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菌群与新生儿疾病
菌群与人类健康和疾病密切相关,新生儿菌群受许多因素的影响.本文主要概述了本课题组在菌群与新生儿疾病关系方面的初步探索:新生儿呼吸机相关性肺炎致病菌以群体形式即生物膜形式致病;新生儿口咽部常寄居的链球菌通过自身诱导因子-2起辅助致病菌作用;新生儿坏死性小肠结肠炎肠壁及粪便中变形菌门相对丰度升高而厚壁菌门相对丰度降低,与短链脂肪酸合成不足进而调节性T细胞分化不足有关;新生儿早发败血症时经验性使用抗生素1周可明显降低肠道菌群多样性,易于损伤肠道自然防御屏障;剖宫产儿肠道拟杆菌属含量明显不足,健康平衡的肠道菌群迟迟不能建立.
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不同环境微生物暴露对小鼠生命早期肠道菌群定植的影响
目的 探讨不同环境微生物暴露对生命早期小鼠肠道菌群定植的影响. 方法 选取无特殊病原体6～8周BALB/c小鼠24只(雌16只,雄8只),雌雄2:1合笼,受孕后按子代不同时期(胎儿期、哺乳期、儿童期)的饲养环境分为4组.A组:胎儿期、哺乳期、儿童期均于清洁环境中饲养;B组:胎儿期、哺乳期于清洁环境中饲养,儿童期于普通环境中饲养;C组:胎儿期于清洁环境中饲养,哺乳期、儿童期于普通环境中饲养;D组:胎儿期、哺乳期、儿童期均于普通环境中饲养.采集小鼠生后3周末和5周末粪便样本,提取样本细菌总DNA,采用Illumina MiSeq高通量测序仪对细菌的16S rDNA V4区进行测序及生物信息学分析.采用Kruskal-Wallis及Dunn-Bonferroni检验进行统计学分析. 结果 1、生后3周末:(1)物种组成分析:①门水平:4组间厚壁菌门、疣微菌门、变形菌门和放线菌门相对丰度比较,差异均有统计学意义(P值均＜ 0.05);A和B组厚壁菌门相对丰度分别低于C和D组[30.876(23.448～41.218)×10-2、3.317(1.116～4.641)×10-2与71.936(53.587～86.713)×10-2、79.105(56.305～82.736)×10-2],而疣微菌门、变形菌门相对丰度高于C和D组[疣微菌门:17.249(9.748～35.106)×10-2、58.883(0.017～6.047)×10-2与0.152(0.066～1.890)×10-2、0.003(0.000～0.016)×10-2;变形菌门:12.640(0.336～15.070)×10-2、3.653(3.362～4.596)×10-2与0.219(0.134～0.325)×10-2、0.124(0.116～0.165)×10-2],差异均有统计学意义(P值均＜0.05或0.01);②属水平:4组间乳酸杆菌属、阿克曼菌属、拟杆菌属等相对丰度比较差异均有统计学意义(P值均＜ 0.01);A和B组乳酸杆菌属相对丰度低于C和D组[19.283(8.618～31.541)×10-2、0.339(0.264～22.278)×10-2与58.414(34.874～71.942)×10-2、66.007(55.141～76.940)×10-2],而阿克曼菌属、拟杆菌属、克雷伯杆菌属相对丰度高于C和D组[阿克曼菌属:17.247 (9.748～35.106)×10-2、58.883(0.017～60.475)×10 2与0.152(0.066～1.890)×10-2、0.003(0.000～0.017)×10-2;拟杆菌属:3.978(0.683～25.171)×10-2、8.216(6.023～9.946)×10-2与0.141 (0.061～0.281)×10-2、0.568(0.149～1.455)×10-2;克雷伯杆菌属:0.209 (0.050～8.888)×10-2、1.402(0.865～1.692)×10-2与0.003(0.000～0.039)×101、0.000(0.000～0.001)×10-2],差异均有统计学意义(P值均＜0.05或＜0.01).(2)α多样性分析:4组间操作分类单位(operational taxonomic unit,OTU)数量、Chaol指数比较差异有统计学意义(P值均＜0.05),Shannon指数差异无统计学意义(P值＞0.05);A和B组OTU数量低于D组[246 (221～348)和257 (209～280)与387 (324～478),P值分别为0.045和0.0082].2、生后5周末:(1)物种组成分析:①门水平:4组间厚壁菌门、疣微菌门、变形菌门相对丰度比较差异有统计学意义(P值均＜0.05或0.01);A组厚壁菌门相对丰度低于B、C和D组[13.765 (64.181～24.238)×10-2与48.912(37.280～59.466)×10-2、86.065(50.149～89.856)×10 1、53.847(31.946～72.936)×10-2],而疣微菌门相对丰度高于B、C和D组[58.089(22.459～61.285)×10-2与0.001 (0.000～0.005)×10-2、0.0000 (0.000～0.001)×10-2、0.003(0.000～0.006)×10-2],差异均有统计学意义(P值均＜0.05或0.01);②属水平:4组间乳酸杆菌属、阿克曼菌属相对丰度比较差异均有统计学意义(P值均＜ 0.01).A组乳酸杆菌属相对丰度低于B、C和D组[1.755 (0.805～8.833)×10-2与26.391(17.550～37.265)×10-2、70.688 (45.713～77.953)×10-2、28.675(15.660～57.224)×10-2],而阿克曼菌属相对丰度高于B、C和D组[58.089(22.460～61.285)×10-2与0.000(0.000～0.006)×10-2、0.000(0.000～o.001)×101、0.003(0.000～0.006)×10-2],差异均有统计学意义(P值均＜0.05或0.01).(2)α多样性分析:4组间OTU数量、Chao1指数、Shannon指数比较差异均有统计学意义(P值均＜0.05或0.01);A组OTU数量低于B、C、D组[268 (241～410)与438 (380～516)、562 (533～588)、546(473～599)],B组OTU数量、Chao1指数、Shannon指数均低于C和D组[OTU数量:438(380～516)与562 (533～588)、546 (473～599);Chao1指数:1 033 (883～1 181)与1 285 (1 220～1 338)、1 328 (1 155～1 516);Shannon指数:3.85 (3.25～4.50)与4.28 (3.30～5.11)、4.17(3.62～4.38)],差异有统计学意义(P值均＜0.05或0.01). 结论 不同环境微生物暴露会影响生命早期小鼠肠道菌群的多样性与结构;环境清洁度越高,肠道菌群多样性越低,菌群结构组成也有一定差异;哺乳期可能是肠道菌群定植的重要“时间窗”.
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机械通气新生儿气管导管表面生物膜细菌多样性研究
目的 观察机械通气新生儿气管导管表面生物膜细菌群落多样性,探讨以变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术为基础的细菌鉴定方法与传统培养法的差异,为临床预防、诊疗细菌性感染提供新思路.方法 以重庆医科大学附属儿童医院新生儿中心2011年10月至2012年3月经治的26例患儿35根气管导管为研究对象,依靠16S rDNA PCR-DGGE技术,通过quantity one软件分析气管导管表面生物膜中细菌群落多样性,通过T-A克隆测序,了解生物膜中细菌种类分布及常见优势菌.结果 35根气管导管经16S rDNA PCR-DGGE所得条带13.8±5.4,香农威纳指数2.42 ±0.38.16份标本来自7例患儿不同疾病阶段,其中6例患儿气管导管留置天数增加,香农威纳指数减小.6例不同基础疾病患儿的气管导管标本香农威纳指数各不相同.回收24条优势条带克隆测序.35份标本中检出克雷伯菌属100％、假单胞菌属80％、链球菌属77％,91％的标本中存在无法培养的细菌,97％检测到2种以上菌属.80％克雷伯菌属和82％链球菌属中分别与假单胞菌属伴随存在.22例有临床痰培养结果,肺炎克雷伯菌10例(45％),鲍曼不动杆菌2例(9％),阴沟肠杆菌、阴性结果各1例(5％),培养结果均为单菌属.8例痰培养显示“正常菌群”,其对应导管上均检测到克雷伯菌等菌属.结论 气管导管表面生物膜中细菌群落具有多样性；16S rDNA PCR-DGGE技术相比培养法更能全面反映气管导管表面细菌群落组成和多样性；克雷伯菌属、假单胞菌属及链球菌属是气管导管表面生物膜中常见菌属,它们在生物膜形成过程中可能存在相互作用.
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内生菌在天然药物研究中的研究进展
内生菌具有丰富的生物多样性,是潜力巨大的微生物新资源.内生菌的研究对于保护野生与濒危药用植物、拓展药用资源、新药研发等均有一定意义.本文对近年来报道的内生菌的活性代谢产物、内生菌与药用植物的相互影响、内生菌对中药材道地性的影响等进行综述,为内生菌的进一步研究提供参考.
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在进口中药材技术审评中发现的有关问题及建议
随着我国人民生活水平的普遍提高,人们对健康和生活质量的要求成了促使医药事业向前发展和医疗诊断水平不断提高的推动力,从而带动了中药产业的发展.中药材资源作为一种生物资源,除取之造福于民外,还须兼顾保护生物多样性和维持生态平衡.由科技部等八个部委联合发出的2002年至2010年<中药现代化发展纲要>中,将"资源可持续利用和产业可持续发展"作为中药现代化发展的一项基本原则,要求"在充分利用资源的同时,保护资源和环境,保护生物多样性和生态平衡.
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澳大利亚生物技术发展概况
澳大利亚拥有优良的基础科学传统和一个富有创造性的生物技术产业，为了建立一个巨大的、有竞争力的商业基础，澳大利亚与其它国家建立合作伙伴关系，与大型跨国公司建立战略联盟。对澳大利亚生物技术进行重大投资的公司中，主要有美国Amgen公司、Johnson＆Johnson公司、Chiron公司，日本HitachiChemical公司，荷兰Numico公司和美国AvaxTechnologies公司等。该国还与许多贸易机构(包括TeamCanada,英国BiotechmeansBusiness,美国BIO,Biocom和Connect等)建立联系。 从1998年，联邦政府和州政府积极支持生物技术产业的发展，1998～1999年政府投入生物技术的研发经费达到2.5亿澳大利亚元。同期，生物技术工业的总收入约为9.65亿澳元。据澳大利亚工业、科学和资源部称，今后30年生物技术产业将成为经济增长和发展的关键力量，将是新投资和就业的重要“发电机”。根据所有涉及生物技术的有关公司的项目，估计2000年其资本总量约为5.15亿澳元。为了加速正在研发产品的商品化，将扩大和增加对“工艺过程放大”的直接投资。 研究与开发澳大利亚的重要生物技术研究基础设施得到各大学、医院、医学研究所、合作研究中心以及联邦科学工业研究组织(澳大利亚大的研究/开发组织，简称CSIRO，堪培拉)的大力支持和资助。此外，为确保有一个适当的管理系统以保护人体健康和环境，成立了基因技术管理处。联邦科学工业研究组织有30个部门，其中有六个部门近加入“生物活性分子研究协会”(BioactiveMoleculesInitiative，简称BMI)，它雇用了约70个实验室300多名科学家，并与国内和国际的企业建立联系。 为了缓和消费者的关注，澳大利亚卫生和老年保健部近公布了一个严格的新制度，以控制所有遗传改良产品在澳大利亚的商业化释放。消费者对遗传改良食品的争论，是当前欧洲和美国关注的热点。人们建议，遗传改良的食品以及来自遗传改良作用的食品应该标示。遗传改良谷物的商业释放将是很缓慢的，因为澳大利亚的管理机构必须对所有材料进行严格的评估。澳大利亚食品制造厂近转向来源非遗传改良的商品，以照顾消费者的情感。 联邦科学工业研究组织所从事的研究工作，包括生物技术，环境工程以及硬科学。该组织的研究涉及制药、人类健康和农业科学等领域，并负责开发新型治疗剂、诊断剂和可植入的装置，其攻克疾病的目标包括糖尿病和癌症。核心领域是细胞生物学、蛋白质工程和药物化学。此外，该组织还生产新型的遗传工程人抗体，供癌症诊治和免疫调节之用。 一种以昆虫为基础的化学文库，是由CSIRO和Biodiscovery公司创办的一家合资企业开发的。CSIRO的植物工业科学家们已开发出一项技术，使农作物生产出可供制造工业化合物和聚合物所需的原材料。他们完成的另一项研究是，详细分析了种子贮存蛋白质、酶及其各自的基因(控制发育中谷粒的糖类合成)，据CSIRO植物工业部称，他们正在利用现代遗传技术开发更优良的小麦、大麦和其它作物新品种。 生物活性分子研究协会(BMI)是由昆士兰分子生物科学研究所主持的。该协会关注为制药、农业和营养领域而发现生物活性分子和新目标。他们还与澳大利亚海洋科学研究所(AIMS)合作，从拥有丰富的生物多样性的澳大利亚海洋环境中发现新颖化合物。AIMS生物多样性采集是为筛选心血管和抗癌化合物和抗微生物的天然产品专门设立的，现在正在寻找合作研究伙伴。 CSIRO的分子科学部与肿瘤研究中心、威尔士王子医院和F.H.Faulding公司合作，从事有关基因治疗的药物传递技术的研究。据称，下一代药物(如以基因为基础的治疗)面临着一种重大的药物传递挑战。因此，Faulding公司正着重于药物传递系统和抗癌疗法的研发，计划建立一种具有潜在广泛应用性的新传递技术。例如，将为治疗雄激素依赖性和非依赖性前列腺癌开发新型化合物。目前，对于雄激素依赖性前列腺癌，只有姑息关怀。
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云南不明原因猝死生态学分析
根据已有调研资料,运用耗散结构理论和系统生态学等的基本原理,分析云南不明原因猝死的基本生态格局.结果显示云南不明原因猝死的病源属性是生物源性;媒介的主要特点是生物气溶胶;病源的基本特性由产生毒素的真菌种类及其生态学特点决定.提出云南不明原因猝死的生态基本格局是特定区域产毒真菌主导,细菌与病毒协同参与,气溶胶为媒介的生物源性疾病.同时提出疾病预防控制的理论与方法都需要更新.
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我国B'亚型HIV-1 gag基因变异与宿主HLA限制性CTL应答的关系
目的 了解我国B'亚型HIV gag基因随时间进化的特征及阳性选择位点与宿主HLA限制性CTL应答的关系.方法 从HIV序列数据库下载我国B’亚型HIV-1 gag序列,计算不同年代病毒多样性及基因离散率,应用Hyphy软件分析Gag蛋白阳性选择位点及其与HLA限制性CTL应答的关系.结果 本研究共获得来自河南、湖北、辽宁及云南地区的122条B '亚型gag序列,按采样时间分为4组:＜2001、2001-2003、2004-2006及2007-2010年,病毒多样性及离散率均随时间逐渐增加(r1=0.497,P1＜0.001；r2 =0.593,P2＜0.001)；Gag蛋白34个阳性选择位点中97.1％位于已明确的47个HLA限制性CTL表位内,HLA-A、B、C限制表位分别占43.1％、49.0％及7.9％.结论 我国B’亚型gag基因多样性及离散率随着流行时间延长逐渐增加,B '亚型毒株正逐渐适应我国人群常见的HLA限制性CTL应答,提示该毒株疫苗研发时需要注意避免选用相关CTL表位为免疫原.
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转基因作物对生态环境的潜在风险
转基因作物在全球范围内的广泛应用在带给人类巨大利益的同时,也可能产生一系列风险.该文概述了转基因作物对生态环境的潜在风险,针对转基因作物的杂草化问题,分析了产生杂草化的遗传和环境因素,同时阐述了转基因作物的释放对生物多样性及生态系统的影响.
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转基因生物对生物多样性的影响
遗传修饰的生物体既是转基因生物(GMOs).从1983年第1株转基因植物诞生以来,转基因作物不断的走出实验室,进入大田实验,到1996年6月被批准进入市场的已有18种.
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海燕化学成分研究
海洋生物具有广泛的生物多样性.为了从我国丰富的海洋生物资源中寻找到具有新颖结构和显著生理活性的次生代谢产物,探讨我国北部海域海洋生物中次生代谢产物的化学结构特征,我们对产自青岛海域的海燕进行了化学成分研究.海燕Asterina pectinifera是棘皮动物门海星纲海燕科动物,是我国北部海域常见的海星品种[1].我们从其95%乙醇提取物的正丁醇部位中分离鉴定12 个化合物,分别为asterosaponin P1(Ⅰ),pectinioside A (Ⅱ),L-色氨酸(Ⅲ),L-苯丙氨酸(Ⅳ),对羟基苯甲酸(Ⅴ),对羟基苯乙酸(Ⅵ),对羟基苯乙胺(Ⅶ),尿嘧啶核苷(Ⅷ),尿嘧啶(Ⅸ),胸腺嘧啶脱氧核苷(Ⅹ),胸腺嘧啶(Ⅺ),次黄嘌呤核苷(ⅩⅡ).以上化合物除Ⅰ、Ⅱ外均为首次报道从海燕中分离得到.
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药用植物迁地保护优先物种评估方法及实证研究
随着天然药物和天然保健品的流行,药用植物资源枯竭的问题日益凸显.我国药用植物的保护日益受到重视,但是目前的药用植物保护评估方法还存在不足.在总结植物受威胁程度和优先保护评估方法的基础上,根据药用植物迁地保护数据特点对现行的药用植物受威胁程度及保护优先等级方法进行了改进,并对分级抽取的10种中药材进行了比较研究.结果表明,本方法与原方法的评估结果存在差异,且新方法在指标灵敏度、数据获取容易程度、批量评估等方面有进一步的提升,能较好地反映物种优先保护程度,对中药资源经济研究和管理具有参考意义.
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312第3届药用与芳香植物世界大会简介
第3届药用与芳香植物世界大会于2003年2月3～7日在泰国清迈市召开,此会每5年举行一次.来自50多个国家的500多名代表出席了本次大会.会议期间有130个报告、415份墙报和120个展览.大会主题是"生物多样性及药用与芳香植物在科学、技术、贸易和生产领域中的可持续应用".本次大会由国际药用与芳香植物协会(ICMAP)、清迈大学科学院、国际园艺学会,以及泰国国家研究委员会、农业与合作社部、大学事务部、泰国王直接赞助的泰国科学学会、遗传工程与生物技术国家中心、政府制药机构和联合国粮农组织亚太地区办公室联合主办.
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加强湿地保护改善生态环境
湿地在孕育和丰富地球生物多样性方面起着举足轻重的作用.它与森林、海洋并称为全球三大生态系统,被誉为"地球之肾"、"天然水库"和"天然物种库".据统计,全球有40％的物种生活在淡水湿地中.
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绿手绢创意大赛
因为我们对一次性纸巾的依赖,大片的原始森林被用于造纸的速生林所替代,物种栖息地消失,生物多样性遭到破坏,并引发生态灾难.生产纸巾的过程消耗了大量的水和能源,对它们的废弃又造成大量垃圾.每一位过度使用纸巾的人,都对此负有难以推卸的责任.
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全球大湿地潘塔纳尔连载之一——人与动物共享的生态天堂
巴西不仅北有恢弘博大的亚马逊奇观,在西南部还有与之媲美,面积达23万平方公里的世界大湿地潘塔纳尔.潘塔纳尔不仅以其独有的生物多样性和充满野性的荒野风光令举世瞩目,而且是生态旅游和观鸟的天堂,政府切合实际的有效的保护举措、居民高素质的环保意识,同样给世人留下深刻的印象.
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生物多样性与中药材质量关系的研究
目的:探讨生物多样性中药材质量的关系.方法:查阅国内的有关资料并结合自己的科研体会进行分析综述.结果:遗传多样化、化学成分多样性、生态系统多样性等与中药材质量息息相关.结论:只有全面掌握和利用生物多样性信息,才能提高中药材的质量.
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唐山山区野生药用双子叶植物资源及其多样性研究
目的:研究唐山山区野生药用双子叶植物资源的种类与多样性,为药用植物资源的开发利用提供依据.方法:深入各代表性样地进行药用植物资源调查,采集、鉴定标本,查阅文献资料等.结果:初步调查结果显示唐山山区有野生药用双子叶植物92科251属321种.结论:唐山山区野生药用双子叶植物资源丰富并具多样性,具有较好的开发利用前景.
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不能告别中医中药
<医学与哲学·人文社会医学版>2006年4期,刊载了张功耀<告别中医中药>一文(以下简称<告别>),作者以文化进步、尊重科学、维护生物多样性及人道主义的名义,提出告别中医药的主张.虽然名义很庄严,旗帜很鲜明,但却表现出以偏概全、以旧概新、全面否定的错误,严重违背科学精神.
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应用PFU法监测冶金工业废水的毒性
冶金工业为鞍山市的主导行业,年排放废水约7 269万吨,占全市工业废水排放量的81%.其废水的排放对生物多样性乃至生态系统均会造成影响.不同的污染源对生物多样性影响程度如何,笔者拟通过PFU法中原生动物群落的变化来阐明废水的毒性效应,为揭示生态系统的生物多样性变化提供依据.
