各国学者都致力于研究适合本地区的VNTR位点组合.本研究采用MLVA基因分型技术,选取国际上通用的15个VNTR位点,对绵阳地区的结核分枝杆菌进行了基因分型研究.
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胰岛β细胞自身免疫的分子机制
根据美国糖尿病学会(ADA,1997)和世界卫生组织(WHO,1999)糖尿病分型诊断的新建议,1型糖尿病可分为免疫介导性和特发性两种亚型.遗传易感因素[如人白细胞抗原(HLA)-DQ/DR、胰岛素基因的可变串联重复序列(INS-VNTR)和细胞毒性T淋巴细胞抗原(CTLA)-4等]与环境因素(如病毒感染、饮食成分及化学毒素等)相互作用,致使免疫调节失衡[如辅助性T细胞(Th)1功能亢进,Th2功能减弱等],胰岛β细胞的免疫耐受性丧失而遭受免疫攻击,发生自身免疫性糖尿病.换言之,免疫介导性1型糖尿病系由自身免疫选择性破坏胰岛β细胞,引起胰岛素分泌缺乏所致.
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中国汉族人群DNA酶Ⅰ基因多态性特点及与急性心肌梗塞的关系
目的:探讨DNA酶Ⅰ(DNase Ⅰ)基因多态性在中国汉族人群的分布频率、与急性心肌梗塞(acute myocardial infarction.AMI)易感性的关系.方法:以283名体检者及260名AMI患者为研究对象,提取外周血基因组DNA,应用PCR及PCR-限制性片段长度多态(PCR-RFLP)技术,分析DNA酶I基因8外显子单核苷酸多态位点A2317G及4内含子56bp可变串联重复序列(HumDNI)的多态性.结果:AMI组和对照组共检测到3种A2317G基因型及10种HumDN1基因型,其中A2317和HumDN13是AMI及对照组中分布频率高的等位基因.但两组中A2317G、HumDN1各基因型和等位基因分布差异无明显统计学意义(P＞0.05).结论:DNA酶Ⅰ基因多态性与中国汉族人群急性心肌梗塞无明显相关性.
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黑龙江地区汉族人群D2S44、D10S28、D7S467、D17S26基因的多态性
目的 了解黑龙江地区汉族群体中D2S44、D10S28、D7S467、D17S26基因型分布及等位基因频率等遗传多态性数据,探讨其应用价值.方法 收集150名黑龙江地区汉族无血缘关系个体的DNA,样本采用限制性片段长度多态性的方法(RFLP),用YNH24、TBQ7、PAC415、EFD52标记探针杂交,测定了D2S44、D10S28、D7S476、D17S26四个VMTR位点等位基因频率,建立黑龙江汉族人数据库.选择了白种人、黑种人和黄种人的D2S44和D10S28进行种族差异的比较.结果 4个VNTR位点共检出110个等位基因,结果表明,D2S44、D10S28、D17S26这3个VNTR位点基因型的观察值与期望值一致,符合Hardy-Weinberg平衡定律.D7S467位点基因型的观察值与期望值不符合Hardy-Weinberg平衡定律(P＜0.05).结论 补充了黑龙江地区汉族人群遗传多态性数据,对法医鉴定是十分重要的和必要的.
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三种亲子鉴定检测方法比较
近年来随着科技的发展,亲子鉴定方法也在不断发展,以保证鉴定结果的准确、可靠.为了对不同鉴定方法进行评估,笔者同时应用三种方法即常规血清学方法、限制性片段长度多态性技术(RFLP)检测数目可变串联重复序列(VNTR)方法及扩增片段长度多态性技术(AFLP)检测短串联重复序列(STR)方法对15例亲子鉴定样本进行检测,通过计算亲权关系概率进行比较分析.现总结如下.
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炭疽芽孢杆菌的分离鉴定及其与疫苗株的鉴别诊断
目的 建立炭疽芽孢杆菌临床分离株和疫苗株的鉴别诊断方法,为炭疽疫情判断和疾病控制提供依据.方法以炭疽芽孢外壁胶原样蛋白的编码基因bclA和pXO1质粒上的aat序列为靶点,设计引物,通过PCR扩增片段多态性和测序结果分析可变串联重复序列(VNTR).在生物安全3级实验室分离炭疽菌体蛋白,使用MALDL-TOF/TOF质谱仪进行检测,BioTyper软件分析图谱.结果 炭疽分离株与Ⅱ号、无荚膜疫苗株,VNTR分析结果均有不同.2个分离株测定bclA基因序列全长均为1 113 bp,编码的蛋白包含66个GXX重复和5个BclA重复.质谱分析发现,2个分离株菌体蛋白表达峰图基本一致,而2个疫苗株与之相比有很大的差异,许多蛋白的表达明显下调.结论 两种方法都能够有效鉴别炭疽临床分离株和疫苗株.
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甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌的 clfB 分型
目的：观察甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌（ MSSA）的凝集因子B（ clfB）分型情况。方法选取2006年和2012年10～12月天津市第一中心医院院内感染分离的7株MSSA，对其进行clfB分型。结果7株MSSA分别属于2-3、2-46D、2-47B、13、14、15和17，共计5个系列，7个型别，质控菌株ATCC29213属于clfB2-11克隆。结论MSSA 的clfB分型复杂，涉及谱系广泛，有助于局部地区短期的流行病学调查。
关键词： 甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌 凝集因子B 可变串联重复序列 基因分型 -
白细胞介素1受体拮抗剂基因内含子2可变串联重复序列多态性与冠心病的相关性
探讨白细胞介素1受体拮抗剂基因内含子2可变数串联重复序列多态性与血清白细胞介素1受体拮抗剂水平及冠心病的相关关系.运用聚合酶链反应的方法,检测了245例冠心病患者和236例健康对照者白细胞介素1受体拮抗剂基因可变数串联重复序列多态性,并用酶联免疫吸附实验检测了血清白细胞介素1受体拮抗剂水平.结果发现该多态有Ⅰ/Ⅰ、Ⅰ/Ⅱ、Ⅰ/Ⅳ和Ⅱ/Ⅱ 4种基因型,冠心病组Ⅰ/Ⅰ型频率为88.6%,Ⅰ/Ⅱ型频率为9.8%,Ⅰ/Ⅳ型频率为1.2%,Ⅱ/Ⅱ型频率为0.4%.对照组Ⅰ/Ⅰ型频率为80.1%,Ⅰ/Ⅱ型频率为16.9%,Ⅰ/Ⅳ型频率为2.1%,Ⅱ/Ⅱ型频率为0.9%,且冠心病组携带Ⅱ型等位基因的基因型频率显著低于对照组,而在心肌梗死组和心绞痛组中的分布差异更为显著.冠心病组Ⅱ型等位基因携带者血清白细胞介素1受体拮抗剂水平明显高于不携带者.研究表明白细胞介素1受体拮抗剂基因可变数串联重复序列多态性可能影响个体血清白细胞介素1受体拮抗剂水平,可能在冠心病的发展过程中具有保护作用.
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多巴胺突触前膜转运载体基因多态性与帕金森病
目的研究多巴胺突触前膜转运载体(dopamine transporter, DAT)的基因多态性与帕金森病(Parkinson's disease, PD)的关系.方法比较了85名健康对照和128例PD患者(包含发病年龄小于或等于50岁的早发型PD亚组和发病年龄大于50岁的晚发型PD亚组)的DAT基因串联重复可变数(variable number of tandem repeat, VNTR)多态性分布.结果该多态性位点的基因型和等位基因分布在对照组和PD患者之间差异有显著性;晚发型PD与7拷贝等位基因强相关,与11拷贝等位基因弱相关,早发型PD主要与9拷贝等位基因相关.结论该结果不仅支持DAT与PD相关的假说,而且提示了DAT基因VNTR多态性与PD发病年龄的可能关系.
关键词： 帕金森病 多巴胺突触前膜转运载体 可变串联重复序列 基因多态性 -
c-Ha-ras基因3′端可变串联重复序列位点遗传多态性与葡萄胎的恶变关系
目的探讨遗传标记物c-Ha-ras基因3′端可变串联重复序列(variable numbers of tandem repeats,VNTR)在妊娠滋养细胞疾病中的变化,以了解DNA来源与葡萄胎恶变的关系.方法用扩增片段长度多态性-聚丙烯酰胺凝胶电泳方法对c-Ha-ras基因3′端VNTR位点进行分析,将患者病变组织与其父母的DNA扩增结果进行对照,以判定病变组织DNA的来源.结果在15组病例中,仅有2例葡萄胎组织的DNA扩增片段全部来自父方;既来自父方又来自母方者有13例,其中2例来自父母双方的比例是一样的,11例来自父方的比例大于来自母方的比例.结论 DNA来自父母亲双方的,且来自父方的比例大于来自母方比例的葡萄胎组织易于发生恶变.
关键词： c-Ha-ras基因 可变串联重复序列 遗传多态性 葡萄胎 -
陕西老年人群Rb1.20位点的VNTR多态性与动脉粥样硬化遗传易感性研究
数目可变串联重复序列(variable number of tandemrepeat, VNTR)是人类基因组中常用的一种遗传标记,其应用十分广泛[1].Rb基因是视网膜母细胞瘤的易感基因,位于13q14,是一种具有生长负调节作用的抑癌基因.Yandell等[2]在Rb基因外显子20附近的内含子中发现一VNTR区,将其命名为Rb1.20,其重复单位4～5 bp,重复次数10～26次,是一个理想的遗传标记.动脉粥样硬化(AS)是一类严重威胁人类健康的疾病,是心脑血管疾病的重要病理基础.有关AS的Rb基因研究报道不是很多,而关于Rb基因的VNTR多态性与AS的遗传易感性的相关性研究目前尚未报道.为此,我们应用PCR技术分析陕西老年AS与对照组人群Rb1.20位点的VNTR多态性,探讨了Rb1.20位点的VNTR多态性与AS的遗传易感性之间的相关性.
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河南汉族人群eNOS基因27 bp VNTR, G894T多态性与深静脉血栓形成的相关性分析
目的:探讨内皮细胞型一氧化氮合酶(eNOS)基因27 bp VNTR,G894T基因多态性与深静脉血栓形成(DVT)的相关关系.方法: 运用PCR-RFLP方法对103例DVT患者和250例健康对照进行eNOS基因27 bp VNTR,G894T多态性的检测分析,并进行基因型频率及等位基因频率的比较以及单倍型分析.结果: 4a/4a基因型频率的分布以及4a等位基因频率的分布在DVT组与对照组差异有统计学意义(P《0.05);相对风险分析发现,携带4a等位基因的个体发生DVT的危险性增加;OR=1.950,95%CI为1.128～3.371.4a-G, 4b-G两种单倍型组合在DVT组与对照组比较,差异具有统计学意义(P《0.05).对eNOS基因4a/b和G894T做配对连锁不平衡检验,D′=0.681,r2=0.003.结论: 提示27 bp VNTR多态性与深静脉血栓形成相关,携带4a等位基因者可能具有易患静脉血栓的危险性;4a-G可能是河南汉族人DVT发生的风险单倍型,而4b-G可能对河南汉族人群DVT的发生具有某种保护作用.4a/b和G894T 之间不具有连锁不平衡.
